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TREX2

La exonucleasa 2 de reparación tres primas es una enzima que en humanos está codificada por el gen TREX2 . [ 5 ] [ 6 ] Este gen codifica una proteína con actividad exonucleasa 3...

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La exonucleasa 2 de reparación tres primas es una enzima que en humanos está codificada por el gen TREX2 . [ 5 ] [ 6 ]

Este gen codifica una proteína con actividad exonucleasa 3' . Las enzimas con esta actividad participan en la replicación , reparación y recombinación del ADN. Su similitud con una proteína de E. coli sugiere que esta enzima podría ser una subunidad de la ADN polimerasa III , la cual no posee actividad exonucleasa intrínseca. [ 6 ]

Investigaciones más recientes han determinado que TREX2 también participa en la actividad de endonucleasa de solapa , detectada en el contexto de la inhibición de nickasas de edición genética que generan una solapa de extensión, como los editores de primoradición que normalmente no crean una ruptura de doble cadena. Esta función fue demostrada por primera vez en una tesis de Lung en 2021, [ 7 ] y replicada por Koeppel et al. en 2023. [ 8 ] Posteriormente, TREX2 se ha incorporado a enzimas de fusión para ingeniería genética por múltiples grupos de investigación con el fin de reducir las ediciones fuera de objetivo, que incluyen translocaciones cromosómicas e inserciones con apareamiento incorrecto. [ 9 ] [ 10 ]

Las mutaciones en este gen pueden provocar el síndrome de Aicardi-Goutières .

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000183479 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000031372 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Mazur DJ, Perrino FW (agosto de 1999). "Identificación y expresión de las secuencias de ADNc TREX1 y TREX2 que codifican exonucleasas 3'-->5' de mamíferos" . J Biol Chem . 274 (28): 19655–60 . doi : 10.1074/jbc.274.28.19655 . PMID 10391904 . 
  6. 1 2 "Gen Entrez: TREX2 exonucleasa de reparación tres primas 2" .
  7. ↑ Lung, Genesis (noviembre de 2021). "Corrección precisa de A1AT E342K mediante edición primaria NGA PAM modificada y determinación de la inhibición de la edición primaria por TREX2" .
  8. ↑ Koeppel, Jonas; Weller, Juliane; Peets, Elin Madli; Pallaseni, Ananth; Kuzmin, Ivan; Raudvere, Uku; Peterson, Hedi; Liberante, Fabio Giuseppe; Parts, Leopold (2023). "Predicción de eficiencias de inserción de edición primaria utilizando características de secuencia y determinantes de reparación de ADN" . Nature Biotechnology . 41 (10): 1444– 1456. doi : 10.1038/s41587-023-01678-y . PMC 10567557. PMID 36797492 .  
  9. ^ Yin, Jianhang; Lu, Rusen; Xin, Changchang; Wang, Yuhong; Ling, Xinyu; Li, Dong; Zhang, Weiwei; Liu, Mengzhu; Xie, Wutao; Kong, Lingyun; Sí, Wen; Wei, Ping; Xiao, Bing Bing; Lee, Hsiang-Ying; Liu, Tao (marzo de 2022). "La exoendonucleasa Cas9 elimina las translocaciones cromosómicas durante la edición del genoma" . Comunicaciones de la naturaleza . 13 (1): 1204. Bibcode : 2022NatCo..13.1204Y . doi : 10.1038/s41467-022-28900-w . PMC 8904484 . PMID 35260581 .  
  10. ^ Wang, Yue; Feng, Yi-Li; Liu, Qian; Liu, Si-Cheng; Huang, Zhi-Cheng (diciembre de 2023). "TREX2 permite una alteración eficiente del genoma mediada por nickasas CRISPR-Cas9 emparejadas que generan extremos colgantes en 3'" . Terapia Molecular Celular . 34 (102072).

Lecturas adicionales

  • Shevelev IV, Hübscher U (2002). "Las exonucleasas 3' 5'". Nat. Rev. Mol. Cell Biol . 3 (5): 364– 76. doi : 10.1038/nrm804 . PMID 11988770 . S2CID 31605786 .  
  • Esposito T, Ciccodicola A, Flagiello L, et  al. (1997). "STS expresados ​​y transcripción del Xq28 humano". Gene . 187 (2): 185– 91. doi : 10.1016/S0378-1119(96)00772-X . PMID 9099879 . 
  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "Clonación de ADN mediante recombinación sitio-específica in vitro" . Genome Res . 10 (11): 1788– 95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948. PMID 11076863 .  
  • Li T, Duan W, Yang H, et  al. (2001). "Identificación de dos proteínas, S14 y UIP1, que interactúan con UCH37". FEBS Lett . 488 (3): 201– 5. Bibcode : 2001FEBSL.488..201L . doi : 10.1016/ S0014-5793 (00)02436-4 . hdl : 10536/DRO/DU:30009147 . PMID 11163772. S2CID 40717095 .  
  • Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, et  al. (2001). "Localización subcelular sistemática de nuevas proteínas identificadas mediante secuenciación de ADNc a gran escala" . EMBO Rep . 1 (3): 287– 92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732. PMID 11256614 .  
  • Mazur DJ, Perrino FW (2001). "Estructura y expresión de los genes de exonucleasa 3' --> 5' TREX1 y TREX2" . J. Biol. Chem . 276 (18): 14718–27 . doi : 10.1074/jbc.M010051200 . PMID 11278605 . 
  • Mazur DJ, Perrino FW (2001). "Escisión de los extremos 3' por las exonucleasas 3'-->5' Trex1 y TREX2. Caracterización de las proteínas recombinantes" . J. Biol. Chem . 276 (20): 17022–9 . doi : 10.1074/jbc.M100623200 . PMID 11279105 . 
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et  al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humanas y de ratón de longitud completa" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .  
  • Shevelev IV, Beliakova NV, Kravetskaia TP, Krutiakov VM (2003). "[El papel corrector de las exonucleasas autónomas 3'-->5' en los complejos de ADN polimerasa multienzimáticos de mamíferos]". Mol. Biol. (Mosk.) . 36 (6): 1055– 61. PMID 12500544 . 
  • Shevelev IV, Ramadan K, Hübscher U (2004). "La exonucleasa TREX2 3'-->5' interactúa físicamente con la ADN polimerasa delta y aumenta su precisión" . ScientificWorldJournal . 2 : 275–81 . doi : 10.1100 /tsw.2002.99 . PMC 6009725. PMID 12806015 .  
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et  al. (2004). "Estado, calidad y expansión del proyecto de ADNc de longitud completa de los NIH: la Colección de Genes de Mamíferos (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .  
  • Wiemann S, Arlt D, Huber W, et  al. (2004). " Del ORFeoma a la biología: una vía de genómica funcional" . Genome Res . 14 (10B): 2136–44 . doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930. PMID 15489336 .  
  • Perrino FW, Krol A, Harvey S, et  al. (2005). "Variantes de secuencia en la desoxirribonucleasa 3'-->5' TREX2: identificación en un cribado genético y efectos sobre la catálisis por las proteínas recombinantes". Adv. Enzyme Regul . 44 : 37–49 . doi : 10.1016/j.advenzreg.2003.11.010 . PMID 15581481 . 
  • Perrino FW, Harvey S, McMillin S, Hollis T (2005). "La estructura de la exonucleasa 3' -> 5' TREX2 humana sugiere un mecanismo para una catálisis de ADN no procesiva eficiente" . J. Biol. Chem . 280 (15): 15212–8 . doi : 10.1074/jbc.M500108200 . PMID 15661738 . 
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et  al. (2005). "Hacia un mapa a escala del proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Nature . 437 ( 7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514. S2CID 4427026 .  
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  • Hahn Y, Lee B (2007). " Mutaciones sin sentido específicas de humanos identificadas mediante comparaciones de secuencias genómicas" . Hum. Genet . 119 ( 1–2 ): 169–78 . doi : 10.1007/s00439-005-0125-6 . PMID 16395595. S2CID 21059468 .  
  • Chen MJ, Ma SM, Dumitrache LC, Hasty P (2007). "Características bioquímicas y celulares de la exonucleasa 3' -> 5' TREX2" . Nucleic Acids Res . 35 (8): 2682– 94. doi : 10.1093 / nar/gkm151 . PMC 1885668. PMID 17426129 .  
  • Parra D, Manils J, Castellana B, Viña-Vilaseca A, Morán-Salvador E, Vázquez-Villoldo N, Tarancón G, Borràs M, Sancho S, Benito C, Ortega S y Soler C (2009). "Mayor susceptibilidad a la carcinogénesis cutánea en ratones knockout TREX2" . Investigación del cáncer . 69 (16): 6676– 84. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-09-1208 . PMID 19654293 . 
  • Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q9BQ50 (exonucleasa 2 de reparación de tres primas humana) en el PDBe-KB .
  • Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q9R1A9 (exonucleasa 2 de reparación de tres primos del ratón) en el PDBe-KB .
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