La proteína WWC2 (que contiene el dominio WW y C2 ) está codificada en humanos por el gen WWC2 (4q35.1). Aunque se desconoce su función, se ha sugerido que podría desempeñar un papel en el cáncer.
Gene
Lugar
El gen humano WWC2 se encuentra en el cromosoma 4, en la banda 4q35.1. El gen se localiza en la cadena positiva del cromosoma y tiene una longitud de 8822 pares de bases. Contiene 23 exones. El locus WWC2 es bastante complejo y parece producir varias proteínas sin solapamiento de secuencia [ 5 ].
Alias
Un alias común del gen es BH3-Only Member B (BOMB) [ 6 ]
Homología
Parálogos
En humanos se encuentran dos parálogos de WWC2: WWC1 y WWC3. WWC1 se localiza en el cromosoma 5 y es un probable regulador de la vía de señalización Hippo , que participa en la supresión tumoral al restringir la proliferación y promover la apoptosis. [ 7 ] WWC3 se localiza en el cromosoma X y se desconoce gran parte de su función.
Ortólogos
El gen WWC2 está altamente conservado en Mammalia , Aves , Reptilia y Amphibia , así como en el raro celacanto , que está más emparentado con los peces pulmonados, los reptiles y los mamíferos que con los peces de aletas radiadas. El gen WWC2 también está conservado en algunos Actinopterygii , Gastropoda y Bivalvia . Sin embargo, no está bien conservado en Insecta .
Proteína
Secuencia primaria
El gen codifica una proteína también llamada WWC2, que tiene 1192 aminoácidos de longitud. El peso molecular de la proteína es de 133,9 kilodaltons. [ 8 ] La proteína es rica en serina y no presenta grupos de carga, segmentos hidrofóbicos ni dominios transmembrana. El punto isoeléctrico es 5,23800. [ 9 ]
Dominios y motivos
WWC2 pertenece a la familia de proteínas WWC [ 10 ] , la cual consta de un dominio WW y un dominio C2 . WWC2 contiene dos dominios WW y un dominio C2. Además, contiene dos dominios de función desconocida, DUF342 y DUF444. Presenta una cremallera de leucina en la posición 854.
Modificaciones postraduccionales
Se predice que la proteína WWC2 está altamente fosforilada . [ 11 ] Se predicen 89 sitios de fosforilación de serina , 17 sitios de fosforilación de treonina y 11 sitios de fosforilación de tirosina . Estas cifras fueron relativamente consistentes en proteínas ortólogas.
También se predice que las quinasas de proteínas activadas por mitógenos p38 y la glucógeno sintasa quinasa 3 se unen en la posición T3, y la caseína quinasa 2 se une en las posiciones S13 y T50. [ 12 ]
Expresión
Expresión
WWC2 se expresa a niveles bajos y es específica de los tejidos del útero, la tiroides, los pulmones y el hígado. Se ha observado que la expresión de WWC2 aumenta durante las etapas de blastocisto y feto del desarrollo.
Variantes de transcripción
Existen muchas variantes de transcripción para WWC2. A continuación se enumeran aquellas que modifican un residuo de aminoácido altamente conservado, o que rodean un residuo de aminoácido altamente conservado:
Proteínas que interactúan
Factores de transcripción
A continuación se muestran los factores de transcripción con las puntuaciones de matriz más altas que se unen a secuencias dentro del promotor (ID GXP_1499160):
- STAT (transductor de señal y activador de la transcripción)
- Caja TATA muscular
- NOLF (factor olfativo específico de la neurona)
- XCPE (elemento promotor central del gen X 1)
- CTCF (factor de unión a CCCTC)
- HDBP ( región reguladora del gen de la enfermedad de Huntington )
- OCT1 (proteína de unión al octámero)
- E2FF ( E2F - regulador del ciclo celular activador de myc )
- ZF57 (proteína 57 con dedo de zinc y dominio KRAB)
- ZF07 ( factor de transcripción 7 con dedo de zinc Cys 2 His 2 )
- EGRF (proteína inducida por el factor de crecimiento nervioso/EGR)
- CDEF (elemento dependiente del ciclo celular - sitio de unión de CDF-1)
- AP2F (proteína activadora 2)
Proteínas
Entre las posibles proteínas que interactúan se incluyen: YWHAZ , YWHAQ , RUVBL1 y REPS1 .
Importancia clínica y bioinformación actual
Aunque la función exacta de WWC2 sigue siendo desconocida, se han investigado varias mutaciones y variantes de WWC2 en enfermedades. Se analizó una nueva mutación de sentido erróneo en WWC2 en el síndrome de piernas inquietas , pero no se identificó como un gen candidato. [ 13 ] Un estudio examinó el papel de Drosophila KIBRA (WWC1) en la cascada de señalización Expanded-Hippo-Warts, que está involucrada con la supresión de tumores . El estudio afirmó que la aberración del número de copias, la translocación y las mutaciones puntuales de WWC2, así como otros genes, deberían investigarse más en cánceres humanos. [ 14 ] WWC2 alias, BOMB, fue investigado en una subvención que sugiere que BOMB, junto con otros dos genes ( APOL6 y APOL1 ) promovió la muerte celular en células HCT116 nulas para p53 .
Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000151718 – Ensembl , mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000031563 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- ↑ AceView. NCBI. Homo sapiens WWC2. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/IEB/Research/Acembly/av.cgi?db=human&term=WWC2&submit=Go
- ↑ Tarjetas genéticas. WWC2. Homo sapiens. https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=WWC2&search=wwc2
- ↑ Tarjetas genéticas. KIBRA. Homo Sapiens. https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=WWC1
- ↑ Entorno de trabajo SDSC. Programa SAPS. WWC2. Homo sapiens
- ↑ Entorno de trabajo SDSC. Programa PI. WWC2. Homo sapiens
- ^ Wennmann DO, Schmitz J, Wehr MC, Krahn MP, Koschmal N, Gromnitza S, Schulze U, Weide T, Chekuri A, Skryabin BV, Gerke V, Pavenstädt H, Duning K, Kremerskothen J (2014). "Los hechos evolutivos y moleculares vinculan la familia de proteínas WWC con la señalización del hipopótamo" . Biología Molecular y Evolución . 31 (7): 1710– 23. doi : 10.1093/molbev/msu115 . PMID 24682284 .
- ↑ ExPASy. Programa NetPhos 2.0. http://www.cbs.dtu.dk/cgi-bin/webface2.fcgi?jobid=5341A6B500000A4BB89D0F8C&wait=20
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- ↑ Weissbach A, Siegesmund K, Brüggemann N, Schmidt A, Kasten M, Pichler I, Muhle H, Lohmann E, Lohnau T, Schwinger E, Hagenah J, Stephani U, Pramstaller PP, Klein C, Lohmann K (noviembre de 2012). "Secuenciación del exoma en una familia con síndrome de piernas inquietas". Movement Disorders . 27 (13): 1686– 9. doi : 10.1002/mds.25191 . PMID 23192925. S2CID 11969320 .
- ↑ Katoh M (diciembre de 2012). "Función y genómica del cáncer de los genes de la familia FAT (revisión)" . International Journal of Oncology . 41 (6): 1913–8 . doi : 10.3892/ijo.2012.1669 . PMC 3583642. PMID 23076869 .
- Genes en el cromosoma 4 humano