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Articulo de referencia

Lysobacterales

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Las Lysobacterales son un orden bacteriano dentro de las Gammaproteobacterias . Son uno de los grupos más grandes de fitopatógenos bacterianos , albergando especies como Xanthomonas citri , Xanthomonas euvesicatoria , Xanthomonas oryzae y Xylella fastidiosa . [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] Estas bacterias afectan plantas de importancia agrícola, incluyendo tomates, plátanos, cítricos, arroz y café. Las especies dentro del género Stenotrophomonas son patógenos oportunistas multirresistentes a los fármacos que son responsables de infecciones nosocomiales en pacientes inmunodeficientes . [ 7 ] [ 8 ]

Características

Las Lysobacterales son bacterias gramnegativas , catalasa positivas, aerobias obligadas que no forman esporas . [ 9 ] Los miembros de este orden son bacilos rectos que carecen de prostecas . Si bien algunos miembros son inmóviles, otras especies dentro del orden son móviles mediante flagelos . Stenotrophomonas es el único género capaz de reducir nitratos dentro de las Lysobacterales.

Taxonomía

Los Lysobacterales constan de 28 géneros válidamente nombrados entre dos familias: Lysobacteraceae y Rhodanobacteraceae . [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] Lysobacteraceae consta de 13 géneros, mientras que Rhodanobacteraceae consta de 14 géneros. Las familias se pueden distinguir entre sí en función de indels característicos conservados que se encuentran entre una variedad de proteínas, específicas para cada familia. [ 11 ] Estos indels son paralelos al análisis filogenómico que revela dos clados distintos que parecen ser evolutivamente divergentes.

Xanthomonadales y Xanthomonadaceae son sinónimos de Lysobacterales y Lysobacteraceae , respectivamente. [ 11 ] [ 13 ]

Posición filogenética

Los Lysobacterales son divergentes tempranos de bacterias dentro de las Gammaproteobacterias , y a menudo se utilizan para enraizar árboles filogenéticos creados para la clase. [ 14 ] Hasta hace poco, el orden Xanthomonadales incluía las familias Xanthomonadaceae , Algiphilaceae , Solimonadaceae , Nevskiaceae y Sinobacteraceae . Sin embargo, no se encontraron firmas moleculares que incluyeran a todas las familias. [ 11 ] Los organismos fueron reorganizados taxonómicamente de manera que Lysobacterales incluyó Lysobacteraceae , que luego se dividió en dos familias. La división fue de acuerdo con los CSI que se encontraron específicamente para todos los miembros del orden Lysobacterales enmendado, lo que proporciona apoyo a la taxonomía actualmente aceptada. Todas las demás especies fueron transferidas a Nevskiales , que no compartía CSI con Lysobacterales, pero siguen siendo parientes cercanos dentro de las Gammaproteobacterias . [ 11 ] Cardiobacteriales , Chromatiales , Methylococcales , Legionellales y Thiotrichales también son órdenes de ramificación profunda que son vecinos filogenéticos de los miembros de Lysobacterales y Nevskiales . [ 11 ] [ 14 ] El orden Nevskiales alberga una sola familia ( Salinisphaeraceae ) y seis géneros: Alkanibacter , Fontimonas , Hydrocarboniphaga , Nevskia , Solimonas y Steroidobacter . [ 11 ] Wohlfahrtiimonas chitiniclastica e Ignatzschineria larvae son dos especies que históricamente han sido aceptadas como miembros de la familia Xanthomonadaceae . Sin embargo, no comparten firmas conservadas con la familia, ni con el orden Xanthomonodales. [ 11 ] Estas especies forman una ramificación profunda dentro de las vecinas Gammaproteobacteria , y son monofiléticas con los miembros de Cardiobacteriales . Por lo tanto, estas especies están actualmente catalogadas como incertae sedis .

Filogenia

La taxonomía actualmente aceptada se basa en el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [ 10 ]

Referencias

  1. 1 2 orden/entrada de Lysobacterales en LPSN ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (1 de noviembre de 2020). "La lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) se traslada a la DSMZ" . Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 70 (11): 5607– 5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
  2. ↑ da Silva AC, Ferro JA, Reinach FC, et al. (2002). "Comparación de los genomas de dos patógenos Xanthomonas con diferentes especificidades de hospedador". Nature . 417 (6887): 459– 463. Bibcode : 2002Natur.417..459D . doi : 10.1038/417459a . PMID 12024217 . S2CID 4302762 .   
  3. ↑ Van Sluys MA, de Oliveira MC, Monteiro-Vitorello CB, et al. (2003). "Análisis comparativos de las secuencias genómicas completas de cepas de Xylella fastidiosa causantes de la enfermedad de Pierce y la clorosis variegada de los cítricos" . J Bacteriol . 185 (3): 1018–26 . doi : 10.1128/JB.185.3.1018-1026.2003 . PMC 142809. PMID 12533478 .   
  4. ↑ Lee BM, Park YJ, Park DS, et al. (2005). "La secuencia del genoma de Xanthomonas oryzae patovar oryzae KACC10331, el patógeno de la tizón bacteriana del arroz" . Nucleic Acids Res . 33 (2): 577– 586. doi : 10.1093 / nar/gki206 . PMC 548351. PMID 15673718 .   
  5. ↑ Ryan RP, Vorholter F, Potnis N, et al. (2005). "Patogenómica de Xanthomonas: comprensión de las interacciones bacteria-planta". Nat Rev Microbiol . 9 (5): 344– 355. doi : 10.1038/nrmicro2558 . PMID 21478901 . S2CID 37510468 .   
  6. ↑ Chen J, Xie G, Han S, Chertkov O, Sims D, Civerolo EL (2010). "Secuencias del genoma completo de dos cepas de Xylella fastidiosa (M12 y M23) que causan la enfermedad de la quemadura de las hojas del almendro en California" . J Bacteriol . 192 (17): 4534. doi : 10.1128/JB.00651-10 . PMC 2937377. PMID 20601474 .  
  7. ↑ Crossman LC, Gould VC, Dow JM, et al. (2008). "El genoma completo, el análisis comparativo y funcional de Stenotrophomonas maltophilia revelan un organismo fuertemente protegido por determinantes de resistencia a fármacos" . Genome Biol . 9 (4): R74. doi : 10.1186 / gb-2008-9-4-r74 . PMC 2643945. PMID 18419807 .   
  8. ↑ Looney WJ, Narita M, Mühlemann K (2009). "Stenotrophomonas maltophilia: un patógeno humano oportunista emergente". Lancet Infect Dis . 9 (5): 312– 323. doi : 10.1016/S1473-3099(09)70083-0 . PMID 19393961 . 
  9. ↑ Saddler GS, Bradbury JF (2005) Orden III. Xanthomonadales ord. nov. En: Manual de Bacteriología Sistemática de Bergey. págs. 63-122. Eds Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity GM, Boone, Vos P, Goodfellow M, Rainey FA, ​​Schleifer KH Springer-: Austin.
  10. 1 2 "Lysobacterales" . Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 20 de octubre de 2025 .
  11. 1 2 3 4 5 6 7 8 Naushad S, Adeolu M, Wong S, Sohail M, Schellhorn HE, Gupta RS (2015). "Un marco taxonómico basado en marcadores filogenómicos y moleculares para el orden Xanthomonadales: propuesta para transferir las familias Algiphilaceae y Solimonadaceae al orden Nevskiales ord. nov. y crear una nueva familia dentro del orden Xanthomonadales, la familia Rhodanobacteraceae fam. nov., que contiene el género Rhodanobacter y sus parientes más cercanos". Antonie van Leeuwenhoek . 107 (2): 467– 485. doi : 10.1007/s10482-014-0344-8 . PMID 25481407 . 
  12. ↑ Oren A, Garrity GM (2015). "Lista de nombres nuevos y nuevas combinaciones publicadas previamente de manera efectiva, pero no válida". Int J Syst Evol Microbiol . 65 (7): 2017– 2025. doi : 10.1099/ijs.0.000317 .
  13. ↑ Christensen P, Cook F (1978). "Lysobacter, un nuevo género de bacterias deslizantes no fructíferas con una alta proporción de bases" . Int J Syst Evol Microbiol . 28 (3): 367– 393. doi : 10.1099/00207713-28-3-367 .
  14. ^ Cutiño -Jiménez AM, Martins-Pinheiro M, Lima WC, Martín-Tornet A, Morales OG, Menck CF (2010). "Colocación evolutiva de Xanthomonadales basada en secuencias distintivas de proteínas conservadas" . Mol Phylogenet Evol . 54 (2): 524– 34. doi : 10.1016/j.ympev.2009.09.026 . PMID 19786109 .