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A1CF

El factor de complementación APOBEC1 es una proteína que en humanos está codificada por el gen A1CF . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Gene En este locus se produce un empalme alternativo y se...

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El factor de complementación APOBEC1 es una proteína que en humanos está codificada por el gen A1CF . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

Gene

En este locus se produce un empalme alternativo y se han descrito tres variantes de transcripción de longitud completa, que codifican tres isoformas distintas. Se ha observado un empalme adicional, pero no se ha determinado si estas variantes son de longitud completa. [ 7 ]

Función

El ARNm de la apolipoproteína B de mamíferos sufre una desaminación de C a U específica del sitio , mediada por un complejo enzimático multicomponente que contiene un núcleo mínimo compuesto por APOBEC1 y un factor de complementación codificado por este gen. [ 8 ] El producto génico tiene tres motivos de reconocimiento de ARN no idénticos y pertenece a la familia hnRNP R de proteínas de unión a ARN. Se ha propuesto que este factor de complementación funciona como una subunidad de unión a ARN y acopla APOBEC1 para desaminar la citidina corriente arriba . Los estudios sugieren que la proteína también podría estar involucrada en otros eventos de edición o procesamiento de ARN. [ 7 ]

Su eliminación produce letalidad en ratones. [ 9 ]

Interacciones

Se ha demostrado que A1CF interactúa con APOBEC1 , [ 10 ] [ 11 ] CUGBP2 , [ 12 ] y SYNCRIP . [ 13 ] [ 10 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000148584 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000052595 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Dance GS, Sowden MP, Cartegni L, Cooper E, Krainer AR, Smith HC (abril de 2002). "Dos proteínas esenciales para la edición del ARNm de la apolipoproteína B se expresan a partir de un solo gen mediante empalme alternativo" . J. Biol. Chem . 277 (15): 12703–9 . doi : 10.1074/jbc.M111337200 . PMID 11815617 . 
  6. ↑ Chester A, Scott J, Anant S, Navaratnam N (diciembre de 2000). "Edición de ARN: conversión de citidina a uridina en el ARNm de la apolipoproteína B". Biochim. Biophys. Acta . 1494 ( 1– 2): 1– 13. doi : 10.1016/S0167-4781(00)00219-0 . PMID 11072063 . 
  7. 1 2 3 "Gen Entrez: factor de complementación A1CF APOBEC1" .
  8. ↑ Henderson JO, Blanc V, Davidson NO (noviembre de 2001). "Aislamiento, caracterización y regulación del desarrollo del gen del factor de complementación (ACF) humano apobec-1". Biochim. Biophys. Acta . 1522 (1): 22– 30. doi : 10.1016/S0167-4781(01)00295-0 . PMID 11718896 . 
  9. ↑ Blanc V, Henderson JO, Newberry EP, Kennedy S, Luo J, Davidson NO (agosto de 2005). "La eliminación dirigida del gen del factor de complementación apobec-1 murino (acf) produce letalidad embrionaria" . Mol . Cell. Biol . 25 (16): 7260–9 . doi : 10.1128/MCB.25.16.7260-7269.2005 . PMC 1190267. PMID 16055734 .  
  10. 1 2 Blanc V, Navaratnam N, Henderson JO, Anant S, Kennedy S, Jarmuz A, Scott J, Davidson NO (marzo de 2001). "Identificación de GRY-RBP como una proteína de unión a ARN de apolipoproteína B que interactúa con apobec-1 y el factor de complementación de apobec-1 para modular la edición de C a U" . J. Biol. Chem . 276 (13): 10272–83 . doi : 10.1074/jbc.M006435200 . PMID 11134005 . 
  11. ↑ Mehta A, Kinter MT, Sherman NE, Driscoll DM (marzo de 2000). "Clonación molecular del factor de complementación apobec-1, una nueva proteína de unión a ARN involucrada en la edición del ARNm de la apolipoproteína B" . Mol . Cell. Biol . 20 (5): 1846– 54. doi : 10.1128/MCB.20.5.1846-1854.2000 . PMC 85365. PMID 10669759 .  
  12. ↑ Anant S, Henderson JO, Mukhopadhyay D, Navaratnam N, Kennedy S, Min J, Davidson NO (diciembre de 2001). "Nuevo papel de la proteína de unión a ARN CUGBP2 en la edición de ARN de mamíferos. CUGBP2 modula la edición de C a U del ARNm de la apolipoproteína B mediante la interacción con apobec-1 y ACF, el factor de complementación de apobec-1" . J. Biol. Chem . 276 (50): 47338–51 . doi : 10.1074/jbc.M104911200 . PMID 11577082 . 
  13. ↑ Lau PP, Chang BH, Chan L (abril de 2001). "La clonación de doble híbrido identifica una proteína de unión a ARN, GRY-RBP, como un componente del editosoma de apobec-1". Biochem. Biophys. Res. Commun . 282 (4): 977–83 . doi : 10.1006/bbrc.2001.4679 . PMID 11352648 . 

Lecturas adicionales

  • Mehta A, Kinter MT, Sherman NE, Driscoll DM (2000). "Clonación molecular del factor de complementación apobec-1, una nueva proteína de unión a ARN involucrada en la edición del ARNm de la apolipoproteína B" . Mol . Cell. Biol . 20 (5): 1846– 54. doi : 10.1128/MCB.20.5.1846-1854.2000 . PMC 85365. PMID 10669759 .  
  • Lellek H, Kirsten R, Diehl I, Apostel F, Buck F, Greeve J (2000). "Purificación y clonación molecular de un nuevo componente esencial del complejo enzimático de edición del ARNm de la apolipoproteína B" . J. Biol. Chem . 275 (26): 19848–56 . doi : 10.1074/jbc.M001786200 . PMID 10781591 . 
  • Yang Y, Sowden MP, Smith HC (2000). "Inducción de la edición de citidina a uridina en el ARNm de la apolipoproteína B citoplasmática mediante la sobreexpresión de APOBEC-1" . J. Biol. Chem . 275 (30): 22663–9 . doi : 10.1074/jbc.M910406199 . PMID 10833526 . 
  • Blanc V, Navaratnam N, Henderson JO, Anant S, Kennedy S, Jarmuz A, Scott J, Davidson NO (2001). "Identificación de GRY-RBP como una proteína de unión a ARN de la apolipoproteína B que interactúa con apobec-1 y el factor de complementación de apobec-1 para modular la edición de C a U" . J. Biol. Chem . 276 (13): 10272–83 . doi : 10.1074/jbc.M006435200 . PMID 11134005 . 
  • Harrington JJ, Sherf B, Rundlett S, Jackson PD, Perry R, ​​Cain S, Leventhal C, Thornton M, Ramachandran R, Whittington J, Lerner L, Costanzo D, McElligott K, Boozer S, Mays R, Smith E, Veloso N, Klika A, Hess J, Cothren K, Lo K, Offenbacher J, Danzig J, Ducar M (2001). "Creación de bibliotecas de expresión de proteínas a nivel genómico mediante activación aleatoria de la expresión génica". Nat . Biotechnol . 19 (5): 440– 5. doi : 10.1038/88107 . PMID 11329013. S2CID 25064683 .  
  • Lau PP, Chang BH, Chan L (2001). "La clonación de doble híbrido identifica una proteína de unión a ARN, GRY-RBP, como un componente del editosoma de apobec-1". Biochem. Biophys. Res. Commun . 282 (4): 977– 83. doi : 10.1006/bbrc.2001.4679 . PMID 11352648 . 
  • Blanc V, Henderson JO, Kennedy S, Davidson NO (2001). "La mutagénesis del factor de complementación apobec-1 revela dominios distintos que modulan la unión al ARN, la interacción proteína-proteína con apobec-1 y la complementación de la actividad de edición de ARN de C a U" . J. Biol. Chem . 276 (49): 46386–93 . doi : 10.1074/jbc.M107654200 . PMID 11571303 . 
  • Anant S, Henderson JO, Mukhopadhyay D, Navaratnam N, Kennedy S, Min J, Davidson NO (2001). "Nuevo papel de la proteína de unión a ARN CUGBP2 en la edición de ARN de mamíferos. CUGBP2 modula la edición de C a U del ARNm de la apolipoproteína B mediante la interacción con apobec-1 y ACF, el factor de complementación de apobec-1" . J. Biol. Chem . 276 (50): 47338–51 . doi : 10.1074/jbc.M104911200 . PMID 11577082 . 
  • Henderson JO, Blanc V, Davidson NO (2001). "Aislamiento, caracterización y regulación del desarrollo del gen del factor de complementación (ACF) humano apobec-1". Biochim. Biophys. Acta . 1522 (1): 22– 30. doi : 10.1016/S0167-4781(01)00295-0 . PMID 11718896 . 
  • Xu XR, Huang J, Xu ZG, Qian BZ, Zhu ZD, Yan Q, Cai T, Zhang X, Xiao HS, Qu J, Liu F, Huang QH, Cheng ZH, Li NG, Du JJ, Hu W, Shen KT, Lu G, Fu G, Zhong M, Xu SH, Gu WY, Huang W, Zhao XT, Hu GX, Gu JR, Chen Z, Han ZG (2001). "Perspectiva sobre la carcinogénesis hepatocelular a nivel transcriptómico mediante la comparación de los perfiles de expresión génica del carcinoma hepatocelular con los del hígado no canceroso correspondiente" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (26): 15089– 94. Bibcode : 2001PNAS...9815089X . doi : 10.1073/pnas.241522398 . PMC 64988 . PMID 11752456 .  
  • Mehta A, Driscoll DM (2002). "Identificación de dominios en el factor de complementación apobec-1 necesarios para la unión al ARN y la edición del ARNm de la apolipoproteína B" . RNA . 8 (1): 69– 82. doi : 10.1017/S1355838202015649 . PMC 1370230. PMID 11871661 .  
  • Chester A, Somasekaram A, Tzimina M, Jarmuz A, Gisbourne J, O'Keefe R, Scott J, Navaratnam N (2003). "El complejo de edición de ARNm de la apolipoproteína B realiza un ciclo multifuncional y suprime la degradación mediada por codones de terminación prematura" . EMBO J. 22 ( 15): 3971–82 . doi : 10.1093/emboj/cdg369 . PMC 169042. PMID 12881431 .  
  • Blanc V, Kennedy S, Davidson NO (2003). "Una nueva señal de localización nuclear en el dominio auxiliar del factor de complementación apobec-1 regula la importación y el transporte nucleocitoplasmático" . J. Biol. Chem . 278 (42): 41198–204 . doi : 10.1074/jbc.M302951200 . PMID 12896982 . 
  • Xie K, Sowden MP, Dance GS, Torelli AT, Smith HC, Wedekind JE (2004). "La estructura de una desaminasa de edición de ARN de levadura proporciona información sobre el plegamiento y la función de la desaminasa inducida por activación y APOBEC-1" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (21): 8114–9 . Bibcode : 2004PNAS..101.8114X . doi : 10.1073 / pnas.0400493101 . PMC 419566. PMID 15148397 .  

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