SINCRIPA

La proteína SYNCRIP (proteína citoplasmática de interacción con ARN que se une a la sinaptotagmina ), también conocida como ribonucleoproteína nuclear heterogénea (hnRNP) Q o proteína 1 asociada a NS1 (NSAP-1) , es una proteína que en humanos está codificada por el gen SYNCRIP . ^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]} Como su nombre lo indica, SYNCRIP se localiza predominantemente en el citoplasma . ^{[ 8 ]} Está conservada evolutivamente en eucariotas y participa en varias vías celulares y patológicas, especialmente en el desarrollo neuronal y muscular. ^{[ 9 ]} En humanos, existen tres isoformas , todas las cuales se asocian in vitro con pre- ARNm , intermediarios de empalme de ARNm y complejos de ARNm-proteína maduros, incluyendo el recambio de ARNm. ^{[ 10 ]}

Este gen pertenece a la subfamilia de ribonucleoproteínas nucleares heterogéneas (hnRNP), que se expresan de forma ubicua. Las hnRNP son proteínas de unión al ARN y forman complejos con el ARN nuclear heterogéneo (hnRNA).

SYNCRIP está compuesto por un haz de hélices N-terminal conocido como el "dominio ácido" (AcD), seguido de tres motivos de reconocimiento de ARN (RRM) secuenciales separados por enlaces cortos, y un dominio rico en arginina y glicina llamado " caja RGG " en el extremo C-terminal. Los RRM desempeñan un papel en la unión al ARN, mientras que el AcD participa en interacciones proteína-proteína (PPI). La caja RGG está involucrada tanto en la unión al ARN como en las PPI. El AcD es exclusivo de SYNCRIP y su homólogo nuclear hnRNP R , y está involucrado en interacciones con APOBEC-1. ^{[ 11 ]} Es un dominio autoensamblable, totalmente helicoidal, de cinco hélices α, que contiene una gran cavidad hidrofóbica y un área de superficie cargada positivamente como posibles sitios de interacción, además de áreas de superficie cargadas negativamente, sin homólogos estructurales en ninguna otra proteína conocida. ^{[ 11 ] [ 12 ]} El núcleo hidrofóbico está compuesto principalmente por residuos de leucina , mientras que la superficie está compuesta por 15 residuos ácidos y 13 residuos básicos que juntos forman una vasta red de interacción. ^{[ 12 ]} El AcD está unido a RRM1 por una unidad α- β -β única, creando un “pliegue RRM extendido” mediado principalmente por interacciones hidrofóbicas. ^{[ 12 ]} La caja RGG es una región no estructurada que contiene numerosas repeticiones Arg-Gly-Gly con un espaciado bastante regular. Hay ocho de estas repeticiones en SYNCRIP. Este dominio puede unirse a proteínas y ARN de forma independiente, incluso si los otros dominios de unión no están presentes. ^{[ 13 ]} Aunque este dominio es rico en contenido de arginina, no tiene ningún grupo rico en arginina como podría observarse en las RBP ricas en arginina habituales. ^{[ 13 ]}

La isoforma 1 es un componente del complejo editosoma del ARNm de la apolipoproteína B (apoB) y modula la edición postranscripcional de ARN de C a U del ARNm de apoB mediante la unión al péptido catalítico 1 de la enzima de edición del ARNm de apoB (APOBEC-1), al factor de complementación de APOBEC-1 (ACF) o directamente al propio ARN. ^{[ 6 ]} La isoforma 1 también está implicada con otras RBP en la desadenilación citoplasmática y la interacción traslacional y de degradación del ARNm de c-Fos mediada por el dominio determinante de la inestabilidad de la región codificante principal (mCRD). ^{[ 14 ]}

La función de la isoforma 2 no se comprende con tanta claridad.

La isoforma 3 participa en el transporte de ARNm mediado por vesículas citoplasmáticas a través de la interacción con sinaptotagminas (SYTs). ^{[ 8 ]} Esta isoforma también es un componente del complejo GAIT ( inhibidor de la traducción activado por interferón gamma, IFNγ ) en humanos, que media la inhibición de la traducción selectiva de transcritos inducida por IFNγ en procesos inflamatorios. ^{[ 15 ]} Tras la activación por IFN-γ, SYNCRIP se ensambla en el complejo GAIT, que se une a elementos GAIT que contienen estructuras de tallo-bucle en la región 3' no traducida (3'-UTR) de diversos ARNm inflamatorios y suprime su traducción, pero esto no parece ser esencial para la función general del complejo GAIT. ^{[ 15 ]}

Se ha demostrado que SYNCRIP interactúa con ACF , ^{[ 6 ] [ 16 ]} APOBEC1 , ^{[ 6 ]} SYT7 , ^{[ 8 ]} y SYT9 . ^{[ 8 ]}