La citidina desaminasa inducida por activación , también conocida como AICDA , AID y desaminasa de citosina de ADN monocatenario , es una enzima de 24 kDa codificada en humanos por el gen AICDA . [ 5 ] Crea mutaciones en el ADN mediante la desaminación de la base citosina , que la convierte en uracilo (reconocido como timina ). En otras palabras, transforma un par de bases C:G en un desajuste U:G. [ 6 ] AID pertenece a la familia APOBEC . [ 7 ]
La maquinaria de replicación del ADN de la célula reconoce la U como una T, por lo que el par de bases C:G se convierte en un par de bases T:A. Durante el desarrollo del centro germinal de las células B , la reparación del ADN propensa a errores tras la acción de AID también genera otros tipos de mutaciones, como C:G a A:T. En las células B de los ganglios linfáticos , AID provoca mutaciones que producen diversidad de anticuerpos, pero ese mismo proceso mutacional también puede conducir al linfoma de células B. [ 8 ]
Función
Este gen codifica una desaminasa de edición de ADN que pertenece a la familia de las citidina desaminasas . La proteína participa en la hipermutación somática, la conversión génica y la recombinación de cambio de clase de los genes de inmunoglobulina en las células B del sistema inmunitario. [ 5 ] [ 9 ]
Actualmente se considera que AID es el principal regulador de la diversificación de anticuerpos secundarios . Está involucrado en el inicio de tres procesos distintos de diversificación de inmunoglobulinas (Ig):
- Hipermutación somática (HSM), en la que los genes de los anticuerpos se mutan mínimamente para generar una biblioteca de variantes de anticuerpos, algunas de las cuales tienen mayor afinidad por un antígeno en particular que cualquiera de sus variantes cercanas.
- Recombinación de cambio de clase (CSR), en la que las células B cambian su expresión de IgM a IgG u otros tipos inmunes.
- La conversión génica somática (CGS) es un proceso que provoca mutaciones en los genes de anticuerpos de pollos, cerdos y algunos otros vertebrados.
Se ha demostrado in vitro que AID es activa en ADN monocatenario, [ 10 ] y que requiere transcripción activa para ejercer su actividad desaminante. [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] Se sospecha la participación de factores reguladores cis , ya que la actividad de AID es varios órdenes de magnitud mayor en la región "variable" de la inmunoglobulina que en otras regiones del genoma que se sabe que están sujetas a la actividad de AID. Esto también es cierto para construcciones reporteras artificiales y transgenes que se han integrado en el genoma . Una publicación reciente sugiere que la alta actividad de AID en algunos objetivos no inmunoglobulina se logra cuando la transcripción en hebras de ADN opuestas converge debido a la actividad de superpotenciadores . [ 14 ]
Recientemente, se ha implicado a AICDA en la desmetilación activa del ADN. AICDA puede desaminar la 5-metilcitosina , que luego puede ser reemplazada por citosina mediante reparación por escisión de bases. [ 15 ]
Mecanismo
Se cree que AID inicia la hipermutación somática (SHM) mediante un mecanismo de múltiples pasos. AID desamina la citosina en el ADN diana. Las citosinas ubicadas dentro de motivos de puntos calientes se desaminan preferentemente (motivos WRCY: W = adenina o timina, R = purina, C = citosina, Y = pirimidina, o el inverso RGYW: G = guanina). El desajuste U:G resultante (U = uracilo) está sujeto a uno de varios destinos. [ 9 ]
- El desajuste U:G se replica creando dos especies hijas, una que permanece sin mutar y otra que sufre una mutación de transición C => T. (U es análogo a T en el ADN y se trata como tal cuando se replica).
- El uracilo puede ser escindido por la uracilo-ADN glicosilasa (UNG), lo que da como resultado un sitio apurínico/apirimidínico .
- Este sitio abásico (o AP, apurínico / apirimidínico ) puede ser copiado por una ADN polimerasa de síntesis translesional como la ADN polimerasa eta , lo que da como resultado la incorporación aleatoria de cualquiera de los cuatro nucleótidos , es decir, A, G, C o T.
- Este sitio abásico también puede ser escindido por la endonucleasa AP (APE), creando una ruptura en el esqueleto de desoxirribosa fosfato . Esta ruptura puede dar lugar a una reparación normal del ADN o, si se producen dos rupturas de este tipo, una en cada hebra, puede formarse una ruptura de doble hebra escalonada (DSB). Se cree que la formación de estas DSB en las regiones de conmutación o en la región variable de Ig puede conducir a CSR o SGC, respectivamente.
- El desajuste U:G también puede ser reconocido por la maquinaria de reparación de errores de apareamiento del ADN (MMR), específicamente por el complejo MutSα(alfa). MutSα es un heterodímero compuesto por MSH2 y MSH6 . Este heterodímero es capaz de reconocer principalmente distorsiones de una sola base en la cadena principal del ADN, consistentes con los desajustes U:G. Se cree que este reconocimiento conduce al procesamiento del ADN mediante actividad exonucleolítica para exponer una región de cadena simple de ADN, seguida de la actividad de la ADN polimerasa propensa a errores para rellenar el hueco. Estas polimerasas propensas a errores introducen mutaciones adicionales aleatoriamente a lo largo del hueco de ADN. Esto permite la generación de mutaciones no solo en el par C:G al que se dirige AID, sino también en pares de bases cercanos (independientemente de las bases que contengan originalmente).
El nivel de actividad de AID en las células B está estrictamente controlado mediante la modulación de la expresión de AID. AID es inducida por los factores de transcripción TCF3 (E47), HoxC4 , Irf8 y Pax5 , e inhibida por PRDM1 (Blimp1) e Id2 . [ 16 ] A nivel de regulación postranscripcional, la expresión de AID es silenciada por mir-155 , un pequeño microARN no codificante [ 17 ] [ 18 ] controlado por la señalización de la citocina IL-10 en las células B. [ 19 ]
Importancia clínica
Los defectos en este gen están asociados con el síndrome de hiper-IgM tipo 2. [ 20 ] En ciertas neoplasias hematológicas, como el linfoma folicular, la expresión persistente de AID se ha relacionado con la linfomagénesis. [ 21 ]
Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000111732 – Ensembl , mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000040627 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- 1 2 "Entrez Gene: Citidina desaminasa inducida por activación de AICDA" .
- ↑ Petersen-Mahrt SK, Harris RS, Neuberger MS (2002-07-04). "AID muta E. coli sugiriendo un mecanismo de desaminación del ADN para la diversificación de anticuerpos". Nature . 418 (6893): 99– 103. Bibcode : 2002Natur.418...99P . doi : 10.1038/nature00862 . ISSN 0028-0836 . PMID 12097915 . S2CID 4388160 .
- ↑ "Q9GZX7 (AICDA_HUMAN)" . Consultado el 26 de enero de 2013 .
- ↑ Lenz G, Staudt LM (abril de 2010). "Linfomas agresivos" . The New England Journal of Medicine . 362 (15): 1417– 1429. doi : 10.1056/NEJMra0807082 . PMC 7316377. PMID 20393178 .
- 1 2 Sheppard EC, Morrish RB, Dillon MJ, Leyland R, Chahwan R (2018). "Modificaciones epigenómicas que median la maduración de anticuerpos" . Frontiers in Immunology . 9 355. doi : 10.3389/fimmu.2018.00355 . PMC 5834911. PMID 29535729 .
- ↑ Bransteitter R, Pham P, Scharff MD, Goodman MF (1 de abril de 2003). "La citidina desaminasa inducida por activación desamina la desoxicitidina en el ADN monocatenario, pero requiere la acción de la RNasa" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 100 ( 7): 4102– 4107. Bibcode : 2003PNAS..100.4102B . doi : 10.1073/pnas.0730835100 . PMC 153055. PMID 12651944 .
- ↑ Chaudhuri J, Tian M, Khuong C, Chua K, Pinaud E, Alt FW (17 de abril de 2003). "Desaminación del ADN dirigida a la transcripción por la enzima de diversificación de anticuerpos AID". Nature . 422 ( 6933): 726– 730. Bibcode : 2003Natur.422..726C . doi : 10.1038/nature01574 . PMID 12692563. S2CID 771802 .
- ↑ Sohail A, Klapacz J, Samaranayake M, Ullah A, Bhagwat AS (15 de junio de 2003). "La citidina desaminasa inducida por activación humana causa desaminaciones de C a U dependientes de la transcripción y con sesgo de cadena" . Nucleic Acids Research . 31 (12): 2990– 2994. doi : 10.1093/nar/gkg464 . PMC 162340. PMID 12799424 .
- ↑ Ramiro AR, Stavropoulos P, Jankovic M, Nussenzweig MC (mayo de 2003). "La transcripción mejora la desaminación de citidina mediada por AID al exponer ADN monocatenario en la hebra no molde". Nature Immunology . 4 (5): 452– 456. doi : 10.1038/ni920 . PMID 12692548. S2CID 11431823 .
- ↑ Meng FL, Du Z, Federation A, Hu J, Wang Q, Kieffer-Kwon KR, et al. (dic. 2014). " La transcripción convergente en superpotenciadores intragénicos apunta a la inestabilidad genómica iniciada por AID" . Cell . 159 (7): 1538–1548 . doi : 10.1016/j.cell.2014.11.014 . PMC 4322776. PMID 25483776 .
- ↑ Morgan HD, Dean W, Coker HA, Reik W, Petersen-Mahrt SK (dic. 2004). "La citidina desaminasa inducida por activación desamina la 5-metilcitosina en el ADN y se expresa en tejidos pluripotentes" . Journal of Biological Chemistry . 279 (50): 52353– 52360. doi : 10.1074/jbc.M407695200 . PMID 15448152 .
- ↑ Xu Z, Pone EJ, Al-Qahtani A, Park SR, Zan H, Casali P (2007-01-01). "Regulación de la expresión de aicda y la actividad de AID: relevancia para la hipermutación somática y la recombinación de ADN de cambio de clase" . Critical Reviews in Immunology . 27 (4): 367– 397. doi : 10.1615/critrevimmunol.v27.i4.60 . PMC 2994649. PMID 18197815 .
- ↑ Dorsett Y, McBride KM, Jankovic M, Gazumyan A, Thai TH, Robbiani DF, et al. (mayo de 2008). "El microARN-155 suprime la translocación de Myc-Igh mediada por la citidina desaminasa inducida por activación" . Immunity . 28 (5): 630– 638. doi : 10.1016/j.immuni.2008.04.002 . PMC 2713656. PMID 18455451 .
- ↑ Teng G, Hakimpour P, Landgraf P, Rice A, Tuschl T, Casellas R, et al. (mayo de 2008). " El microARN-155 es un regulador negativo de la citidina desaminasa inducida por activación" . Immunity . 28 (5): 621– 629. doi : 10.1016/j.immuni.2008.03.015 . PMC 2430982. PMID 18450484 .
- ↑ Fairfax KA, Gantier MP, Mackay F, Williams BR, McCoy CE (enero de 2015). "IL-10 regula la expresión de Aicda a través de miR-155". Journal of Leukocyte Biology . 97 (1): 71– 78. doi : 10.1189/jlb.2A0314-178R . PMID 25381386. S2CID 9138000 .
- ↑ Luo Z, Ronai D, Scharff MD (octubre de 2004). "El papel de la citidina desaminasa inducida por activación en la diversificación de anticuerpos, la inmunodeficiencia y las neoplasias malignas de células B" . The Journal of Allergy and Clinical Immunology . 114 (4): 726–35 , cuestionario 736. doi : 10.1016/j.jaci.2004.07.049 . PMID 15480307 .
- ↑ Scherer F, Navarrete M, Bertinetti-Lapatki C, Boehm J, Schmitt-Graeff A, Veelken H (enero de 2016). "El linfoma folicular con cambio de isotipo muestra disociación entre la expresión de la citidina desaminasa inducida por activación y la hipermutación somática". Leukemia & Lymphoma . 57 (1): 151– 160. doi : 10.3109/10428194.2015.1037758 . PMID 25860234. S2CID 31242381 .
Lecturas adicionales
- Wedekind JE, Dance GS, Sowden MP, Smith HC (abril de 2003). "Edición de ARN mensajero en mamíferos: nuevos miembros de la familia APOBEC buscan roles en el negocio familiar". Trends in Genetics . 19 (4): 207–216 . doi : 10.1016/S0168-9525(03)00054-4 . PMID 12683974 .
- Bransteitter R, Sneeden JL, Allen S, Pham P, Goodman MF (junio de 2006). "Primero se necesita AID (deaminasa de citidina inducida por activación) para producir anticuerpos con cambio de isotipo de alta afinidad" . Journal of Biological Chemistry . 281 (25): 16833– 16836. doi : 10.1074/jbc.R600006200 . PMID 16624806 .
- Muto T, Muramatsu M, Taniwaki M, Kinoshita K, Honjo T (agosto de 2000). "Aislamiento, distribución tisular y localización cromosómica del gen de la citidina desaminasa inducida por activación (AID) humana". Genomics . 68 (1): 85– 88. doi : 10.1006/geno.2000.6268 . PMID 10950930 .
- Revy P, Muto T, Levy Y, Geissmann F, Plebani A, Sanal O, et al. (septiembre de 2000). "La deficiencia de citidina desaminasa inducida por activación (AID) causa la forma autosómica recesiva del síndrome de hiper-IgM (HIGM2)". Cell . 102 ( 5): 565– 575. doi : 10.1016/S0092-8674(00)00079-9 . hdl : 11655/14257 . PMID 11007475. S2CID 13092588 .
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (noviembre de 2000). "Clonación de ADN mediante recombinación sitio-específica in vitro" . Genome Research . 10 (11): 1788– 1795. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948. PMID 11076863 .
- Minegishi Y, Lavoie A, Cunningham-Rundles C, Bédard PM, Hébert J, Côté L, et al. (diciembre de 2000). "Mutaciones en la citidina desaminasa inducida por activación en pacientes con síndrome de hiperIgM". Inmunología clínica . 97 (3). Orlando, Florida: 203– 210. doi : 10.1006/clim.2000.4956 . PMID 11112359 .
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (septiembre de 2000). "Localización subcelular sistemática de nuevas proteínas identificadas mediante secuenciación de ADNc a gran escala" . EMBO Reports . 1 (3): 287– 292. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732. PMID 11256614 .
- Noguchi E, Shibasaki M, Inudou M, Kamioka M, Yokouchi Y, Yamakawa-Kobayashi K, et al. (septiembre de 2001). "Asociación entre un nuevo polimorfismo en el gen de la citidina desaminasa inducida por activación y el asma atópica y la regulación de los niveles séricos totales de IgE". The Journal of Allergy and Clinical Immunology . 108 (3): 382– 386. doi : 10.1067/mai.2001.117456 . PMID 11544457 .
- Martin A, Bardwell PD, Woo CJ, Fan M, Shulman MJ, Scharff MD (febrero de 2002). "La citidina desaminasa inducida por activación activa la hipermutación somática en hibridomas". Nature . 415 ( 6873): 802– 806. Bibcode : 2002Natur.415..802M . doi : 10.1038/nature714 . PMID 11823785. S2CID 4349496 .
- Rada C, Jarvis JM, Milstein C (mayo de 2002). "La proteína quimérica AID-GFP aumenta la hipermutación de los genes Ig sin evidencia de localización nuclear" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 99 (10): 7003–7008 . Bibcode : 2002PNAS...99.7003R . doi : 10.1073/pnas.092160999 . PMC 124518. PMID 12011459 .
- Petersen-Mahrt SK, Harris RS, Neuberger MS (julio de 2002). "AID muta E. coli sugiriendo un mecanismo de desaminación del ADN para la diversificación de anticuerpos". Nature . 418 ( 6893): 99– 103. Bibcode : 2002Natur.418...99P . doi : 10.1038/nature00862 . PMID 12097915. S2CID 4388160 .
- Dudley DD, Manis JP, Zarrin AA, Kaylor L, Tian M, Alt FW (julio de 2002). "Las deleciones de la región de cambio de clase de IgH interna son independientes de la posición y se ven potenciadas por la expresión de AID" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 99 (15): 9984–9989 . Bibcode : 2002PNAS...99.9984D . doi : 10.1073/pnas.152333499 . PMC 126611. PMID 12114543 .
- Martin A, Scharff MD (septiembre de 2002). "Hipermutación somática del transgén AID en células B y no B" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 99 (19): 12304–12308 . Bibcode : 2002PNAS...9912304M . doi : 10.1073 / pnas.192442899 . PMC 129440. PMID 12202747 .
- Greeve J, Philipsen A, Krause K, Klapper W, Heidorn K, Castle BE, et al. (mayo de 2003). "Expresión de la citidina desaminasa inducida por activación en linfomas no Hodgkin de células B humanas" . Blood . 101 (9): 3574– 3580. doi : 10.1182/blood-2002-08-2424 . PMID 12511417 .
- Oppezzo P, Vuillier F, Vasconcelos Y, Dumas G, Magnac C, Payelle-Brogard B, et al. (mayo de 2003). "Las células B de leucemia linfocítica crónica que expresan AID muestran disociación entre la recombinación de cambio de clase y la hipermutación somática" . Blood . 101 (10): 4029– 4032. doi : 10.1182/blood-2002-10-3175 . PMID 12521993 .
- Bransteitter R, Pham P, Scharff MD, Goodman MF (abril de 2003). "La citidina desaminasa inducida por activación desamina la desoxicitidina en el ADN monocatenario, pero requiere la acción de la RNasa" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 100 (7): 4102– 4107. Bibcode : 2003PNAS..100.4102B . doi : 10.1073/pnas.0730835100 . PMC 153055. PMID 12651944 .
- Zhu Y, Nonoyama S, Morio T, Muramatsu M, Honjo T, Mizutani S (marzo de 2003). "Síndrome de hiper-IgM tipo dos causado por mutación en la citidina desaminasa inducida por activación". Journal of Medical and Dental Sciences . 50 (1): 41– 46. PMID 12715918 .
- Sohail A, Klapacz J, Samaranayake M, Ullah A, Bhagwat AS (junio de 2003). "La citidina desaminasa inducida por activación humana causa desaminaciones de C a U dependientes de la transcripción y con sesgo de cadena" . Nucleic Acids Research . 31 (12): 2990– 2994. doi : 10.1093/nar/gkg464 . PMC 162340. PMID 12799424 .
Enlaces externos
- AICDA+proteína en los Encabezamientos de Materias Médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.
- Ubicación del genoma humano AICDA y página de detalles del gen AICDA en el navegador genómico de UCSC .
- Genes en el cromosoma 12 humano
- Enzimas
- CE 3.5.4
- Sistema inmunitario