APOBEC

APOBEC ("enzima de edición de ARNm de apolipoproteína B, polipéptido catalítico") es una familia de desaminasas de citidina conservadas evolutivamente .

Un mecanismo para generar diversidad proteica es la edición del ARNm . La familia de proteínas APOBEC realiza modificaciones en el ARNm mediante la desaminación de las bases de citidina a uracilo. El dominio N-terminal de las proteínas tipo APOBEC es el dominio catalítico, mientras que el dominio C-terminal es un dominio pseudocatalítico. Más específicamente, el dominio catalítico es un dominio de citidina desaminasa dependiente de zinc y es esencial para la desaminación de la citidina. El ion zinc con carga positiva en el dominio catalítico se siente atraído por la carga parcialmente negativa del ARN.

En el caso de APOBEC-1, el transcrito de ARNm de la apolipoproteína B intestinal se altera. La edición de ARN por APOBEC-1 requiere homodimerización y este complejo interactúa con proteínas de unión a ARN para formar el editosoma . ^{[ 2 ]} La estructura resultante interactúa con el codón CAA en el codón 2153 y lo desamina a UAA, produciendo un codón de parada que da como resultado un ARNm que se traduce en la isoforma apoB-48 intestinal . ^{[ 3 ]} Para otros transcritos modificados por APOBEC, como en la desaminación sitio-específica de un codón de parada CGA a UGA en el ARNm de la neurofibromatosis tipo 1 ( NF1 ), se predice que las proteínas resultantes también se truncan, aunque estos transcritos posiblemente se degradan. ^{[ 4 ]}

Las modificaciones de C a U no siempre resultan en el truncamiento de las proteínas. Por ejemplo, en humanos/mamíferos ayudan a proteger contra infecciones virales. ^{[ 5 ] [ 6 ]} Las proteínas de la familia APOBEC se expresan ampliamente en las células del sistema inmunitario innato humano. ^{[ 7 ]}

Estas enzimas, cuando están desreguladas, son una fuente importante de mutación en numerosos tipos de cáncer. ^{[ 5 ] [ 6 ] [ 8 ]} Cuando se activa la expresión de las proteínas de la familia APOBEC, las mutaciones accidentales en las células somáticas pueden conducir al desarrollo de oncogenes, células que tienen el potencial de convertirse en un tumor. Las proteínas APOBEC se expresan además en un intento de regular la formación de tumores. Esto convierte a las proteínas APOBEC en un marcador útil para el diagnóstico de tumores malignos. ^{[ 9 ]}

A 2013 review discussed the structural and biophysical aspects of APOBEC3 family enzymes.^[10] Many of the APOBEC protein features are described in the widely studied APOBEC3G's page.

Human genes encoding members of the APOBEC protein family include:

• APOBEC1
• APOBEC2
• APOBEC3A
• APOBEC3B
• APOBEC3C
• APOBEC3D ("APOBEC3E" now refers to this)
• APOBEC3F
• APOBEC3G
• APOBEC3H
• APOBEC4
• Activation-induced (cytidine) deaminase (AID)

• Gupta, A., Gazzo, A., Selenica, P. et al., La mutagénesis de APOBEC3 impulsa la resistencia a la terapia en el cáncer de mama , Nature Genetics (1 de abril de 2025) doi : 10.1038/s41588-025-02187-1