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Proteína 3 que contiene bromodominio

La proteína 3 que contiene bromodominio (BRD3), también conocida como proteína similar a RING3 (RING3L), es una proteína que en humanos está codificada por el gen BRD3 . [ 5 ] [...

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La proteína 3 que contiene bromodominio (BRD3), también conocida como proteína similar a RING3 (RING3L), es una proteína que en humanos está codificada por el gen BRD3 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Este gen se identificó en función de su homología con el gen que codifica la proteína RING3 ( BRD2 ) , una serina/treonina quinasa . El gen se localiza en 9q34 , una región que contiene varios genes del complejo mayor de histocompatibilidad (MHC).

Estructura

BRD3 pertenece a la familia de proteínas BET (Bomodominio y Motivo Extraterminal) . Al igual que otros miembros de la familia BET, contiene dos bromodominios homólogos en tándem y un motivo "extraterminal".

BRD3, al igual que BRD2, no posee un dominio C-terminal largo como las proteínas de la familia BET, BRD4 y BRDT . [ 8 ]

Función

Al igual que otros miembros de la familia de proteínas BET , BRD3 se asocia con residuos de lisina acetilados en histonas y factores de transcripción . [ 9 ] [ 10 ]

BRD3 ha sido implicada en la remodelación de nucleosomas en el contexto de la transcripción. [ 11 ] Además, se ha demostrado que BRD3 interactúa con moléculas de ARN y forma agregados de proteína-ARN. [ 12 ]

BRD2 y BRD3 realizan funciones celulares superpuestas. [ 13 ]

Importancia clínica

La translocación cromosómica de BRD3 con el gen NUT se ha relacionado con el carcinoma de la línea media NUT . [ 14 ] Los cánceres impulsados ​​por BRD3-NUT son histopatológicamente indistinguibles de los cánceres impulsados ​​por BRD4-NUT, probablemente porque estas translocaciones involucran la porción N-terminal que contiene el bromodominio de estas proteínas, que está altamente conservada.

La disminución de BRD3 ralentiza el crecimiento en modelos de cáncer, incluyendo el cáncer de próstata y el meduloblastoma . El efecto de la disminución de BRD3 es más leve que el de otras proteínas BET, BRD2 y BRD4, cuando se prueban de forma aislada. [ 15 ] [ 16 ] Los inhibidores de BET se dirigen a los bromodominios BET altamente conservados y desplazan simultáneamente a BRD2, BRD3 y BRD4 de la cromatina. La redundancia funcional entre BRD2 y BRD3 sugiere que su interrupción simultánea de estas proteínas puede ser más importante de lo que se aprecia al disminuir individualmente estas proteínas. [ 17 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000169925 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000026918 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ^ Nomura N, Nagase T, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Sato S, Seki N, Kawarabayasi Y, Ishikawa K, Tabata S (diciembre de 1995). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. II. Las secuencias codificantes de 40 nuevos genes (KIAA0041-KIAA0080) deducidas mediante análisis de clones de ADNc de la línea celular humana KG-1" . Investigación del ADN . 1 (5): 223– 9. doi : 10.1093/dnares/1.5.223 . PMID 7584044 . 
  6. ↑ Thorpe KL, Abdulla S, Kaufman J, Trowsdale J, Beck S (octubre de 1996). "Filogenia y estructura del gen RING3". Immunogenetics . 44 ( 5): 391– 6. doi : 10.1007/BF02602785 . PMID 8781126. S2CID 44613743 .  
  7. ↑ "Gen Entrez: BRD3 bromodominio que contiene 3" .
  8. ↑ Belkina AC, Denis GV (julio de 2012). " Correguladores del dominio BET en la obesidad, la inflamación y el cáncer" . Nature Reviews. Cancer . 12 (7): 465–77 . doi : 10.1038/nrc3256 . PMC 3934568. PMID 22722403 .  
  9. ↑ Gamsjaeger R, Webb SR, Lamonica JM, Billin A, Blobel GA, Mackay JP (julio de 2011). "Base estructural y especificidad del reconocimiento del factor de transcripción acetilado GATA1 por la proteína de bromodominio de la familia BET Brd3" . Biología molecular y celular . 31 (13): 2632–40 . doi : 10.1128/MCB.05413-11 . PMC 3133386. PMID 21555453 .  
  10. ↑ Lamonica JM, Deng W, Kadauke S, Campbell AE, Gamsjaeger R, Wang H, Cheng Y, Billin AN, Hardison RC, Mackay JP, Blobel GA (mayo de 2011). "La proteína de bromodominio Brd3 se asocia con GATA1 acetilada para promover su ocupación de cromatina en genes diana eritroides" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 108 (22): E159-68. doi : 10.1073/pnas.1102140108 . PMC 3107332. PMID 21536911 .  
  11. ↑ LeRoy G, Rickards B, Flint SJ (abril de 2008). "Las proteínas de doble bromodominio Brd2 y Brd3 acoplan la acetilación de histonas a la transcripción" . Molecular Cell . 30 (1): 51– 60. doi : 10.1016/j.molcel.2008.01.018 . PMC 2387119. PMID 18406326 .  
  12. ↑ Daneshvar K, Ardehali MB, Klein IA, Hsieh FK, Kratkiewicz AJ, Mahpour A; et al. (2020). " El lncRNA DIGIT y la proteína BRD3 forman condensados ​​separados por fases para regular la diferenciación del endodermo" . Nat Cell Biol . 22 (10): 1211– 1222. doi : 10.1038/s41556-020-0572-2 . PMC 8008247. PMID 32895492 .   {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  13. ↑ Stonestrom AJ, Hsu SC, Jahn KS, Huang P, Keller CA, Giardine BM, Kadauke S, Campbell AE, Evans P, Hardison RC, Blobel GA (febrero de 2015). " Funciones de las proteínas BET en la expresión génica eritroide" . Blood . 125 (18): 2825–34 . doi : 10.1182/blood-2014-10-607309 . PMC 4424630. PMID 25696920 .  
  14. ↑ French CA (2012). "Patogénesis del carcinoma de la línea media NUT". Annual Review of Pathology . 7 : 247–65 . doi : 10.1146/annurev-pathol-011811-132438 . PMID 22017582 . 
  15. ↑ Asangani IA, Dommeti VL, Wang X, Malik R, Cieslik M, Yang R, Escara-Wilke J, Wilder-Romans K, Dhanireddy S, Engelke C, Iyer MK, Jing X, Wu YM, Cao X, Qin ZS, Wang S, Feng FY, Chinnaiyan AM (junio de 2014). "Dirigiendo terapéuticamente las proteínas del bromodominio BET en el cáncer de próstata resistente a la castración" . Nature . 510 ( 7504): 278–82 . Bibcode : 2014Natur.510..278A . doi : 10.1038/nature13229 . PMC 4075966. PMID 24759320 .  
  16. ^ Tang Y, Gholamin S, Schubert S, Willardson MI, Lee A, Bandopadhayay P, Bergthold G, Masoud S, Nguyen B, Vue N, Balansay B, Yu F, Oh S, Woo P, Chen S, Ponnuswami A, Monje M, Atwood SX, Whitson RJ, Mitra S, Cheshier SH, Qi J, Beroukhim R, Tang JY, Wechsler-Reya R, Oro AE, Link BA, Bradner JE, Cho YJ (julio de 2014). "Dirección epigenética de la salida transcripcional de la vía Hedgehog mediante la inhibición del bromodominio BET" (PDF) . Medicina de la Naturaleza . 20 (7): 732– 40. doi : 10.1038/nm.3613 . PMC 4108909 . PMID 24973920 .  
  17. ↑ Stonestrom AJ, Hsu SC, Jahn KS, Huang P, Keller CA, Giardine BM, Kadauke S, Campbell AE, Evans P, Hardison RC, Blobel GA (abril de 2015). " Funciones de las proteínas BET en la expresión génica eritroide" . Blood . 125 (18): 2825–34 . doi : 10.1182/blood-2014-10-607309 . PMC 4424630. PMID 25696920 .  

Lecturas adicionales

  • Thorpe KL, Gorman P, Thomas C, Sheer D, Trowsdale J, Beck S (octubre de 1997). "Localización cromosómica, estructura genética y patrón de transcripción del gen ORFX, un homólogo del gen RING3 ligado al MHC". Gene . 200 ( 1–2 ): 177–83 . doi : 10.1016/S0378-1119(97)00415-0 . PMID 9373153 . 
  • Kaneko H, Inoue R, Teramoto T, Morimoto W, Isogai K, Kasahara K, Kondo N (2003). "Detección de los genes inducidos en linfocitos activados mediante visualización diferencial modificada". Journal of Investigational Allergology & Clinical Immunology . 12 (2): 86– 90. PMID 12371535 . 
  • Zhou M, Peng C, Nie XM, Zhang BC, Zhu SG, Yu Y, Li XL, Li GY (febrero de 2003). "[Expresión de las proteínas que interactúan con BRD7, BRD2 y BRD3, en tejidos de carcinoma nasofaríngeo]". AI Zheng = Aizheng = Revista China del Cáncer . 22 (2): 123– 7. PMID 12600283 . 
  • Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (agosto de 2004). "Caracterización a gran escala de las fosfoproteínas nucleares de células HeLa" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (33): 12130– 5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .  
  • Ishii H, Mimori K, Mori M, Vecchione A (julio de 2005). "Genes expresados ​​diferencialmente en la diferenciación endotelial". DNA and Cell Biology . 24 (7): 432–7 . doi : 10.1089/dna.2005.24.432 . PMID 16008511 . 
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (noviembre de 2006). " Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización" . Cell . 127 (3): 635–48 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573 .