Candida auris

Candida auris es una especie de hongo que crece como levadura . ^[1] Es una de las pocas especies del género Candida que causan candidiasis en humanos. A menudo, la candidiasis se adquiere en hospitales por pacientes con sistemas inmunológicos debilitados . C.  auris puede causar candidiasis invasiva ( fungemia ) en la que se infectan el torrente sanguíneo , el sistema nervioso central y los órganos internos . Ha atraído una gran atención debido a su resistencia a múltiples fármacos . El tratamiento también es complicado porque se identifica fácilmente de forma errónea como otras especies de Candida .

Candida auris fue descrita por primera vez en 2009, después de que fuera aislada del canal auditivo de una mujer japonesa de 70 años en el Hospital Geriátrico Metropolitano de Tokio (Japón). En 2011, Corea del Sur vio sus primeros casos de C.  auris causante de enfermedades . Según se informa, esta se extendió por Asia y Europa, y apareció por primera vez en los EE. UU. en 2013. ^[4]

El análisis de ADN de cuatro cepas distintas pero resistentes a los fármacos de Candida auris indica una divergencia evolutiva que tuvo lugar hace al menos 4.000 años, con un salto común entre las cuatro variedades hacia la resistencia a los fármacos posiblemente vinculado al uso generalizado de antimicóticos de tipo azol en la agricultura. ^[4] Sin embargo, las explicaciones sobre su surgimiento siguen siendo especulativas.

Identificada por primera vez en 2009, Candida auris es una especie de hongo ascomiceto del género Candida que crece como una levadura . ^[1] Su nombre proviene de la palabra latina para oreja, aus (genitivo auris ). ^[5] Forma colonias lisas, brillantes, de color gris blanquecino y viscosas en medios de crecimiento. Microscópicamente, las células tienen forma elipsoide. ^[1]

Candida auris ha atraído una mayor atención clínica debido a su resistencia a múltiples fármacos . ^{[6] [7] [4]}

In vitro, más del 90% de los aislados de C.  auris son resistentes al fluconazol ^{[8] [9]} y un rango de 3–73% de los aislados de C.  auris son resistentes al voriconazol , ^{[9] [10]} mientras que otros triazoles ( posaconazol , itraconazol e isavuconazol ) muestran una mejor actividad. ^{[8] [9] [10]}  De los aislados, se informó que entre el 13% y el 35% eran resistentes a la anfotericina B; ^{[8] [10]} sin embargo, la mayoría de los aislados son susceptibles a las equinocandinas . ^{[8] [9] [10]}

El tratamiento es complicado porque C.  auris se confunde fácilmente con varias otras especies de Candida . ^{[6] [7] [11] [12] El} Centro de Investigación y Política de Enfermedades Infecciosas de la Universidad de Minnesota^[actualizar] publicó un breve resumen de su relevancia clínica a partir de 2016 , comprensible para el público general . ^[13]

Según artículos publicados entre 2011 y 2016, la mortalidad de las personas con infecciones del torrente sanguíneo por C.  auris osciló entre el 30 y el 60 %. ^[14] Muchas de estas personas tenían otras enfermedades y afecciones graves (comorbilidades) que aumentaban su riesgo de muerte. ^[14]

En octubre de 2023, la Facultad de Medicina de la Universidad de Oporto publicó un estudio que demostró que el peróxido de hidrógeno es extremadamente eficaz para matar C. auris en las superficies de los hospitales, evitando su propagación. ^[15]

A partir de octubre de 2024 ^[actualizar]no existe una vacuna humana contra Candida auris . ^[16] Los experimentos con la vacuna NDV-3A han inmunizado con éxito a ratones contra el hongo. ^[17] La ​​vacuna también mejoró la eficacia protectora del fármaco antimicótico micafungina contra la infección por C. auris en el torrente sanguíneo del ratón. ^[18]

Se han publicado varios borradores de genomas a partir de la secuenciación del genoma completo . ^{[6] [19]} C.  auris tiene un tamaño de genoma de 12,3-12,5 Mb con un contenido de GC de 44,5-44,8%. ^{[6] [19]} Se encontró que el genoma de C.  auris codifica varios genes para la familia de transportadores ABC , una superfamilia facilitadora importante , que ayuda a explicar su resistencia a múltiples fármacos . ^[6] Su genoma también codifica familias de genes relacionados con la virulencia, como lipasas , transportadores de oligopéptidos , manosil transferasas y factores de transcripción que facilitan la colonización, la invasión y la adquisición de hierro. [6] Otro factor que contribuye a la resistencia a los antifúngicos es la presencia de un conjunto de genes que se sabe que están involucrados en la formación de biopelículas . [ ^{6 ]}

Se necesitan más estudios para determinar si la divergencia filogenética de los clones de C.  auris exhibe patrones específicos de región de invasividad, virulencia y/o resistencia a fármacos. ^[20]

La filogenética de C.  auris sugiere que existen genotipos distintos en diferentes regiones geográficas con una diversidad genómica sustancial. ^[20] Se han utilizado diversos métodos analíticos basados ​​en secuencias para respaldar este hallazgo. ^{[ cita requerida ]}

La secuenciación del genoma completo y los análisis de aislamientos de Pakistán, India, Sudáfrica, Venezuela, Japón y genomas de C.  auris previamente secuenciados depositados en el Archivo de Lectura de Secuencias del Centro Nacional de Información Biotecnológica ^[21] identificaron una distribución geográfica distinta de genotipos. ^{[8] Se identificaron cuatro} clados distintos separados por decenas de miles de polimorfismos de un solo nucleótido . ^[8] La distribución de estos clados se segregó geográficamente en el sur de Asia (India y Pakistán), Sudáfrica, Venezuela y Japón con una diversidad genética intrarregional mínima observada. ^[8]

El análisis del polimorfismo de la longitud de fragmentos amplificados de aislamientos de C.  auris del Reino Unido, India, Japón, Sudáfrica, Corea del Sur y Venezuela sugirió que los aislamientos de Londres formaban un grupo distinto en comparación con los demás. ^[22]

La comparación de las secuencias de ADN ribosómico de los aislamientos de C.  auris de Israel, Asia, Sudáfrica y Kuwait reveló que las cepas de Israel eran filogenéticamente distintas de las de otras regiones. ^[23] Chatterjee et al. escribieron en 2015: "Su distribución global real sigue siendo oscura, ya que los métodos comerciales actuales de diagnóstico clínico la identifican erróneamente como C.  haemulonii ". ^[6]

Candida auris fue descrita por primera vez en 2009 después de ser aislada del canal auditivo de una mujer japonesa de 70 años en el Hospital Geriátrico Metropolitano de Tokio en Japón. ^[1] Fue aislada en base a su capacidad de crecer en presencia del fungicida micafungina , un fungicida de la clase de las equinocandinas . ^[1] Los análisis fenotípicos, quimiotaxonómicos y filogenéticos establecieron a C.  auris como una nueva cepa del género Candida . ^{[1] [24]}

Los primeros tres casos de C.  auris causante de enfermedades se notificaron en Corea del Sur en 2011. ^[25] Se habían obtenido dos aislamientos durante un estudio de 2009 y se descubrió un tercero en una muestra almacenada de 1996. ^[25] Los tres casos tenían fungemia persistente, es decir, infección del torrente sanguíneo, y dos de los pacientes murieron posteriormente debido a complicaciones. ^[25] En particular, los aislamientos inicialmente se identificaron erróneamente como Candida haemulonii y Rhodotorula glutinis utilizando métodos estándar, hasta que el análisis de secuencia los identificó correctamente como C.  auris . ^[25] Estos primeros casos enfatizan la importancia de la identificación precisa de las especies y la aplicación oportuna del antimicótico correcto para el tratamiento eficaz de la candidiasis por C.  auris . ^[25]

Durante 2009-2011, se obtuvieron 12 aislamientos de C.  auris de pacientes en dos hospitales en Delhi, India. ^[26] Se encontró el mismo genotipo en distintos entornos: cuidados intensivos, salas quirúrgicas, médicas, oncológicas, neonatales y pediátricas, que eran mutuamente excluyentes con respecto al personal de atención médica. ^[26] La mayoría tenía candidemia persistente y se observó una alta tasa de mortalidad. ^[26] Sin embargo, todos los aislamientos eran de la misma cepa clonal y solo se identificaron positivamente mediante análisis de secuencia de ADN. ^[26] Como anteriormente, la cepa se identificó erróneamente con pruebas de laboratorio de diagnóstico establecidas. ^[26] Los investigadores indios escribieron en 2013 que C.  auris era mucho más frecuente de lo que indican los informes publicados, ya que la mayoría de los laboratorios de diagnóstico no utilizan métodos basados ​​en secuencias para la identificación de cepas. ^[26]

El hongo se propagó a otros continentes y, finalmente, a principios de 2016 se descubrió una cepa resistente a múltiples fármacos en países del sudeste asiático. ^[27]

El primer informe de un brote de C.  auris en Europa fue en octubre de 2016 en el Royal Brompton Hospital , un hospital cardiotorácico de Londres. ^[22] En abril de 2017, la directora de los CDC, Anne Schuchat , lo calificó de "amenaza catastrófica". ^[28] Hasta mayo de 2017, ^[actualizar]los CDC habían informado de 77 casos en los Estados Unidos. De ellos, 69 se obtuvieron de muestras recogidas en Nueva York y Nueva Jersey. ^[29]

Al 31 de agosto de 2019, ^[actualizar]el número de casos de personas que contrajeron C.  auris en los Estados Unidos había aumentado a 806, con 388 reportados en Nueva York, 137 en Nueva Jersey y 227 en Illinois, según los CDC. ^{[4] [30]}

Desde que se observó por primera vez en el Reino Unido, se ha propagado a más de 20 hospitales del NHS Trust y ha infectado a 200 personas. ^[31]

En abril de 2019 ^[actualizar], los CDC han documentado casos de C.  auris en los siguientes países: Australia, Austria, Bélgica, Canadá, China, Colombia, Francia, Alemania, India, Irán, Israel, Japón, Kenia, Kuwait, Malasia, México, Países Bajos, Noruega, Omán, Pakistán, Panamá, Rusia, Arabia Saudita, Singapur, Sudáfrica, Corea del Sur, España, Suiza, Taiwán, Tailandia, Emiratos Árabes Unidos, Reino Unido, Estados Unidos y Venezuela. ^[30]

El hongo Candida auris ( C. auris ) es una infección micótica resistente a múltiples fármacos que se propaga en los hospitales y es extremadamente mortal: mata hasta una de cada tres personas que la contraen.

—Abby Haglage de Yahoo! Lifestyle , ^[32] citando a los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades ^[33]

Arturo Casadevall, MD, PhD, y presidente de Microbiología Molecular e Inmunología de la Escuela de Salud Pública Bloomberg de Johns Hopkins, afirmó:

Lo que sugiere este estudio es que estamos ante el comienzo de la adaptación de los hongos a temperaturas más altas y que tendremos cada vez más problemas a medida que avance el siglo. El calentamiento global conducirá a la selección de linajes de hongos más tolerantes a las temperaturas. ^[32]

La pandemia de COVID-19 ha quitado recursos para combatir y rastrear el hongo, lo que ha provocado brotes. ^[34] La escasez de equipo de protección personal obligó al personal médico a reutilizar batas y mascarillas durante la pandemia, lo que ha contribuido a la propagación del hongo. ^[34] En 2021, los CDC identificaron cepas de Candida auris que eran inmunes a todos los medicamentos existentes que se usan para tratar las infecciones por hongos. ^[35] Una investigación publicada en Annals of Internal Medicine que rastrea la propagación de Candida auris desde 2019 hasta 2021 reveló que el hongo estaba presente en más de la mitad de los estados estadounidenses. ^{[36] [37] [38]}

La resistencia a los antimicrobianos en general es un fenómeno cada vez más común. En 2010, se informó que dos millones de personas contrajeron infecciones resistentes en los Estados Unidos, de las cuales 23.000 fueron mortales. ^[A] "Según estimaciones más recientes de investigadores de la Facultad de Medicina de la Universidad de Washington, la cifra de muertos es de 162.000. Se estima que las muertes a nivel mundial por infecciones resistentes ascienden a 700.000 al año. ^{[4] [39]} C. auris es uno de los muchos microbios que contribuyen a esta estimación global de la resistencia a los antimicrobianos. ^[39]

• Candida blankii

• Base de datos del genoma de Candida