Sistema de clasificación de Cavalier-Smith

La versión inicial de un sistema de clasificación de la vida del zoólogo británico Thomas Cavalier-Smith apareció en 1978. ^{[ 1 ] [ 2 ]} Este sistema inicial continuó modificándose en versiones posteriores que se publicaron hasta su muerte en 2021. Al igual que las clasificaciones de otros, como Carl Linnaeus , Ernst Haeckel , Robert Whittaker y Carl Woese , la clasificación de Cavalier-Smith intenta incorporar los últimos avances en taxonomía. ^{[ 3 ] [ 4 ]} Cavalier-Smith utilizó sus clasificaciones para transmitir sus opiniones sobre las relaciones evolutivas entre varios organismos, principalmente microbianos. Sus clasificaciones complementaban las ideas que comunicaba en publicaciones científicas, charlas y diagramas. Las diferentes iteraciones podían tener un alcance más amplio o más reducido, incluir diferentes agrupaciones, proporcionar mayor o menor detalle y colocar los grupos en diferentes disposiciones a medida que su pensamiento evolucionaba. Sus clasificaciones han tenido una gran influencia en la taxonomía moderna, particularmente en la de los protistas.

Cavalier-Smith ha publicado extensamente sobre la clasificación de los protistas . Una de sus principales contribuciones a la biología fue su propuesta de un nuevo reino de la vida: los Chromista , aunque la utilidad de esta agrupación es cuestionable dado que generalmente se acepta que es una agrupación arbitraria (polifilética) de taxones. También propuso que todos los chromista y alveolata comparten un mismo ancestro común, una afirmación que posteriormente fue refutada por estudios de evidencia morfológica y molecular realizados por otros laboratorios. Denominó a este nuevo grupo Chromalveolates . Asimismo, propuso y nombró muchos otros taxones de alto rango, como Opisthokonta (1987), Rhizaria (2002) y Excavata (2002), aunque él mismo no incluye sistemáticamente a Opisthokonta como taxón formal en sus esquemas. Junto con Chromalveolata, Amoebozoa (cuya descripción modificó en 1998) y Archaeplastida (a los que denominó Plantae desde 1981), los seis grupos formaron la base de la taxonomía de los eucariotas a mediados de la década de 2000. También ha publicado profusamente sobre temas como el origen de varios orgánulos celulares (incluidos el núcleo y las mitocondrias ), la evolución del tamaño del genoma y la endosimbiosis . Aunque bastante conocidas, muchas de sus afirmaciones han sido controvertidas y no han obtenido una amplia aceptación en la comunidad científica hasta la fecha. Más recientemente, ha publicado un artículo que cita la parafilia de su reino bacteriano , el origen de Neomura a partir de Actinobacteria y la taxonomía de los procariotas .

Según Palaeos.com :

El profesor Cavalier-Smith, de la Universidad de Oxford, ha producido una extensa obra muy valorada. Sin embargo, su estilo es controvertido, algo difícil de describir. Quizás se deba a su estilo de escritura. Cavalier-Smith tiende a hacer afirmaciones donde otros usarían oraciones declarativas, oraciones declarativas donde otros expresarían una opinión, y opiniones que nadie se atrevería a expresar. Además, puede sonar arrogante, reaccionario e incluso perverso. Por otro lado, tiene un largo historial de acertar cuando todos los demás estaban equivocados. A nuestro parecer, todo esto queda eclipsado por una virtud incomparable: su dedicación a los detalles. Esto da lugar a artículos muy extensos y complejos, y provoca todo tipo de murmullos, frustración y rechinar de dientes entre quienes intentan explicar sus puntos de vista sobre la juventud. Véase, por ejemplo, Zrzavý (2001) ^{[ 5 ]} y Patterson (1999). ^{[ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]} Sin embargo, aborda todos los hechos relevantes. ^{[ 9 ]}

Para 1981, Cavalier-Smith había dividido todos los eucariotas en hasta nueve reinos, agrupando alternativamente los reinos Cryptophyta y Chromophyta como un solo reino: Chromista. ^{[ 21 ]}

La mayoría de los cromistas son fotosintéticos . Esto los distingue de la mayoría de los demás protistas, que carecen de fotosíntesis. Tanto en las plantas como en los cromistas, la fotosíntesis tiene lugar en los cloroplastos . Sin embargo, en las plantas, los cloroplastos se localizan en el citosol , mientras que en los cromistas se encuentran en el lumen de su retículo endoplasmático rugoso . Esto distingue a los cromistas de las plantas. ^{[ 13 ]}

Basándose en la adición de Chromista como reino, afirmó que "el mejor para uso científico general es un sistema de siete reinos", ^{[ 21 ]} que incluye:

1. Viridiplantae ,
2. Biliphyta ,
3. Animalia ,
4. Euglenozoa ,
5. Protozoos ,
6. Chromista ,
7. Hongos .

En el artículo se propone una clasificación aún más compacta: Euglenozoa y Protozoa pueden unirse en el reino Protista, y Viridiplantae y Biliphyta en el reino Plantae. Todos los procariotas se incluyeron en el reino Bacteria en este punto. ^{[ 21 ]}

En 1983, Cavalier-Smith adaptó el término Archezoa, utilizado previamente por Haeckel, Perty y para protistas que carecen de mitocondrias . ^{[ 22 ]} Inicialmente, el taxón incluía a los metamónadas y microscopridia, bastante no relacionados, y se expandió para incluir otros taxones no relacionados, de modo que el término se refería a muchas agrupaciones diferentes de protistas. ^{[ 23 ] [ 24 ] [ 25 ] [ 26 ] [ 27 ] [ 28 ] [ 29 ] [ 30 ] [ 31 ] [ 32 ] [ 33 ] [ 34 ] [ 35 ] [ 36 ] [ 37 ] [ 38 ]} Originalmente lo consideró un subreino, pero en 1989, con el establecimiento de Chromista como reino separado, lo trató como un reino. ^{[ 19 ]}

Archezoa ahora está extinto. ^{[ 40 ]} Él asignó a los antiguos miembros del reino Archezoa al filo Amoebozoa. ^{[ 41 ]} Hoy, sus antiguos miembros pertenecen a Metamonada (por ejemplo, Trimastix ), hongos (Microsporidia), Amoebozoa (por ejemplo, Pelomyxa ). ^{[ 42 ]}

Cavalier-Smith se refirió a lo que quedaba del reino protista, después de eliminar los reinos Archezoa y Chromista, como el "reino Protozoa". En 1993, este reino contenía 18 filos, como se resume en la siguiente tabla. ^{[ 13 ]} La primera división importante se basó en la presencia o ausencia de dictiosomas, aunque posteriormente se demostró la existencia de un aparato de Golgi en los 'Adictyozoa'. ^{[ 43 ]}

El filo Opalozoa fue establecido por Cavalier-Smith en 1991. ^{[ 45 ]}

Para 1998, Cavalier-Smith había reducido el número total de reinos de ocho a seis: Animalia, Protozoa, Fungi, Plantae, Chromista y Bacteria. ^{[ 20 ]}

Los eucariotas se dividen en dos grupos principales: unikontes y bikontes. Los uniciliados son células con un solo flagelo , y los unikontes descienden de los uniciliados. Las células unikontes a menudo también tienen un solo centriolo . Las células bikontes tienen dos flagelos, y los bikontes descienden de los bikontes. Los bikontes experimentan una transformación ciliar mediante la conversión de un flagelo anterior más joven en un flagelo posterior más antiguo y diferente. Los animales y los hongos son unikontes, mientras que las plantas y los cromistas son bikontes. Algunos protozoos son unikontes, mientras que otros son bikontes.

Las bacterias (= procariotas) se subdividen en Negibacteria ( Gram-negativas ) y Unibacteria ( Gram-positivas y Arqueobacterias). Según Cavalier-Smith, las Eubacterias constituyen el grupo más antiguo de organismos terrestres que aún viven. Clasifica los grupos que considera más recientes (arqueobacterias y eucariotas) como Neomura. ^{[ 20 ]}

En 1987, Cavalier-Smith introdujo una clasificación dividida en dos superreinos (Prokaryota y Eukaryota) y siete reinos, dos reinos procariotas (Eubacteria y Archaebacteria) y cinco reinos eucariotas (Protozoa, Chromista, Fungi, Plantae y Animalia). ^{[ 48 ]}

Cavalier-Smith y sus colaboradores revisaron la clasificación en 2015 y la publicaron en PLOS ONE . En este esquema, reintrodujeron la clasificación con la división del superreino de los procariotas en dos reinos: Bacteria (=Eubacteria) y Archaea (=Arqueobacteria). Esto se basa en el consenso del Esquema Taxonómico de Bacterias y Arqueas (TOBA) y el Catálogo de la Vida . ^{[ 49 ]}