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Cofactor (bioquímica)

El complejo de la succinato deshidrogenasa que muestra varios cofactores, entre ellos flavina , centros hierro-azufre y hemo . Un cofactor es un compuesto químico no proteico o ...

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El complejo de la succinato deshidrogenasa que muestra varios cofactores, entre ellos flavina , centros hierro-azufre y hemo .

Un cofactor es un compuesto químico no proteico o un ion metálico necesario para que una enzima actúe como catalizador . Los cofactores pueden considerarse "moléculas auxiliares" que ayudan en las transformaciones bioquímicas . La velocidad a la que ocurren estas transformaciones se caracteriza en un campo de estudio denominado cinética enzimática . Los cofactores se diferencian de los ligandos en que, por lo general, ejercen su función al permanecer unidos a ellos.

Los cofactores se pueden clasificar en dos tipos: iones inorgánicos y moléculas orgánicas complejas llamadas coenzimas . [ 1 ] Las coenzimas se derivan principalmente de vitaminas y otros nutrientes orgánicos esenciales en pequeñas cantidades (algunas definiciones limitan el uso del término "cofactor" a sustancias inorgánicas; ambos tipos se incluyen aquí). [ 2 ] [ 3 ]

Las coenzimas se dividen a su vez en dos tipos. El primero se denomina " grupo prostético " y consiste en una coenzima unida firmemente (o incluso de forma covalente y, por lo tanto, permanente) a una proteína. [ 4 ] El segundo tipo de coenzimas se denomina "cosustratos" y se une transitoriamente a la proteína. Los cosustratos pueden liberarse de la proteína en algún momento y volver a unirse posteriormente. Tanto los grupos prostéticos como los cosustratos tienen la misma función: facilitar la reacción de las enzimas y las proteínas. Una enzima inactiva sin el cofactor se denomina apoenzima , mientras que la enzima completa con el cofactor se denomina holoenzima . [ 5 ]

La Unión Internacional de Química Pura y Aplicada (IUPAC) define "coenzima" de forma ligeramente diferente, concretamente como un compuesto orgánico no proteico de bajo peso molecular que se une de forma laxa y participa en reacciones enzimáticas como un portador disociable de grupos químicos o electrones; un grupo prostético se define como una unidad no polipeptídica fuertemente unida a una proteína que se regenera en cada ciclo enzimático. [ 6 ]

Algunas enzimas o complejos enzimáticos requieren varios cofactores. Por ejemplo, el complejo multienzimático piruvato deshidrogenasa [ 7 ] en la unión de la glucólisis y el ciclo del ácido cítrico requiere cinco cofactores orgánicos y un ion metálico: pirofosfato de tiamina (TPP) débilmente unido, lipoamida y flavina adenina dinucleótido (FAD) unidos covalentemente , cosustratos nicotinamida adenina dinucleótido (NAD + ) y coenzima A (CoA), y un ion metálico (Mg2 + ). [ 8 ]

Los cofactores orgánicos suelen ser vitaminas o derivados de ellas. Muchos contienen el nucleótido adenosín monofosfato (AMP) como parte de su estructura, como el ATP , la coenzima A , el FAD y el NAD + . Esta estructura común podría reflejar un origen evolutivo común como parte de las ribozimas en un mundo de ARN ancestral . Se ha sugerido que la parte de AMP de la molécula puede considerarse una especie de "asa" mediante la cual la enzima puede "agarrar" la coenzima para cambiarla entre diferentes centros catalíticos. [ 9 ]

Clasificación

Los cofactores se pueden dividir en dos grupos principales: cofactores orgánicos , como la flavina o el hemo ; y cofactores inorgánicos , como los iones metálicos Mg 2+ , Zn 2+ , Cu + , Mn 2+ y los cúmulos de hierro-azufre .

Los cofactores orgánicos a veces se subdividen en coenzimas y grupos prostéticos . El término coenzima se refiere específicamente a las enzimas y, como tales, a las propiedades funcionales de una proteína. Por otro lado, "grupo prostético" enfatiza la naturaleza de la unión de un cofactor a una proteína (fuerte o covalente) y, por lo tanto, se refiere a una propiedad estructural. Diferentes fuentes ofrecen definiciones ligeramente distintas de coenzimas, cofactores y grupos prostéticos. Algunos consideran las moléculas orgánicas fuertemente unidas como grupos prostéticos y no como coenzimas, mientras que otros definen todas las moléculas orgánicas no proteicas necesarias para la actividad enzimática como coenzimas, y clasifican aquellas fuertemente unidas como grupos prostéticos de coenzimas. Estos términos a menudo se usan de forma imprecisa.

En una carta publicada en 1980 en Trends in Biochemistry Sciences, se señaló la confusión existente en la literatura y la distinción esencialmente arbitraria entre grupos prostéticos y coenzimas, y se propuso el siguiente esquema. En este esquema, los cofactores se definieron como una sustancia adicional, además de la proteína y el sustrato , necesaria para la actividad enzimática, y un grupo prostético como una sustancia que completa su ciclo catalítico unida a una sola molécula de enzima. Sin embargo, el autor no logró llegar a una definición única y completa de "coenzima" y propuso que se dejara de usar este término en la literatura. [ 10 ]

cofactores inorgánicos

Iones metálicos

Los iones metálicos son cofactores comunes. [ 11 ] El estudio de estos cofactores se enmarca dentro del área de la química bioinorgánica . En nutrición , la lista de oligoelementos esenciales refleja su función como cofactores. En los humanos, esta lista suele incluir hierro , magnesio , manganeso , cobalto , cobre , zinc y molibdeno . [ 12 ] Aunque la deficiencia de cromo causa intolerancia a la glucosa , no se ha identificado ninguna enzima humana que utilice este metal como cofactor. [ 13 ] [ 14 ] El yodo también es un oligoelemento esencial, pero este elemento se utiliza como parte de la estructura de las hormonas tiroideas en lugar de como cofactor enzimático. [ 15 ] El calcio es otro caso especial, ya que se requiere como componente de la dieta humana y es necesario para la actividad completa de muchas enzimas, como la óxido nítrico sintasa , las fosfatasas de proteínas y la adenilato quinasa , pero el calcio activa estas enzimas en la regulación alostérica , a menudo uniéndose a ellas en un complejo con la calmodulina . [ 16 ] Por lo tanto, el calcio es un ion de señalización celular y no se suele considerar un cofactor de las enzimas que regula. [ 17 ]

Otros organismos requieren metales adicionales como cofactores enzimáticos, como el vanadio en la nitrogenasa de las bacterias fijadoras de nitrógeno del género Azotobacter , [ 18 ] el tungsteno en la aldehído ferredoxina oxidorreductasa de la arquea termófila Pyrococcus furiosus , [ 19 ] e incluso el cadmio en la anhidrasa carbónica de la diatomea marina Thalassiosira weissflogii . [ 20 ] [ 21 ]

En muchos casos, el cofactor incluye un componente tanto inorgánico como orgánico. Un conjunto diverso de ejemplos son las hemoproteínas , que consisten en un anillo de porfirina coordinado con hierro . [ 22 ]

Un clúster simple de [Fe 2 S 2 ] que contiene dos átomos de hierro y dos átomos de azufre, coordinado por cuatro residuos de cisteína de la proteína.

cúmulos de hierro-azufre

Los cúmulos de hierro-azufre son complejos de átomos de hierro y azufre unidos a las proteínas por residuos de cisteína. Desempeñan funciones tanto estructurales como funcionales, incluyendo la transferencia de electrones, la detección redox y como módulos estructurales. [ 23 ]

Orgánico

Los cofactores orgánicos son pequeñas moléculas orgánicas (típicamente una masa molecular menor a 1000 Da) que pueden estar unidas de forma laxa o fuerte a la enzima y participar directamente en la reacción. [ 5 ] [ 24 ] [ 25 ] [ 26 ] En este último caso, cuando es difícil eliminarlo sin desnaturalizar la enzima, se puede llamar grupo prostético . No hay una división clara entre cofactores unidos de forma laxa y fuerte. [ 5 ] Muchos, como el NAD +, pueden estar unidos de forma fuerte en algunas enzimas, mientras que están unidos de forma laxa en otras. [ 5 ] Otro ejemplo es el pirofosfato de tiamina (TPP), que está unido de forma fuerte en la transcetolasa o la piruvato descarboxilasa , mientras que está unido de forma menos fuerte en la piruvato deshidrogenasa . [ 27 ] Otras coenzimas, como el flavín adenín dinucleótido (FAD), la biotina y la lipoamida , por ejemplo, están unidas de forma fuerte. [ 28 ] Los cofactores fuertemente unidos, en general, se regeneran durante el mismo ciclo de reacción, mientras que los cofactores débilmente unidos pueden regenerarse en una reacción posterior catalizada por una enzima diferente. En este último caso, el cofactor también puede considerarse un sustrato o cosustrato.

Las vitaminas pueden servir como precursores de muchos cofactores orgánicos (p. ej., vitaminas B1 , B2 , B6 , B12 , niacina , ácido fólico ) o como coenzimas (p. ej., vitamina C ). Sin embargo, las vitaminas también tienen otras funciones en el cuerpo. [ 29 ] Muchos cofactores orgánicos también contienen un nucleótido , como los transportadores de electrones NAD y FAD , y la coenzima A , que transporta grupos acilo . La mayoría de estos cofactores se encuentran en una gran variedad de especies, y algunos son universales para todas las formas de vida. Una excepción a esta amplia distribución es un grupo de cofactores únicos que evolucionaron en los metanógenos , los cuales están restringidos a este grupo de arqueas . [ 30 ]

Aunque los procesos industriales catalizados por enzimas son altamente eficientes, algunas de estas enzimas dependen de cofactores de nicotinamida (NADH/NAD+, NADP/NAPH). Debido al alto precio de dichos cofactores, estos procesos no serían económicamente competitivos. Recientemente, se han identificado algunos compuestos orgánicos sintéticos como contrapartes biomiméticas de cofactores naturales con potencial económico. [ 31 ]

Vitaminas y derivados

No vitaminas

Cofactores como intermediarios metabólicos

Las reacciones redox del dinucleótido de nicotinamida y adenina .

El metabolismo implica una amplia gama de reacciones químicas, pero la mayoría se engloban en unos pocos tipos básicos de reacciones que implican la transferencia de grupos funcionales . [ 61 ] Esta química común permite a las células utilizar un pequeño conjunto de intermediarios metabólicos para transportar grupos químicos entre diferentes reacciones. [ 62 ] Estos intermediarios de transferencia de grupos son los cofactores orgánicos débilmente unidos, a menudo llamados coenzimas .

Cada clase de reacción de transferencia de grupo es llevada a cabo por un cofactor particular, que es el sustrato de un conjunto de enzimas que lo producen y de un conjunto de enzimas que lo consumen. Un ejemplo de esto son las deshidrogenasas que utilizan nicotinamida adenina dinucleótido (NAD + ) como cofactor. En este caso, cientos de enzimas de distintos tipos extraen electrones de sus sustratos y reducen el NAD + a NADH. Este cofactor reducido es entonces un sustrato para cualquiera de las reductasas de la célula que requieren electrones para reducir sus sustratos. [ 33 ]

Por lo tanto, estos cofactores se reciclan continuamente como parte del metabolismo . Por ejemplo, la cantidad total de ATP en el cuerpo humano es de aproximadamente 0,1 moles . Este ATP se descompone constantemente en ADP y luego se convierte de nuevo en ATP. Así, en cualquier momento dado, la cantidad total de ATP + ADP permanece bastante constante. La energía utilizada por las células humanas requiere la hidrólisis de 100 a 150 moles de ATP diariamente, lo que equivale a unos 50 a 75 kg. En situaciones típicas, los humanos consumen su peso corporal en ATP a lo largo del día. [ 63 ] Esto significa que cada molécula de ATP se recicla de 1000 a 1500 veces al día.   

Evolución

Los cofactores orgánicos, como el ATP y el NADH , están presentes en todas las formas de vida conocidas y constituyen una parte fundamental del metabolismo . Esta conservación universal indica que estas moléculas evolucionaron muy temprano en el desarrollo de los seres vivos. [ 64 ] Por lo tanto, al menos algunos de los cofactores actuales podrían haber estado presentes en el último ancestro universal , que vivió hace unos 4000 millones de años. [ 65 ] [ 66 ]

Los cofactores orgánicos podrían haber estado presentes incluso antes en la historia de la vida en la Tierra. [ 67 ] El nucleótido adenosina es un cofactor para muchas enzimas metabólicas básicas como las transferasas. Podría ser un remanente del mundo del ARN . [ 68 ] [ 69 ] Los cofactores basados ​​en adenosina podrían haber actuado como adaptadores que permitieron a las enzimas y ribozimas unirse a nuevos cofactores a través de pequeñas modificaciones en los dominios de unión a adenosina existentes , que originalmente habían evolucionado para unirse a un cofactor diferente. [ 9 ] Este proceso de adaptación de una estructura pre-evolucionada para un uso novedoso se conoce como exaptación .

Origen prebiótico de las coenzimas . Al igual que los aminoácidos y los nucleótidos , ciertas vitaminas y, por lo tanto, las coenzimas, pueden crearse en las condiciones de la Tierra primitiva. Por ejemplo, la vitamina B3 puede sintetizarse mediante descargas eléctricas aplicadas al etileno y al amoníaco . [ 70 ] De manera similar, la panteteína (un derivado de la vitamina B5 ), precursora de la coenzima A y de la síntesis dependiente de tioéster, puede formarse espontáneamente en condiciones de evaporación. [ 71 ] Otras coenzimas podrían haber existido en la Tierra primitiva, como las pterinas (un derivado de la vitamina B9 ), las flavinas ( FAD , flavín mononucleótido = FMN) y la riboflavina (vitamina B2). [ 72 ]

Cambios en las coenzimas . Un método computacional, IPRO, predijo recientemente mutaciones que cambiaron experimentalmente la especificidad del cofactor de la xilosa reductasa de Candida boidinii de NADPH a NADH. [ 73 ]

Evolución de enzimas sin coenzimas . Si las enzimas requieren una coenzima, ¿cómo evoluciona la coenzima? El escenario más probable es que las enzimas puedan funcionar inicialmente sin sus coenzimas y luego reclutar la coenzima, incluso si la reacción catalizada no es tan eficiente o tan rápida. Ejemplos de ello son la alcohol deshidrogenasa (coenzima: NAD⁺ ), [ 74 ] la lactato deshidrogenasa (NAD⁺), [ 75 ] la glutatión reductasa ( NADPH ). [ 76 ]

Historia

El primer cofactor orgánico descubierto fue el NAD + , identificado por Arthur Harden y William Young en 1906. [ 77 ] Observaron que la adición de extracto de levadura hervido y filtrado aceleraba considerablemente la fermentación alcohólica en extractos de levadura sin hervir. Llamaron cofermento al factor no identificado responsable de este efecto . Mediante una larga y difícil purificación a partir de extractos de levadura, este factor termoestable fue identificado como un nucleótido azúcar fosfato por Hans von Euler-Chelpin . [ 78 ] Otros cofactores fueron identificados a lo largo de principios del siglo XX, con el ATP aislado en 1929 por Karl Lohmann, [ 79 ] y la coenzima A descubierta en 1945 por Fritz Albert Lipmann . [ 80 ]

Las funciones de estas moléculas fueron inicialmente misteriosas, pero, en 1936, Otto Heinrich Warburg identificó la función del NAD + en la transferencia de hidruro. [ 81 ] Este descubrimiento fue seguido a principios de la década de 1940 por el trabajo de Herman Kalckar , quien estableció el vínculo entre la oxidación de azúcares y la generación de ATP. [ 82 ] Esto confirmó el papel central del ATP en la transferencia de energía que había sido propuesto por Fritz Albert Lipmann en 1941. [ 83 ] Más tarde, en 1949, Morris Friedkin y Albert L. Lehninger demostraron que el NAD + vinculaba vías metabólicas como el ciclo del ácido cítrico y la síntesis de ATP. [ 84 ]

Cofactores derivados de proteínas

En varias enzimas, la porción que actúa como cofactor se forma mediante la modificación postraduccional de una parte de la secuencia proteica. Esto suele reemplazar la necesidad de un factor de unión externo, como un ion metálico, para la función proteica. Las posibles modificaciones podrían ser la oxidación de residuos aromáticos, la unión entre residuos, la escisión o la formación de anillos. [ 85 ] Estas alteraciones se distinguen de otras modificaciones proteicas postraduccionales , como la fosforilación , la metilación o la glicosilación, en que los aminoácidos suelen adquirir nuevas funciones. Esto aumenta la funcionalidad de la proteína; los aminoácidos no modificados suelen estar limitados a reacciones ácido-base, y la alteración de los residuos puede proporcionar a la proteína sitios electrófilos o la capacidad de estabilizar radicales libres. [ 85 ] Ejemplos de producción de cofactores incluyen triptófano triptofilquinona (TTQ), derivado de dos cadenas laterales de triptófano, [ 86 ] y 4-metilideno-imidazol-5-ona (MIO), derivado de un motivo Ala-Ser-Gly. [ 87 ] La caracterización de cofactores derivados de proteínas se lleva a cabo mediante cristalografía de rayos X y espectrometría de masas ; los datos estructurales son necesarios porque la secuenciación no identifica fácilmente los sitios alterados.

Cofactores no enzimáticos

El término se utiliza en otras áreas de la biología para referirse de forma más general a moléculas no proteicas (o incluso proteicas) que activan, inhiben o son necesarias para el funcionamiento de la proteína. Por ejemplo, los ligandos como las hormonas que se unen a las proteínas receptoras y las activan se denominan cofactores o coactivadores, mientras que las moléculas que inhiben las proteínas receptoras se denominan correpresores. Un ejemplo de ello es la familia de receptores acoplados a proteínas G, que se encuentran frecuentemente en las neuronas sensoriales. La unión del ligando a los receptores activa la proteína G, que a su vez activa una enzima para activar el efector. [ 88 ] Para evitar confusiones, se ha sugerido que dichas proteínas cuya activación o represión está mediada por la unión del ligando se denominen correguladores. [ 89 ]

Véase también

Referencias

  1. ^ Hasim, Onn H.; Adnan, Nor Azila (2010). "Grupo de coenzimas, cofactores y prótesis: jerga bioquímica ambigua" (PDF) . Educación Bioquímica . 22 (2): 93– 94. doi : 10.1016/0307-4412(94)90088-4 .
  2. ↑ "Coenzimas y cofactores" . Archivado del original el 26 de agosto de 1999. Consultado el 17 de noviembre de 2007 .
  3. ↑ "Cofactores enzimáticos" . Archivado del original el 5 de mayo de 2003. Consultado el 17 de noviembre de 2007 .
  4. ↑ Nelson DL, Cox MM (2008). Principios de bioquímica de Lehninger (Quinta ed.). Nueva York: WH Freeman and Company. pág. 184. ISBN   978-1429224161.
  5. 1 2 3 4 5 6 Sauke DJ, Metzler DE, Metzler CM (2001). Bioquímica: las reacciones químicas de las células vivas (2.ª ed.). San Diego: Harcourt/Academic Press. ISBN  978-0-12-492540-3.
  6. ↑ de Bolster, MWG (1997). Glosario de términos utilizados en química bioinorgánica (PDF) . Química pura y aplicada.
  7. ↑ Jordan F, Patel MS (2004). Tiamina: mecanismos catalíticos en estados normales y patológicos . Nueva York, NY: Marcel Dekker. pág. 588. ISBN  978-0-8247-4062-7.
  8. ↑ "Complejo de piruvato deshidrogenasa" . Chemistry LibreTexts . 2 de octubre de 2013. Consultado el 10 de mayo de 2017 .
  9. 1 2 Denessiouk KA, Rantanen VV, Johnson MS (agosto de 2001). "Reconocimiento de adenina: un motivo presente en proteínas dependientes de ATP, CoA, NAD, NADP y FAD". Proteins . 44 (3): 282– 91. doi : 10.1002/prot.1093 . PMID 11455601 . S2CID 10848692 .  
  10. ↑ Bryce (marzo de 1979). "SAM: semántica y malentendidos". Trends Biochem. Sci . 4 (3): N62– N63. doi : 10.1016/0968-0004(79)90255-X .
  11. ↑ "Bioquímica: Enzimas: Clasificación y catálisis (Cofactores)" . vle.du.ac.in. Consultado el 7 de febrero de 2018 .
  12. ↑ Aggett PJ (agosto de 1985). "Fisiología y metabolismo de los oligoelementos esenciales: un esquema". Clinics in Endocrinology and Metabolism . 14 (3): 513– 43. doi : 10.1016/S0300-595X(85)80005-0 . PMID 3905079 . 
  13. ↑ Stearns DM (2000). "¿Es el cromo un metal esencial en cantidades traza?". BioFactors . 11 ( 3): 149– 62. doi : 10.1002/biof.5520110301 . PMID 10875302. S2CID 19417496 .  
  14. ↑ Vincent JB (abril de 2000). "La bioquímica del cromo" . The Journal of Nutrition . 130 (4): 715–8 . doi : 10.1093/jn/130.4.715 . PMID 10736319 . 
  15. ↑ Cavalieri RR (abril de 1997). "Metabolismo del yodo y fisiología tiroidea: conceptos actuales". Thyroid . 7 (2): 177– 81. doi : 10.1089/thy.1997.7.177 . PMID 9133680 . 
  16. ↑ Clapham DE (2007). "Señalización de calcio" . Cell . 131 ( 6): 1047– 58. doi : 10.1016/j.cell.2007.11.028 . PMID 18083096. S2CID 15087548 .  
  17. ↑ Niki I, Yokokura H, Sudo T, Kato M, Hidaka H (octubre de 1996). "Señalización de Ca2+ y proteínas intracelulares de unión a Ca2+" . Journal of Biochemistry . 120 (4): 685–98 . doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021466 . PMID 8947828 . 
  18. ↑ Eady RR (julio de 1988). "La nitrogenasa que contiene vanadio de Azotobacter". BioFactors . 1 (2): 111– 6. PMID 3076437 . 
  19. ↑ Chan MK, Mukund S, Kletzin A, Adams MW, Rees DC (marzo de 1995). "Estructura de una enzima tungstopterina hipertermófila, aldehído ferredoxina oxidorreductasa". Science . 267 ( 5203): 1463– 9. Bibcode : 1995Sci...267.1463C . doi : 10.1126/science.7878465 . PMID 7878465. S2CID 20868012 .  
  20. ↑ Lane TW, Morel FM (abril de 2000). "Una función biológica del cadmio en las diatomeas marinas" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 97 (9): 4627–31 . Bibcode : 2000PNAS...97.4627L . doi : 10.1073/pnas.090091397 . PMC 18283. PMID 10781068 .  
  21. ↑ Lane TW, Saito MA, George GN, Pickering IJ, Prince RC, Morel FM (2005). "Bioquímica: una enzima de cadmio de una diatomea marina" . Nature . 435 ( 7038): 42. Bibcode : 2005Natur.435...42L . doi : 10.1038/435042a . PMID 15875011. S2CID 52819760 .  
  22. ↑ Li T, Bonkovsky HL, Guo JT (marzo de 2011). " Análisis estructural de las hemoproteínas: implicaciones para el diseño y la predicción" . BMC Structural Biology . 11 13. doi : 10.1186/1472-6807-11-13 . PMC 3059290. PMID 21371326 .  
  23. ↑ Meyer J (febrero de 2008). "Plegamientos de proteínas hierro-azufre, química hierro-azufre y evolución". J. Biol. Inorg. Chem . 13 (2): 157–70 . doi : 10.1007/s00775-007-0318-7 . PMID 17992543. S2CID 21961142 .  
  24. ↑ Palmer T (1981). Comprensión de las enzimas . Nueva York: Horwood. ISBN 978-0-85312-307-1.
  25. ↑ Cox M, Lehninger AL, Nelson DR (2000). Principios de bioquímica de Lehninger (3.ª ed.). Nueva York: Worth Publishers. ISBN  978-1-57259-153-0.
  26. ↑ Farrell SO, Campbell MK (2009). Bioquímica (6.ª ed.). Pacific Grove: Brooks Cole. ISBN  978-0-495-39041-1.
  27. ↑ Morey AV, Juni E (junio de 1968). "Estudios sobre la naturaleza de la unión del pirofosfato de tiamina a las enzimas" . The Journal of Biological Chemistry . 243 (11): 3009–19 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)93372-7 . PMID 4968184 . 
  28. ↑ Hanukoglu I (diciembre de 2017). "Conservación de las interfaces enzima-coenzima en la adrenodoxina reductasa de unión a FAD y NADP: una enzima ubicua". Journal of Molecular Evolution . 85 ( 5–6 ): 205–218 . Bibcode : 2017JMolE..85..205H . doi : 10.1007/s00239-017-9821-9 . PMID 29177972. S2CID 7120148 .  
  29. ↑ Bolander FF (2006). "Vitaminas: no solo para las enzimas". Curr Opin Investig Drugs . 7 (10): 912– 5. PMID 17086936 . 
  30. ↑ Rouvière PE, Wolfe RS (junio de 1988). "Nueva bioquímica de la metanogénesis" . The Journal of Biological Chemistry . 263 (17): 7913–6 . Bibcode : 1988JBiCh.263.7913R . doi : 10.1016/S0021-9258(18)68417-0 . PMID 3131330 . 
  31. ↑ Nowak, Claudia; Pick, André; Csepei, Lénárd-István; Sieber, Volker (2017). "Caracterización de cofactores biomiméticos según la estabilidad, los potenciales redox y la conversión enzimática por la NADH oxidasa de Lactobacillus pentosus" . ChemBioChem . 18 (19): 1944–1949 . doi : 10.1002/cbic.201700258 . ISSN 1439-7633 . PMID 28752634 .  
  32. ↑ Frank RA, Leeper FJ, Luisi BF (2007). "Estructura, mecanismo y dualidad catalítica de las enzimas dependientes de tiamina" . Cell . Mol. Life Sci . 64 ( 7–8 ): 892–905 . doi : 10.1007/ s00018-007-6423-5 . PMC 11136255. PMID 17429582. S2CID 20415735 .   
  33. 1 2 Pollak N, Dölle C, Ziegler M (2007). "El poder de reducir: nucleótidos de piridina: moléculas pequeñas con multitud de funciones" . Biochem . J. 402 ( 2): 205– 18. doi : 10.1042/BJ20061638 . PMC 1798440. PMID 17295611 .  
  34. ↑ Eliot AC, Kirsch JF (2004). "Enzimas de fosfato de piridoxal: consideraciones mecanísticas, estructurales y evolutivas". Annu. Rev. Biochem. 73 (1): 383– 415. Bibcode : 2004ARBio..73..383E . doi : 10.1146/annurev.biochem.73.011303.074021 . PMID 15189147 . 
  35. ↑ Banerjee R, Ragsdale SW (2003). " Las múltiples caras de la vitamina B 12 : catálisis por enzimas dependientes de cobalamina" . Annu. Rev. Biochem. 72 : 209–47 . doi : 10.1146/annurev.biochem.72.121801.161828 . PMID 14527323. S2CID 37393683 .  
  36. ↑ Jitrapakdee S, Wallace JC (2003). "La familia de enzimas de biotina: motivos estructurales conservados y reordenamientos de dominios". Curr. Protein Pept. Sci . 4 (3): 217– 29. doi : 10.2174/1389203033487199 . PMID 12769720 . 
  37. ↑ Leonardi R, Zhang YM, Rock CO, Jackowski S (2005). "Coenzima A: de vuelta a la acción". Prog. Lipid Res . 44 ( 2–3 ): 125–53 . Bibcode : 2005PLipR..44..125L . doi : 10.1016/j.plipres.2005.04.001 . PMID 15893380 . 
  38. ↑ Donnelly JG (junio de 2001). "Ácido fólico". Critical Reviews in Clinical Laboratory Sciences . 38 (3): 183– 223. doi : 10.1080/20014091084209 . PMID 11451208. S2CID 218866247 .  
  39. ↑ Søballe B, Poole RK (agosto de 1999). "Ubiquinonas microbianas: múltiples funciones en la respiración, la regulación genética y el manejo del estrés oxidativo" (PDF) . Microbiology . 145 (8): 1817–30 . doi : 10.1099/13500872-145-8-1817 . PMID 10463148 . 
  40. ^ Linster CL, Van Schaftingen E (2007). "Vitamina C. Biosíntesis, reciclaje y degradación en mamíferos" . FEBS J. 274 (1): 1– 22. doi : 10.1111/j.1742-4658.2006.05607.x . PMID 17222174 . 
  41. ^ Joosten V, van Berkel WJ (2007). "Flavoenzimas". Opinión actual Chem Biol . 11 (2): 195– 202. Código bibliográfico : 2007COCB...11..195J . doi : 10.1016/j.cbpa.2007.01.010 . PMID 17275397 . 
  42. ↑ Mack M, Grill S (2006). "Análogos de riboflavina e inhibidores de la biosíntesis de riboflavina". Appl . Microbiol. Biotechnol . 71 (3): 265– 75. doi : 10.1007/s00253-006-0421-7 . PMID 16607521. S2CID 12634062 .  
  43. ↑ Bugg T (1997). Introducción a la química de enzimas y coenzimas . Oxford: Blackwell Science. pp. 95. ISBN  978-0-86542-793-8.
  44. ↑ Chiang PK, Gordon RK, Tal J, Zeng GC, Doctor BP, Pardhasaradhi K, McCann PP (marzo de 1996). "S-adenosilmetionina y metilación" . FASEB Journal . 10 (4): 471–80 . Bibcode : 1996FASEJ..10..471C . doi : 10.1096 / fasebj.10.4.8647346 . PMID 8647346. S2CID 11214528 .  
  45. ↑ Noll KM, Rinehart KL, Tanner RS, Wolfe RS (junio de 1986). "Estructura del componente B (7-mercaptoheptanoiltreonina fosfato) del sistema metilreductasa de la metilcoenzima M de Methanobacterium thermoautotrophicum" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 83 (12): 4238–42 . Bibcode : 1986PNAS ...83.4238N . doi : 10.1073/pnas.83.12.4238 . PMC 323707. PMID 3086878 .  
  46. ↑ Taylor CD, Wolfe RS (agosto de 1974). "Estructura y metilación de la coenzima M(HSCH2CH2SO3)" . The Journal of Biological Chemistry . 249 (15): 4879–85 . Bibcode : 1974JBiCh.249.4879T . doi : 10.1016/S0021-9258(19)42403-4 . PMID 4367810 . 
  47. ↑ Balch WE, Wolfe RS (enero de 1979). "Especificidad y distribución biológica de la coenzima M (ácido 2-mercaptoetanosulfónico)" . Journal of Bacteriology . 137 (1): 256–63 . Bibcode : 1979JBact.137..256B . doi : 10.1128/JB.137.1.256-263.1979 . PMC 218444. PMID 104960 .  
  48. ↑ Crane FL (diciembre de 2001). " Funciones bioquímicas de la coenzima Q10" . Journal of the American College of Nutrition . 20 (6): 591–8 . doi : 10.1080/07315724.2001.10719063 . PMID 11771674. S2CID 28013583. Archivado del original el 16 de diciembre de 2008.  
  49. ↑ Buchanan BB, Gruissem W, Jones RL (2000). Bioquímica y biología molecular de las plantas (1.ª ed.). Sociedad Americana de Fisiología Vegetal. ISBN  978-0-943088-39-6.
  50. ↑ Grill D, Tausz T, De Kok LJ (2001). Importancia del glutatión en la adaptación de las plantas al medio ambiente . Springer. ISBN 978-1-4020-0178-9.
  51. ↑ Meister A, Anderson ME (1983). "Glutatión". Annual Review of Biochemistry . 52 : 711–60 . doi : 10.1146/annurev.bi.52.070183.003431 . PMID 6137189 . 
  52. ↑ Wijayanti N, Katz N, Immenschuh S (2004). "Biología del hemo en la salud y la enfermedad". Curr. Med. Chem . 11 (8): 981– 6. doi : 10.2174/0929867043455521 . PMID 15078160 . 
  53. ↑ Vorholt JA , Thauer RK (septiembre de 1997). "La especie activa de 'CO2' utilizada por la formilmetanofurano deshidrogenasa de arqueas metanogénicas" . European Journal of Biochemistry . 248 (3): 919– 24. Bibcode : 1997EJBio.248..919V . doi : 10.1111/j.1432-1033.1997.00919.x . PMID 9342247 . 
  54. ↑ Mendel RR, Hänsch R (agosto de 2002). "Molibdoenzimas y cofactor de molibdeno en plantas" . Journal of Experimental Botany . 53 (375): 1689–98 . doi : 10.1093/jxb/erf038 . PMID 12147719 . 
  55. ↑ Mendel RR, Bittner F (2006). "Biología celular del molibdeno". Biochim. Biophys. Acta . 1763 (7): 621– 35. doi : 10.1016/j.bbamcr.2006.03.013 . PMID 16784786 . 
  56. ↑ Ginsburg V (1978). "Bioquímica comparativa de azúcares unidos a nucleótidos". Progress in Clinical and Biological Research . 23 : 595–600 . PMID 351635 . 
  57. ↑ Negishi M, Pedersen LG, Petrotchenko E, Shevtsov S, Gorokhov A, Kakuta Y, Pedersen LC (junio de 2001). "Estructura y función de las sulfotransferasas" . Archives of Biochemistry and Biophysics . 390 (2): 149– 57. Bibcode : 2001ArBB..390..149N . doi : 10.1006/abbi.2001.2368 . PMID 11396917 . 
  58. ↑ Salisbury SA, Forrest HS, Cruse WB, Kennard O (agosto de 1979). "Una nueva coenzima de las alcohol deshidrogenasas primarias bacterianas". Nature . 280 ( 5725): 843– 4. Bibcode : 1979Natur.280..843S . doi : 10.1038/280843a0 . PMID 471057. S2CID 3094647 .  
  59. ↑ Thöny B, Auerbach G, Blau N (abril de 2000). "Biosíntesis, regeneración y funciones de la tetrahidrobiopterina" . The Biochemical Journal . 347 (1): 1– 16. doi : 10.1042/0264-6021:3470001 . PMC 1220924. PMID 10727395 .  
  60. ↑ DiMarco AA, Bobik TA, Wolfe RS (1990). "Coenzimas inusuales de la metanogénesis". Annual Review of Biochemistry . 59 : 355–94 . doi : 10.1146/annurev.bi.59.070190.002035 . PMID 2115763 . 
  61. ↑ Mitchell P (marzo de 1979). "La novena conferencia Sir Hans Krebs. Compartimentación y comunicación en sistemas vivos. Conducción de ligandos: un principio catalítico general en sistemas de reacción química, osmótica y quimiosmótica" . European Journal of Biochemistry . 95 (1): 1–20 . doi : 10.1111/j.1432-1033.1979.tb12934.x . PMID 378655 . 
  62. ↑ Wimmer MJ, Rose IA (1978). "Mecanismos de reacciones de transferencia de grupos catalizadas por enzimas". Annual Review of Biochemistry . 47 : 1031–78 . doi : 10.1146/annurev.bi.47.070178.005123 . PMID 354490 . 
  63. ↑ Di Carlo SE, Collins HL (2001). "Estimación de la resíntesis de ATP durante una carrera de maratón: un método para introducir el metabolismo" . Advan. Physiol. Edu . 25 (2): 70– 1.
  64. ↑ Chen X, Li N, Ellington AD (2007). "Catálisis del metabolismo por ribozimas en el mundo del ARN". Química y Biodiversidad . 4 (4): 633– 55. doi : 10.1002/cbdv.200790055 . PMID 17443876 . S2CID 44873410 .  
  65. ↑ Koch AL (1998). ¿Cómo surgieron las bacterias? Avances en fisiología microbiana. Vol. 40. págs. 353–99 . doi : 10.1016/S0065-2911(08)60135-6 . ISBN   9780120277407. PMID 9889982 . 
  66. ↑ Ouzounis C, Kyrpides N (julio de 1996). "El surgimiento de los principales procesos celulares en la evolución" . FEBS Letters . 390 (2): 119– 23. Bibcode : 1996FEBSL.390..119O . doi : 10.1016 / 0014-5793(96)00631-X . PMID 8706840. S2CID 39128865 .  
  67. ↑ White HB (marzo de 1976). "Las coenzimas como fósiles de un estado metabólico anterior". Journal of Molecular Evolution . 7 (2): 101– 4. Bibcode : 1976JMolE...7..101W . doi : 10.1007/BF01732468 . PMID 1263263. S2CID 22282629 .  
  68. ↑ Saran D, Frank J, Burke DH (2003). " La tiranía del reconocimiento de adenosina entre los aptámeros de ARN para la coenzima A" . BMC Evol. Biol . 3 26. doi : 10.1186/1471-2148-3-26 . PMC 317284. PMID 14687414 .  
  69. ^ Jadhav VR, Yarus M (2002). "Coenzimas como coribozimas". Bioquimia . 84 (9): 877– 88. doi : 10.1016/S0300-9084(02)01404-9 . PMID 12458080 . 
  70. ↑ Dowler, MJ; Fuller, WD; Orgel, LE; Sanchez, RA (1970-09-25). "Síntesis prebiótica de propiolaldehído y nicotinamida". Science . 169 (3952): 1320– 1321. Bibcode : 1970Sci...169.1320D . doi : 10.1126/science.169.3952.1320 . ISSN 0036-8075 . PMID 4247738 .  
  71. ↑ Keefe, AD; Newton, GL; Miller, SL (1995-02-23). ​​"Una posible síntesis prebiótica de panteteína, un precursor de la coenzima A". Nature . 373 (6516): 683– 685. Bibcode : 1995Natur.373..683K . doi : 10.1038/373683a0 . ISSN 0028-0836 . PMID 7854449 .  
  72. ↑ Monteverde, RD; Gómez-Consarnau, L.; Suffridge, C.; Sañudo-Wilhelmy, SA (enero 2017). "La utilización de las vitaminas B por parte de la vida en la Tierra primitiva" . Geobiología . 15 (1): 3– 18. Código Bib : 2017Gbio...15....3M . doi : 10.1111/gbi.12202 . ISSN 1472-4677 . PMID 27477998 .  
  73. ↑ Khoury GA, Fazelinia H, Chin JW, Pantazes RJ, Cirino PC, Maranas CD (octubre de 2009). "Diseño computacional de la xilosa reductasa de Candida boidinii para una especificidad de cofactor alterada" . Protein Science . 18 (10): 2125–38 . doi : 10.1002/pro.227 . PMC 2786976. PMID 19693930 .  
  74. ↑ Cinética enzimática integral . 2004. doi : 10.1007/b100340 . ISBN 0-306-46712-7.
  75. ↑ Garrett, R.; Grisham, Charles M. (2010). Bioquímica (4.ª ed.). Belmont, CA: Brooks/Cole, Cengage Learning. ISBN  978-0-495-10935-8.
  76. ↑ Carlberg, Inger; Mannervik, Bengt (1985), "Glutathione reductase", Glutamate, Glutamine, Glutathione, and Related Compounds , Methods in Enzymology, vol. 113, Elsevier, pp. 484–490 , doi : 10.1016/s0076-6879(85)13062-4 , ISBN   978-0-12-182013-8, PMID 3003504 , consultado el 21/09/2024 
  77. ↑ Harden A, Young WJ (24 de octubre de 1906). "La fermentación alcohólica del jugo de levadura" . Actas de la Royal Society B: Ciencias Biológicas . 78 (526): 369– 75. doi : 10.1098/rspb.1906.0070 .
  78. ↑ "Fermentación de azúcares y enzimas fermentativas: Conferencia Nobel, 23 de mayo de 1930" (PDF) . Fundación Nobel . Consultado el 30 de septiembre de 2007 .
  79. ↑ Lohmann K (agosto de 1929). "Über die Pyrophosphatfraktion im Muskel". Naturwissenschaften . 17 (31): 624– 5. Bibcode : 1929NW.....17..624. . doi : 10.1007/BF01506215 . S2CID 20328411 . 
  80. ↑ Lipmann F (1 de septiembre de 1945). "Acetilación de sulfanilamida por homogeneizados y extractos de hígado" . J. Biol. Chem . 160 (1): 173–90 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)43110-9 .
  81. ↑ Warburg O, Christian W (1936). "Piridin, the hydrogen-transferring component of the fermentation enzymes (pyridine nucleotide)". Biochemische Zeitschrift . 287 : E79– E88. doi : 10.1002/hlca.193601901199 .
  82. ↑ Kalckar HM (noviembre de 1974). " Orígenes del concepto de fosforilación oxidativa". Bioquímica molecular y celular . 5 ( 1–2 ): 55–63 . doi : 10.1007/BF01874172 . PMID 4279328. S2CID 26999163 .  
  83. ↑ Lipmann F (1941). "Generación metabólica y utilización de la energía del enlace fosfato". Un libro de referencia en química, 1900-1950 . Adv Enzymol. Vol. 1. págs. 99–162 . doi : 10.4159/harvard.9780674366701.c141 . ISBN   9780674366701.{{cite book}}: Incompatibilidad de ISBN/Fecha ( ayuda )
  84. ↑ Friedkin M, Lehninger AL (1949). "Esterificación de fosfato inorgánico acoplada al transporte de electrones entre nucleótido de dihidrodifosfopiridina y oxígeno" . J. Biol. Chem . 178 (2): 611–23 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)56879-4 . PMID 18116985 . 
  85. 1 2 Davidson VL (2007). "Cofactores derivados de proteínas. Ampliando el alcance de las modificaciones postraduccionales†". Biochemistry . 46 (18): 5283– 5292. doi : 10.1021/bi700468t . PMID 17439161 . 
  86. ↑ Davidson VL, Wilmot CM (2013). "Biosíntesis postraduccional del cofactor derivado de proteínas triptófano triptofilquinona" . Annual Review of Biochemistry . 82 : 531–50 . doi : 10.1146/annurev-biochem-051110-133601 . PMC 4082410. PMID 23746262 .  
  87. ↑ Huang SX, Lohman JR, Huang T, Shen B (mayo de 2013). "Un nuevo miembro de la familia de aminomutasas que contienen 4-metilidenimidazol-5-ona de la vía biosintética de la enediina kedarcidina" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 110 (20): 8069– 74. Bibcode : 2013PNAS..110.8069H . doi : 10.1073/pnas.1304733110 . PMC 3657804. PMID 23633564 .  
  88. ↑ Lodish, Harvey; Berk, Arnold; Zipursky, S. Lawrence; Matsudaira, Paul; Baltimore, David; Darnell, James (1 de enero de 2000). «Receptores acoplados a proteínas G y sus efectores». Biología celular molecular (4.ª ed.). Archivado del original el 15 de abril de 2021. 
  89. ↑ O'Malley BW, McKenna NJ (octubre de 2008). "Coactivadores y correpresores: ¿qué hay en un nombre?" . Endocrinología Molecular . 22 (10): 2213– 4. doi : 10.1210/me.2008-0201 . PMC 2582534 . PMID 18701638 .  

Lecturas adicionales

  • Bugg T (1997). Introducción a la química de enzimas y coenzimas . Oxford: Blackwell Science. ISBN 978-0-86542-793-8.
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