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DMAC1

La proteína transmembrana 261 es una proteína que en humanos está codificada por el gen TMEM261 ubicado en el cromosoma 9. [ 2 ] TMEM261 también se conoce como C9ORF123 y DMAC1 ...

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La proteína transmembrana 261 es una proteína que en humanos está codificada por el gen TMEM261 ubicado en el cromosoma 9. [ 2 ] TMEM261 también se conoce como C9ORF123 y DMAC1 , marco de lectura abierto 123 del cromosoma 9 y proteína transmembrana C9orf123 [ 3 ] y proteína 1 del complejo de ensamblaje del brazo de membrana distal. [ 4 ]

Características genéticas

TMEM261 se encuentra en 9p24.1, su longitud es de 91.891 pares de bases (pb) en la cadena inversa. [ 3 ] Su gen vecino es PTPRD, ubicado en 9p23-p24.3 también en la cadena inversa y codifica el receptor de tirosina fosfatasa de proteína tipo delta. [ 2 ] [ 3 ] TMEM261 tiene 2 exones y 1 intrón , y 6 variantes de transcripción primarias ; la variante de transcripción de ARNm más grande consta de 742 pb con una proteína de 129 aminoácidos (aa) de longitud y 13.500 daltons (Da) de tamaño, y la variante de transcripción codificante más pequeña es de 381 pb con una proteína de 69 aa de longitud y 6.100 Da de tamaño. [ 5 ] [ 6 ]

Características anotadas de la proteína TMEM261, incluyendo su topología y sitios importantes para la fosforilación y la miristoilación, así como los dominios helicoidales transmembrana DUF4536.

Características de las proteínas

TMEM261 es una proteína compuesta por 112 aminoácidos, con un peso molecular de 11,8 kDa. [ 7 ] Se predice que su punto isoeléctrico es 10,2, [ 8 ] mientras que su valor de modificación postraduccional es 9,9. [ 6 ]

Estructura

Se han encontrado algunas proteínas que interactúan con TMEM261.

TMEM261 contiene un dominio de función desconocida , DUF4536 (pfam15055), predicho como un dominio transmembrana helicoidal de aproximadamente 45 aa ( Cys 47- Ser 92) de longitud sin relaciones de dominio conocidas. [ 9 ] [ 10 ] Se predicen otros dos dominios helicoidales transmembrana de longitudes de 18 aa ( Val 52- Ala 69) y 23 aa ( Pro 81- Ala 102)]. [ 11 ] [ 12 ] También hay una región de baja complejidad que abarca 25 aa ( Thr 14- Ala 39). [ 13 ] La estructura terciaria de TMEM261 aún no se ha determinado. Sin embargo, su estructura secundaria proteica está compuesta principalmente por regiones de hélice enrollada con hebras beta y hélices alfa encontradas dentro de las regiones transmembrana y del dominio de función desconocida . La región N-terminal de TMEM261 está compuesta por una región desordenada [ 14 ] [ 15 ] que contiene la región de baja complejidad [ 13 ] que no está altamente conservada entre ortólogos. [ 16 ] [ 17 ]

Modificaciones

Se ha demostrado que un dominio de N-miristoilación está presente en la mayoría de las variantes de la proteína TMEM261. [ 6 ] Las modificaciones postraduccionales incluyen la miristoilación del residuo de glicina N-terminal ( Gly 2) [ 6 ] [ 18 ] de la proteína TMEM261, así como la fosforilación de la treonina 31. [ 19 ]

Interacciones

Entre las proteínas que interactúan con TMEM261 se encuentran NAAA ( interacción proteína-proteína ), QTRT1 ( interacción ARN-proteína ), ZC4H2 ( interacción ADN-proteína ) [ 20 ] y ZNF454 (interacción ADN-proteína). [ 21 ] [ 22 ] También se ha demostrado que interactúa con APP (interacción proteína-proteína), [ 23 ] ARHGEF38 (interacción proteína-proteína) [ 24 ] y HNRNPD ( interacción ARN-proteína ). [ 25 ] [ 26 ]

Expresión tisular de TMEM261 que muestra expresión de genes enriquecidos en tejidos (TEG) [ 27 ]

Entre los sitios de unión de factores de transcripción adicionales predichos (interacción ADN-proteína) se incluye un sitio de unión para MEF2C , un factor de mejora específico de monocitos que participa en la regulación de las células musculares, particularmente en el sistema cardiovascular [ 3 ] [ 28 ] , y dos sitios de unión para GATA1 , que es un factor de transcripción de globina 1 involucrado en la regulación del desarrollo de los eritroblastos . [ 29 ] [ 30 ] [ 31 ]

Expresión

TMEM261 muestra una expresión ubicua en humanos y se detecta en casi todos los tipos de tejido. [ 32 ] [ 33 ] Muestra una expresión de genes enriquecidos en tejidos (TEG) en comparación con la expresión de genes de mantenimiento (HKG). [ 27 ] Su mayor expresión se observa en el corazón (expresión relativa general del 94%), particularmente en fibroblastos cardíacos , timo (expresión relativa general del 90%) y tiroides (expresión relativa general del 93%), particularmente en células glandulares tiroideas. [ 27 ] [ 32 ] La intensidad de tinción de las células cancerosas mostró una expresión intermedia a alta en mama , colorrectal , ovario , piel , urotelial , cabeza y cuello . [ 32 ]

Función

Actualmente se desconoce la función de TMEM261. [ 34 ] Sin embargo, la amplificación genética y los reordenamientos de su locus se han asociado con varios tipos de cáncer, incluyendo cáncer colorrectal , [ 35 ] cáncer de mama [ 36 ] y linfomas . [ 37 ] [ 38 ]

Evolución

Ortólogos

Los ortólogos y homólogos de TMEM261 se limitan a los vertebrados ; su homólogo más antiguo data de los peces cartilaginosos [ 39 ] , que divergieron de Homo sapiens hace 462,5 millones de años [ 40 ] . La estructura primaria de la proteína TMEM261 muestra una mayor conservación general en mamíferos ; sin embargo, se observa una alta conservación del dominio de función desconocida (DUF4536) en la región del extremo C-terminal en todos los ortólogos, incluidos los homólogos distantes. La estructura de la proteína TMEM261 muestra conservación en la mayoría de los ortólogos [ 16 ] [ 17 ] .

Paralelos

TMEM261 no tiene parálogos conocidos. [ 39 ]

Referencias

  1. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  2. 1 2 "Proteína Entrez: TMEM261" .
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  • Registro genético del NCBI
  • Tarjetas genéticas
  • Navegador del genoma de UCSC
  • Portal de recursos bioinformáticos de Expasy
  • Banco de trabajo de biología del SDSC
  • Uniprot
  • HUGO Archivado el 24/09/2015 en la Wayback Machine

Lecturas adicionales

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