Hispanopedia Wiki
Articulo de referencia

Edición de ARN

La edición de ARN (también llamada modificación de ARN ) es un proceso molecular mediante el cual algunas células pueden realizar cambios discretos en secuencias de nucleótidos ...

Hispanopedia WikiContenido en espanolLectura gratuita

La edición de ARN (también llamada modificación de ARN ) es un proceso molecular mediante el cual algunas células pueden realizar cambios discretos en secuencias de nucleótidos específicas dentro de una molécula de ARN después de que esta haya sido generada por la ARN polimerasa . Ocurre en todos los organismos vivos y es una de las propiedades de los ARN más conservadas evolutivamente . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] La edición de ARN puede incluir la inserción, la deleción y la sustitución de bases de nucleótidos dentro de la molécula de ARN. La edición de ARN es relativamente rara, y las formas comunes de procesamiento de ARN (por ejemplo , el empalme , la adición de la caperuza 5' y la poliadenilación 3' ) no suelen considerarse edición. Puede afectar la actividad, la localización y la estabilidad de los ARN, y se ha relacionado con enfermedades humanas. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]

Se ha observado edición de ARN en algunas moléculas de ARNt , ARNr , ARNm o ARNm mi de eucariotas y sus virus , arqueas y procariotas . [ 5 ] La edición de ARN ocurre en el núcleo celular , así como dentro de las mitocondrias y los plastidios . En los vertebrados, la edición es rara y generalmente consiste en un pequeño número de cambios en la secuencia de las moléculas afectadas. En otros organismos, como los calamares , [ 6 ] puede ocurrir una edición extensa ( panedición ); en algunos casos, la mayoría de los nucleótidos en una secuencia de ARNm pueden resultar de la edición. Hasta ahora se han descrito más de 160 tipos de modificaciones de ARN. [ 7 ] El descubrimiento de modificaciones de ARN que resultan en la supresión de la inmunogenicidad del ARNm terapéutico llevó a su eventual adopción para las vacunas de ARNm de COVID y fue reconocido con el Premio Nobel de Fisiología o Medicina 2023 a Katalin Karikó y Drew Weissman . [ 8 ]

Los procesos de edición de ARN muestran una gran diversidad molecular, y algunos parecen ser adquisiciones evolutivamente recientes que surgieron de forma independiente. La diversidad de los fenómenos de edición de ARN incluye modificaciones de nucleobases como la desaminación de citidina (C) a uridina (U) y de adenosina (A) a inosina (I) , así como adiciones e inserciones de nucleótidos no codificantes. La edición de ARN en los ARNm altera efectivamente la secuencia de aminoácidos de la proteína codificada, de modo que difiere de la predicha por la secuencia de ADN genómico. [ 9 ]

El complejo editosoma

Detección de la edición de ARN

secuenciación de próxima generación

Para identificar diversas modificaciones postranscripcionales de las moléculas de ARN y determinar el panorama transcriptómico de las modificaciones de ARN mediante secuenciación de ARN de nueva generación, recientemente muchos estudios han desarrollado métodos de secuenciación convencionales [ 10 ] o especializados. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] Ejemplos de métodos especializados son MeRIP-seq , [ 11 ] m6A-seq, [ 12 ] PA-m5C - seq [ 13 ] , metilación-iCLIP, [ 14 ] m6A-CLIP, [ 15 ] Pseudo-seq, [ 16 ] Ψ-seq, [ 17 ] CeU-seq, [ 18 ] Aza-IP [ 19 ] y RiboMeth-seq [ 20 ] ). Muchos de estos métodos se basan en la captura específica de las especies de ARN que contienen la modificación específica, por ejemplo, mediante la unión de anticuerpos acoplada a la secuenciación de las lecturas capturadas. Después de la secuenciación, estas lecturas se mapean contra todo el transcriptoma para ver de dónde se originan. [ 21 ] Generalmente, con este tipo de enfoque es posible ver la ubicación de las modificaciones junto con la posible identificación de algunas secuencias consenso que podrían ayudar a la identificación y mapeo posteriores. Un ejemplo de los métodos especializados es PA-m ​​5 C-seq. Este método se desarrolló a partir del método PA-m ​​6 A-seq para identificar modificaciones m 5 C en el ARNm en lugar del objetivo original N6-metiladenosina. El cambio fácil entre diferentes modificaciones como objetivo es posible con un simple cambio del anticuerpo de captura de específico para m6A a específico para m 5 C. [ 13 ] La aplicación de estos métodos ha permitido identificar diversas modificaciones (por ejemplo, pseudouridina, m 6 A , m5C, 2′-O-Me) dentro de genes codificantes y genes no codificantes (por ejemplo, ARNt, ARNnc, microARN) a nivel de un solo nucleótido o con muy alta resolución. [ 4 ]

Espectrometría de masas

La espectrometría de masas es una forma de cuantificar las modificaciones del ARN. [ 22 ] Generalmente, las modificaciones provocan un aumento de masa en un nucleósido determinado . Esto proporciona una lectura característica para el nucleósido y su contraparte modificada. [ 22 ] Además, la espectrometría de masas permite investigar la dinámica de las modificaciones mediante el marcaje de moléculas de ARN con isótopos pesados ​​estables (no radiactivos) in vivo . Debido al aumento de masa definido de los nucleósidos marcados con isótopos pesados, estos pueden distinguirse de sus isótopos respectivos no marcados mediante espectrometría de masas. Este método, denominado NAIL-MS (espectrometría de masas acoplada al marcaje de isótopos de ácidos nucleicos), permite diversos enfoques para investigar la dinámica de las modificaciones del ARN. [ 23 ] [ 24 ] [ 25 ]

Tipos de ARN

Modificación del ARN mensajero

Recientemente, experimentos funcionales han revelado muchas funciones novedosas de las modificaciones del ARN. La mayoría de las modificaciones del ARN se encuentran en el ARN de transferencia y el ARN ribosómico, pero también se ha demostrado que el ARNm eucariota se modifica con múltiples modificaciones diferentes. Se han identificado 17 modificaciones naturales en el ARNm, de las cuales la N6-metiladenosina es la más abundante y estudiada. [ 26 ] Las modificaciones del ARNm están vinculadas a muchas funciones en la célula. Aseguran la correcta maduración y función del ARNm, pero también actúan al mismo tiempo como parte del sistema inmunitario de la célula. [ 27 ] Ciertas modificaciones, como los nucleótidos 2'O-metilados, se han asociado con la capacidad de las células para distinguir su propio ARNm del ARN extraño. [ 28 ] Por ejemplo, se ha predicho que m 6 A afecta la traducción y localización de proteínas, [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] la estabilidad del ARNm, [ 29 ] la elección alternativa de poliA [ 15 ] y la pluripotencia de las células madre. [ 30 ] La pseudouridilación de codones sin sentido suprime la terminación de la traducción tanto in vitro como in vivo , lo que sugiere que la modificación del ARN puede proporcionar una nueva forma de expandir el código genético. [ 31 ] Por otro lado, la 5-metilcitosina se ha asociado con el transporte de ARNm del núcleo al citoplasma y la mejora de la traducción. Estas funciones de m 5 C no se conocen ni se han demostrado completamente, pero un argumento sólido a favor de estas funciones en la célula es la localización observada de m 5 C en el sitio de inicio de la traducción. [ 32 ] Es importante destacar que muchas enzimas modificadoras están desreguladas y mutadas genéticamente en muchos tipos de enfermedades. [ 1 ] Por ejemplo, las mutaciones genéticas en las pseudouridina sintasas causan miopatía mitocondrial, anemia sideroblástica (MLASA) [ 33 ] y disqueratosis congénita. [ 34 ]

En comparación con las modificaciones identificadas en otras especies de ARN, como el ARNt y el ARNr, la cantidad de modificaciones identificadas en el ARNm es muy pequeña. Una de las principales razones por las que las modificaciones del ARNm no se conocen tan bien es la falta de técnicas de investigación. Además de la falta de modificaciones identificadas, el conocimiento de las proteínas asociadas también está por detrás del de otras especies de ARN. Las modificaciones son el resultado de interacciones enzimáticas específicas con la molécula de ARN. [ 26 ] En cuanto a las modificaciones del ARNm, la mayoría de las enzimas relacionadas conocidas son las enzimas escritoras que añaden la modificación al ARNm. Los grupos adicionales de enzimas lectoras y borradoras son, para la mayoría de las modificaciones, poco conocidos o desconocidos en absoluto. [ 35 ]  Por estas razones, durante la última década ha habido un gran interés en estudiar estas modificaciones y su función. [ 21 ]

Modificaciones del ARN de transferencia

El ARN de transferencia o ARNt es el tipo de ARN que se modifica con mayor frecuencia. [ 36 ] Las modificaciones en el ARNt desempeñan funciones cruciales para mantener la eficiencia de la traducción a través de la estructura de soporte, las interacciones anticodón-codón y las interacciones con enzimas. [ 37 ]

Las modificaciones del anticodón son importantes para la correcta decodificación del ARNm. Dado que el código genético es degenerado, estas modificaciones son necesarias para decodificar adecuadamente el ARNm. En particular, la posición de balanceo del anticodón determina cómo se leen los codones. Por ejemplo, en eucariotas, una adenosina en la posición 34 del anticodón puede convertirse en inosina. La inosina es una modificación que permite el apareamiento de bases con citosina, adenina y uridina. [ 38 ]

Otra base comúnmente modificada en el ARNt es la posición adyacente al anticodón. La posición 37 suele estar hipermodificada con modificaciones químicas voluminosas. Estas modificaciones previenen el cambio de marco de lectura y aumentan la estabilidad de la unión anticodón-codón mediante interacciones de apilamiento. [ 38 ]

Modificación del ARN ribosómico

El ARN ribosómico (ARNr) es esencial para la constitución de los ribosomas y la transferencia de péptidos durante los procesos de traducción. [ 39 ] Las modificaciones del ARN ribosómico se producen a lo largo de la síntesis de ribosomas y, a menudo, ocurren durante o después de la traducción. Estas modificaciones desempeñan principalmente un papel en la estructura del ARNr para proteger la eficiencia de la traducción. [ 39 ] La modificación química del ARNr consiste en la metilación de los azúcares de ribosa , la isomerización de las uridinas y la metilación y acetilación de bases individuales. [ 40 ]

Metilación

La metilación del ARNr mantiene la rigidez estructural al bloquear el apilamiento de pares de bases y rodea el grupo 2'-OH para bloquear la hidrólisis. Ocurre en partes específicas del ARNr eucariota. La plantilla para la metilación consta de 10-21 nucleótidos. [ 39 ] La 2'-O-metilación del azúcar ribosa es una de las modificaciones más comunes del ARNr. [ 41 ] La metilación es introducida principalmente por pequeños ARN nucleolares, denominados snoRNP. Hay dos clases de snoRNP que se dirigen a sitios de metilación, y se denominan caja C/D y caja H/ACA. [ 40 ] [ 41 ] Un tipo de metilación, la 2'-O-metilación, contribuye a la estabilización helicoidal. [ 39 ]

Isomerización

La isomerización de uridina a pseudouridina es la segunda modificación más común del ARNr. Estas pseudouridinas también son introducidas por las mismas clases de snoRNP que participan en la metilación. Las pseudouridina sintasas son las principales enzimas participantes en la reacción. [ 42 ] Los snoRNP de la caja H/ACA introducen secuencias guía que tienen aproximadamente 14-15 nucleótidos de longitud. [ 40 ] La pseudouridilación se desencadena en numerosos lugares de los ARNr a la vez para preservar la estabilidad térmica del ARN. [ 40 ] La pseudouridina permite un aumento de los enlaces de hidrógeno y altera la traducción en el ARNr y el ARNt. [ 41 ] [ 42 ] Altera la traducción al aumentar la afinidad de la subunidad del ribosoma a ARNm específicos. [ 39 ]

Edición básica:

La edición de bases es la tercera clase principal de modificación del ARNr, específicamente en eucariotas. Hay 8 categorías de ediciones de bases que pueden ocurrir en el espacio entre las subunidades ribosómicas pequeña y grande. [ 39 ] Las ARN metiltransferasas son las enzimas que introducen la metilación de bases. [ 39 ] Las acetiltransferasas son las enzimas responsables de la acetilación de la citosina en el ARNr. La metilación de bases juega un papel en la traducción. Todas estas modificaciones de bases trabajan en conjunto con las otras dos clases principales de modificación para contribuir a la estabilidad estructural del ARN. Un ejemplo de esto ocurre en la N7-metilación, que aumenta la carga del nucleótido para aumentar las interacciones iónicas de las proteínas que se unen al ARN antes de la traducción.

Edición mediante inserción o eliminación

El efecto de la inserción de uracilo en los transcritos de pre-ARNm

Se ha descubierto la edición de ARN mediante la adición y eliminación de uracilo en cinetoplastos de las mitocondrias de Trypanosoma brucei . [ 43 ] Debido a que esto puede involucrar una gran fracción de los sitios en un gen, a veces se le llama "pan-edición" para distinguirlo de la edición tópica de uno o pocos sitios.

La panedición comienza con el apareamiento de bases del transcrito primario no editado con un ARN guía (ARNg), que contiene secuencias complementarias a las regiones alrededor de los puntos de inserción/deleción. La región de doble cadena recién formada es luego envuelta por un editosoma, un gran complejo multiproteico que cataliza la edición. [ 44 ] [ 45 ] El editosoma abre el transcrito en el primer nucleótido mal emparejado y comienza a insertar uridinas. Las uridinas insertadas se aparearán con el ARN guía, y la inserción continuará mientras haya A o G en el ARN guía y se detendrá cuando se encuentre una C o U. [ 46 ] [ 47 ] Los nucleótidos insertados causan un cambio de marco de lectura y dan como resultado una proteína traducida que difiere de su gen.

El mecanismo del editosoma implica un corte endonucleolítico en el punto de desajuste entre el ARN guía y el transcrito no editado. El siguiente paso es catalizado por una de las enzimas del complejo, una U-transferasa terminal, que añade U desde UTP en el extremo 3' del ARNm. [ 48 ] Los extremos abiertos se mantienen en su lugar mediante otras proteínas del complejo. Otra enzima, una exorribonucleasa específica de U, elimina las U no apareadas. Después de que la edición ha hecho que el ARNm sea complementario al ARN guía, una ARN ligasa vuelve a unir los extremos del transcrito de ARNm editado. [ 49 ] [ 50 ] En consecuencia, el editosoma solo puede editar en dirección 3' a 5' a lo largo del transcrito de ARN primario. El complejo solo puede actuar sobre un único ARN guía a la vez. Por lo tanto, un transcrito de ARN que requiera una edición extensa necesitará más de un ARN guía y un complejo editosoma.

Edición por desaminación

Edición de C a U

El efecto de la edición de ARN de C a U en el gen ApoB humano

La edición implica la citidina desaminasa que desamina una base de citidina en una base de uridina. Un ejemplo de edición de C a U es con el gen de la apolipoproteína B en humanos. La apo B100 se expresa en el hígado y la apo B48 se expresa en los intestinos. En los intestinos, el ARNm tiene una secuencia CAA editada a UAA, un codón de parada, produciendo así la forma más corta B48. La edición de C a U ocurre a menudo en el ARN mitocondrial de las plantas con flores. Diferentes plantas tienen diferentes grados de edición de C a U; por ejemplo, ocurren ocho eventos de edición en las mitocondrias del musgo Funaria hygrometrica , mientras que ocurren más de 1700 eventos de edición en las licófitas Isoetes engelmanii . [ 51 ] La edición de C a U es realizada por miembros de la familia de proteínas de repetición de pentatricopéptido (PPR). Las angiospermas poseen grandes familias de PPR, que actúan como factores trans para elementos cis que carecen de una secuencia consenso; Arabidopsis cuenta con alrededor de 450 miembros en su familia de PPR. Se han descubierto numerosas proteínas PPR tanto en plastidios como en mitocondrias. [ 52 ]

Edición de la A a la I

Las modificaciones de adenosina a inosina (A a I) contribuyen a casi el 90 % de todos los eventos de edición en el ARN. La desaminación de la adenosina es catalizada por la adenosina desaminasa específica de ARN de doble cadena ( ADAR ), que normalmente actúa sobre los pre-ARNm. La desaminación de la adenosina a inosina interrumpe y desestabiliza el apareamiento de bases del ARN de doble cadena, lo que reduce la capacidad de dicho ARN para producir siRNA , que interfiere con la vía de ARN de interferencia (ARNi) .

El apareamiento de bases tambaleante hace que el ARN desaminado tenga una estructura única pero diferente, que puede estar relacionada con la inhibición del paso de iniciación de la traducción del ARN. Los estudios han demostrado que el ARN-I (ARN con muchas repeticiones del par de bases IU) recluta metilasas que están involucradas en la formación de heterocromatina y que esta modificación química interfiere fuertemente con los sitios diana de miRNA. [ 53 ] Hay una investigación activa sobre la importancia de las modificaciones de A a I y su propósito en el nuevo concepto de epitranscriptómica , en el que se hacen modificaciones al ARN que alteran su función. [ 54 ] [ 55 ] Una consecuencia establecida desde hace mucho tiempo de A a I en el ARNm es la interpretación de I como una G, por lo tanto conduce a la sustitución funcional de A a G, por ejemplo en la interpretación del código genético por los ribosomas. Sin embargo, estudios más recientes han debilitado esta correlación al demostrar que las inosinas también pueden ser decodificadas por el ribosoma (aunque en menor medida) como adenosinas o uracilos. Además, se demostró que las inosinas provocan el bloqueo de los ribosomas en el ARNm rico en inosinas. [ 56 ]

El desarrollo de la secuenciación de alto rendimiento en los últimos años ha permitido el desarrollo de extensas bases de datos para diferentes modificaciones y ediciones de ARN. RADAR (Base de datos rigurosamente anotada de edición de ARN de A a I) se desarrolló en 2013 para catalogar la gran variedad de sitios de A a I y los niveles específicos de tejido presentes en humanos, ratones y moscas . La adición de nuevos sitios y ediciones generales a la base de datos está en curso. [ 57 ] El nivel de edición para sitios de edición específicos, por ejemplo en el transcrito de filamina A, es específico de tejido. [ 58 ] La eficiencia del empalme de ARNm es un factor importante que controla el nivel de edición de ARN de A a I. [ 59 ] [ 60 ] Curiosamente, ADAR1 y ADAR2 también afectan el empalme alternativo a través de la capacidad de edición de A a I y la capacidad de unión al ARN bicatenario. [ 61 ] [ 62 ]

Edición alternativa de ARNm

La edición alternativa de ARNm de U a C se informó por primera vez en los transcritos de WT1 (tumor de Wilms-1), [ 63 ] y los cambios no clásicos de ARNm de GA se observaron por primera vez en los transcritos de HNRNPK (ribonucleoproteína nuclear heterogénea K) en muestras colorrectales tanto malignas como normales. [ 64 ] Estos últimos cambios también se observaron más tarde junto con alteraciones no clásicas de U a C en los transcritos de TPH2 (triptófano hidroxilasa 2) de células cerebrales. [ 65 ] Aunque la aminación inversa podría ser la explicación más simple para los cambios de U a C, se han propuesto mecanismos de transaminación y transglicosilación para los eventos de edición de U a C en plantas en los transcritos mitocondriales. [ 66 ] Un estudio reciente informó cambios novedosos de ARNm de G a A en los transcritos de WT1 en dos puntos críticos, proponiendo a APOBEC3A (enzima de edición de ARNm de apolipoproteína B, polipéptido catalítico 3A) como la enzima implicada en esta clase de edición alternativa de ARNm. [ 67 ] También se demostró que los cambios alternativos de ARNm estaban asociados con variantes de empalme canónicas de WT1 , lo que indica su importancia funcional.

Edición de ARN en mitocondrias y plastidios de plantas

Se ha demostrado en estudios previos que los únicos tipos de edición de ARN observados en las mitocondrias y plastidios de las plantas son la conversión de C a U y de U a C (muy rara). [ 68 ] [ 69 ] [ 70 ] [ 71 ] [ 72 ] [ 73 ] [ 74 ] [ 75 ] [ 76 ] [ 77 ] [ 78 ] [ 79 ] [ 80 ] Los sitios de edición de ARN se encuentran principalmente en las regiones codificantes del ARNm, intrones y otras regiones no traducidas. [ 70 ] De hecho, la edición de ARN puede restaurar la funcionalidad de las moléculas de ARNt. [ 72 ] [ 73 ] Los sitios de edición se encuentran principalmente corriente arriba de los ARN mitocondriales o de plastidios . Aunque las posiciones específicas para los eventos de edición de ARN de C a U se han estudiado bastante bien tanto en la mitocondria como en el plastidio, [ 81 ] la identidad y organización de todas las proteínas que componen el editosoma aún no se han establecido. Se ha demostrado que los miembros de la extensa familia de proteínas PPR funcionan como factores trans -actuantes para el reconocimiento de secuencias de ARN. [ 82 ] Miembros específicos de la familia MORF (Multiple Organellar RNA editing Factor) también son necesarios para la edición adecuada en varios sitios. Como se ha demostrado que algunas de estas proteínas MORF interactúan con miembros de la familia PPR, es posible que las proteínas MORF sean componentes del complejo editosoma. [ 83 ] Una enzima responsable de la trans- o desaminación del transcrito de ARN sigue siendo esquiva, aunque se ha propuesto que las proteínas PPR también pueden desempeñar esta función.

La edición de ARN es esencial para el funcionamiento normal de la traducción y la respiración de la planta. La edición puede restaurar las secuencias esenciales de apareamiento de bases de los ARNt, restaurando así su funcionalidad. [ 84 ] También se ha relacionado con la producción de proteínas editadas por ARN que se incorporan a los complejos polipeptídicos de la vía respiratoria. Por lo tanto, es muy probable que los polipéptidos sintetizados a partir de ARN no editados no funcionen correctamente y obstaculicen la actividad tanto de las mitocondrias como de los plastidios.

La edición de ARN de C a U puede crear codones de inicio y de parada , pero no puede destruir los codones de inicio y de parada existentes. Se crea un codón de inicio críptico cuando el codón ACG se edita para convertirse en AUG.

Resumen de las diversas funciones de la edición de ARN

Edición de ARN en virus

Se ha demostrado que los virus (es decir, sarampión , paperas o parainfluenza ), especialmente los virus que tienen un genoma de ARN, han evolucionado para utilizar modificaciones de ARN de muchas maneras al tomar el control de la célula huésped. Se sabe que los virus utilizan las modificaciones de ARN en diferentes partes de su ciclo de infección, desde la evasión inmunitaria hasta la mejora de la traducción de proteínas. [ 28 ] La edición de ARN se utiliza para la estabilidad y la generación de variantes de proteínas. [ 85 ] [ 86 ] Los ARN virales son transcritos por una ARN polimerasa dependiente de ARN codificada por el virus , que es propensa a pausarse y "tartamudear" en ciertas combinaciones de nucleótidos. Además, la polimerasa agrega hasta varios cientos de A no moldeadas en el extremo 3' del ARNm naciente. [ 87 ] Estas A ayudan a estabilizar el ARNm. Además, la pausa y el tartamudeo de la ARN polimerasa permiten la incorporación de una o dos G o A corriente arriba del codón de traducción. [ 87 ] La adición de los nucleótidos no codificados desplaza el marco de lectura, lo que genera una proteína diferente.

Además, se ha demostrado que las modificaciones del ARN tienen efectos tanto positivos como negativos en la eficiencia de replicación y traducción, dependiendo del virus. Por ejemplo, Courtney et al. [ 13 ] demostraron que una modificación del ARN llamada 5-metilcitosina se añade al ARNm viral en células huésped infectadas para mejorar la traducción de proteínas del virus VIH-1. La inhibición de la modificación m5C en el ARNm viral produce una reducción significativa en la traducción de proteínas virales, pero curiosamente no tiene efecto en la expresión de los ARNm virales en la célula. Por otro lado, Lichinchi et al. [ 88 ] demostraron que la modificación N6-metiladenosina en el ARNm del ZIKV inhibe la replicación viral.

Origen y evolución de la edición de ARN

El sistema de edición de ARN observado en el animal puede haber evolucionado a partir de desaminasas de mononucleótidos, lo que ha dado lugar a familias de genes más grandes que incluyen los genes apobec-1 y adar. Estos genes comparten una estrecha identidad con las desaminasas bacterianas implicadas en el metabolismo de nucleótidos. La adenosina desaminasa de E. coli no puede desaminar un nucleósido en el ARN; el bolsillo de reacción de la enzima es demasiado pequeño para que la cadena de ARN se una. Sin embargo, este sitio activo se amplía mediante cambios de aminoácidos en los genes análogos humanos correspondientes, APOBEC1 y ADAR , lo que permite la desaminación. [ 89 ] [ 90 ] La panedición mediada por gRNA en las mitocondrias de tripanosomas , que implica la inserción de residuos de U mediante plantilla, es una reacción bioquímica completamente diferente. Se ha demostrado en otros estudios que las enzimas implicadas se reclutan y adaptan de diferentes fuentes. [ 44 ] [ 91 ] Pero la especificidad de la inserción de nucleótidos a través de la interacción entre el ARN guía y el ARNm es similar a los procesos de edición del ARNt en las mitocondrias de animales y Acanthamoeba . [ 92 ] La metilación de la ribosa eucariota de los ARNr por moléculas de ARN guía es una forma similar de modificación. [ 93 ]

Así, la edición de ARN evolucionó más de una vez. Se han sugerido varias razones adaptativas para la edición. [ 94 ] La edición se describe a menudo como un mecanismo de corrección o reparación para compensar defectos en las secuencias genéticas. Sin embargo, en el caso de la edición mediada por ARN guía, esta explicación no parece posible porque si primero se produce un defecto, no hay forma de generar una región codificante de ARN guía libre de errores, que presumiblemente surge por duplicación de la región genética original. Una alternativa más plausible para los orígenes evolutivos de este sistema es a través de la evolución neutral constructiva , donde el orden de los pasos se invierte, con la capacidad gratuita de edición precediendo al "defecto". [ 95 ]

Edición terapéutica de ARNm

La edición dirigida para corregir secuencias mutadas se propuso y demostró por primera vez en 1995. [ 96 ] Este trabajo inicial utilizó oligonucleótidos antisentido de ARN sintéticos complementarios a una mutación de codón de parada prematuro en una secuencia de distrofina para activar la edición de A a I del codón de parada a un codón de lectura continua en un sistema modelo de células de xenopus. [ 96 ] Si bien esto también condujo a transiciones inadvertidas de A a I cercanas, las transiciones de A a I (leídas como G) pueden corregir los tres codones de parada, pero no pueden crear un codón de parada. Por lo tanto, los cambios llevaron a una corrección >25% del codón de parada objetivo con lectura continua a una secuencia reportera de luciferasa corriente abajo. El trabajo posterior de Rosenthal logró la edición de la secuencia de ARNm mutada en cultivo de células de mamíferos dirigiendo un oligonucleótido unido a una citidina desaminasa para corregir una secuencia mutada de fibrosis quística. [ 97 ] Más recientemente, se ha empleado CRISPR-Cas13 fusionado a deaminasas para dirigir la edición de ARNm. [ 98 ]

En 2022, se informó sobre la edición terapéutica de ARN para Cas7-11. [ 99 ] [ 100 ] Permite cortes suficientemente dirigidos y una versión temprana se utilizó para la edición in vitro en 2021. [ 101 ]

Comparación con la edición de ADN

A diferencia de la edición de ADN, que es permanente, los efectos de la edición de ARN —incluidas las posibles mutaciones no deseadas en el ARN— son transitorios y no se heredan. Por lo tanto, la edición de ARN se considera menos riesgosa. Además, puede requerir únicamente un ARN guía mediante el uso de la proteína ADAR, ya presente en humanos y en muchas otras células eucariotas, en lugar de tener que introducir una proteína extraña en el organismo. [ 102 ]

Véase también

Referencias

  1. 1 2 3 4 5 Li S, Mason CE (2013). "El panorama regulatorio fundamental de las modificaciones del ARN" . Annual Review of Genomics and Human Genetics . 15 : 127–150 . doi : 10.1146/annurev-genom-090413-025405 . PMID 24898039 . 
  2. 1 2 3 4 Song CX, Yi C, He C (noviembre de 2012). "Mapeo de variantes de nucleótidos recientemente identificadas en el genoma y el transcriptoma" . Nature Biotechnology . 30 (11): 1107– 1116. doi : 10.1038/nbt.2398 . PMC 3537840. PMID 23138310 .  
  3. 1 2 3 4 Meyer KD, Jaffrey SR (mayo de 2014). "El epitranscriptoma dinámico: N6-metiladenosina y control de la expresión génica" . Nature Reviews. Biología Celular Molecular . 15 (5): 313– 326. doi : 10.1038/nrm3785 . PMC 4393108. PMID 24713629 .  
  4. 1 2 Sun WJ, Li JH, Liu S, Wu J, Zhou H, Qu LH, Yang JH (enero de 2016). " RMBase: un recurso para decodificar el panorama de las modificaciones del ARN a partir de datos de secuenciación de alto rendimiento" . Nucleic Acids Research . 44 (D1): D259– D265. doi : 10.1093/nar/gkv1036 . PMC 4702777. PMID 26464443 .  
  5. ↑ Su AA, Randau L (agosto de 2011). "Edición de A a I y de C a U dentro de los ARN de transferencia". Bioquímica . Biokhimiia . 76 (8): 932– 937. doi : 10.1134/S0006297911080098 . PMID 22022967. S2CID 11283810 .  
  6. ↑ "Descubren nuevos poderes de edición genética en el calamar" . phys.org . Consultado el 5 de abril de 2020 .
  7. ^ Boccaletto P, Machnicka MA, Purta E, Piatkowski P, Baginski B, Wirecki TK, et al. (Enero de 2018). "MODOMICS: una base de datos de vías de modificación de ARN. Actualización de 2017" . Investigación de ácidos nucleicos . 46 (D1): D303– D307. doi : 10.1093/nar/gkx1030 . PMC 5753262 . PMID 29106616 .   
  8. ↑ "Premio Nobel de Fisiología o Medicina 2023" . NobelPrize.org . Consultado el 9 de abril de 2026 .
  9. ^ Brennicke A, Marchfelder A, Binder S (junio de 1999). "Edición de ARN" . Reseñas de microbiología FEMS . 23 (3): 297– 316. doi : 10.1111/j.1574-6976.1999.tb00401.x . PMID 10371035 . 
  10. ↑ Hoffmann A, Fallmann J, Vilardo E, Mörl M, Stadler PF, Amman F (abril de 2018). "Mapeo preciso de lecturas de ARNt" . Bioinformatics . 34 (7). Oxford, Inglaterra: 1116–1124 . doi : 10.1093/bioinformatics/btx756 . PMID 29228294 . 
  11. ↑ Meyer KD, Saletore Y, Zumbo P, Elemento O, Mason CE, Jaffrey SR (junio de 2012). "Análisis exhaustivo de la metilación del ARNm revela enriquecimiento en las regiones 3' UTR y cerca de los codones de parada" . Cell . 149 ( 7): 1635–1646 . doi : 10.1016/j.cell.2012.05.003 . PMC 3383396. PMID 22608085 .  
  12. ↑ Dominissini D, Moshitch-Moshkovitz S, Schwartz S, Salmon-Divon M, Ungar L, Osenberg S, et al. (abril de 2012). "Topología de los metilomas de ARN m6A humanos y de ratón revelada por m6A-seq". Nature . 485 (7397): 201– 206. Bibcode : 2012Natur.485..201D . doi : 10.1038/nature11112 . PMID 22575960. S2CID 3517716 .   
  13. 1 2 3 Courtney DG, Tsai K, Bogerd HP, Kennedy EM, Law BA, Emery A, et al. (agosto de 2019). "La adición epitranscriptómica de m 5 C a los transcritos del VIH-1 regula la expresión génica viral" . Cell Host & Microbe . 26 (2): 217–227.e6. doi : 10.1016/j.chom.2019.07.005 . PMC 6714563. PMID 31415754 .   
  14. ↑ Hussain S, Sajini AA, Blanco S, Dietmann S, Lombard P, Sugimoto Y, et al. (julio de 2013). " La metilación de la citosina-5 mediada por NSun2 del ARN no codificante de la bóveda determina su procesamiento en pequeños ARN reguladores" . Cell Reports . 4 (2): 255– 261. doi : 10.1016/j.celrep.2013.06.029 . PMC 3730056. PMID 23871666 .   
  15. 1 2 Ke S, Alemu EA, Mertens C, Gantman EC, Fak JJ, Mele A, et al. (octubre de 2015). "La mayoría de los residuos de m6A se encuentran en los últimos exones, lo que permite el potencial de regulación de la región 3' UTR" . Genes & Development . 29 (19): 2037–2053 . doi : 10.1101/gad.269415.115 . PMC 4604345. PMID 26404942 .   
  16. ↑ Carlile TM, Rojas-Duran MF, Zinshteyn B, Shin H, Bartoli KM, Gilbert WV (noviembre de 2014). " El perfil de pseudouridina revela la pseudouridilación regulada del ARNm en levaduras y células humanas" . Nature . 515 (7525): 143–146 . Bibcode : 2014Natur.515..143C . doi : 10.1038/nature13802 . PMC 4224642. PMID 25192136 .  
  17. ↑ Schwartz S, Bernstein DA, Mumbach MR, Jovanovic M, Herbst RH, León-Ricardo BX, et al. (septiembre de 2014). " Mapeo de todo el transcriptoma revela pseudouridilación regulada dinámicamente generalizada de ARNnc y ARNm" . Cell . 159 (1): 148–162 . doi : 10.1016/j.cell.2014.08.028 . PMC 4180118. PMID 25219674 .   
  18. ↑ Li X, Zhu P, Ma S, Song J, Bai J, Sun F, Yi C (agosto de 2015). "El pulldown químico revela la pseudouridilación dinámica del transcriptoma de mamíferos". Nature Chemical Biology . 11 (8): 592– 597. doi : 10.1038/nchembio.1836 . PMID 26075521 . 
  19. ↑ Khoddami V, Cairns BR (mayo de 2013). " Identificación de objetivos directos y bases modificadas de metiltransferasas de citosina de ARN" . Nature Biotechnology . 31 (5): 458– 464. doi : 10.1038/nbt.2566 . PMC 3791587. PMID 23604283 .  
  20. ^ Birkedal U, Christensen-Dalsgaard M, Krogh N, Sabarinathan R, Gorodkin J, Nielsen H (enero de 2015). "Perfiles de metilaciones de ribosa en ARN mediante secuenciación de alto rendimiento". Angewandte Chemie . 54 (2): 451– 455. Código bibliográfico : 2015ACIE...54..451B . doi : 10.1002/anie.201408362 . PMID 25417815 . 
  21. 1 2 Chen LQ, Zhao WS, Luo GZ (2020). "Mapeo y edición de modificaciones de ácidos nucleicos" . Computational and Structural Biotechnology Journal . 18 : 661–667 . doi : 10.1016/j.csbj.2020.03.010 . PMC 7113611. PMID 32257049 .  
  22. 1 2 Wetzel C, Limbach PA (enero de 2016). "Espectrometría de masas de ARN modificados: desarrollos recientes" . The Analyst . 141 (1): 16– 23. Bibcode : 2016Ana...141...16W . doi : 10.1039/ C5AN01797A . PMC 4679475. PMID 26501195 .  
  23. ↑ Heiss M, Reichle VF, Kellner S (septiembre de 2017). "Observación del destino del ARNt y sus modificaciones mediante espectrometría de masas con marcaje isotópico de ácidos nucleicos: NAIL-MS" . RNA Biology . 14 (9): 1260–1268 . doi : 10.1080/15476286.2017.1325063 . PMC 5699550. PMID 28488916 .  
  24. ↑ Reichle VF, Weber V, Kellner S (diciembre de 2018). "NAIL-MS en E. coli determina el origen y el destino de la metilación en el ARNt" . ChemBioChem . 19 ( 24): 2575–2583 . doi : 10.1002/cbic.201800525 . PMC 6582434. PMID 30328661 .  
  25. ↑ Reichle VF, Kaiser S, Heiss M, Hagelskamp F, Borland K, Kellner S (marzo de 2019). "Superando los límites del análisis estático de modificación de ARN con NAIL-MS dinámico" . Methods . 156 : 91–101 . doi : 10.1016/j.ymeth.2018.10.025 . PMID 30395967 . 
  26. 1 2 McCown PJ, Ruszkowska A, Kunkler CN, Breger K, Hulewicz JP, Wang MC, et al. (septiembre de 2020). " Ribonucleósidos modificados de origen natural" . Wiley Interdisciplinary Reviews. RNA . 11 (5) e1595. doi : 10.1002/wrna.1595 . PMC 7694415. PMID 32301288 .   
  27. ↑ Ontiveros RJ, Stoute J, Liu KF (abril de 2019). "La diversidad química de las modificaciones del ARN" . The Biochemical Journal . 476 (8): 1227– 1245. doi : 10.1042/BCJ20180445 . PMC 9073955. PMID 31028151. S2CID 135425191 .   
  28. ^ Pereira -Montecinos C, Valiente-Echeverría F, Soto-Rifo R (abril de 2017). "Regulación epitranscriptómica de la replicación viral" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Mecanismos reguladores de genes . 1860 (4): 460– 471. doi : 10.1016/j.bbagrm.2017.02.002 . PMID 28219769 . 
  29. ↑ Wang X, Lu Z, Gomez A, Hon GC, Yue Y, Han D, et al. (enero de 2014). "Regulación de la estabilidad del ARN mensajero dependiente de N6-metiladenosina" . Nature . 505 (7481): 117–120 . Bibcode : 2014Natur.505..117W . doi : 10.1038/nature12730 . PMC 3877715. PMID 24284625 .   
  30. ↑ Geula S, Moshitch-Moshkovitz S, Dominissini D, Mansour AA, Kol N, Salmon-Divon M, et al. (febrero de 2015). " Células madre. La metilación del ARNm m6A facilita la resolución de la pluripotencia ingenua hacia la diferenciación" . Science . 347 (6225): 1002–1006 . doi : 10.1126/science.1261417 . PMID 25569111. S2CID 206562941 .   
  31. ↑ Karijolich J, Yu YT (junio de 2011). "Conversión de codones sin sentido en codones con sentido mediante pseudouridilación dirigida" . Nature . 474 (7351): 395–398 . doi : 10.1038/nature10165 . PMC 3381908. PMID 21677757 .  
  32. ↑ Yang X, Yang Y, Sun BF, Chen YS, Xu JW, Lai WY, et al. (mayo de 2017). " La 5-metilcitosina promueve la exportación de ARNm: NSUN2 como metiltransferasa y ALYREF como lector de m 5 C" . Cell Research . 27 (5): 606– 625. doi : 10.1038/cr.2017.55 . PMC 5594206. PMID 28418038 .   
  33. ↑ Bykhovskaya Y, Casas K, Mengesha E, Inbal A, Fischel-Ghodsian N (junio de 2004). "Mutación de sentido erróneo en la pseudouridina sintasa 1 (PUS1) causa miopatía mitocondrial y anemia sideroblástica (MLASA)" . American Journal of Human Genetics . 74 (6): 1303–1308 . doi : 10.1086/421530 . PMC 1182096. PMID 15108122 .  
  34. ↑ Heiss NS, Knight SW, Vulliamy TJ, Klauck SM, Wiemann S, Mason PJ, et al. (mayo de 1998). "La disqueratosis congénita ligada al cromosoma X es causada por mutaciones en un gen altamente conservado con supuestas funciones nucleolares". Nature Genetics . 19 (1): 32– 38. doi : 10.1038/ng0598-32 . PMID 9590285. S2CID 205342127 .   
  35. ↑ Gilbert WV, Bell TA, Schaening C (junio de 2016). "Modificaciones del ARN mensajero: forma, distribución y función" . Science . 352 ( 6292): 1408–1412 . Bibcode : 2016Sci...352.1408G . doi : 10.1126/science.aad8711 . PMC 5094196. PMID 27313037 .  
  36. ↑ Kirchner S, Ignatova Z (febrero de 2015). "Funciones emergentes del ARNt en la traducción adaptativa, la dinámica de la señalización y las enfermedades". Nature Reviews. Genetics . 16 (2): 98– 112. doi : 10.1038/nrg3861 . PMID 25534324. S2CID 6727707 .  
  37. ↑ Lorenz C, Lünse CE, Mörl M (abril de 2017). " Modificaciones del ARNt: impacto en la estructura y la adaptación térmica" . Biomolecules . 7 (2): 35. doi : 10.3390/biom7020035 . PMC 5485724. PMID 28375166 .  
  38. 1 2 Agris PF, Vendeix FA, Graham WD (febrero de 2007). "Decodificación del genoma mediante el balanceo del ARNt: 40 años de modificación". Journal of Molecular Biology . 366 (1): 1– 13. doi : 10.1016/j.jmb.2006.11.046 . PMID 17187822 . 
  39. 1 2 3 4 5 6 7 Sloan KE, Warda AS, Sharma S, Entian KD, Lafontaine DL, Bohnsack MT (septiembre de 2017). "Ajustando el ribosoma: la influencia de la modificación del ARNr en la biogénesis y función del ribosoma eucariota" . RNA Biology . 14 (9): 1138– 1152. doi : 10.1080/15476286.2016.1259781 . PMC 5699541. PMID 27911188 .  
  40. 1 2 3 4 Sharma, Sunny; Entian, Karl-Dieter (2022), "Modificaciones químicas del ARN ribosómico", en Entian, Karl-Dieter (ed.), Biogénesis del ribosoma: métodos y protocolos , Métodos en biología molecular, vol. 2533, Nueva York, NY: Springer US, pp. 149–166 , doi : 10.1007/978-1-0716-2501-9_9 , ISBN   978-1-0716-2501-9, PMC 9761533 , PMID 35796987  
  41. 1 2 3 Borchardt, Erin K.; Martinez, Nicole M.; Gilbert, Wendy V. (23 de noviembre de 2020). " Regulación y función de la pseudouridilación del ARN en células humanas" . Annual Review of Genetics . 54 : 309–336 . doi : 10.1146/annurev-genet-112618-043830 . ISSN 0066-4197 . PMC 8007080. PMID 32870730 .   
  42. 1 2 Borchardt, Erin K.; Martinez, Nicole M.; Gilbert, Wendy V. (23 de noviembre de 2020). "Regulación y función de la pseudouridilación del ARN en células humanas" . Annual Review of Genetics . 54 (1): 309– 336. doi : 10.1146/ annurev -genet-112618-043830 . ISSN 0066-4197 . PMC 8007080. PMID 32870730 .   
  43. ↑ Benne R (abril de 1994). "Edición de ARN en tripanosomas" . European Journal of Biochemistry . 221 (1): 9– 23. doi : 10.1111/j.1432-1033.1994.tb18710.x . PMID 7513284 . 
  44. 1 2 Arts GJ, Benne R (junio de 1996). "Mecanismo y evolución de la edición de ARN en kinetoplástidos". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Estructura y expresión génica . 1307 (1): 39– 54. doi : 10.1016/0167-4781(96)00021-8 . PMID 8652667 . 
  45. ↑ Alfonzo JD, Thiemann O, Simpson L (octubre de 1997). "El mecanismo de edición de ARN por inserción/deleción de U en mitocondrias de cinetoplástidos" . Nucleic Acids Research . 25 (19): 3751–3759 . doi : 10.1093/nar/25.19.3751 (inactivo el 12 de julio de 2025). PMC 146959. PMID 9380494 .  {{cite journal}}: CS1 maint: DOI inactivo desde julio de 2025 ( enlace )
  46. ↑ Blum B, Bakalara N, Simpson L (enero de 1990). "Un modelo para la edición de ARN en mitocondrias de cinetoplástidos: las moléculas de ARN "guía" transcritas a partir del ADN del maxicírculo proporcionan la información editada". Cell . 60 ( 2): 189–198 . doi : 10.1016/0092-8674(90)90735-W . PMID 1688737. S2CID 19656609 .  
  47. ↑ Kable ML, Heidmann S, Stuart KD (mayo de 1997). "Edición de ARN: cómo introducir U en el ARN". Trends in Biochemical Sciences . 22 (5): 162– 166. doi : 10.1016/S0968-0004(97)01041-4 . PMID 9175474 . 
  48. ↑ Simpson L, Thiemann OH (junio de 1995). "Sentido a partir del sinsentido: edición de ARN en mitocondrias de protozoos cinetoplástidos y mohos mucilaginosos" . Cell . 81 ( 6): 837– 840. doi : 10.1016/0092-8674(95)90003-9 . PMID 7781060. S2CID 4634304 .  
  49. ↑ Stuart K (febrero de 1991). "Edición de ARN en el ARNm mitocondrial de tripanosomátidos". Trends in Biochemical Sciences . 16 (2): 68– 72. doi : 10.1016/0968-0004(91)90027-S . PMID 1713359 . 
  50. ↑ Hajduk SL, Sabatini RS (1998). "Edición de ARNm mitocondrial en protozoos cinetoplástidos". En Grosjean H, Benne R (eds.). Modificación y Edición de ARN . Washington, DC: Prensa ASM. págs. 377-394 . 
  51. ^ Takenaka M, Verbitskiy D, Zehrmann A, Härtel B, Bayer-Császár E, Glass F, Brennicke A (noviembre de 2014). "Edición de ARN en mitocondrias de plantas: conexión de secuencias diana de ARN y proteínas actuantes". Mitocondria . Plantar mitocondrias en mitocondria. 19 (Parte B): 191– 197. doi : 10.1016/j.mito.2014.04.005 . PMID 24732437 . 
  52. ↑ Shikanai T (septiembre de 2015). "Edición de ARN en plantas: maquinaria y flexibilidad del reconocimiento de sitios" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergética . SI: Biogénesis de cloroplastos. 1847 (9): 779–785 . doi : 10.1016/j.bbabio.2014.12.010 . PMID 25585161 . 
  53. ↑ Nishikura K (2010). "Funciones y regulación de la edición de ARN por desaminasas ADAR" . Annual Review of Biochemistry . 79 (1): 321– 349. doi : 10.1146/annurev-biochem-060208-105251 . PMC 2953425. PMID 20192758 .  
  54. ↑ Tajaddod M, Jantsch MF, Licht K (marzo de 2016). "El epitranscriptoma dinámico: la edición de A a I modula la información genética" . Chromosoma . 125 ( 1): 51– 63. doi : 10.1007/s00412-015-0526-9 . PMC 4761006. PMID 26148686 .  
  55. ↑ Licht K, Jantsch MF (abril de 2016). " Regulación rápida y dinámica del transcriptoma mediante edición y modificaciones de ARN" . The Journal of Cell Biology . 213 (1): 15–22 . doi : 10.1083/jcb.201511041 . PMC 4828693. PMID 27044895 .  
  56. ↑ Licht K, Hartl M, Amman F, Anrather D, Janisiw MP, Jantsch MF (enero de 2019). "La inosina induce una recodificación dependiente del contexto y un bloqueo traslacional" . Nucleic Acids Research . 47 (1): 3– 14. doi : 10.1093/nar/gky1163 . PMC 6326813. PMID 30462291 .  
  57. ↑ Ramaswami G, Li JB (enero de 2014). "RADAR: una base de datos rigurosamente anotada de edición de ARN de A a I" . Nucleic Acids Research . 42 (número especial de bases de datos): D109– D113. doi : 10.1093/nar/gkt996 . PMC 3965033. PMID 24163250 .  
  58. ↑ Stulić M, Jantsch MF (octubre de 2013). "Perfil espacio-temporal de la edición de ARN de filamina A revela preferencias de ADAR y altos niveles de edición fuera de los tejidos neuronales" . RNA Biology . 10 (10): 1611– 1617. doi : 10.4161/rna.26216 . PMC 3866242. PMID 24025532 .  
  59. ↑ Licht K, Kapoor U, Mayrhofer E, Jantsch MF (julio de 2016). "La frecuencia de edición de adenosina a inosina está controlada por la eficiencia del empalme" . Nucleic Acids Research . 44 (13): 6398– 6408. doi : 10.1093 / nar/gkw325 . PMC 5291252. PMID 27112566 .  
  60. ↑ Licht K, Kapoor U, Amman F, Picardi E, Martin D, Bajad P, Jantsch MF (septiembre de 2019). " Un mapa de edición A-a-I de alta resolución en el ratón identifica eventos de edición controlados por el empalme del pre-ARNm" . Genome Research . 29 (9): 1453– 1463. doi : 10.1101/gr.242636.118 . PMC 6724681. PMID 31427386 .  
  61. ↑ Kapoor U, Licht K, Amman F, Jakobi T, Martin D, Dieterich C, Jantsch MF (agosto de 2020). " La deficiencia de ADAR perturba el panorama global del empalme en los tejidos del ratón" . Genome Research . 30 (8): 1107– 1118. doi : 10.1101/gr.256933.119 . PMC 7462079. PMID 32727871 .  
  62. ↑ Tang SJ, Shen H, An O, Hong H, Li J, Song Y, et al. (febrero de 2020). "Las regulaciones cis y trans del empalme del pre-ARNm por enzimas de edición de ARN influyen en el desarrollo del cáncer" . Nature Communications . 11 (1) 799. Bibcode : 2020NatCo..11..799T . doi : 10.1038/s41467-020-14621-5 . PMC 7005744. PMID 32034135 .   
  63. ↑ Sharma PM, Bowman M, Madden SL, Rauscher FJ, Sukumar S (marzo de 1994). "Edición de ARN en el gen de susceptibilidad al tumor de Wilms, WT1" . Genes & Development . 8 (6): 720–731 . doi : 10.1101/gad.8.6.720 . PMID 7926762 . 
  64. ^ Klimek-Tomczak K, Mikula M, Dzwonek A, Paziewska A, Karczmarski J, Hennig E, et al. (febrero de 2006). "Edición del ARNm de la proteína hnRNP K en adenocarcinoma colorrectal y mucosa circundante" . Revista británica de cáncer . 94 (4): 586– 592. doi : 10.1038/sj.bjc.6602938 . PMC 2361188 . PMID 16404425 .   
  65. ↑ Grohmann M, Hammer P, Walther M, Paulmann N, Büttner A, Eisenmenger W, et al. (enero de 2010). " Empalme alternativo y edición extensa de ARN de los transcritos humanos de TPH2" . PLOS ONE . 5 (1) e8956. Bibcode : 2010PLoSO...5.8956G . doi : 10.1371/journal.pone.0008956 . PMC 2813293. PMID 20126463 .   
  66. ↑ Castandet B, Araya A (agosto de 2011). "Edición de ARN en orgánulos vegetales. ¿Por qué hacerlo fácil?". Bioquímica. Biokhimiia . 76 (8): 924– 931. doi : 10.1134/S0006297911080086 . PMID 22022966 . S2CID 2174535 .  
  67. ↑ Niavarani A, Currie E, Reyal Y, Anjos-Afonso F, Horswell S, Griessinger E, et al. (2015). " APOBEC3A está implicada en una nueva clase de edición de ARNm de G a A en los transcritos de WT1" . PLOS ONE . 10 (3) e0120089. Bibcode : 2015PLoSO..1020089N . doi : 10.1371/journal.pone.0120089 . PMC 4373805. PMID 25807502 .   
  68. ↑ Covello PS, Gray MW (octubre de 1989). " Edición de ARN en mitocondrias de plantas". Nature . 341 (6243): 662– 666. Bibcode : 1989Natur.341..662C . doi : 10.1038/341662a0 . PMID 2552326. S2CID 4373041 .  
  69. ^ Gualberto JM, Lamattina L, Bonnard G, Weil JH, Grienenberger JM (octubre de 1989). "La edición de ARN en las mitocondrias del trigo da como resultado la conservación de secuencias de proteínas". Naturaleza . 341 (6243): 660– 662. Bibcode : 1989Natur.341..660G . doi : 10.1038/341660a0 . PMID 2552325 . S2CID 19402913 .  
  70. ^ Hiesel R, Wissinger B, Schuster W, Brennicke A (diciembre de 1989). "Edición de ARN en mitocondrias de plantas". Ciencia . 246 (4937): 1632– 1634. Bibcode : 1989Sci...246.1632H . doi : 10.1126/ciencia.2480644 . PMID 2480644 . 
  71. ↑ Hoch B, Maier RM, Appel K, Igloi GL, Kössel H (septiembre de 1991). "Edición de un ARNm de cloroplasto mediante la creación de un codón de iniciación". Nature . 353 ( 6340): 178– 180. Bibcode : 1991Natur.353..178H . doi : 10.1038/353178a0 . PMID 1653905. S2CID 4303733 .  
  72. 1 2 Pring D, Brennicke A, Schuster W (marzo de 1993). "La edición de ARN da un nuevo significado a la información genética en mitocondrias y cloroplastos". Plant Molecular Biology . 21 (6): 1163– 1170. Bibcode : 1993PMolB..21.1163P . doi : 10.1007/BF00023611 . PMID 8490134 . S2CID 30396182 .  
  73. 1 2 Wissinger B, Brennicke A, Schuster W (septiembre de 1992). "Regenerando el buen sentido: edición de ARN y trans-empalme en mitocondrias de plantas". Trends in Genetics . 8 (9): 322– 328. doi : 10.1016/0168-9525(92)90265-6 . PMID 1365399 . 
  74. ↑ Grienenberger JM (1993). "Edición de ARN en orgánulos vegetales". Edición de ARN (Benne, R., Ed.), Ellis Harwood, Nueva York .
  75. ↑ Malek O, Lättig K, Hiesel R, Brennicke A, Knoop V (marzo de 1996). "Edición de ARN en briofitas y una filogenia molecular de plantas terrestres" . The EMBO Journal . 15 (6): 1403– 1411. doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00482.x . PMC 450045. PMID 8635473 .  
  76. ↑ Freyer R, Kiefer-Meyer MC, Kössel H (junio de 1997). "Presencia de edición de ARN de plastidios en todos los linajes principales de plantas terrestres" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 94 (12): 6285– 6290. Bibcode : 1997PNAS...94.6285F . doi : 10.1073/pnas.94.12.6285 . PMC 21041. PMID 9177209 .  
  77. ↑ Dietrich A, Small I, Cosset A, Weil JH, Maréchal-Drouard L (1996). "Edición e importación: estrategias para proporcionar a las mitocondrias de las plantas un conjunto completo de ARN de transferencia funcionales". Biochimie . 78 (6): 518– 529. doi : 10.1016/0300-9084(96)84758-4 . PMID 8915541 . 
  78. ↑ Bock R, Hermann M, Fuchs M (octubre de 1997). "Identificación de posiciones de nucleótidos críticos para el reconocimiento del sitio de edición del ARN de los plastidios" . RNA . 3 ( 10): 1194– 1200. PMC 1369561. PMID 9326494 .  
  79. ↑ Gray MW, Covello PS (enero de 1993). " Edición de ARN en mitocondrias y cloroplastos de plantas" . FASEB Journal . 7 (1): 64– 71. doi : 10.1096/fasebj.7.1.8422976 . PMID 8422976. S2CID 26005486 .  
  80. ↑ Marchfelder A, Binder S, Brennicke A, Knoop V (1998). "Prefacio". En Grosjean H, Benne R (eds.). Modificación y edición del ARN . Washington, DC: ASM Press. págs. 307–323 . 
  81. ^ Takenaka M, Zehrmann A, Verbitskiy D, Härtel B, Brennicke A (2013). "Edición de ARN en plantas y su evolución". Revista Anual de Genética . 47 : 335– 352. doi : 10.1146/annurev-genet-111212-133519 . PMID 24274753 . 
  82. ↑ Barkan A, Small I (2014). "Proteínas con repeticiones de pentatricopéptidos en plantas" . Annual Review of Plant Biology . 65 (1): 415– 442. Bibcode : 2014AnRPB..65..415B . doi : 10.1146/annurev-arplant-050213-040159 . PMID 24471833 . 
  83. ↑ Bentolila S, Oh J, Hanson MR, Bukowski R (junio de 2013). "Análisis exhaustivo de alta resolución del papel de una familia de genes de Arabidopsis en la edición de ARN" . PLOS Genetics . 9 (6) e1003584. doi : 10.1371/journal.pgen.1003584 . PMC 3688494. PMID 23818871 .  
  84. ↑ Price DH, Gray MW (1998). "Edición del ARNt". En Grosjean H, Benne R (eds.). Modificación y edición del ARN . Washington, DC: ASM Press. págs. 289–306 . 
  85. ^ Curran J, Boeck R, Kolakofsky D (octubre de 1991). "El gen P del virus Sendai expresa una proteína esencial y un inhibidor de la síntesis de ARN mediante la combinación de módulos mediante la edición de ARNm" . La Revista EMBO . 10 (10): 3079– 3085. doi : 10.1002/j.1460-2075.1991.tb07860.x . PMC 453024 . PMID 1655410 .  
  86. ↑ Zheng H, Fu TB, Lazinski D, Taylor J (agosto de 1992). "Edición en el ARN genómico del virus delta de la hepatitis humana" . Journal of Virology . 66 (8): 4693– 4697. doi : 10.1128/jvi.66.8.4693-4697.1992 . PMC 241294. PMID 1629949 .  
  87. 1 2 Kolakofsky D, Hausmann S (1998). "Capítulo 23: Edición cotranscripcional del ARNm de paramixovirus: ¿una contradicción en los términos?". En Grosjean H, Benne R (eds.). Modificación y edición del ARN . Washington, DC: ASM Press. págs. 413–420 . 
  88. ↑ Lichinchi G, Zhao BS, Wu Y, Lu Z, Qin Y, He C, Rana TM (noviembre de 2016). " Dinámica de la metilación del ARN humano y viral durante la infección por el virus Zika" . Cell Host & Microbe . 20 (5): 666– 673. doi : 10.1016/j.chom.2016.10.002 . PMC 5155635. PMID 27773536 .  
  89. ↑ Carter CW (1998). "Desaminasas de nucleósidos para citidina y adenosina: comparaciones con desaminasas que actúan sobre el ARN". En Grosjean H, Benne R (eds.). Modificación y edición del ARN . Washington, DC: ASM Press. págs. 363–376 . 
  90. ↑ Navaratnam N, Fujino T, Bayliss J, Jarmuz A, How A, Richardson N, et al. (enero de 1998). "La citidina desaminasa de Escherichia coli proporciona un modelo molecular para la edición de ARN de ApoB y un mecanismo para el reconocimiento del sustrato de ARN". Journal of Molecular Biology . 275 (4): 695– 714. doi : 10.1006/jmbi.1997.1506 . PMID 9466941 .  
  91. ↑ Covello PS, Gray MW (agosto de 1993). "Sobre la evolución de la edición de ARN". Trends in Genetics . 9 (8): 265– 268. doi : 10.1016/0168-9525(93)90011-6 . PMID 8379005 . 
  92. ↑ Lonergan KM, Gray MW (septiembre de 1993). " Edición predicha de ARN de transferencia adicionales en mitocondrias de Acanthamoeba castellanii" . Nucleic Acids Research . 21 (18): 4402. doi : 10.1093/nar/21.18.4402 . PMC 310088. PMID 8415006 .  
  93. ↑ Bachellerie JP, Cavaille J (1998). "Los ARN nucleolares pequeños guían las metilaciones de ribosa de los ARN ribosómicos eucariotas". En Grosjean H, Benne R (eds.). Modificación y edición del ARN . Washington, DC: ASM Press. págs. 255–272 . 
  94. ↑ Speijer D (mayo de 2011). "¿Desempeña la evolución neutral constructiva un papel importante en el origen de la complejidad celular? Dando sentido a los orígenes y usos de la complejidad biológica". BioEssays . 33 ( 5): 344– 349. doi : 10.1002/bies.201100010 . PMID 21381061. S2CID 205470421 .  
  95. ↑ Stoltzfus A (agosto de 1999). "Sobre la posibilidad de una evolución neutral constructiva". Journal of Molecular Evolution . 49 (2): 169– 181. Bibcode : 1999JMolE..49..169S . CiteSeerX 10.1.1.466.5042 . doi : 10.1007/PL00006540 . PMID 10441669. S2CID 1743092 .   
  96. 1 2 Woolf TM, Chase JM, Stinchcomb DT (agosto de 1995). "Hacia la edición terapéutica de secuencias de ARN mutadas" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 92 (18): 8298– 8302. Bibcode : 1995PNAS...92.8298W . doi : 10.1073/pnas.92.18.8298 . PMC 41144. PMID 7545300 .  
  97. ↑ Montiel-Gonzalez MF, Vallecillo-Viejo I, Yudowski GA, Rosenthal JJ (noviembre de 2013). "Corrección de mutaciones dentro del regulador de conductancia transmembrana de la fibrosis quística mediante edición de ARN dirigida al sitio" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 110 (45): 18285– 18290. Bibcode : 2013PNAS..11018285M . doi : 10.1073/pnas.1306243110 . PMC 3831439. PMID 24108353 .  
  98. ↑ Cox DB, Gootenberg JS, Abudayyeh OO, Franklin B, Kellner MJ, Joung J, Zhang F (noviembre de 2017). " Edición de ARN con CRISPR-Cas13" . Science . 358 (6366): 1019–1027 . Bibcode : 2017Sci...358.1019C . doi : 10.1126/science.aaq0180 . PMC 5793859. PMID 29070703 .  
  99. ↑ Williams S. "Neurocientíficos amplían el conjunto de herramientas CRISPR con la nueva y compacta enzima Cas7-11" . Instituto Tecnológico de Massachusetts . Consultado el 22 de junio de 2022 .
  100. ↑ Kato K, Zhou W, Okazaki S, Isayama Y, Nishizawa T, Gootenberg JS, et al. (junio de 2022). " Estructura e ingeniería del complejo efector CRISPR-Cas7-11 tipo III-E" . Cell . 185 (13): 2324–2337.e16. doi : 10.1016/j.cell.2022.05.003 . PMID 35643083. S2CID 249103058 .   
  101. ↑ Özcan A, Krajeski R, Ioannidi E, Lee B, Gardner A, Makarova KS, et al. (septiembre de 2021). "Dirigir ARN programable con el efector CRISPR de proteína única Cas7-11". Nature . 597 ( 7878): 720– 725. Bibcode : 2021Natur.597..720O . doi : 10.1038/s41586-021-03886-5 . PMID 34489594. S2CID 237432753 .   
  102. ↑ Cross R (25 de marzo de 2019). "Cuidado, CRISPR. La carrera por la edición de ARN ha comenzado" . Chemical & Engineering News . 97 (12) . Recuperado el 30 de septiembre de 2020 .
Lecturas relacionadas
6 articulos
Secuencia de ácido nucleicoSecuencia de ácido nucleicoUna secuencia de ácidos nucleicos es una sucesión de bases dentro de los nucleótidos que forman alelos dentro de una molécula de ADN (usando GACT) ...ARNARNEl ácido ribonucleico ( ARN ) es una molécula polimérica que es esencial para la mayoría de las funciones biológicas, ya sea realizando la función ...ARN polimerasaARN polimerasaLa ARN polimerasa (violeta) desenrolla la doble hélice del ADN. Utiliza una hebra (naranja más oscuro) como plantilla para crear el ARN mensajero m...Empalme de ARNEmpalme de ARNEl empalme de ARN es un proceso de biología molecular en el que un transcrito de ARN mensajero precursor recién creado (pre- ARNm ) se transforma e...PDB 1ckm EBIEnzima de tapadoUna enzima de caperuza (CE) es una enzima que cataliza la unión de la caperuza 5' a las moléculas de ARN mensajero que están en proceso de sintetiz...PoliadenilaciónPoliadenilación120 ms 10.7% MediaWiki\Extension\Scribu...