Imitación SWI

ISWI ( imitación SWI tch) es uno de los cinco tipos principales de complejos de remodelación de la cromatina del ADN, o subfamilias, que se encuentran en la mayoría de los organismos eucariotas. [ ^{1 ] Los} complejos de remodelación ISWI colocan nucleosomas a lo largo de segmentos de ADN a intervalos regulares. La colocación de nucleosomas por los complejos proteicos ISWI generalmente resulta en el silenciamiento del ADN porque la colocación de nucleosomas impide la transcripción del ADN. ^{[ 2 ]} ISWI, al igual que la subfamilia SWI/SNF estrechamente relacionada, es un remodelador de cromatina dependiente de ATP. Sin embargo, las actividades de remodelación de la cromatina de ISWI y SWI/SNF son distintas y median la unión de conjuntos no superpuestos de factores de transcripción del ADN. ^{[ 3 ]}

La proteína ISW1 es la primera subunidad ATPasa aislada en la familia de remodelación de cromatina ISWI en la mosca de la fruta Drosophila . Esta proteína presenta un alto grado de similitud con la familia de remodelación de cromatina SWI/SNF en el dominio ATPasa. Fuera de este dominio, ISWI pierde la similitud con el miembro de la familia SWI/SNF, ya que posee un dominio SANT en lugar del bromodominio . La proteína ISWI puede interactuar con varias proteínas, dando lugar a tres complejos de remodelación de cromatina diferentes en Drosophila melanogaster : NURF ( factor de remodelación de nucleosomas ), CHRAC (complejo de remodelación y ensamblaje de cromatina) y ACF (factor de remodelación y ensamblaje de cromatina que utiliza ATP).

In vitro , la proteína ISWI por sí sola puede ensamblar nucleosomas en ADN lineal y moverlos desde el centro hacia los extremos. Dentro del complejo CHRAC, ISWI cataliza la reacción inversa, moviendo los nucleosomas desde los extremos hacia el centro. ^{[ 4 ]}

Un estudio de molécula única utilizando microscopía de fuerza atómica (AFM) y movimiento de partículas atadas (TPM) ha observado que ISWI puede unirse al ADN desnudo en ausencia de ATP , envolviendo el ADN alrededor de la proteína. En presencia de ATP , la proteína genera bucles de ADN mientras genera simultáneamente superenrollamientos negativos en la plantilla. ^{[ 5 ]} La primera figura de este artículo muestra tres imágenes de AFM de donde se depositó ADN individual interactuando con ISWI sobre superficies de mica. En el centro, un solo ISWI está unido cerca del extremo de una plantilla de ADN bicatenario. La imagen de la derecha muestra dos bucles de ADN generados por ISWI. Estos bucles contienen superenrollamientos. El estudio TPM, en cambio, mostró que la duración del bucle formado por ISWI dependía del ATP.