Articulo de referencia

Okenane

El okenano , producto final diagenético de la okenona, es un biomarcador de Chromatiaceae , las bacterias púrpuras del azufre . [ 1 ] Estos fotótrofos anoxigénicos utilizan la l...

El okenano , producto final diagenético de la okenona, es un biomarcador de Chromatiaceae , las bacterias púrpuras del azufre . [ 1 ] Estos fotótrofos anoxigénicos utilizan la luz como fuente de energía y el sulfuro como donador de electrones y fuente de azufre . El descubrimiento de okenano en sedimentos marinos implica un ambiente euxínico pasado, donde las columnas de agua eran anóxicas y sulfurosas. Esto es potencialmente de suma importancia para reconstruir las condiciones oceánicas del pasado, pero hasta ahora el okenano solo se ha identificado en una muestra de roca del Paleoproterozoico (de 1600 millones de años de antigüedad) del norte de Australia. [ 2 ] [ 3 ]

Fondo

Las bacterias púrpuras del azufre producen la molécula de pigmento okenona, que posteriormente se modifica diagenéticamente y se conserva como okenano parcialmente saturado. El hallazgo de okenano en los sedimentos se considera evidencia de la presencia de bacterias púrpuras del azufre, lo que implica un ambiente anóxico y sulfuroso.
Durante el Paleoproterozoico, la columna de agua posiblemente se volvió sulfurosa y anóxica. Es probable que las bacterias del azufre púrpuras y verdes proliferaran en este ambiente euxínico. Las bacterias del azufre púrpuras producen el pigmento okenona, que durante la diagénesis se degrada a okenano. Las bacterias del azufre verdes, con pigmentos verdes, producen clorobacteno, que se transforma en clorobactano durante su enterramiento. Las bacterias del azufre verdes, con pigmentos marrones, producen isorenierateno, que se conserva como isorenieratano. Cada fotótrofo anoxigénico ocupa un rango de profundidad diferente en el océano, según la absorción de luz de su pigmento. Los biomarcadores de estas especies pueden brindarnos información sobre paleoambientes anóxicos.

La okenona es un carotenoide , [ 4 ] una clase de pigmentos omnipresentes en los organismos fotosintéticos . Estas moléculas conjugadas actúan como accesorios en el complejo de captación de luz . Se conocen más de 600 carotenoides, cada uno con una variedad de grupos funcionales que alteran su espectro de absorción . La okenona parece estar mejor adaptada a la transición amarillo-verde (520  nm) del espectro visible , capturando la luz debajo del plancton marino en el océano. Esta profundidad varía según la estructura de la comunidad de la columna de agua. Un estudio de floraciones microbianas encontró Chromatiaceae en cualquier lugar entre 1,5 m y 24 m de profundidad, pero más del 75% se produjo por encima de los 12 metros. [ 5 ] Otras bacterias planctónicas del azufre ocupan otros nichos: las bacterias verdes del azufre , las Chlorobiaceae , que producen el carotenoide clorobacteno se encontraron en mayor abundancia por encima de los 6 m, mientras que las bacterias verdes del azufre que producen isorenierateno se identificaron predominantemente por encima de los 17 m. El hallazgo de cualquiera de estos carotenoides en rocas antiguas podría delimitar la profundidad de la transición óxica a anóxica, así como también delimitar la ecología del pasado . El okenano y el clorobactano descubiertos en muestras paleoproterozoicas australianas permitieron concluir que hubo una transición anóxica superficial temporal, probablemente entre 12 y 25 m. [ 2 ]

La okenona se sintetiza en 12 especies de Chromatiaceae, que abarcan ocho géneros . Otras bacterias púrpuras del azufre tienen pigmentos carotenoides acíclicos como el licopeno y la rodopina . Sin embargo, los geoquímicos estudian principalmente la okenona porque es estructuralmente única. Es el único pigmento con un patrón de sustitución de trimetil arilo 2,3,4. En contraste, las bacterias verdes del azufre producen isoprenoides 2,3,6 trimetilarílicos . [ 6 ] La síntesis de estas estructuras produce especificidad biológica que puede distinguir la ecología de ambientes pasados. La okenona, el clorobacteno y el isorenierateno son producidos por bacterias del azufre a través de la modificación del licopeno . En la okenona, el grupo terminal del licopeno produce un anillo χ, mientras que el clorobacteno tiene un anillo φ. [ 7 ] El primer paso en la biosíntesis de estos dos pigmentos es similar, la formación de un anillo β por una enzima β-ciclasa . Posteriormente, las síntesis divergen: la enzima caroteno desaturasa/ metiltransferasa transforma el grupo terminal del anillo β en un anillo χ. Otras reacciones completan la síntesis de la okenona: alargando la conjugación, añadiendo un grupo metoxi e insertando una cetona . Sin embargo, solo los primeros pasos sintéticos están bien caracterizados biológicamente.

Preservación

Una vía diagenética propuesta para saturar la okenona a okenano es la desulfuración reductiva, en la que el sulfuro de hidrógeno se adiciona a un doble enlace y posteriormente se elimina. Se necesita más investigación sobre otras reacciones que eliminan grupos funcionales antes de la conservación.

Los pigmentos y otros biomarcadores producidos por organismos pueden evadir la degradación microbiana y química y persistir en rocas sedimentarias . [ 8 ] En condiciones de preservación, el ambiente suele ser anóxico y reductor, lo que lleva a la pérdida química de grupos funcionales como enlaces dobles y grupos hidroxilo . Las reacciones exactas durante la diagénesis no se comprenden bien, aunque algunos han propuesto la desulfuración reductiva como mecanismo para la saturación de okenona a okenano. [ 9 ] [ 10 ] Siempre existe la posibilidad de que el okenano se cree por reacciones abióticas, posiblemente a partir de desplazamientos de metilo en el β-caroteno . [ 11 ] Si esta reacción estuviera ocurriendo, el okenano tendría múltiples precursores y la especificidad biológica del biomarcador estaría disminuida. Sin embargo, es improbable que se produzcan reordenamientos específicos de isómeros de dos grupos metilo sin actividad enzimática. La mayoría de los estudios concluyen que el okenano es un verdadero biomarcador de bacterias púrpuras del azufre. Sin embargo, otros argumentos biológicos en contra de esta interpretación tienen mérito. [ 12 ] Los organismos del pasado que sintetizaban okenona podrían no ser análogos modernos de las bacterias púrpuras del azufre. También podría haber otros organismos fotosintéticos productores de okenona en el océano actual que no han sido caracterizados. Una complicación adicional es la transferencia horizontal de genes . [ 13 ] Si las Chromatiaceae adquirieron la capacidad de crear okenona más recientemente que el Paleoproterozoico, entonces la okenana no rastrea a las bacterias púrpuras del azufre, sino al donante original del gen. Estas ambigüedades indican que la interpretación de los biomarcadores en rocas de miles de millones de años estará limitada por la comprensión de los metabolismos antiguos .

Técnicas de medición

GC/MS

Antes del análisis, se extrae la materia orgánica de las rocas sedimentarias . Normalmente, solo se puede extraer menos del uno por ciento debido a la madurez térmica de la roca madre. El contenido orgánico se separa a menudo en saturados , aromáticos y polares . La cromatografía de gases se puede acoplar a la espectrometría de masas para analizar la fracción aromática extraída. Los compuestos eluyen de la columna según su relación masa/carga (M/Z) y se muestran según su intensidad relativa. Los picos se asignan a los compuestos según búsquedas en bibliotecas, estándares y tiempos de retención relativos . Algunas moléculas tienen picos característicos que permiten búsquedas sencillas en relaciones masa/carga particulares. Para el isoprenoide trimetilarílico okenano, este pico característico aparece en M/Z de 134.

Relaciones isotópicas

Las proporciones de isótopos de carbono de las bacterias púrpuras y verdes del azufre son significativamente diferentes a las de otros organismos fotosintéticos. La biomasa de las bacterias púrpuras del azufre, Chromatiaceae, suele estar empobrecida en δ 13 C en comparación con los fotótrofos oxigénicos típicos, mientras que las bacterias verdes del azufre, Chlorobiaceae, suelen estar enriquecidas. [ 14 ] Esto ofrece una discriminación adicional para determinar las comunidades ecológicas preservadas en rocas sedimentarias. Para el biomarcador okenano, el δ 13 C podría determinarse mediante un espectrómetro de masas de relación isotópica .

Estudio de caso: el norte de Australia

En los entornos modernos, las bacterias púrpuras del azufre prosperan en lagos meromícticos (permanentemente estratificados) [ 15 ] y fiordos con umbral , y se observan en pocos ecosistemas marinos. Las aguas hipersalinas como el Mar Negro son excepciones. [ 16 ] Sin embargo, hace miles de millones de años, cuando los océanos eran anóxicos y sulfurosos, las bacterias fototróficas del azufre tenían más espacio habitable. Investigadores de la Universidad Nacional de Australia y del Instituto Tecnológico de Massachusetts investigaron rocas de 1.600 millones de años para examinar las condiciones químicas del océano paleoproterozoico . Muchos creen que en ese momento existían columnas de agua oxigenada de gran profundidad debido a la desaparición de las formaciones de hierro bandeado hace aproximadamente 1.800 millones de años. Otros, liderados por el artículo de Donald Canfield de 1998 en Nature , creen que las aguas eran euxínicas. El examen de rocas de esa época reveló biomarcadores de bacterias púrpuras y verdes del azufre, lo que aporta evidencia para apoyar la hipótesis del océano de Canfield . El afloramiento sedimentario analizado fue la Formación Barney Creek del grupo McArthur en el norte de Australia. El análisis de muestras identificó tanto los isoprenoides 2,3,6 trimetilarilo (clorobactano) de Chlorobiaceae como los isoprenoides 2,3,4 trimetilarilo (okenano) de Chromatiaceae. Tanto el clorobactano como el okenano indican un océano euxínico , con condiciones superficiales sulfídicas y anóxicas por debajo de los 12-25 m. Los autores concluyeron que, si bien había oxígeno en la atmósfera, los océanos del Paleoproterozoico no estaban completamente oxigenados. [ 2 ]

Véase también

Referencias

  1. Imhoff, Johannes F. (1995-01-01). "Taxonomía y fisiología de las bacterias púrpuras fototróficas y las bacterias verdes del azufre". En Blankenship, Robert E .; Madigan, Michael T.; Bauer, Carl E. (eds.). Bacterias fotosintéticas anoxigénicas . Avances en fotosíntesis y respiración. Vol.  2. Springer Netherlands. pp. 1–15 . doi : 10.1007/0-306-47954-0_1 . ISBN  9780792336815.
  2. 1 2 3 Brocks, Jochen J.; Schaeffer, Philippe (1 de marzo de 2008). "Okenane, un biomarcador de bacterias de azufre púrpura (Chromatiaceae) y otros nuevos derivados de carotenoides de la formación 1640 Ma Barney Creek". Geochimica et Cosmochimica Acta . 72 (5): 1396–1414 . Bibcode : 2008GeCoA..72.1396B . doi : 10.1016/j.gca.2007.12.006 .
  3. Brocks, Jochen J.; Love, Gordon D.; Summons, Roger E.; Knoll, Andrew H.; Logan, Graham A.; Bowden, Stephen A. (2005). "Evidencia de biomarcadores para bacterias de azufre verdes y púrpuras en un mar estratificado del Paleoproterozoico". Nature . 437 (7060): 866– 870. Bibcode : 2005Natur.437..866B . doi : 10.1038/nature04068 . PMID 16208367 . S2CID 4427285 .  
  4. Schaeffer, Philippe; Adam, Pierre; Wehrung, Patrick; Albrecht, Pierre (1997-12-01). "Nuevos derivados de carotenoides aromáticos de bacterias fotosintéticas de azufre en sedimentos". Tetrahedron Letters . 38 (48): 8413– 8416. doi : 10.1016/S0040-4039(97)10235-0 .
  5. Gemerden, Hans Van; Mas, Jordi (1995-01-01). Blankenship, Robert E.; Madigan, Michael T.; Bauer, Carl E. (eds.). Bacterias fotosintéticas anoxigénicas . Avances en fotosíntesis y respiración. Springer Netherlands. pp. 49–85 . doi : 10.1007/0-306-47954-0_4 . ISBN  9780792336815.
  6. Summons, RE; Powell, TG (1987-03-01). "Identificación de isoprenoides arílicos en rocas madre y petróleos crudos: marcadores biológicos para las bacterias verdes del azufre". Geochimica et Cosmochimica Acta . 51 (3): 557– 566. Bibcode : 1987GeCoA..51..557S . doi : 10.1016/0016-7037(87)90069-X .
  7. Vogl, K.; Bryant, DA (2012-05-01). "Biosíntesis del biomarcador okenona: formación del anillo χ". Geobiology . 10 (3): 205– 215. Bibcode : 2012Gbio...10..205V . doi : 10.1111/j.1472-4669.2011.00297.x . ISSN 1472-4669 . PMID 22070388 . S2CID 205627793 .   
  8. Brocks, Jochen J.; Grice, Kliti (1 de enero de 2011). Reitner, Joachim; Thiel, Volker (eds.). Enciclopedia de Geobiología . Serie Enciclopedia de Ciencias de la Tierra. Springer Netherlands. pp. 147–167 . doi : 10.1007/978-1-4020-9212-1_30 . ISBN  9781402092114.
  9. Hebting, Y.; Schaeffer, P.; Behrens, A.; Adam, P.; Schmitt, G.; Schneckenburger, P.; Bernasconi, SM; Albrecht, P. (2006-06-16). "Evidencia de biomarcadores para una vía principal de preservación del carbono orgánico sedimentario" . Science . 312 (5780): 1627– 1631. Bibcode : 2006Sci...312.1627H . doi : 10.1126 /science.1126372 . ISSN 0036-8075 . PMID 16690819. S2CID 45660326 .   
  10. Werne, Josef P.; Lyons, Timothy W.; Hollander, David J.; Schouten, Stefan; Hopmans, Ellen C.; Sinninghe Damsté, Jaap S. (2008-07-15). "Investigating pathways of diagenetic organic matter sulfurization using compound-specific sulfur isotope analysis". Geochimica et Cosmochimica Acta . 72 (14): 3489– 3502. Bibcode : 2008GeCoA..72.3489W . doi : 10.1016/j.gca.2008.04.033 .
  11. ^ Koopmans, Martín P.; Schouten, Stefan; Kohnen, Matemáticas EL; Sinninghe Damsté, Jaap S. (1 de diciembre de 1996). "Utilidad restringida de los arilisoprenoides como indicadores de anoxia de la zona fótica". Geochimica et Cosmochimica Acta . 60 (23): 4873– 4876. Código bibliográfico : 1996GeCoA..60.4873K . doi : 10.1016/S0016-7037(96)00303-1 . hdl : 1874/4427 .
  12. Brocks, Jochen J.; Banfield, Jillian (2009). "Descifrando la historia microbiana antigua con proteogenómica comunitaria y geoquímica de lípidos". Nature Reviews Microbiology . 7 (8): 601– 609. doi : 10.1038/nrmicro2167 . PMID 19609261 . S2CID 20913191 .  
  13. Cobbs, Cassidy; Heath, Jeremy; Stireman III, John O.; Abbot, Patrick (2013-08-01). "Carotenoides en lugares inesperados: mosquitos de las agallas, transferencia lateral de genes y biosíntesis de carotenoides en animales". Molecular Phylogenetics and Evolution . 68 (2): 221– 228. Bibcode : 2013MolPE..68..221C . doi : 10.1016/j.ympev.2013.03.012 . PMID 23542649 . 
  14. Zyakun, AM; Lunina, ON; Prusakova, TS; Pimenov, NV; Ivanov, MV (2009-12-06). "Fraccionamiento de isótopos estables de carbono por bacterias púrpuras y verdes de azufre anoxigénicas de crecimiento fotoautotrófico". Microbiology . 78 (6): 757. doi : 10.1134/S0026261709060137 . ISSN 0026-2617 . S2CID 34430255 .  
  15. Overmann, Jörg; Beatty, J. Thomas; Hall, Ken J.; Pfennig, Norbert; Northcote, Tom G. (1991-07-01). "Caracterización de una densa capa bacteriana de azufre púrpura en un lago salado meromíctico" (PDF) . Limnología y Oceanografía . 36 (5): 846– 859. Bibcode : 1991LimOc..36..846O . doi : 10.4319/lo.1991.36.5.0846 . ISSN 1939-5590 . 
  16. ^ Hashwa, FA; Truper, HG (1978). "Bacterias de azufre fototróficas viables del fondo del Mar Negro" . Helgoländer Wissenschaftliche Meeresuntersuchungen . 31 ( 1– 2): 249– 253. Bibcode : 1978HWM....31..249H . doi : 10.1007/BF02297000 . ISSN 0017-9957 .