Fagoma

Un fagoma es una comunidad de bacteriófagos y sus metagenomas localizados en un entorno particular, similar a un microbioma . ^{[ 1 ] [ 2 ]} El fagoma es una subcategoría del viroma , que son todos los virus que están asociados con un huésped o entorno. ^{[ 3 ]} El término fue utilizado por primera vez en un artículo de Modi et al. en 2013 ^{[ 4 ]} y ha continuado utilizándose en artículos científicos relacionados con bacteriófagos y sus metagenomas. Un bacteriófago , o fago para abreviar, es un virus que puede infectar bacterias y arqueas, y puede replicarse dentro de ellas. Los fagos constituyen la mayoría de la mayoría de los viromas y actualmente se entiende que son el organismo más abundante. ^{[ 5 ]} A menudo, los científicos solo observan un fagoma en lugar de un viroma al realizar investigaciones. También se han explorado variaciones debidas a muchos factores, como la dieta, la edad y la geografía. El fagoma se ha estudiado en humanos en relación con una amplia gama de trastornos del cuerpo humano, incluyendo la EII, el SII y el cáncer colorrectal. ^{[ 6 ]}

Aunque los bacteriófagos no pueden infectar células humanas, se encuentran en abundancia en el viroma humano . ^{[ 7 ]} La investigación del fagoma en humanos se ha centrado principalmente en el intestino, sin embargo, también se está investigando en otras áreas como la piel, ^{[ 8 ]} la sangre, ^{[ 9 ]} y la boca. ^{[ 10 ]} La composición de los fagos que conforman un fagoma intestinal humano sano es actualmente objeto de debate, ya que diferentes métodos de investigación pueden conducir a resultados diferentes. ^{[ 11 ]} Al nacer, el fagoma humano, y el viroma en general, es casi inexistente. [ 12 ^] Se cree que el fagoma humano se origina en los recién nacidos a través de la inducción de profagos de bacterias transmitidas por la madre vaginalmente durante el parto. ^{[ 12 ]} Sin embargo, los fagos pueden introducirse a través de la lactancia materna, lo que se evidencia en estudios que encuentran coincidencias casi exactas de secuencias ^de crAssphage entre la madre y el niño. ^{[ 12 ] Las variaciones en el fagoma intestinal humano continúan a lo largo de} la vida. Siphoviridae y Myoviridae son los más abundantes en lactantes, y su número disminuye durante la infancia, mientras que Crassvirales predomina en adultos. ^{[ 13 ]} El fagoma también puede experimentar cambios como resultado de la dieta, que puede introducir nuevos fagos presentes en nuestros alimentos. ^{[ 6 ]} Por ejemplo, en aquellos con dietas sin gluten, se observó una mayor abundancia de crAssphage junto con disminuciones en las familias de Podoviridae . ^{[ 13 ]} Se han observado diferencias geográficas globales en la composición del fagoma, con una variación adicional encontrada dentro de individuos que viven en áreas rurales y urbanas. ^{[ 13 ]} Por ejemplo, se encontró que los residentes de Hong Kong, China, tenían menos fagos asociados con bacterias patógenas dirigidas en comparación con aquellos en la provincia de Yunnan. ^{[ 14 ]} Además, residir durante períodos más largos de tiempo en regiones urbanas se correlacionó con aumentos de fagos de Lactobacillus y Lactococcus . ^{[ 14 ]}

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