La subunidad A de la succinato deshidrogenasa, variante flavoproteína, es una proteína codificada en humanos por el gen SDHA . [ 5 ] Este gen codifica una subunidad catalítica principal de la succinato-ubiquinona oxidorreductasa , un complejo de la cadena respiratoria mitocondrial. El complejo está compuesto por cuatro subunidades codificadas en el núcleo y se localiza en la membrana mitocondrial interna. SDHA contiene el sitio de unión de FAD , donde el succinato se desprotona y se convierte en fumarato . Las mutaciones en este gen se han asociado con una forma de deficiencia de la cadena respiratoria mitocondrial conocida como síndrome de Leigh. Se ha identificado un pseudogén en el cromosoma 3q29. Se han encontrado variantes de transcripción con empalme alternativo que codifican diferentes isoformas para este gen. [ 6 ]
Estructura
El gen SDHA se localiza en el brazo p del cromosoma 5 , en el locus 15, y está compuesto por 17 exones. [ 6 ] La proteína SDHA codificada por este gen tiene 664 aminoácidos de longitud y pesa 72,7 kDa. [ 7 ] [ 8 ]
La proteína SDHA tiene cuatro subdominios, incluyendo un dominio de recubrimiento, un dominio helicoidal, un dominio C-terminal y, sobre todo, un dominio de unión a FAD con estructura de barril β en el extremo N-terminal . Por lo tanto, la SDHA es una flavoproteína (Fp) debido al grupo prostético flavina adenina dinucleótido (FAD). La estructura cristalina sugiere que el FAD se une covalentemente a un residuo de histidina (His99) y se coordina mediante enlaces de hidrógeno con otros residuos de aminoácidos dentro del dominio de unión a FAD. El FAD, derivado de la riboflavina (vitamina B2 ) , es, por lo tanto, un cofactor esencial para la función de la SDHA y de todo el complejo II. [ 9 ]
Función

El complejo SDH se localiza en la membrana interna de la mitocondria y participa tanto en el ciclo del ácido cítrico como en la cadena respiratoria . El complejo proteico succinato deshidrogenasa (SDH) cataliza la oxidación del succinato (succinato + ubiquinona => fumarato + ubiquinol). Los electrones extraídos del succinato se transfieren a SDHA, y posteriormente, a través de SDHB mediante grupos hierro-azufre, a las subunidades SDHC / SDHD en el extremo hidrofóbico del complejo anclado en la membrana mitocondrial.
Inicialmente, la SDHA oxida el succinato mediante desprotonación en el sitio de unión de FAD, formando FADH2 y dejando fumarato , débilmente unido al sitio activo, libre para salir de la proteína. Los electrones derivados del succinato se desplazan por el túnel [Fe-S] en la subunidad SDHB hasta que alcanzan el clúster de hierro-azufre [3Fe-4S] . Los electrones se transfieren entonces a una molécula de ubiquinona que espera en el sitio activo del pool Q en el dímero SDHC/SDHD. El oxígeno carbonilo O1 de la ubiquinona se orienta en el sitio activo mediante interacciones de enlace de hidrógeno con Tyr83 de SDHD . La presencia de electrones en el clúster de hierro-azufre [3Fe-4S] induce el movimiento de la ubiquinona hacia una segunda orientación. Esto facilita una segunda interacción de enlace de hidrógeno entre el grupo carbonilo O4 de la ubiquinona y Ser27 de SDHC . Tras el primer paso de reducción de un solo electrón, se forma una especie radical semiquinona . El segundo electrón llega del clúster [3Fe-4S] para proporcionar la reducción completa de la ubiquinona a ubiquinol . [ 10 ]
La SDHA actúa como intermediario en la acción básica de la enzima SDH:
- La SDHA convierte el succinato en fumarato como parte del ciclo del ácido cítrico . Esta reacción también convierte el FAD en FADH2 .
- Los electrones del FADH2 se transfieren a los grupos de hierro de la subunidad SDHB [2Fe-2S],[4Fe-4S],[3Fe-4S]. Esta función forma parte de la cadena respiratoria.
- Finalmente, los electrones se transfieren al conjunto de ubiquinona (Q) a través de las subunidades SDHC / SDHD .
Importancia clínica
Debido a la complejidad del locus de SDHA, este gen rara vez se analizaba, [ 11 ] pero en un creciente número de investigaciones se ha descubierto que las mutaciones en SDHA son patogénicas para diversas afecciones, incluyendo el síndrome de feocromocitoma-paraganglioma hereditario (PPGL), la deficiencia del complejo II mitocondrial, los tumores del estroma gastrointestinal, el síndrome de Leigh, la miocardiopatía dilatada y una posible relación con adenomas hipofisarios, carcinomas suprarrenales y otros tumores neuroendocrinos. [ 12 ] El síndrome PPGL hereditario asociado con mutaciones en SDHA se denomina "Paragangliomas 5" y probablemente tenga una penetrancia menor que otras mutaciones de SDHx. [ 13 ]
Se sabe que las mutaciones bialélicas en SDHA son patogénicas para el síndrome de Leigh en bebés o niños pequeños , un trastorno cerebral progresivo. [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ] Sin embargo, se desconoce cómo se relacionan las mutaciones en el gen SDHA con las características específicas del síndrome de Leigh. Existe cierta relación entre el síndrome de Leigh como fenotipo de deficiencia del complejo II mitocondrial, pero ambos pueden ocurrir independientemente del otro en relación con las mutaciones de SDHA. [ 17 ]
SDHA es un gen supresor de tumores, y los portadores heterocigotos tienen un mayor riesgo de paragangliomas , así como de feocromocitomas y cáncer renal. [ 18 ] El manejo del riesgo para los portadores heterocigotos de una mutación SDHA generalmente implica el monitoreo mediante análisis de orina anuales para metanefrinas y catecolaminas, así como imágenes no radiactivas como resonancias magnéticas. Se utilizan tomografías por emisión de positrones (PET) e imágenes radiactivas, pero deben limitarse para evitar la exposición a la radiación. [ 19 ]
Mapa interactivo de la ruta
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Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000073578 – Ensembl , mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000021577 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- ↑ Hirawake H, Wang H, Kuramochi T, Kojima S, Kita K (julio de 1994). "Complejo II humano (succinato-ubiquinona oxidorreductasa): clonación de ADNc de la subunidad flavoproteína (Fp) de las mitocondrias hepáticas" . Journal of Biochemistry . 116 (1): 221–7 . doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a124497 . PMID 7798181 .
- 1 2 "Gen Entrez: complejo succinato deshidrogenasa" .
- ↑Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, et al. (October 2013). "Integration of cardiac proteome biology and medicine by a specialized knowledgebase". Circulation Research. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
- ↑"SDHA - Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial". Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB). Archived from the original on 2018-07-19. Retrieved 2018-07-18.
- ↑Van Vranken JG, Na U, Winge DR, Rutter J (March–April 2015). "Protein-mediated assembly of succinate dehydrogenase and its cofactors". Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology. 50 (2): 168–80. doi:10.3109/10409238.2014.990556. PMC 4653115. PMID 25488574.
- ↑Horsefield R, Yankovskaya V, Sexton G, Whittingham W, Shiomi K, Omura S, et al. (March 2006). "Structural and computational analysis of the quinone-binding site of complex II (succinate-ubiquinone oxidoreductase): a mechanism of electron transfer and proton conduction during ubiquinone reduction". The Journal of Biological Chemistry. 281 (11): 7309–16. doi:10.1074/jbc.m508173200. PMID 16407191.
- ↑Wagner AJ, Remillard SP, Zhang YX, Doyle LA, George S, Hornick JL (February 2013). "Loss of expression of SDHA predicts SDHA mutations in gastrointestinal stromal tumors". Mod Pathol. 26 (2): 289–94. doi:10.1038/modpathol.2012.153. PMID 22955521.
- ↑"SDHA[gene] ▶ GRCh37". ClinVar. National Library of Medicine.
- ↑van der Tuin K, Mensenkamp AR, Tops CM, Corssmit EP, Dinjens WN, van de Horst-Schrivers AN, Jansen JC, de Jong MM, Kunst HP, Kusters B, Leter EM, Morreau H, van Nesselrooij BM, Oldenburg RA, Spruijt L, Hes FJ, Timmers HJ (February 2018). "Clinical Aspects of SDHA-Related Pheochromocytoma and Paraganglioma: A Nationwide Study". J Clin Endocrinol Metab. 103 (2): 438–445. doi:10.1210/jc.2017-01762. PMID 29177515."CORRIGENDUM FOR "Clinical Aspects of SDHA-Related Pheochromocytoma and Paraganglioma: A Nationwide Study"". J Clin Endocrinol Metab. 103 (5): 2077. May 2018. doi:10.1210/jc.2018-00533. hdl:1887/79414. PMID 29538659.
- ↑"Leigh syndrome". Genetics Home Reference. U.S. National Library of Medicine. Retrieved 30 July 2018.
- ↑Pagnamenta AT, Hargreaves IP, Duncan AJ, Taanman JW, Heales SJ, Land JM, et al. (November 2006). "Phenotypic variability of mitochondrial disease caused by a nuclear mutation in complex II". Molecular Genetics and Metabolism. 89 (3): 214–21. doi:10.1016/j.ymgme.2006.05.003. PMID 16798039.
- ↑Van Coster R, Seneca S, Smet J, Van Hecke R, Gerlo E, Devreese B, et al. (July 2003). "Homozygous Gly555Glu mutation in the nuclear-encoded 70 kDa flavoprotein gene causes instability of the respiratory chain complex II". American Journal of Medical Genetics. Part A. 120A (1): 13–8. doi:10.1002/ajmg.a.10202. PMID 12794685. S2CID 30987591.
- ↑Fullerton M, McFarland R, Taylor RW, Alston CL (2020). "The genetic basis of isolated mitochondrial complex II deficiency". Mol Genet Metab. 131 (1–2): 53–65. doi:10.1016/j.ymgme.2020.09.009. PMC 7758838. PMID 33162331.
- ↑Reference, Genetics Home. "SDHA". Genetics Home Reference. Retrieved 2016-08-31.
- ↑ "Paraganglioma-feocromocitoma familiar relacionado con SDHA, SDHB o SDHC: manejo del riesgo" . eviQ Cancer Treatments Online . Cancer Institute NSW. 22 de febrero de 2022. 4066 v.3.
Lecturas adicionales
- Aboulaich N, Vainonen JP, Strålfors P, Vener AV (octubre de 2004). "La proteómica vectorial revela la focalización, fosforilación y fragmentación específica de la polimerasa I y el factor de liberación de transcripción (PTRF) en la superficie de las caveolas en adipocitos humanos" . The Biochemical Journal . 383 (Pt 2): 237–48 . doi : 10.1042/BJ20040647 . PMC 1134064. PMID 15242332 .
- Bonache S, Martínez J, Fernández M, Bassas L, Larriba S (junio de 2007). "Polimorfismos de un solo nucleótido en subunidades de succinato deshidrogenasa y genes de citrato sintasa: resultados de asociación para la espermatogénesis alterada" . International Journal of Andrology . 30 (3): 144– 52. doi : 10.1111/j.1365-2605.2006.00730.x . PMID 17298551 .
- Horváth R, Abicht A, Holinski-Feder E, Laner A, Gempel K, Prokisch H, et al. (enero de 2006). "Síndrome de Leigh causado por mutaciones en la subunidad flavoproteína (Fp) de la succinato deshidrogenasa (SDHA)" . Journal of Neurology, Neurosurgery, and Psychiatry . 77 (1): 74– 6. doi : 10.1136 / jnnp.2005.067041 . PMC 2117401. PMID 16361598 .
- Kullberg M, Nilsson MA, Arnason U, Harley EH, Janke A (agosto de 2006). "Genes de mantenimiento para el análisis filogenético de las relaciones de los euterios" . Biología molecular y evolución . 23 (8): 1493– 503. doi : 10.1093/molbev/msl027 . PMID 16751257 .
- Tomitsuka E, Kita K, Esumi H (2009). "Regulación de las actividades de la succinato-ubiquinona reductasa y la fumarato reductasa en el complejo II humano mediante la fosforilación de su subunidad flavoproteína" . Actas de la Academia Japonesa. Serie B, Ciencias Físicas y Biológicas . 85 ( 7): 258– 65. Bibcode : 2009PJAB...85..258T . doi : 10.2183/pjab.85.258 . PMC 3561849. PMID 19644226 .
- Hao HX, Khalimonchuk O, Schraders M, Dephoure N, Bayley JP, Kunst H, et al. (agosto de 2009). "SDH5, un gen requerido para la flavinación de la succinato deshidrogenasa, está mutado en el paraganglioma" . Science . 325 (5944): 1139– 42. Bibcode : 2009Sci...325.1139H . doi : 10.1126/science.1175689 . PMC 3881419. PMID 19628817 .
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, et al. (enero de 2006). " Diversificación de la modulación transcripcional: identificación y caracterización a gran escala de promotores alternativos putativos de genes humanos" . Genome Research . 16 (1): 55– 65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129. PMID 16344560 .
- González-Cabo P, Vázquez-Manrique RP, García-Gimeno MA, Sanz P, Palau F (agosto de 2005). "La frataxina interactúa funcionalmente con las proteínas de la cadena de transporte de electrones mitocondriales" . Genética Molecular Humana . 14 (15): 2091–8.doi : 10.1093 / hmg /ddi214 . PMID 15961414 .
- Baysal BE, Lawrence EC, Ferrell RE (marzo de 2007). "Variación de secuencia en genes de succinato deshidrogenasa humana: evidencia de selección equilibradora a largo plazo en SDHA" . BMC Biology . 5 12. doi : 10.1186/1741-7007-5-12 . PMC 1852088. PMID 17376234 .
- Eng C, Kiuru M, Fernandez MJ, Aaltonen LA (marzo de 2003). "Un papel para las enzimas mitocondriales en la neoplasia hereditaria y más allá". Nature Reviews. Cancer . 3 (3): 193– 202. doi : 10.1038/nrc1013 . PMID 12612654 . S2CID 20549458 .
- Brière JJ, Favier J, El Ghouzzi V, Djouadi F, Bénit P, Gimenez AP, Rustin P (octubre de 2005). "Deficiencia de succinato deshidrogenasa en humanos" . Ciencias de la vida celulares y moleculares . 62 ( 19– 20): 2317– 24. doi : 10.1007/s00018-005-5237-6 . PMC 11139140 . PMID 16143825 . S2CID 23793565 .
- Korsten A, de Coo IF, Spruijt L, de Wit LE, Smeets HJ, Sluiter W (febrero de 2010). "Los pacientes con neuropatía óptica hereditaria de Leber no logran compensar la fosforilación oxidativa alterada" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergética . 1797 (2): 197– 203. doi : 10.1016/j.bbabio.2009.10.003 . PMID 19836344 .
- Hendrickson SL, Lautenberger JA, Chinn LW, Malasky M, Sezgin E, Kingsley LA, et al. (septiembre de 2010). "Las variantes genéticas en genes mitocondriales codificados en el núcleo influyen en la progresión del SIDA" . PLOS ONE . 5 (9) e12862. Bibcode : 2010PLoSO...512862H . doi : 10.1371/journal.pone.0012862 . PMC 2943476. PMID 20877624 .
- Van Coster R, Seneca S, Smet J, Van Hecke R, Gerlo E, Devreese B, et al. (julio de 2003). "La mutación homocigótica Gly555Glu en el gen de la flavoproteína de 70 kDa codificada en el núcleo causa inestabilidad del complejo II de la cadena respiratoria". American Journal of Medical Genetics. Parte A. 120A ( 1): 13–8 . doi : 10.1002/ajmg.a.10202 . PMID 12794685. S2CID 30987591 .
- Wang L, McDonnell SK, Hebbring SJ, Cunningham JM, St Sauver J, Cerhan JR, et al. (diciembre de 2008). " Polimorfismos en genes mitocondriales y riesgo de cáncer de próstata" . Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention . 17 (12): 3558– 66. doi : 10.1158/1055-9965.EPI-08-0434 . PMC 2750891. PMID 19064571 .
- Huang G, Chen Y, Lu H, Cao X (febrero de 2007). "Acoplamiento de la cadena respiratoria mitocondrial a la muerte celular: un papel esencial del complejo I mitocondrial en la muerte celular cancerosa inducida por interferón beta y ácido retinoico" . Cell Death and Differentiation . 14 (2): 327–37 . doi : 10.1038/sj.cdd.4402004 . PMID 16826196 .
- Sifroni KG, Damiani CR, Stoffel C, Cardoso MR, Ferreira GK, Jeremias IC, et al. (septiembre de 2010). "Cadena respiratoria mitocondrial en la mucosa colónica de pacientes con colitis ulcerosa". Molecular and Cellular Biochemistry . 342 ( 1–2 ): 111–5 . doi : 10.1007/s11010-010-0474-x . PMID 20440543. S2CID 34103232 .
- Ma YY, Wu TF, Liu YP, Wang Q, Li XY, Ding Y, et al. (mayo de 2014). "Dos mutaciones compuestas de cambio de marco en el gen de la succinato deshidrogenasa de un niño chino con encefalopatía". Brain & Development . 36 (5): 394–8 . doi : 10.1016/j.braindev.2013.06.003 . PMID 23849264. S2CID 24730430 .
- Genes en el cromosoma 5 humano
- CE 1.3.5
