Las enzimas activadoras de ubiquitina , también conocidas como enzimas E1 , catalizan el primer paso de la reacción de ubiquitinación , que (entre otras cosas) puede dirigir una proteína hacia la degradación a través del proteasoma . Este enlace covalente de ubiquitina o proteínas similares a la ubiquitina a proteínas específicas es un mecanismo fundamental para regular la función proteica en organismos eucariotas . [ 2 ] Muchos procesos, como la división celular , las respuestas inmunitarias y el desarrollo embrionario, también están regulados por la modificación postraduccional mediante ubiquitina y proteínas similares a la ubiquitina. [ 2 ]
Ubiquitinación (ubiquitilación)
La enzima activadora de ubiquitina (E1) inicia el proceso de ubiquitinación (Figura 1). La enzima E1, junto con ATP , se une a la proteína ubiquitina. A continuación, la enzima E1 transfiere la proteína ubiquitina a una segunda proteína, denominada proteína transportadora de ubiquitina o proteína de conjugación (E2). La proteína E2 forma un complejo con una ubiquitina ligasa (E3). Esta ubiquitina ligasa reconoce la proteína que necesita ser marcada y cataliza la transferencia de ubiquitina a dicha proteína. Esta vía se repite hasta que la proteína diana tiene una cadena completa de ubiquitina unida a sí misma. [ 3 ]
Estructura y mecanismo
Al inicio de la cascada de ubiquitinación, la enzima E1 (Figura 2) se une a ATP-Mg²⁺ y ubiquitina, y cataliza la adenilación del extremo C-terminal de la ubiquitina. [ 4 ] En el siguiente paso, una cisteína catalítica (Figura 3) de la enzima E1 ataca el complejo ubiquitina-AMP mediante sustitución de acilo, creando simultáneamente un enlace tioéster y un grupo saliente de AMP. [ 2 ] Finalmente, el complejo E1-ubiquitina transfiere la ubiquitina a una enzima E2 mediante una reacción de transtioesterificación, en la que una cisteína catalítica de E2 ataca la parte posterior del complejo E1-ubiquitina. [ 5 ] Sin embargo, el proceso de transtioesterificación es muy complejo, ya que ambas enzimas, E1 y E2, forman un complejo intermedio en el que ambas experimentan una serie de cambios conformacionales para unirse entre sí. [ 5 ]
A lo largo de este mecanismo, la enzima E1 se une a dos moléculas de ubiquitina. Si bien esta ubiquitina secundaria también se adenila, no forma el mismo complejo tioéster descrito anteriormente. La función de la ubiquitina secundaria sigue siendo en gran medida desconocida; sin embargo, se cree que podría facilitar los cambios conformacionales observados en la enzima E1 durante el proceso de transtioesterificación. [ 2 ]
La figura 1 muestra la secuencia de cómo la enzima activadora de ubiquitina se une al ATP y al sustrato de ubiquitina. También muestra cómo se pueden unir dos sustratos de ubiquitina simultáneamente. [ 6 ]
Figura 2. La proteína E1 se une a una molécula de ubiquitina en cada uno de los dos sitios activos idénticos (resaltados). Los residuos importantes, cisteína y arginina, están marcados en rojo. [ 2 ]
Figura 3. Vista en primer plano del sitio activo no unido. Se cree que la arginina (603) recarga la cisteína catalítica (600) una vez que la ubiquitina se ha transferido a la enzima E2. [ 2 ]
Figura 4. Mecanismo completo de adenilación de la ubiquitina y posterior unión de la ubiquitina a E1.
Diagrama esquemático del sistema de ubiquitinación.
isoenzimas
Los siguientes genes codifican enzimas activadoras de ubiquitina:
Asociación de enfermedades
El sistema ubiquitina-proteasoma es fundamental para la degradación adecuada de proteínas dentro de las células. Las disfunciones de este sistema pueden alterar la homeostasis celular y provocar una serie de trastornos. En las células que funcionan normalmente, la unión covalente de ubiquitina o una proteína similar a la ubiquitina a una proteína diana modifica la superficie de esta última. Estas proteínas ubiquitinadas están sujetas a degradación por vías proteolíticas y no proteolíticas. [ 7 ] Si este sistema falla, pueden surgir numerosas enfermedades hereditarias y adquiridas, como cáncer, diabetes , accidente cerebrovascular , enfermedad de Alzheimer , esclerosis lateral amiotrófica , esclerosis múltiple , asma , enfermedad inflamatoria intestinal , tiroiditis autoinmune , artritis inflamatoria , lupus y síndrome VEXAS . [ 7 ]
Mutación de sentido erróneo en UBE1 y atrofia muscular espinal infantil ligada al cromosoma X (XL-SMA)
Entre los diversos trastornos asociados con la vía ubiquitina-proteasoma se encuentra la atrofia muscular espinal infantil ligada al cromosoma X (XL-SMA). [ 8 ] Este trastorno infantil fatal se asocia con la pérdida de células del asta anterior y la muerte infantil. Las características clínicas incluyen hipotonía, arreflexia y múltiples contracturas congénitas. En un análisis de mutaciones a gran escala, el cribado de seis familias con XL-SMA proporcionó resultados que indicaban dos nuevas mutaciones de cambio de sentido en dos familias y una nueva sustitución sinónima C→T en otras tres familias. Todas estas mutaciones detectadas se ubicaron en el exón 15 del gen UBE1 (el gen que codifica la enzima activadora de la ubiquitina) y se observó que segregaban con la enfermedad en las familias. En resumen, el cambio de sentido en UBE1 puede conducir a una alteración en la formación de complejos con la gigaxonina , una proteína involucrada en la estructura axonal y el mantenimiento neuronal. Esto puede conducir a una degradación deficiente de la proteína 1B asociada a microtúbulos (MAP1B), lo que resulta en la acumulación de proteína MAP1B, que puede aumentar la muerte celular neuronal. [ 8 ] Por lo tanto, se sospecha que las mutaciones en UBE1 son la causa de los defectos genéticos en individuos XL-SMA.
Referencias
- ↑ PDB : 3CMM ;Lee I, Schindelin H (julio de 2008). "Perspectivas estructurales sobre la activación de la ubiquitina catalizada por E1 y su transferencia a enzimas conjugadoras" . Cell . 134 (2): 268–78 . doi : 10.1016/j.cell.2008.05.046 . PMID 18662542 .
- 1 2 3 4 5 6 Schulman BA, Harper JW (mayo de 2009). "Activación de proteínas similares a la ubiquitina por enzimas E1: el ápice de las vías de señalización descendentes" . Nature Reviews Molecular Cell Biology . 10 (5): 319–31 . doi : 10.1038/nrm2673 . PMC 2712597. PMID 19352404 .
- ↑ Lecker SH, Goldberg AL, Mitch WE (julio de 2006). "Degradación de proteínas por la vía ubiquitina-proteasoma en estados normales y patológicos" (PDF) . Journal of the American Society of Nephrology . 17 (7): 1807–19 . doi : 10.1681/ASN.2006010083 . PMID 16738015 .
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- ↑ Esta figura está adaptada del Esquema 1 de "El mecanismo de la enzima activadora de ubiquitina: un análisis cinético y de equilibrio" de Arthur Haas. Haas AL, Rose IA (septiembre de 1982). "El mecanismo de la enzima activadora de ubiquitina. Un análisis cinético y de equilibrio" . The Journal of Biological Chemistry . 257 (17): 10329–37 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)34024-9 . PMID 6286650 .
- 1 2 Wang J, Maldonado MA (agosto de 2006). "El sistema ubiquitina-proteasoma y su papel en las enfermedades inflamatorias y autoinmunes" (PDF) . Inmunología Celular y Molecular . 3 (4): 255– 61. PMID 16978533 .
- 1 2 Ramser J, Ahearn ME, Lenski C, et al. (enero de 2008). "Variantes sinónimas y de cambio de sentido poco frecuentes en UBE1 están asociadas con la atrofia muscular espinal infantil ligada al cromosoma X" . American Journal of Human Genetics . 82 (1): 188– 93. doi : 10.1016/j.ajhg.2007.09.009 . PMC 2253959. PMID 18179898 .
Enlaces externos
- Enzimas activadoras de ubiquitina en los encabezamientos de materias médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.
- CE 6.3.2