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ARN pequeño de Xanthomonas

En biología molecular, los ARN pequeños de Xanthomonas son ARN pequeños que se han identificado en varias especies de la bacteria Xanthomonas . El análisis del patógeno vegetal ...

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En biología molecular, los ARN pequeños de Xanthomonas son ARN pequeños que se han identificado en varias especies de la bacteria Xanthomonas .

El análisis del patógeno vegetal Xanthomonas campestris pv. vesicatoria reveló la expresión de siete ARN antisentido codificados en cis (asX1-asX7) y 15 ARN pequeños intergénicos (sX1-sX15). También se han identificado varios ARN pequeños en Xanthomonas campestris patovar campestris . Algunos de estos ARN pequeños de X. campestris solo se encuentran en Xanthomonas , mientras que otros también se expresan en otras bacterias. [ 1 ] [ 2 ] Varios de estos ARN pequeños parecen contribuir a la virulencia , incluidos sX12, sX13 y sRNA-Xcc1 . [ 1 ] [ 3 ] [ 4 ]

El análisis computacional predice 63 sRNA en Xanthomonas oryzae patovar oryzae ; la expresión de 8 de ellos ha sido confirmada experimentalmente. La expresión de tres de estos depende de Hfq . [ 5 ]

Véase también

Referencias

  1. 1 2 Schmidtke C, Findeiß S, Sharma CM, Kuhfuß J, Hoffmann S, Vogel J, et  al. (2011). "Análisis del transcriptoma a nivel genómico del patógeno vegetal Xanthomonas identifica sRNAs con funciones de virulencia putativas" . Nucleic Acids Res . 40 (5): 2020– 31. doi : 10.1093 / nar/gkr904 . PMC 3300014. PMID 22080557 .  
  2. ↑ Jiang RP, Tang DJ, Chen XL, He YQ, Feng JX, Jiang BL, et al. (2010). " Identificación de cuatro nuevos ARN pequeños no codificantes de Xanthomonas campestris patovar campestris" . BMC Genomics . 11 316. doi : 10.1186/1471-2164-11-316 . PMC 2996969. PMID 20482898 .   
  3. ↑ Chen XL, Tang DJ, Jiang RP, He YQ, Jiang BL, Lu GT, et al. (2011). "sRNA-Xcc1, un sRNA transactivo codificado por integrón, transferido por transposón y plásmido, está bajo el control positivo de los reguladores de virulencia clave HrpG y HrpX de Xanthomonas campestris patovar campestris" . RNA Biol . 8 (6): 947– 953. doi : 10.4161/rna.8.6.16690 . PMC 3256417. PMID 21941121 .   
  4. ↑ Schmidtke, C; Abendroth, U; Brock, J; Serrania, J; Becker, A; Bonas, U (septiembre de 2013). " ARN pequeño sX13: un regulador multifacético de la virulencia en el patógeno vegetal Xanthomonas" . PLOS Pathogens . 9 (9) e1003626. doi : 10.1371/journal.ppat.1003626 . PMC 3771888. PMID 24068933 .  
  5. ↑ Liang H, Zhao YT, Zhang JQ, Wang XJ, Fang RX, Jia YT (2011). "Identificación y caracterización funcional de pequeños ARN no codificantes en Xanthomonas oryzae patovar oryzae" . BMC Genomics . 12 87. doi : 10.1186/1471-2164-12-87 . PMC 3039613. PMID 21276262 .