Amiloide

Los amiloides son agregados de proteínas caracterizados por una morfología fibrilar de un diámetro típico de 7 a 13 nm , una estructura secundaria de lámina β (conocida como β cruzada) y la capacidad de teñirse con colorantes específicos, como el rojo Congo . ^{[ 1 ]} En el cuerpo humano , los amiloides se han relacionado con el desarrollo de diversas enfermedades . ^{[ 2 ]} Los amiloides patógenos se forman cuando proteínas previamente sanas pierden su estructura y funciones fisiológicas normales ( mal plegamiento ) y forman depósitos fibrosos dentro y alrededor de las células. Estos procesos de mal plegamiento y depósito de proteínas alteran la función saludable de los tejidos y órganos.

Estos amiloides se han asociado con (pero no necesariamente como la causa de) más de 50 ^{[ 2 ] [ 3 ]} enfermedades humanas, incluida la amiloidosis , y pueden desempeñar un papel en algunas enfermedades neurodegenerativas . ^{[ 2 ] [ 4 ]} Algunas de estas enfermedades son principalmente esporádicas y solo unos pocos casos son familiares . Otras son solo familiares. Algunas resultan del tratamiento médico . Los priones son una forma infecciosa de amiloides que puede actuar como plantilla para convertir otras formas no infecciosas. ^{[ 5 ]} Los amiloides también pueden tener funciones biológicas normales; por ejemplo, en la formación de fimbrias en algunos géneros de bacterias , la transmisión de rasgos epigenéticos en hongos, así como la deposición de pigmento y la liberación de hormonas en humanos. ^{[ 6 ]}

Se sabe que los amiloides se originan a partir de muchas proteínas diferentes. ^{[ 2 ] [ 7 ]} Estas cadenas polipeptídicas generalmente forman estructuras de láminas β que se agregan en fibras largas; sin embargo, polipéptidos idénticos pueden plegarse en múltiples conformaciones amiloides distintas. ^{[ 8 ]} La diversidad de las conformaciones puede haber dado lugar a diferentes formas de enfermedades priónicas . ^{[ 6 ]}

Se ha propuesto una estructura secundaria inusual denominada lámina α como el componente tóxico de las proteínas precursoras amiloides, ^{[ 9 ]} pero esta idea no está ampliamente aceptada en la actualidad.

El nombre amiloide proviene de la identificación errónea inicial que hizo Rudolf Virchow de la sustancia como almidón ( amilo en latín , del griego antiguo : ἄμυλον , romanizado :  amylon ), basándose en técnicas rudimentarias de tinción con yodo . Durante un tiempo, la comunidad científica debatió si los depósitos de amiloide eran depósitos grasos o de carbohidratos , hasta que finalmente se descubrió (en 1859) que, de hecho, son depósitos de material proteínico similar a la albúmina . ^{[ 10 ]}

• La definición histopatológica clásica de amiloide es un depósito fibrilar proteínico extracelular que exhibe una estructura secundaria de lámina β y se identifica por birrefringencia verde manzana cuando se tiñe con rojo Congo bajo luz polarizada . Estos depósitos suelen reclutar diversos azúcares y otros componentes, como el componente P del amiloide sérico , lo que da lugar a estructuras complejas y, a veces, heterogéneas. ^{[ 11 ]} Recientemente, esta definición se ha puesto en entredicho, ya que se han observado algunas especies clásicas de amiloide en localizaciones claramente intracelulares. ^{[ 12 ]}
• Una definición biofísica más reciente es más amplia, incluyendo cualquier polipéptido que se polimeriza para formar una estructura β cruzada, in vivo o in vitro , dentro o fuera de las células . Microbiólogos , bioquímicos , biofísicos , químicos y físicos han adoptado en gran medida esta definición, ^{[ 13 ] [ 14 ]} lo que ha generado cierto conflicto en la comunidad biológica sobre una cuestión de terminología .

Hasta la fecha, se han encontrado 37 proteínas humanas que forman amiloide en patologías y están asociadas con enfermedades bien definidas . ^{[ 2 ]} La Sociedad Internacional de Amiloidosis clasifica las fibrillas amiloides y sus enfermedades asociadas según las proteínas asociadas (por ejemplo, ATTR es el grupo de enfermedades y fibrillas asociadas formadas por TTR ). ^{[ 3 ]} A continuación se incluye una tabla.

Se han identificado muchos ejemplos de amiloide no patológico con una función fisiológica bien definida en diversos organismos, incluido el ser humano . Estos pueden denominarse amiloide funcional, fisiológico o nativo. ^{[ 25 ] [ 26 ] [ 2 ]}

• Amiloide funcional en Homo sapiens :
  • Dominio intralumenal de la proteína de melanocitos PMEL ^{[ 27 ]}
  • Las hormonas peptídicas/proteicas se almacenan como amiloides dentro de los gránulos secretores endocrinos ^{[ 28 ].}
  • Proteína quinasa 1/3 de serina/treonina que interactúa con el receptor ( RIP1 / RIP3 ) ^{[ 29 ]}
  • Fragmentos de fosfatasa ácida prostática y semenogelinas ^{[ 30 ]}
• Amiloide funcional en otros organismos:
  • Las fibrillas curli son producidas por E. coli , Salmonella y algunos otros miembros de las Enterobacteriales (Csg). Los elementos genéticos ( operones ) que codifican el sistema curli están ampliamente distribuidos filogenéticamente y se pueden encontrar en al menos cuatro filos bacterianos. ^{[ 31 ]} Esto sugiere que muchas más bacterias podrían expresar fibrillas curli.
  • GvpA, formando las paredes de vesículas de gas particulares , es decir, los orgánulos de flotabilidad de las arqueas acuáticas y las eubacterias ^{[ 32 ].}
  • Fibrillas Fap en varias especies de Pseudomonas ^{[ 33 ] [ 34 ]}
  • Chaplins de Streptomyces coelicolor ^{[ 35 ]}
  • Espidroína de Trichonephila edulis ( araña ) ( seda de araña ) ^{[ 36 ]}
  • Hidrofobinas de Neurospora crassa y otros hongos ^{[ 37 ]}
  • Proteínas de adhesión celular fúngica que forman regiones amiloides en la superficie celular con una fuerza de unión considerablemente aumentada ^{[ 38 ] [ 39 ]}
  • Biopelículas ambientales según la tinción con colorantes y anticuerpos específicos para amiloide. ^{[ 40 ]}
  • Vainas tubulares que envuelven filamentos de Methanosaeta thermophila ^{[ 41 ]}
• Amiloide funcional que actúa como priones
  • Varios priones de levadura se basan en un amiloide infeccioso, por ejemplo: [PSI+] ( Sup35p ); [URE3] ( Ure2p ); [PIN+] o [RNQ+] (Rnq1p); [SWI1+] (Swi1p) y [OCT8+] (Cyc8p).
  • Priones HET-s de Podospora anserina ^{[ 42 ]}
  • Isoforma específica de neuronas de CPEB de Aplysia californica (caracol marino) ^{[ 43 ]}

Los amiloides están formados por fibras largas y no ramificadas que se caracterizan por una estructura secundaria de lámina β extendida , en la que las hebras β individuales (flechas de colores en la figura adyacente) se disponen perpendicularmente al eje longitudinal de la fibra. Esta estructura se conoce como estructura β cruzada. Cada fibra individual puede tener entre 7 y 13 nanómetros de ancho y unos pocos micrómetros de largo. ^{[ 6 ] [ 2 ]} Las principales características reconocidas por diferentes disciplinas para clasificar los agregados de proteínas como amiloide son la presencia de una morfología fibrilar con el diámetro esperado, detectada mediante microscopía electrónica de transmisión (TEM) o microscopía de fuerza atómica (AFM), la presencia de una estructura secundaria β cruzada, determinada con dicroísmo circular , FTIR , resonancia magnética nuclear de estado sólido (ssNMR), cristalografía de rayos X o difracción de fibras de rayos X (a menudo considerada la prueba de "estándar de oro" para ver si una estructura contiene fibras β cruzadas), y la capacidad de teñirse con colorantes específicos, como rojo Congo , tioflavina T o tioflavina S. ^{[ 2 ]}

El término "cruz β" se basó en la observación de dos conjuntos de líneas de difracción, uno longitudinal y otro transversal, que forman un patrón característico en forma de "cruz". ^{[ 45 ]} Se producen dos señales de difracción de dispersión características a 4,7 y 10 Å (0,47 nm y 1,0 nm), que corresponden a las distancias entre hebras y de apilamiento en las láminas β. ^{[ 1 ]} Las "pilas" de láminas β son cortas y atraviesan el ancho de la fibrilla amiloide; la longitud de la fibrilla amiloide está formada por hebras β alineadas. El patrón de cruz β se considera un sello distintivo diagnóstico de la estructura amiloide. ^{[ 6 ]}   

Las fibrillas amiloides generalmente están compuestas por 1 a 8 protofilamentos (en la figura se muestra un protofilamento que también corresponde a una fibrilla), cada uno de 2 a 7  nm de diámetro, que interactúan lateralmente como cintas planas que mantienen una altura de 2 a 7  nm (la de un solo protofilamento) y tienen hasta 30  nm de ancho; con mayor frecuencia, los protofilamentos se entrelazan para formar las  fibrillas, que suelen tener entre 7 y 13 nm de ancho. ^{[ 2 ]} Cada protofilamento posee la estructura β cruzada típica y puede estar formado por 1 a 6 láminas β (seis se muestran en la figura) apiladas unas sobre otras. Cada molécula de proteína individual puede contribuir con una o varias hebras β en cada protofilamento, y las hebras pueden estar dispuestas en láminas β antiparalelas, pero con mayor frecuencia en láminas β paralelas. Solo una fracción de la cadena polipeptídica se encuentra en conformación de hebra β en las fibrillas; el resto forma bucles o colas estructuradas o no estructuradas.

Durante mucho tiempo, nuestro conocimiento de la estructura a nivel atómico de las fibrillas amiloides se vio limitado por el hecho de que no son adecuadas para los métodos más tradicionales de estudio de estructuras proteicas. En los últimos años se han producido avances en los métodos experimentales, incluyendo la espectroscopia de RMN de estado sólido y la criomicroscopía electrónica . En conjunto, estos métodos han proporcionado estructuras atómicas tridimensionales de fibrillas amiloides formadas por péptidos β-amiloides, α-sinucleína, tau y la proteína FUS, asociadas a diversas enfermedades neurodegenerativas. ^{[ 46 ] [ 47 ]}

Los estudios de difracción de rayos X de microcristales revelaron detalles atómicos de la región central del amiloide, aunque solo para péptidos simplificados con una longitud notablemente más corta que la de los péptidos o proteínas involucrados en la enfermedad. ^{[ 48 ] [ 49 ]} Las estructuras cristalográficas muestran que tramos cortos de regiones propensas a la formación de amiloide de proteínas amiloidogénicas corren perpendicularmente al eje del filamento, consistente con la característica "cruzada-β" de la estructura amiloide. También revelan una serie de características de las estructuras amiloides: las láminas β vecinas están compactadas entre sí a través de una interfaz desprovista de agua (por lo tanto, denominada interfaz seca), con las hebras β opuestas ligeramente desplazadas entre sí de modo que sus cadenas laterales se interdigitan. Esta interfaz compacta deshidratada creada se denominó interfaz de cremallera estérica. ^{[ 6 ]} Existen ocho clases teóricas de interfaces de cremallera estérica, determinadas por la direccionalidad de las láminas β (paralelas y antiparalelas) y la simetría entre láminas β adyacentes. Una limitación de la cristalografía de rayos X para resolver la estructura amiloide radica en la necesidad de formar microcristales, lo cual solo se puede lograr con péptidos más cortos que los asociados a la enfermedad.

Aunque las estructuras amiloides genuinas siempre se basan en láminas β intermoleculares, se han observado o propuesto diferentes tipos de pliegues terciarios de "orden superior". Las láminas β pueden formar un sándwich β o un solenoide β, que puede ser una hélice β o un rollo β. También se han propuesto fibrillas amiloides similares a las nativas, en las que las proteínas que contienen láminas β nativas mantienen su estructura similar a la nativa en las fibrillas. ^{[ 50 ]} Existen pocas ideas desarrolladas sobre cómo las topologías complejas de la cadena principal de las proteínas con restricciones de disulfuro, que son propensas a formar fibrillas amiloides (como la insulina y la lisozima), adoptan el motivo de lámina β amiloide. La presencia de múltiples restricciones reduce significativamente el espacio conformacional accesible, lo que hace que las simulaciones computacionales de estructuras amiloides sean más factibles. ^{[ 51 ]}

Un factor que complica los estudios de polipéptidos amiloidogénicos es que polipéptidos idénticos pueden plegarse en múltiples conformaciones amiloides distintas. ^{[ 6 ]} Este fenómeno se describe típicamente como polimorfismo amiloide . ^{[ 8 ]}

El amiloide se forma mediante la polimerización de cientos a miles de péptidos o proteínas monoméricas en fibras largas. La formación de amiloide implica una fase de latencia (también llamada fase de nucleación ), una fase exponencial (también llamada fase de crecimiento ) y una fase de meseta (también llamada fase de saturación ), como se muestra en la figura. ^{[ 52 ] [ 53 ] [ 54 ] [ 55 ]} Cuando se grafica la cantidad de fibrillas en función del tiempo, se observa una evolución temporal sigmoidal que refleja las tres fases distintas.

En el modelo más simple de "polimerización nucleada" (marcado con flechas rojas en la figura siguiente), las cadenas polipeptídicas individuales desplegadas o parcialmente desplegadas (monómeros) se convierten en un núcleo ( monómero u oligómero ) mediante un proceso termodinámicamente desfavorable que ocurre al inicio de la fase de latencia. ^{[ 54 ]} Posteriormente, las fibrillas crecen a partir de estos núcleos mediante la adición de monómeros en la fase exponencial. ^{[ 54 ]}

Posteriormente se introdujo un modelo diferente, denominado «conversión conformacional nucleada» y marcado con flechas azules en la figura siguiente, para ajustarse a algunas observaciones experimentales: se ha observado que los monómeros se convierten con frecuencia en oligómeros mal plegados y altamente desorganizados, distintos de los núcleos. ^{[ 56 ]} Solo más tarde, estos agregados se reorganizarán estructuralmente en núcleos, sobre los cuales otros oligómeros desorganizados se añadirán y reorganizarán mediante un mecanismo de plantilla o ajuste inducido (este modelo de «conversión conformacional nucleada»), formando finalmente fibrillas. ^{[ 56 ]}

Normalmente, las proteínas plegadas deben desplegarse parcialmente antes de que pueda producirse la agregación a través de uno de estos mecanismos. ^{[ 57 ]} Sin embargo, en algunos casos, las proteínas plegadas pueden agregarse sin cruzar la principal barrera energética para el despliegue, al poblar conformaciones similares a las nativas como consecuencia de fluctuaciones térmicas , liberación de ligandos o despliegue local que ocurre en circunstancias particulares. ^{[ 57 ]} En estas conformaciones similares a las nativas, los segmentos que normalmente están enterrados o estructurados en el estado completamente plegado y que poseen una alta propensión a agregarse quedan expuestos al disolvente o flexibles, lo que permite la formación de agregados similares a los nativos, que posteriormente se convierten en núcleos y fibrillas. Este proceso se llama "agregación similar a la nativa" (flechas verdes en la figura) y es similar al modelo de "conversión conformacional nucleada".

Un modelo posterior de formación de fibrillas amiloides implica la intervención de eventos secundarios, como la «fragmentación», en la que una fibrilla se divide en dos o más fibrillas más cortas, y la «nucleación secundaria», en la que las superficies de las fibrillas (no los extremos de las fibrillas) catalizan la formación de nuevos núcleos. ^{[ 55 ]} Ambos eventos secundarios aumentan el número de extremos de fibrillas capaces de reclutar nuevos monómeros u oligómeros, acelerando así la formación de fibrillas mediante un mecanismo de retroalimentación positiva. Estos eventos se suman a los pasos bien conocidos de nucleación primaria (formación del núcleo a partir de los monómeros mediante uno de los modelos descritos anteriormente), elongación de la fibrilla (adición de monómeros u oligómeros a los extremos de las fibrillas en crecimiento) y disociación (proceso opuesto).

Dicho modelo se describe en la figura de la derecha e implica la utilización de una ecuación maestra que incluye todos los pasos de la formación de fibrillas amiloides, es decir, nucleación primaria, elongación de fibrillas, nucleación secundaria y fragmentación de fibrillas. ^{[ 55 ] [ 58 ]} Las constantes de velocidad de los distintos pasos se pueden determinar a partir de un ajuste global de varias series temporales de agregación (por ejemplo, emisión de fluorescencia de ThT frente al tiempo) registradas a diferentes concentraciones de proteína. ^{[ 55 ]} El enfoque general de la ecuación maestra para la formación de fibrillas amiloides con vías secundarias ha sido desarrollado por Knowles , Vendruscolo , Cohen, Michaels y colaboradores y considera la evolución temporal de la concentración${\displaystyle f(t,j)}$de fibrillas de longitud${\displaystyle j}$(aquí${\displaystyle j}$representa el número de monómeros en un agregado). ^{[ 58 ]}$${\displaystyle {\begin{aligned}{\frac {\partial f(t,j)}{\partial t}}&=2k_{+}m(t)f(t,j-1)-2k_{+}m(t)f(t,j)\\&+2k_{\rm {off}}f(t,j+1)-2k_{\rm {off}}f(t,j)\\&+k_{-}\sum _{i=j+1}^{\infty }f(t,i)-k_{-}(j-1)f(t,j)\\&+k_{1}m(t)^{n_{1}}\delta _{j,n_{1}}+k_{2}m(t)^{n_{2}}M(t)\delta _{j,n_{2}}\\\\\end{aligned}}}$$dónde${\displaystyle \delta _{i,j}}$denota la delta de Kronecker . La interpretación física de los diversos términos en la ecuación maestra anterior es directa: los términos de la primera línea describen el crecimiento de fibrillas mediante la adición de monómeros con una constante de velocidad${\displaystyle k_{+}}$(elongación). Los términos de la segunda línea describen la disociación del monómero, es decir, el proceso inverso de la elongación.${\displaystyle k_{\rm {off}}}$es la constante de velocidad de disociación del monómero. Los términos de la tercera línea describen el efecto de la fragmentación, que se supone que ocurre de manera homogénea a lo largo de las fibrillas con una constante de velocidad${\displaystyle k_{-}}$Finalmente, los términos de la última línea describen la nucleación primaria y secundaria respectivamente. Nótese que la tasa de nucleación secundaria es proporcional a la masa de agregados, definida como${\displaystyle M(t)=\sum _{j=n_{1}}^{\infty }jf(t,j)}$.

Siguiendo este enfoque analítico, se ha hecho evidente que la fase de latencia no corresponde necesariamente solo a la formación de núcleos, sino que resulta de una combinación de varios pasos. De manera similar, la fase exponencial no es solo elongación de fibrillas, sino que resulta de una combinación de varios pasos, que incluyen nucleación primaria, elongación de fibrillas y también eventos secundarios. Una cantidad significativa de fibrillas resultantes de la nucleación primaria y la elongación de fibrillas puede formarse durante la fase de latencia, y los pasos secundarios, en lugar de solo la elongación de fibrillas, pueden ser los procesos dominantes que contribuyen al crecimiento de las fibrillas durante la fase exponencial. Con este nuevo modelo, cualquier agente perturbador de la formación de fibrillas amiloides, como posibles fármacos , metabolitos , mutaciones , chaperonas , etc., puede asignarse a un paso específico de la formación de fibrillas.

En general, la polimerización amiloide (agregación o polimerización no covalente) es sensible a la secuencia, es decir, las mutaciones en la secuencia pueden inducir o prevenir el autoensamblaje. ^{[ 59 ] [ 60 ]} Por ejemplo, los humanos producen amilina , un péptido amiloidogénico asociado con la diabetes tipo II, pero en ratas y ratones las prolinas se sustituyen en lugares críticos y no ocurre la amiloidogénesis. ^{[ 61 ]} Estudios que comparan el péptido β amiloide sintético con el recombinante en ensayos que miden la tasa de fibrilación, la homogeneidad de las fibrillas y la toxicidad celular mostraron que el péptido β amiloide recombinante tiene una tasa de fibrilación más rápida y mayor toxicidad que el péptido β amiloide sintético. ^{[ 62 ]}

Existen múltiples clases de secuencias polipeptídicas formadoras de amiloide. ^{[ 8 ]} Los polipéptidos ricos en glutamina son importantes en la amiloidogénesis de los priones de levadura y mamíferos , así como en los trastornos por repetición de trinucleótidos, incluida la enfermedad de Huntington . Cuando los polipéptidos ricos en glutamina se encuentran en una conformación de lámina β, las glutaminas pueden reforzar la estructura mediante la formación de enlaces de hidrógeno entre las cadenas, entre los carbonilos amida y los nitrógenos tanto del esqueleto como de las cadenas laterales. La edad de inicio de la enfermedad de Huntington muestra una correlación inversa con la longitud de la secuencia de poliglutamina , con hallazgos análogos en un sistema modelo de C. elegans con péptidos de poliglutamina modificados genéticamente. ^{[ 63 ]}

Otros polipéptidos y proteínas, como la amilina y el péptido β-amiloide, no tienen una secuencia consenso simple y se cree que se agregan a través de segmentos de secuencia enriquecidos con residuos hidrofóbicos, o residuos con alta propensión a formar estructuras de lámina β. ^{[ 59 ]} Entre los residuos hidrofóbicos, se ha descubierto que los aminoácidos aromáticos tienen la mayor propensión amiloidogénica. ^{[ 64 ] [ 65 ]}

La polimerización cruzada (fibrillas de una secuencia polipeptídica que provocan la formación de otras fibrillas de otra secuencia) se observa in vitro y posiblemente in vivo. Este fenómeno es importante, ya que explicaría la propagación de priones entre especies y las tasas diferenciales de propagación de priones, así como un vínculo estadístico entre la enfermedad de Alzheimer y la diabetes tipo 2. ^{[ 66 ]} En general, cuanto más similar sea la secuencia peptídica, más eficiente será la polimerización cruzada, aunque secuencias totalmente disímiles pueden polimerizarse cruzadamente e incluso secuencias muy similares pueden actuar como "bloqueadores" que impiden la polimerización.

Las razones por las que el amiloide causa enfermedades no están claras. En algunos casos, los depósitos alteran físicamente la arquitectura del tejido, lo que sugiere una alteración de la función por algún proceso general. Un consenso emergente implica a los intermediarios prefibrilares, en lugar de las fibras amiloides maduras, en la causa de la muerte celular, particularmente en enfermedades neurodegenerativas. ^{[ 17 ] [ 67 ]} Sin embargo, las fibrillas distan mucho de ser inocuas, ya que mantienen activa la red de homeostasis proteica, liberan oligómeros, causan la formación de oligómeros tóxicos mediante nucleación secundaria, crecen indefinidamente extendiéndose de un distrito a otro ^{[ 2 ]} y, en algunos casos, pueden ser tóxicas por sí mismas. ^{[ 68 ]}

Se ha observado que la desregulación del calcio ocurre tempranamente en células expuestas a oligómeros de proteínas. Estos pequeños agregados pueden formar canales iónicos a través de membranas de bicapa lipídica y activar los receptores NMDA y AMPA. Se ha planteado la hipótesis de que la formación de canales explica la desregulación del calcio y la disfunción mitocondrial al permitir la fuga indiscriminada de iones a través de las membranas celulares. ^{[ 69 ]} Los estudios han demostrado que la deposición de amiloide está asociada con la disfunción mitocondrial y la consiguiente generación de especies reactivas de oxígeno (ROS), que pueden iniciar una vía de señalización que conduce a la apoptosis . ^{[ 70 ]} Hay informes que indican que los polímeros amiloides (como los de huntingtina, asociados con la enfermedad de Huntington) pueden inducir la polimerización de proteínas amiloidogénicas esenciales, lo que debería ser perjudicial para las células. Además, los socios de interacción de estas proteínas esenciales también pueden ser secuestrados. ^{[ 71 ]}

Es probable que todos estos mecanismos de toxicidad desempeñen un papel. De hecho, la agregación de una proteína genera diversos agregados, todos ellos potencialmente tóxicos en cierta medida. Se ha identificado una amplia variedad de alteraciones bioquímicas, fisiológicas y citológicas tras la exposición de células y animales a dichas especies, independientemente de su identidad. También se ha informado que los oligómeros interactúan con diversos objetivos moleculares. Por lo tanto, es improbable que exista un único mecanismo de toxicidad o una única cascada de eventos celulares. El mal plegamiento de los agregados proteicos provoca múltiples interacciones aberrantes con diversos componentes celulares, como membranas, receptores proteicos, proteínas solubles, ARN, pequeños metabolitos, etc.

En el ámbito clínico, las enfermedades amiloides se identifican típicamente por un cambio en las propiedades espectroscópicas de colorantes aromáticos planares como la tioflavina T , el rojo Congo o el NIAD-4. ^{[ 72 ]} En general, esto se atribuye al cambio ambiental, ya que estos colorantes se intercalan entre las hebras β para confinar su estructura. ^{[ 73 ]}

La positividad al Rojo Congo sigue siendo el estándar de oro para el diagnóstico de la amiloidosis . En general, la unión del Rojo Congo a las placas amiloides produce una birrefringencia verde manzana típica cuando se observa bajo luz polarizada cruzada. Recientemente, se aprovechó una mejora significativa del rendimiento cuántico de fluorescencia de NIAD-4 para la obtención de imágenes de fluorescencia de superresolución de fibrillas amiloides ^{[ 74 ] y oligómeros [ 75 ]} . Para evitar la tinción inespecífica, se utilizan otras tinciones histológicas , como la tinción de hematoxilina y eosina , para atenuar la actividad de los colorantes en otros lugares, como el núcleo, donde el colorante podría unirse. La tecnología moderna de anticuerpos e inmunohistoquímica ha facilitado la tinción específica, pero a menudo esto puede causar problemas porque los epítopos pueden estar ocultos en el pliegue amiloide; en general, una estructura de proteína amiloide es una conformación diferente de la que reconoce el anticuerpo.

• JUNQ e IPOD
• Proteopatía
• Predictores de agregación de proteínas
• enfermedad de Alzheimer
• placa amiloide

• Los cuerpos de inclusión bacterianos contienen una estructura similar al amiloide, según SciVee.
• Hipótesis de la cascada amiloide
• Página web de la revista Amiloide: Journal of Protein Folding Disorders
• Papel de los anestésicos en la enfermedad de Alzheimer: se revelan detalles moleculares.