Los metanógenos son arqueas anaeróbicas que producen metano como subproducto de su metabolismo energético , es decir, catabolismo . La producción de metano, o metanogénesis , es la única vía bioquímica para la generación de ATP en los metanógenos. Todos los metanógenos conocidos pertenecen exclusivamente al dominio Archaea, aunque también se sabe que algunas bacterias , plantas y células animales producen metano. [ 1 ] Sin embargo, la vía bioquímica para la producción de metano en estos organismos difiere de la de los metanógenos y no contribuye a la formación de ATP. Los metanógenos pertenecen a varios filos dentro del dominio Archaea. Estudios anteriores ubicaron a todos los metanógenos conocidos en el superfilo Euryarchaeota. [ 2 ] [ 3 ] Sin embargo, datos filogenómicos recientes han llevado a su reclasificación en varios filos diferentes. [ 4 ] Los metanógenos son comunes en diversos ambientes anóxicos, como sedimentos marinos y de agua dulce, humedales , tractos digestivos de animales, plantas de tratamiento de aguas residuales , suelos de arrozales y vertederos . [ 5 ] Si bien algunos metanógenos son extremófilos , como Methanopyrus kandleri , que crece entre 84 y 110 °C (183 y 230 °F) , [ 6 ] o Methanonatronarchaeum thermophilum , que crece en un rango de pH de 8,2 a 10,2 y una concentración de Na + de 3 a 4,8 M, [ 7 ] la mayoría de los aislados son mesófilos y crecen alrededor de un pH neutro. [ 8 ]
Descripción física
Los metanógenos suelen tener forma de cocos (esféricos) o bacilos (cilíndricos), pero también se presentan filamentos largos ( Methanobrevibacter filiformis , Methanospirillum hungatei ) y formas curvas ( Methanobrevibacter curvatus , Methanobrevibacter cuticularis ). Existen más de 150 especies de metanógenos descritas, [ 9 ] que no forman un grupo monofilético en el dominio Archaea (véase Taxonomía). Son organismos exclusivamente anaeróbicos que no pueden funcionar en condiciones aeróbicas debido a la extrema sensibilidad al oxígeno de las enzimas de la metanogénesis y los clústeres de FeS involucrados en la producción de ATP. Sin embargo, el grado de sensibilidad al oxígeno varía, ya que la metanogénesis se ha detectado con frecuencia en ambientes temporalmente oxigenados como el suelo de los arrozales, [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] y se han propuesto varios mecanismos moleculares potencialmente involucrados en la desintoxicación de oxígeno y especies reactivas de oxígeno (ROS). [ 13 ] Por ejemplo, una especie recientemente identificada, Candidatus Methanothrix paradoxum, común en humedales y suelos, puede funcionar en micrositios anóxicos dentro de ambientes aeróbicos [ 14 ] pero es sensible a la presencia de oxígeno incluso a niveles traza y generalmente no puede soportar el estrés por oxígeno durante un tiempo prolongado. Sin embargo, Methanosarcina barkeri de una familia hermana , Methanosarcinaceae, es excepcional por poseer una enzima superóxido dismutasa (SOD) y puede sobrevivir más tiempo que las demás en presencia de O 2 . [ 3 ]
Al igual que otras arqueas, los metanógenos carecen de peptidoglicano , un polímero presente en las paredes celulares de las bacterias . [ 15 ] En cambio, algunos metanógenos poseen una pared celular formada por pseudopeptidoglicano (también conocido como pseudomureína ). [ 16 ] Sin embargo, la mayoría de los metanógenos presentan una matriz de proteínas paracristalinas (capa S) que se ensambla como un rompecabezas . [ 17 ] En algunos linajes existen tipos menos comunes de envoltura celular, como la vaina proteínica de Methanospirillum o la metanocondroitina de las células agregadas de Methanosarcina . [ 18 ]
Ecología
En ambientes anaeróbicos , los metanógenos desempeñan un papel ecológico vital, eliminando el exceso de hidrógeno y los productos de fermentación producidos por otras formas de respiración anaeróbica . [ 19 ] Los metanógenos suelen prosperar en ambientes donde se han agotado todos los aceptores de electrones distintos del CO 2 (como el oxígeno , el nitrato , el hierro férrico (Fe(III)) y el sulfato ). Estos ambientes incluyen humedales y suelos de arrozales, los tractos digestivos de diversos animales (rumiantes, artrópodos, humanos), [ 20 ] [ 21 ] [ 22 ] plantas de tratamiento de aguas residuales y vertederos, sedimentos oceánicos de aguas profundas y fuentes hidrotermales. [ 23 ] La mayoría de estos ambientes no se clasifican como extremos, por lo que los metanógenos que los habitan tampoco se consideran extremófilos. Sin embargo, muchos metanógenos bien estudiados son termófilos, como Methanopyrus kandleri , Methanothermobacter marburgensis y Methanocaldococcus jannaschii . Por otro lado, los metanógenos intestinales, como Methanobrevibacter smithii, común en humanos, o Methanobrevibacter ruminantium, omnipresente en rumiantes, son mesófilos .
Metanógenos en ambientes extremos
En rocas basálticas profundas cerca de las dorsales oceánicas , los metanógenos pueden obtener su hidrógeno de la reacción de serpentinización de la olivina , como se observa en el campo hidrotermal de Lost City . La descomposición térmica del agua y la radiólisis del agua son otras posibles fuentes de hidrógeno. Los metanógenos son agentes clave de la remineralización del carbono orgánico en sedimentos de márgenes continentales y otros sedimentos acuáticos con altas tasas de sedimentación y alto contenido de materia orgánica. Bajo las condiciones adecuadas de presión y temperatura, el metano biogénico puede acumularse en depósitos masivos de clatratos de metano [ 24 ] que representan una fracción significativa del carbono orgánico en los sedimentos de márgenes continentales y constituyen un reservorio clave de un potente gas de efecto invernadero. [ 25 ]
Se han encontrado metanógenos en diversos entornos extremos de la Tierra: enterrados bajo kilómetros de hielo en Groenlandia y viviendo en suelos desérticos cálidos y secos. Se sabe que son las arqueas más comunes en hábitats subterráneos profundos. Investigadores de la Universidad de California, Berkeley , encontraron microbios vivos productores de metano en una muestra de núcleo de hielo glacial extraída a unos tres kilómetros bajo Groenlandia. También hallaron un metabolismo constante capaz de reparar el daño macromolecular a temperaturas de entre 145 y -40 °C. [ 6 ]
Otro estudio [ 7 ] también ha descubierto metanógenos en un entorno hostil en la Tierra. Los investigadores estudiaron docenas de muestras de suelo y vapor de cinco entornos desérticos diferentes en Utah , Idaho y California en Estados Unidos , y en Canadá y Chile . De estas, se encontraron indicios de metanógenos viables en cinco muestras de suelo y tres de vapor de las cercanías de la Estación de Investigación del Desierto de Marte en Utah. [ 8 ]
Algunos científicos han propuesto que la presencia de metano en la atmósfera marciana podría ser indicativa de metanógenos nativos en ese planeta. [ 26 ] En junio de 2019, el rover Curiosity de la NASA detectó metano, comúnmente generado por microbios subterráneos como los metanógenos, lo que señala la posibilidad de vida en Marte . [ 27 ]
Estrechamente relacionados con los metanógenos se encuentran los oxidadores anaeróbicos de metano, que utilizan metano como sustrato junto con la reducción de sulfato y nitrato. [ 28 ] La mayoría de los metanógenos son productores autótrofos , pero aquellos que oxidan CH 3 COO − se clasifican como heterótrofos .
Metanógenos en el tracto digestivo de los animales
El tracto digestivo de los animales se caracteriza por un ambiente rico en nutrientes y predominantemente anaeróbico, lo que lo convierte en un hábitat ideal para muchos microbios, incluidos los metanógenos. A pesar de ello, los metanógenos y las arqueas, en general, fueron ignorados como parte de la microbiota intestinal hasta hace poco. Sin embargo, desempeñan un papel crucial en el mantenimiento del equilibrio intestinal al utilizar los productos finales de la fermentación bacteriana, como H₂ , acetato, metanol y metilaminas.
Methanobrevibacter smithii es la arquea metanogénica predominante en la microbiota del intestino humano . [ 29 ] Estudios recientes y extensos sobre la presencia de arqueas en el intestino animal, basados en el análisis del ARNr 16S, han proporcionado una visión integral de la diversidad y abundancia de arqueas. [ 30 ] [ 31 ] [ 21 ] Estos estudios revelaron que solo están presentes unos pocos linajes de arqueas, siendo la mayoría metanógenas, mientras que las arqueas no metanogénicas son raras y no abundantes. La clasificación taxonómica de la diversidad de arqueas identificó que representantes de solo tres filos están presentes en los tractos digestivos de los animales: Methanobacteriota (orden Methanobacteriales), Thermoplasmatota (orden Methanomassiliicoccales) y Halobacteriota (órdenes Methanomicrobiales y Methanosarcinales). Sin embargo, no todas las familias y géneros dentro de estos órdenes se detectaron en los intestinos de los animales, sino solo unos pocos géneros, lo que sugiere sus adaptaciones específicas al entorno intestinal.
Genómica comparativa y firmas moleculares
El análisis proteómico comparativo ha llevado a la identificación de 31 proteínas características específicas de los metanógenos (también conocidos como Methanoarchaeota). La mayoría de estas proteínas están relacionadas con la metanogénesis y podrían servir como marcadores moleculares potenciales para los metanógenos. Además, 10 proteínas encontradas en todos los metanógenos, que son compartidas por Archaeoglobus , sugieren que estos dos grupos están relacionados. En los árboles filogenéticos, los metanógenos no son monofiléticos y generalmente se dividen en tres clados. Por lo tanto, la presencia compartida única de un gran número de proteínas por todos los metanógenos podría deberse a transferencias horizontales de genes. [ 32 ] Además, proteínas novedosas más recientes asociadas con el tráfico de sulfuro se han vinculado a las arqueas metanógenas. [ 33 ] Se necesita más análisis proteómico para diferenciar aún más los géneros específicos dentro de la clase de metanógenos y revelar nuevas vías para el metabolismo metanogénico.
Los enfoques modernos de secuenciación de ADN o ARN han dilucidado varios marcadores genómicos específicos de varios grupos de metanógenos. Un hallazgo de este tipo aisló nueve metanógenos del género Methanoculleus y encontró que había al menos 2 genes de trehalosa sintasa que se encontraron en los nueve genomas. [ 34 ] Hasta ahora, el gen se ha observado solo en este género, por lo que puede usarse como marcador para identificar la arquea Methanoculleus. A medida que las técnicas de secuenciación progresan y las bases de datos se llenan con una abundancia de datos genómicos, se puede identificar un mayor número de cepas y rasgos, pero muchos géneros han permanecido poco estudiados. Por ejemplo, los metanógenos halófilos son microbios potencialmente importantes para el ciclo del carbono en los ecosistemas de humedales costeros, pero parecen estar muy poco estudiados. Una publicación reciente aisló una cepa nueva del género Methanohalophilus que reside en agua de mar rica en sulfuro. Curiosamente, han aislado varias porciones del genoma de esta cepa que son diferentes de otras cepas aisladas de este género ( Methanohalophilus mahii , Methanohalophilus halophilus , Methanohalophilus portucalensis , Methanohalophilus euhalbius ). Algunas diferencias incluyen un genoma altamente conservado, metabolismos de azufre y glucógeno y resistencia viral. [ 35 ] Se han observado marcadores genómicos consistentes con el entorno de los microbios en muchos otros casos. Un estudio de este tipo encontró que las arqueas productoras de metano encontradas en zonas de fracturación hidráulica tenían genomas que variaban con la profundidad vertical. Los genomas subsuperficiales y superficiales variaban junto con las restricciones encontradas en zonas de profundidad individuales, aunque también se encontró diversidad a pequeña escala en este estudio. [ 36 ] Los marcadores genómicos que señalan factores ambientalmente relevantes a menudo no son excluyentes. Un estudio de Thermoplasmata metanogénicos ha encontrado estos organismos en los tractos intestinales humanos y animales. Esta nueva especie también se encontró en otros ambientes metanogénicos, como suelos de humedales, aunque el grupo aislado en los humedales tendía a tener un mayor número de genes que codifican enzimas antioxidantes que no estaban presentes en el mismo grupo aislado en el tracto intestinal humano y animal. [ 37 ]Un problema común al identificar y descubrir nuevas especies de metanógenos es que, a veces, las diferencias genómicas pueden ser muy pequeñas, pero el grupo de investigación decide que son lo suficientemente diferentes como para separarlas en especies individuales. Un estudio tomó un grupo de Methanocellales y realizó un estudio genómico comparativo. Las tres cepas se consideraron originalmente idénticas, pero un enfoque detallado para el aislamiento genómico mostró diferencias entre sus genomas previamente considerados idénticos. Se observaron diferencias en el número de copias de genes y también hubo diversidad metabólica asociada con la información genómica. [ 38 ]
Las firmas genómicas no solo permiten marcar metanógenos únicos y genes relevantes para las condiciones ambientales; también han llevado a una mejor comprensión de la evolución de estas arqueas. Algunos metanógenos deben mitigar activamente los ambientes oxigenados. Se han encontrado genes funcionales involucrados con la producción de antioxidantes en metanógenos, y algunos grupos específicos tienden a tener un enriquecimiento de esta característica genómica. Los metanógenos que contienen un genoma con propiedades antioxidantes enriquecidas pueden proporcionar evidencia de que esta adición genómica pudo haber ocurrido durante el Gran Evento de Oxigenación. [ 39 ] En otro estudio, tres cepas del linaje Thermoplasmatales aisladas de tractos gastrointestinales de animales revelaron diferencias evolutivas. El gen de histona de tipo eucariota que está presente en la mayoría de los genomas de metanógenos no estaba presente, lo que sugiere evidencia de que una rama ancestral se perdió dentro de Thermoplasmatales y linajes relacionados. [ 40 ] Además, el grupo Methanomassiliicoccus tiene un genoma que parece haber perdido muchos genes comunes que codifican las primeras etapas de la metanogénesis. Estos genes parecen haber sido reemplazados por genes que codifican una nueva vía metagenética metilada. Esta vía se ha descrito en varios tipos de ambientes, lo que apunta a una evolución no específica del ambiente y podría indicar una desviación ancestral. [ 41 ]
Metabolismo
Producción de metano
Se sabe que los metanógenos producen metano a partir de sustratos como H₂ / CO₂ , acetato, formiato , metanol y metilaminas en un proceso llamado metanogénesis . [ 42 ] Las diferentes reacciones metanogénicas son catalizadas por conjuntos únicos de enzimas y coenzimas . Si bien el mecanismo de reacción y la energética varían entre una reacción y otra, todas estas reacciones contribuyen a la producción neta de energía positiva al crear gradientes de concentración de iones que se utilizan para impulsar la síntesis de ATP. [ 43 ] La reacción general para la metanogénesis de H₂ / CO₂ es :
- (∆G˚' = -134 kJ/mol CH 4 )
Entre los organismos bien estudiados que producen metano mediante metanogénesis de H₂/CO₂ se incluyen Methanosarcina barkeri , Methanobacterium thermoautotrophicum y Methanobacterium wolfei . [ 44 ] [ 45 ] [ 46 ] Estos organismos se encuentran típicamente en ambientes anaeróbicos. [ 42 ]
En la etapa inicial de la metanogénesis de H₂ / CO₂ , el CO₂ se une al metanofurano (MF) y se reduce a formil-MF. Este proceso reductivo endergónico (∆G˚'= +16 kJ/mol) depende de la disponibilidad de H₂ y es catalizado por la enzima formil-MF deshidrogenasa. [ 42 ]
El componente formilo del formil-MF se transfiere a la coenzima tetrahidrometanopterina (H4MPT) y es catalizado por una enzima soluble conocida como formiltransferasa . Esto da como resultado la formación de formil-H4MPT. [ 42 ]
El formil-H4MPT se reduce posteriormente a metenil-H4MPT. El metenil-H4MPT sufre entonces una hidrólisis en un paso seguida de una reducción en dos pasos a metil-H4MPT. La reducción reversible en dos pasos es asistida por la coenzima F 420 , cuyo aceptor de hidruro se oxida espontáneamente. [ 42 ] Una vez oxidado, el suministro de electrones de F 420 se repone aceptando electrones de H 2 . Este paso es catalizado por la metileno H4MPT deshidrogenasa. [ 47 ]
- (Reducción de formil-H4MPT)
- (Hidrólisis de metenil-H4MPT)
- (Reducción de H4MPT)
A continuación, el grupo metilo del metil-M4MPT se transfiere a la coenzima M mediante una reacción catalizada por metiltransferasa. [ 48 ] [ 49 ]
El paso final de la metanogénesis de H₂ / CO₂ involucra la metil -coenzima M reductasa y dos coenzimas: N-7 mercaptoheptanoiltreonina fosfato (HS-HTP) y la coenzima F₄₃₀ . El HS-HTP dona electrones a la metil-coenzima M, permitiendo la formación de metano y disulfuro mixto de HS-CoM. [ 50 ] Por otro lado, la F₄₃₀ actúa como grupo prostético para la reductasa. El H₂ dona electrones al disulfuro mixto de HS-CoM y regenera la coenzima M. [ 51 ]
- (Formación de metano)
- (Regeneración de la coenzima M)
Aplicación biotecnológica
Tratamiento de aguas residuales
Los metanógenos se utilizan ampliamente en digestores anaeróbicos para tratar aguas residuales y contaminantes orgánicos acuosos. Las industrias han seleccionado los metanógenos por su capacidad para realizar la biometanización durante la descomposición de las aguas residuales, lo que hace que el proceso sea sostenible y rentable. [ 52 ]
La biodescomposición en el digestor anaeróbico implica una acción cooperativa de cuatro etapas llevada a cabo por diferentes microorganismos. [ 53 ] La primera etapa es la hidrólisis de la materia orgánica polimerizada insoluble por anaerobios como Streptococcus y Enterobacterium. [ 54 ] En la segunda etapa, los acidógenos descomponen los contaminantes orgánicos disueltos en las aguas residuales en ácidos grasos . En la tercera etapa, los acetógenos convierten los ácidos grasos en acetatos . En la etapa final, los metanógenos metabolizan los acetatos en metano gaseoso . El metano, como subproducto, abandona la capa acuosa y sirve como fuente de energía para impulsar el procesamiento de las aguas residuales dentro del digestor, generando así un mecanismo autosostenible. [ 55 ]
Los metanógenos también reducen eficazmente la concentración de materia orgánica en las aguas residuales. [ 56 ] Por ejemplo, las aguas residuales agrícolas , ricas en materia orgánica, han sido una causa importante de la degradación de los ecosistemas acuáticos. Los desequilibrios químicos pueden provocar graves consecuencias, como la eutrofización . Mediante la digestión anaeróbica, la purificación de las aguas residuales puede prevenir proliferaciones inesperadas en los sistemas acuáticos y atrapar la metanogénesis dentro de los digestores. Esto permite destinar el biometano a la producción de energía y evita la liberación a la atmósfera de metano, un potente gas de efecto invernadero.
Los componentes orgánicos de las aguas residuales varían enormemente. Las estructuras químicas de la materia orgánica seleccionan metanógenos específicos para realizar la digestión anaeróbica. Un ejemplo es que los miembros del género Methanosaeta dominan la digestión del efluente de las plantas de aceite de palma (POME) y los residuos de las cervecerías. [ 56 ] La modernización de los sistemas de tratamiento de aguas residuales para incorporar una mayor diversidad de microorganismos y disminuir el contenido orgánico en el tratamiento es objeto de investigación activa en el campo de la ingeniería microbiológica y química. [ 57 ] Las nuevas generaciones actuales de reactores anaeróbicos multifásicos por etapas y sistemas de reactores de lecho de lodos de flujo ascendente están diseñados para tener características innovadoras para contrarrestar la entrada de aguas residuales de alta carga, las condiciones de temperatura extremas y los posibles compuestos inhibidores. [ 58 ]
Taxonomía
Inicialmente, los metanógenos se consideraban bacterias, ya que no era posible distinguir entre arqueas y bacterias antes de la introducción de técnicas moleculares como la secuenciación de ADN y la PCR. Desde la introducción del dominio Archaea por Carl Woese en 1977, [ 59 ] los metanógenos fueron considerados durante un período prolongado un grupo monofilético, posteriormente denominado superfilo Euryarchaeota. Sin embargo, estudios intensivos de diversos entornos han demostrado que existen cada vez más linajes no metanogénicos entre los metanogénicos.
El desarrollo de la secuenciación del genoma directamente a partir de muestras ambientales (metagenómica) permitió el descubrimiento de los primeros metanógenos fuera del superfilo Euryarchaeota. El primer linaje metanogénico putativo fue Bathyarchaeia, [ 60 ] una clase dentro del filo Thermoproteota. Posteriormente, se demostró que este linaje no es metanogénico sino oxidante de alcanos utilizando la enzima Acr altamente divergente similar al gen distintivo de la metanogénesis, la metil-CoM reductasa (McrABG). [ 61 ] El primer aislado de Bathyarchaeum tardum del sedimento de un lago costero en Rusia mostró que metaboliza compuestos aromáticos y proteínas [ 62 ] como se había predicho previamente basándose en estudios metagenómicos. [ 63 ] [ 64 ] [ 65 ] Sin embargo, se descubrieron más metanógenos putativos nuevos fuera de Euryarchaeota basándose en la presencia de McrABG.
Por ejemplo, se encontraron metanógenos en los filos Thermoproteota (órdenes Methanomethyliales, Korarchaeales, Methanohydrogenales, Nezhaarchaeales) y Methanobacteriota_B (orden Methanofastidiosales). Además, se aislaron algunos nuevos linajes de metanógenos en cultivo puro, lo que permitió el descubrimiento de un nuevo tipo de metanogénesis: metanogénesis metil-reductora dependiente de H₂ , que es independiente de la vía de Wood-Ljungdahl. Por ejemplo, en 2012, el orden Methanoplasmatales del filo Thermoplasmatota fue descrito como un séptimo orden de metanógenos. [ 66 ] Posteriormente, el orden fue renombrado Methanomassiliicoccales basándose en el Methanomassiliicoccus luminyensis aislado del intestino humano . [ 67 ] [ 68 ]
Otro nuevo linaje en el filo Halobacteriota, orden Methanonatronarchaeales, fue descubierto en lagos salinos alcalinos en Siberia en 2017. [ 69 ] [ 70 ] También emplea metanogénesis metil-reductora dependiente de H 2 pero curiosamente alberga casi la vía completa de Wood-Ljungdahl. Sin embargo, está desconectado de McrABG ya que no se detectó ningún complejo MtrA-H. [ 71 ] [ 72 ]
La taxonomía de los metanógenos refleja la evolución de estas arqueas , y algunos estudios sugieren que el último ancestro común de las arqueas era metanogénico. [ 73 ] De ser correcto, esto sugiere que muchos linajes de arqueas perdieron la capacidad de producir metano y cambiaron a otros tipos de metabolismo. Actualmente, la mayoría de los metanógenos aislados pertenecen a uno de los tres filos de arqueas ( clasificación GTDB versión 220): Halobacteriota, Methanobacteriota y Thermoplasmatota. Según el Código Internacional de Nomenclatura para Procariotas, [ 74 ] los tres filos pertenecen al mismo reino, Methanobacteriati. [ 75 ] [ 76 ] En total, se conocen más de 150 especies de metanógenos en cultivo, algunas representadas por más de una cepa . [ 77 ]
- Filo Halobacteria
- Clase Metanocelia
- Orden Metanocelales
- Familia Metanocellaceae
- Género Methanocella Sakai et al. 2008
- Methanocella paludicola Sakai et al. 2008 (especie tipo)
- Methanocella arvoryzae Sakai et al. 2010
- Methanocella conradii Lü y Lu 2012
- Género Methanooceanicella Zhang et al. 2024
- Methanooceanicella nereidis Zhang et al. 2024 (especie tipo)
- Género Methanocella Sakai et al. 2008
- Familia Metanocellaceae
- Orden Metanocelales
- Clase Metanomicrobia
- Orden Metanomicrobiano
- Familia Methanocalculaceae Zhilina et al. 2014
- Género Methanocalculus Ollivier et al. 1998
- Methanocalculus halotolerans Ollivier et al. 1998 (especie tipo)
- Methanocalculus alkaliphilus Sorokin et al. 2015
- Methanocalculus chunghsingensis Lai et al. 2004
- Methanocalculus natronophilus Zhilina et al. 2014
- Methanocalculus pumilus Mori et al. 2000
- Methanocalculus taiwanensis Lai et al. 2002
- Género Methanocalculus Ollivier et al. 1998
- Familia Methanocorpusculaceae Zellner et al. 1989
- Metanocorpusculum Zellner et al. 1988
- Methanocorpusculum parvum Zellner et al. 1988 (especie tipo)
- Methanocorpusculum bavaricum Zellner et al. 1989
- Metanocorpusculum labreanum
- Methanocorpusculum sinense Zellner et al. 1989
- Metanocorpusculum Zellner et al. 1988
- Familia Methanomicrobiaceae Balch y Wolfe 1981
- Género Methanomicrobium Balch y Wolfe 1981
- Methanomicrobium mobile (Paynter y Hungate 1968) Balch y Wolfe 1981 (especie tipo)
- Methanomicrobium antiquum Mochimaru et al. 2016
- Género Methanoculleus Maestrojuán et al. 1990
- Methanoculleus bourgensis corrig. (Ollivier et al. 1986) Maestrojuán et al. 1990 (especie tipo)
- Methanoculleus chikugoensis Dianou et al. 2001
- Methanoculleus horonobensis Shimizu et al. 2013
- Methanoculleus hydrogenitrophicus Tian et al. 2010
- Metanoculleus marisnigri
- Methanoculleus palmolei Zellner et al. 1998
- Methanoculleus receptaculi Cheng et al. 2008
- Methanoculleus sediminis Chen et al. 2015
- Methanoculleus submarinus Mikucki et al. 2003
- Methanoculleus taiwanensis Weng et al. 2015
- Methanoculleus thermophilus corrig. (Rivard y Smith 1982) Maestrojuán et al. 1990
- Género Metanogenium Romesser et al. 1981
- Metanogenium cariaci Romesser et al. 1981 (especie tipo)
- Metanógeno frigidum
- Metanogenium marinum Chong et al. 2003
- Organófilo de metanógeno
- Género Methanofollis Zellner et al. 1999
- Methanofollis tationis (Zabel et al. 1986) Zellner et al. 1999 (cepas tipo)
- Methanofollis aquaemaris Lai y Chen 2001
- Methanofollis etanolicus Imachi et al. 2009
- Methanofollis fontis Chen et al. 2020
- Methanofollis formosanus Wu et al. 2005
- Methanofollis liminatans (Zellner et al. 1990) Zellner et al. 1999
- Género Methanomicrobium Balch y Wolfe 1981
- Familia Methanoregulaceae Sakai et al. 2012
- Género Methanoregula Bräuer et al. 2011
- Methanoregula boonei Bräuer et al. 2011 (especie tipo)
- Metanoregula formicica Yashiro et al. 2011
- Género Methanoregula Bräuer et al. 2011
- Familia Methanospirillaceae Boone et al. 2002
- Metanospirillum Ferry et al. 1974
- Methanospirillum hungatei corrig. Ferry y cols. 1974 (especie tipo)
- Methanospirillum lagunae Iino et al. 2010
- Methanospirillum psychrodurum Zhou et al. 2014
- Methanospirillum stamsii Parshina et al. 2014
- Metanospirillum Ferry et al. 1974
- Familia Methanocalculaceae Zhilina et al. 2014
- Orden Metanomicrobiano
- Clase Methanonatronarchaeia
- Orden Methanonatronarchaeales
- Familia Methanonatronarchaeaceae Sorokin et al. 2018
- Género Methanonatronarchaeum Sorokin et al. 2018
- Methanonatronarchaeum thermophilum Sorokin et al. 2018 (especie tipo)
- Género Methanonatronarchaeum Sorokin et al. 2018
- Familia Methanonatronarchaeaceae Sorokin et al. 2018
- Orden Methanonatronarchaeales
- Clase Methanosarcinia
- Orden Methanosarcinales
- Familia Methanosarcinaceae
- Género Methanosarcina Kluyver y van Niel 1936
- Methanosarcina barkeri Schnellen 1947 (especie tipo)
- Methanosarcina acetivorans
- Metanosarcina baltica von Klein et al. 2002
- Methanosarcina flavescens Kern et al. 2016
- Methanosarcina horonobensis Shimizu et al. 2011
- Methanosarcina lacustris Simankova et al. 2002
- Methanosarcina mazei (Barker 1936) Mah y Kuhn 1984
- Methanosarcina semesiae Lyimo et al. 2000
- Methanosarcina siciliae (Stetter y König 1989) Ni et al. 1994
- Methanosarcina soligelidi Wagner et al. 2013
- Methanosarcina spelaei Ganzert et al. 2014
- Methanosarcina subterranea Shimizu et al. 2015
- Methanosarcina thermophila Zinder et al. 1985
- Methanosarcina vacuolata Zhilina y Zavarzin 1987
- Género Metanimicrococcus corrig. Sprenger et al. 2000
- Methanimicrococcus blatticola corrig. Sprenger et al. 2000 (especie tipo)
- Methanimicrococcus hacksteinii Protasov y Brune 2025
- Methanimicrococcus hongohii Protasov y Brune 2025
- Methanimicrococcus stummii Protasov y Brune 2025
- Género Methanococcoides Sowers y Ferry 1985
- Methanococcoides methylutens Sowers y Ferry 1985 (especie tipo)
- Methanococcoides alaskense Singh et al. 2005
- Methanococcoides burtonii Franzmann et al. 1993
- Methanococcoides orientis Liang et al. 2022
- Methanococcoides vulcani L'Haridon et al. 2014
- Género Methanohalobium Zhilina y Zavarzin 1988
- Methanohalobium vestigatum corrig. Zhilina y Zavarzin 1988 (especie tipo)
- Género Methanohalophilus Paterek y Smith 1988
- Methanohalophilus mahii Paterek y Smith 1988 (especie tipo)
- Methanohalophilus halophilus (Zhilina 1984) Wilharm et al. 1991
- Methanohalophilus levihalophilus Katayama et al. 2014
- Methanohalophilus portucalensis Boone et al. 1993
- Methanohalophilus profundi L'Haridon et al. 2021
- Género Methanolapillus Protasov y Brune 2025
- Methanolapillus millepedarum Protasov y Brune 2025 (especie tipo)
- Methanolapillus africanus Protasov y Brune 2025
- Methanolapillus ohkumae Protasov y Brune 2025
- Género Metanolobus König y Stetter 1983
- Methanolobus tindarius König y Stetter 1983 (especie tipo)
- Methanolobus bombayensis Kadam et al. 1994
- Methanolobus chelungpuianus Wu y Lai 2015
- Methanolobus halotolerans Shen et al. 2020
- Metanolobus mangrovi Zhou et al. 2023
- Metanolobus oregonensis (Liu et al. 1990) Boone 2002
- Metanolobus profundi Mochimaru et al. 2009
- Methanolobus psychrotolerans Chen et al. 2018
- Metanolobus sediminis Zhou et al. 2023
- Methanolobus taylorii Oremland y Boone 1994
- Metanolobus vulcani Stetter et al. 1989
- Metanolobus zinderi Doerfert et al. 2009
- Género Methanomethylovorans Lomans et al. 2004
- Methanomethylovorans hollandica Lomans et al. 2004 (especie tipo)
- Metanometilovorans thermophila Jiang et al. 2005
- Methanomethylovorans uponensis Cha et al. 2014
- Género Methanosalsum Boone y Baker 2002
- Methanosalsum zhilinae (Mathrani et al. 1988) Boone y Baker 2002 (especie tipo)
- Methanosalsum natronophilum Sorokin et al. 2015
- Género Methanosarcina Kluyver y van Niel 1936
- Familia Methanotrichaceae
- Género Methanothrix Huser et al. 1983
- Methanothrix soehngenii Huser et al. 1983 (especie tipo)
- Methanothrix harundinacea (Ma et al. 2006) Akinyemi et al. 2021
- Methanothrix thermoacetophila corrig. Nozhevnikova y Chudina 1988
- " Candidatus Methanothrix paradoxa" corrig. Ángulo y col. 2017
- Género Methanothrix Huser et al. 1983
- Familia Methermicoccaceae
- Género Methermicoccus Cheng et al. 2007
- Methermicoccus shengliensis Cheng et al. 2007 (especie tipo)
- Género Methermicoccus Cheng et al. 2007
- Familia Methanosarcinaceae
- Orden Methanosarcinales
- Clase Metanocelia
- Filo Methanobacterota
- Clase Metanobacteria
- Orden Metanobacteriales
- Familia Methanobacteriaceae
- Género Methanobacterium Kluyver y van Niel 1936
- Methanobacterium formicicum Schnellen 1947 (especie tipo)
- Metanobacterium bryantii
- Género Methanobrevibacter Balch y Wolfe 1981
- Methanobrevibacter ruminantium (Smith y Hungate 1958) Balch y Wolfe 1981 (especie tipo)
- Methanobrevibacter acididurans Savant et al. 2002
- Methanobrevibacter arboriphilus corrig. (Zeikus y Henning 1975) Balch y Wolfe 1981
- Methanobrevibacter boviskoreani Lee et al. 2013
- Methanobrevibacter curvatus Leadbetter y Breznak 1997
- Methanobrevibacter cuticularis Leadbetter y Breznak 1997
- Methanobrevibacter filiformis Leadbetter et al. 1998
- Methanobrevibacter gottschalkii Miller y Lin 2002
- Methanobrevibacter intestini Weinberger et al. 2025
- Methanobrevibacter millerae Rea et al. 2007
- Methanobrevibacter olleyae Rea et al. 2007
- Methanobrevibacter oralis Ferrari et al. 1995
- Methanobrevibacter smithii Balch y Wolfe 1981
- Methanobrevibacter thaueri Miller y Lin 2002
- Methanobrevibacter woesei Miller y Lin 2002
- Methanobrevibacter wolinii Miller y Lin 2002
- " Methanobrevibacter massiliense " Huynh et al. 2015
- Género Methanosphaera Miller y Wolin 1985
- Methanosphaera stadtmanae corrig. Miller y Wolin 1985 (especie tipo)
- Methanosphaera cuniculi Biavati et al. 1990
- Género Methanothermobacter Wasserfallen et al. 2000
- Methanothermobacter thermautotrophicus corrig. (Zeikus y Wolfe 1972) Wasserfallen et al. 2000 (especie tipo)
- Methanothermobacter crinale Cheng et al. 2012
- Methanothermobacter defluvii (Kotelnikova et al. 1994) Boone 2002
- Methanothermobacter marburgensis Wasserfallen et al. 2000
- Methanothermobacter tenebrarum Nakamura et al. 2013
- Methanothermobacter thermoflexus (Kotelnikova et al. 1994) Boone 2002
- Methanothermobacter thermophilus (Laurinavichus et al. 1990) Boone 2002
- Methanothermobacter wolfei corrig. (Winter et al. 1985) Wasserfallen et al. 2000
- Género Methanobacterium Kluyver y van Niel 1936
- Familia Methanothermaceae
- Género Methanothermus Stetter 1982
- Methanothermus fervidus Stetter 1982 (especie tipo)
- Género Methanothermus Stetter 1982
- Familia Methanobacteriaceae
- Orden Metanobacteriales
- Clase Metanopiri
- Orden Metanopyrales
- Familia Methanopyraceae
- Género Methanopyrus Kurr et al. 1992
- Methanopyrus kandleri Kurr et al. 1992 (especie tipo)
- Género Methanopyrus Kurr et al. 1992
- Familia Methanopyraceae
- Orden Metanopyrales
- Clase Metanococos
- Orden Metanococcales
- Familia Methanococcaceae Balch y Wolfe 1981
- Género Methanococcus Kluyver y van Niel 1936
- Género Methanofervidicoccus
- Methanofervidicoccus abyssi Sakai et al. 2019 (especie tipo)
- Género Methanothermococcus
- Methanothermococcus thermolithotrophicus (Huber et al. 1984) Whitman 2002 (especie tipo)
- Familia Methanocaldococcaceae
- Género Methanocaldococcus
- Methanocaldococcus jannaschii (Jones et al. 1984) Whitman 2002 (especie tipo)
- Género Methanotorris
- Methanotorris igneus (Burggraf et al. 1990) Whitman 2002 (especie tipo)
- Género Methanocaldococcus
- Familia Methanococcaceae Balch y Wolfe 1981
- Orden Metanococcales
- Clase Metanobacteria
- Filo Thermoplasmatota
- Clase Thermoplasmata
- Orden Methanomassiliicoccales
- Familia Methanomassiliicoccaceae
- Género Methanomassiliicoccus Dridi et al. 2012
- Methanomassiliicoccus luminyensis Dridi et al. 2012 (especie tipo)
- Género Methanomassiliicoccus Dridi et al. 2012
- Familia Methanomethylophilaceae
- Género Methanomethylophilus Borrel et al. 2024
- Methanomethylophilus alvi Borrel et al. 2024 (especie tipo)
- Género Methanomethylophilus Borrel et al. 2024
- Familia Methanomassiliicoccaceae
- Orden Methanomassiliicoccales
- Clase Thermoplasmata
Véase también
Referencias
- ^ Ernst, Leonardo; Steinfeld, Benedikt; Barayeu, Uladzimir; Klintzsch, Thomas; Kurth, Markus; Grimm, Dirk; Dick, Tobías P.; Rebelein, Johannes G.; Bischofs, Ilka B.; Keppler, Frank (17 de marzo de 2022). "Formación de metano impulsada por especies reactivas de oxígeno en todos los organismos vivos" . Naturaleza . 603 (7901): 482– 487. Bibcode : 2022Natur.603..482E . doi : 10.1038/s41586-022-04511-9 . ISSN 0028-0836 . PMID 35264795 .
- ↑ Liu, Yuchen; Whitman, William B. (marzo de 2008). "Diversidad metabólica, filogenética y ecológica de las arqueas metanogénicas" . Anales de la Academia de Ciencias de Nueva York . 1125 (1): 171– 189. Bibcode : 2008NYASA1125..171L . doi : 10.1196/annals.1419.019 . ISSN 0077-8923 . PMID 18378594 .
- 1 2 Peters, V.; Conrad, R. (1995). "Bacterias metanogénicas y otras bacterias estrictamente anaeróbicas en suelos desérticos y otros suelos oxigenados" . Microbiología Aplicada y Ambiental . 61 (4): 1673– 1676. Bibcode : 1995ApEnM..61.1673P . doi : 10.1128/AEM.61.4.1673-1676.1995 . PMC 1388429. PMID 16535011 .
- ↑ "Copia archivada" . Archivado del original el 27 de marzo de 2009. Consultado el 20 de septiembre de 2009 .
{{cite web}}: CS1 mantenimiento: copia archivada como título ( enlace ) - ^ Boone, David R. (2015). "Metanobacteria". Manual de sistemática de arqueas y bacterias de Bergey . John Wiley & Sons, Ltd. págs. 1 a 8. doi : 10.1002/9781118960608.gbm00495 . ISBN 978-1-118-96060-8.
- 1 2 Kurr, Margit; Huber, Robert; König, Helmut; Jannasch, Holger W.; Fricke, Hans; Trincone, Antonio; Kristjansson, Jakob K.; Stetter, Karl O. (septiembre de 1991). "Methanopyrus kandleri, gen. y sp. nov. representa un nuevo grupo de metanógenos hipertermófilos, que crecen a 110 °C" . Archives of Microbiology . 156 (4): 239– 247. Bibcode : 1991ArMic.156..239K . doi : 10.1007/BF00262992 . ISSN 0302-8933 .
- 1 2 Sorokin, Dimitry Y.; Merkel, Alexander Y.; Abbas, Ben; Makarova, Kira S.; Rijpstra, W. Irene C.; Koenen, M.; Sinninghe Damsté, Jaap S.; Galinski, Erwin A.; Koonin, Eugene V.; van Loosdrecht, Mark CM (2018-07-01). "Methanonatronarchaeum thermophilum gen. nov., sp. nov. y 'Candidatus Methanohalarchaeum thermophilum', metanógenos reductores de metilo extremadamente halo(natronofílicos) de lagos hipersalinos que comprenden una nueva clase de euryarchaeales Methanonatronarchaeia classis nov". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 68 (7): 2199– 2208. doi : 10.1099/ijsem.0.002810 . ISSN 1466-5026 .
- 1 2 Michał, Burdukiewicz; Gagat, Przemysław; Jabłoński, Sławomir; Chilimoniuk, Jarosław; Gaworski, Michał; Mackiewicz, Pawel; Marcin, Łukaszewicz (junio de 2018). "PhyMet 2: una base de datos y un conjunto de herramientas para análisis filogenéticos y metabólicos de metanógenos" . Informes de Microbiología Ambiental . 10 (3): 378– 382. Código Bib : 2018EnvMR..10..378M . doi : 10.1111/1758-2229.12648 . ISSN 1758-2229 . PMID 29624889 .
- ↑ "Instituto Leibniz DSMZ: Bienvenido al Instituto Leibniz DSMZ" . www.dsmz.de. Consultado el 17 de julio de 2024 .
- ↑ Angel, Roey; Matthies, Diethart; Conrad, Ralf (2011-05-31). "Activación de la metanogénesis en costras biológicas de suelos áridos a pesar de la presencia de oxígeno" . PLOS ONE . 6 (5) e20453. Bibcode : 2011PLoSO...620453A . doi : 10.1371/journal.pone.0020453 . ISSN 1932-6203 . PMC 3105065. PMID 21655270 .
- ↑ Angel, Roey; Claus, Peter; Conrad, Ralf (abril de 2012). "Las arqueas metanogénicas son omnipresentes a nivel mundial en suelos aireados y se activan en condiciones anóxicas húmedas" . The ISME Journal . 6 (4): 847– 862. Bibcode : 2012ISMEJ...6..847A . doi : 10.1038/ismej.2011.141 . ISSN 1751-7362 . PMC 3309352. PMID 22071343 .
- ↑ Conrad, Ralf (11 de junio de 2020). "Producción de metano en ambientes de suelo: biogeoquímica anaeróbica y vida microbiana entre inundación y desecación" . Microorganisms . 8 (6): 881. doi : 10.3390/microorganisms8060881 . ISSN 2076-2607 . PMC 7357154. PMID 32545191 .
- ↑ Lyu, Zhe; Lu, Yahai (2017-11-14). "El cambio metabólico a nivel de clase arroja luz sobre la adaptación de los metanógenos a los entornos oxidativos" . The ISME Journal . 12 (2): 411– 423. Bibcode : 2018ISMEJ..12..411L . doi : 10.1038/ismej.2017.173 . ISSN 1751-7362 . PMC 5776455. PMID 29135970 .
- ↑ Angle, Jordan C.; Morin, Timothy H.; Solden, Lindsey M.; Narrowe, Adrienne B.; Smith, Garrett J.; Borton, Mikayla A.; Rey-Sanchez, Camilo; Daly, Rebecca A.; Mirfenderesgi, Golnazalsdat; Hoyt, David W.; Riley, William J.; Miller, Christopher S.; Bohrer, Gil; Wrighton, Kelly C. (2017-11-16). "La metanogénesis en suelos oxigenados es una fracción sustancial de las emisiones de metano de los humedales" . Nature Communications . 8 (1): 1567. Bibcode : 2017NatCo...8.1567A . doi : 10.1038/s41467-017-01753-4 . ISSN 2041-1723 . PMC 5691036 . PMID 29146959 .
- ↑ van Wolferen, Marleen; Pulschen, André Arashiro; Baum, zumbido; Gribaldo, Simonetta; Albers, Sonja-Verena (17 de octubre de 2022). "La biología celular de las arqueas" . Microbiología de la naturaleza . 7 (11): 1744–1755.doi : 10.1038 / s41564-022-01215-8 . ISSN 2058-5276 . PMC 7613921 . PMID 36253512 .
- ^ Whitman, William B., ed. (14 de septiembre de 2015). Manual de sistemática de arqueas y bacterias de Bergey (1 ed.). Wiley. doi : 10.1002/9781118960608.gbm00495 . ISBN 978-1-118-96060-8.
- ^ Sivabalasarma, Shamphavi; van Wolferen, Marleen; Albers, Sonja-Verena; Charles-Orszag, Arthur (agosto de 2025). "Biogénesis, función y evolución de la capa S de arqueas" . Opinión actual en biología celular . 95 102534. doi : 10.1016/j.ceb.2025.102534 . ISSN 0955-0674 . PMID 40441074 .
- ↑ Albers, Sonja-Verena; Meyer, Benjamin H. (junio de 2011). "La envoltura celular de las arqueas" . Nature Reviews Microbiology . 9 (6): 414– 426. doi : 10.1038/nrmicro2576 . ISSN 1740-1526 . PMID 21572458 .
- ↑ Thauer, Rudolf K.; Kaster, Anne-Kristin; Seedorf, Henning; Buckel, Wolfgang; Hedderich, Reiner (agosto de 2008). "Arqueas metanogénicas: diferencias ecológicamente relevantes en la conservación de la energía" . Nature Reviews Microbiology . 6 (8): 579– 591. doi : 10.1038/nrmicro1931 . ISSN 1740-1526 . PMID 18587410 .
- ^ Chibani, Cynthia María; Mahnert, Alejandro; Borrel, Guillaume; Almeida, Alejandro; Werner, Almut; Brugère, Jean-François; Gribaldo, Simonetta; Finn, Robert D.; Schmitz, Ruth A.; Moissl-Eichinger, Christine (30 de diciembre de 2021). "Un catálogo de 1.167 genomas del arqueoma del intestino humano" . Microbiología de la naturaleza . 7 (1): 48– 61. doi : 10.1038/s41564-021-01020-9 . ISSN 2058-5276 . PMC 8727293 . PMID 34969981 .
- 1 2 Protasov, Evgenii; Nonoh, James O.; Kästle Silva, Joana M.; Mies, Undine S.; Hervé, Vicente; Dietrich, Carsten; Lang, Cristina; Mikulski, Lena; Platt, Katja; Poehlein, Anja; Köhler-Ramm, Tim; Miambi, Eduardo; Boga, Hamadi I.; Feldewert, Christopher; Ngugi, David K. (15 de noviembre de 2023). "Diversidad y revisión taxonómica de metanógenos y otras arqueas en el tracto intestinal de artrópodos terrestres" . Fronteras en Microbiología . 14 1281628. doi : 10.3389/fmicb.2023.1281628 . ISSN 1664-302X . PMC 10684969 . PMID 38033561 .
- ↑ Thomas, Courtney M.; Desmond-Le Quéméner, Elie; Gribaldo, Simonetta; Borrel, Guillaume (2022-06-10). "Factores que dan forma a la abundancia y diversidad del arqueoma intestinal en todo el reino animal" . Nature Communications . 13 (1): 3358. Bibcode : 2022NatCo..13.3358T . doi : 10.1038/ s41467-022-31038-4 . ISSN 2041-1723 . PMC 9187648. PMID 35688919 .
- ↑ Lyu, Zhe; Shao, Nana; Akinyemi, Taiwo; Whitman, William B. (julio de 2018). "Metanogénesis" . Current Biology . 28 (13): R727– R732. Bibcode : 2018CBio...28.R727L . doi : 10.1016/j.cub.2018.05.021 . PMID 29990451 .
- ↑ Kvenvolden, K. (1995). "Una revisión de la geoquímica del metano en el hidrato de gas natural". Geoquímica Orgánica . 23 ( 11– 12): 997– 1008. Bibcode : 1995OrGeo..23..997K . doi : 10.1016/0146-6380(96)00002-2 .
- ↑ Milkov, Alexei V (2004). "Estimaciones globales de gas ligado a hidratos en sedimentos marinos: ¿cuánto hay realmente ahí fuera?". Earth-Science Reviews . 66 ( 3– 4): 183– 197. Bibcode : 2004ESRv...66..183M . doi : 10.1016/j.earscirev.2003.11.002 .
- ↑ "Criaturas de cráter: dónde podrían acechar los microbios de Marte" . Space.com . 20 de diciembre de 2005. Consultado el 16 de diciembre de 2014 .
- ↑ "Un rover de la NASA en Marte detecta una nube de gas que sugiere la posibilidad de vida" . The New York Times . 22 de junio de 2019.
- ↑ Thauer, RK y Shima, S. (2006). " Biogeoquímica: Metano y microbios". Nature . 440 (7086): 878– 879. Bibcode : 2006Natur.440..878T . doi : 10.1038/440878a . PMID 16612369. S2CID 4373591 .
- ↑ TL Miller; MJ Wolin (1 de febrero de 1982) . "Enumeración de Methanobrevibacter smithii en heces humanas". Archives of Microbiology . 131 (1): 14– 18. doi : 10.1007/BF00451492 . ISSN 0302-8933 . PMID 7065811. Wikidata Q54521537 .
- ^ Youngblut, Nicolás D.; Reischer, Georg H.; Dauser, Silke; Maisch, Sophie; Walzer, Chris; Stalder, Gabrielle; Farnleitner, Andreas H.; Ley, Ruth E. (26 de octubre de 2021). "La filogenia del huésped vertebrado influye en la diversidad de arqueas intestinales" . Microbiología de la naturaleza . 6 (11): 1443–1454.doi : 10.1038 / s41564-021-00980-2 . ISSN 2058-5276 . PMC 8556154 . PMID 34702978 .
- ↑ Thomas, Courtney M.; Desmond-Le Quéméner, Elie; Gribaldo, Simonetta; Borrel, Guillaume (2022-06-10). "Factores que dan forma a la abundancia y diversidad del arqueoma intestinal en todo el reino animal" . Nature Communications . 13 (1): 3358. Bibcode : 2022NatCo..13.3358T . doi : 10.1038/ s41467-022-31038-4 . ISSN 2041-1723 . PMC 9187648. PMID 35688919 .
- ↑ Gao, Beile; Gupta, Radhey S (2007). "Análisis filogenómico de proteínas distintivas de Archaea y sus principales subgrupos y el origen de la metanogénesis" . BMC Genomics . 8 (1): 86. doi : 10.1186/1471-2164-8-86 . PMC 1852104. PMID 17394648 .
- ↑ Rauch, Benjamin Julius; Gustafson, Andrew; Perona, John J. (diciembre de 2014). "Nuevas proteínas para la biosíntesis de homocisteína en microorganismos anaeróbicos" . Molecular Microbiology . 94 (6): 1330– 1342. doi : 10.1111/mmi.12832 . ISSN 0950-382X . PMID 25315403 .
- ↑ Chen, Sheng-Chung; Weng, Chieh-Yin; Lai, Mei-Chin; Tamaki, Hideyuki; Narihiro, Takashi (octubre de 2019). "Análisis genómicos comparativos revelan genes de trehalosa sintasa como la firma en el género Methanoculleus". Marine Genomics . 47 100673. Bibcode : 2019MarGn..4700673C . doi : 10.1016/j.margen.2019.03.008 . PMID 30935830. S2CID 91188321 .
- ↑ Guan, Yue; Ngugi, David K.; Vinu, Manikandan; Blom, Jochen; Alam, Intikhab; Guillot, Sylvain; Ferry, James G.; Stingl, Ulrich (2019-04-24). "Genómica comparativa del género Methanohalophilus, incluyendo una cepa recientemente aislada de Kebrit Deep en el Mar Rojo" . Frontiers in Microbiology . 10 839. doi : 10.3389/fmicb.2019.00839 . ISSN 1664-302X . PMC 6491703. PMID 31068917 .
- ↑ Borton, Mikayla A.; Daly, Rebecca A.; O'Banion, Bridget; Hoyt, David W.; Marcus, Daniel N.; Welch, Susan; Hastings, Sybille S.; Meulia, Tea; Wolfe, Richard A.; Booker, Anne E.; Sharma, Shikha (diciembre de 2018). "Genómica comparativa y fisiología del género Methanohalophilus, un metanógeno prevalente en esquisto fracturado hidráulicamente" . Microbiología ambiental . 20 (12): 4596– 4611. Bibcode : 2018EnvMi..20.4596B . doi : 10.1111/1462-2920.14467 . ISSN 1462-2912 . PMID 30394652 . S2CID 53220420 .
- ↑ Söllinger, Andrea; Schwab, Clarissa; Weinmaier, Thomas; Loy, Alexander; Tveit, Alexander T.; Schleper, Christa; Urich, Tim (enero de 2016). King, Gary (ed.). "Análisis filogenético y genómico de Methanomassiliicoccales en humedales y tractos intestinales de animales revela preferencias de hábitat específicas del clado" . FEMS Microbiology Ecology . 92 (1) fiv149. doi : 10.1093/femsec/fiv149 . hdl : 10037/8522 . ISSN 1574-6941 . PMID 26613748 .
- ↑ Lyu, Zhe; Lu, Yahai (junio de 2015). "Genómica comparativa de tres cepas de Methanocellales revela nuevas características taxonómicas y metabólicas: Genómica comparativa de tres cepas de Methanocellales". Environmental Microbiology Reports . 7 (3): 526– 537. doi : 10.1111/1758-2229.12283 . PMID 25727385 .
- ↑ Lyu, Zhe; Lu, Yahai (febrero de 2018). "El cambio metabólico a nivel de clase arroja luz sobre la adaptación de los metanógenos a los entornos oxidativos" . The ISME Journal . 12 (2): 411– 423. Bibcode : 2018ISMEJ..12..411L . doi : 10.1038/ismej.2017.173 . ISSN 1751-7362 . PMC 5776455. PMID 29135970 .
- ↑ Borrel, Guillaume; Parisot, Nicolas; Harris, Hugh MB; Peyretaillade, Eric; Gaci, Nadia; Tottey, William; Bardot, Olivier; Raymann, Kasie; Gribaldo, Simonetta; Peyret, Pierre; O'Toole, Paul W (2014). "La genómica comparativa destaca la biología única de Methanomassiliicoccales, un séptimo orden de arqueas metanogénicas relacionadas con Thermoplasmatales que codifica la pirrolisina" . BMC Genomics . 15 (1): 679. doi : 10.1186/1471-2164-15-679 . ISSN 1471-2164 . PMC 4153887. PMID 25124552 .
- ↑ Borrel, Guillaume; O'Toole, Paul W.; Harris, Hugh MB; Peyret, Pierre; Brugère, Jean-François; Gribaldo, Simonetta (octubre de 2013). "Los datos filogenómicos respaldan un séptimo orden de metanógenos metilotróficos y proporcionan información sobre la evolución de la metanogénesis" . Genome Biology and Evolution . 5 (10): 1769– 1780. doi : 10.1093/gbe/evt128 . ISSN 1759-6653 . PMC 3814188. PMID 23985970 .
- 1 2 3 4 5 Blaut, M. (1994). "Metabolismo de los metanógenos". Antonie van Leeuwenhoek . 66 ( 1– 3): 187– 208. doi : 10.1007/bf00871639 . ISSN 0003-6072 . PMID 7747931 . S2CID 23706408 .
- ↑ Dybas, M; Konisky, J (1992). " La transducción de energía en el metanógeno Methanococcus voltae se basa en una corriente de sodio" . J Bacteriol . 174 (17): 5575– 5583. doi : 10.1128/jb.174.17.5575-5583.1992 . PMC 206501. PMID 1324904 .
- ↑ Karrasch, M.; Börner, G.; Enssle, M.; Thauer, RK (1990-12-12). "La molibdoenzima formilmetanofurano deshidrogenasa de Methanosarcina barkeri contiene un cofactor de pterina". European Journal of Biochemistry . 194 (2): 367– 372. doi : 10.1111/j.1432-1033.1990.tb15627.x . ISSN 0014-2956 . PMID 2125267 .
- ↑ Börner, G.; Karrasch, M.; Thauer, RK (1991-09-23). "Molibdopterina adenina dinucleótido y molibdopterina hipoxantina dinucleótido en la formilmetanofurano deshidrogenasa de Methanobacterium thermoautotrophicum (Marburg)" . FEBS Letters . 290 ( 1–2 ): 31–34 . Bibcode : 1991FEBSL.290...31B . doi : 10.1016/0014-5793(91)81218-w . ISSN 0014-5793 . PMID 1915887. S2CID 24174561 .
- ↑ Schmitz, Ruth A.; Albracht, Simon PJ; Thauer, Rudolf K. (1992-11-01). "Una isoenzima de molibdeno y otra de tungsteno de la formilmetanofurano deshidrogenasa en la arquea termófila Methanobacterium wolfei" . European Journal of Biochemistry . 209 (3): 1013– 1018. doi : 10.1111/j.1432-1033.1992.tb17376.x . ISSN 1432-1033 . PMID 1330558 .
- ↑ Zirngibl, C (febrero de 1990). "La N5,N10-metilentetrahidrometanopterina deshidrogenasa de Methanobacterium thermoautotrophicum tiene actividad hidrogenasa" . Laboratorium Fir Mikrobiologie . 261 (1): 112– 116. Bibcode : 1990FEBSL.261..112Z . doi : 10.1016/0014-5793(90)80649-4 .
- ↑ te Brömmelstroet, BW; Geerts, WJ; Keltjens, JT; van der Drift, C.; Vogels, GD (1991-09-20). "Purificación y propiedades de la 5,10-metilentetrahidrometanopterina deshidrogenasa y la 5,10-metilentetrahidrometanopterina reductasa, dos enzimas dependientes de la coenzima F420, de Methanosarcina barkeri". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Estructura de proteínas y enzimología molecular . 1079 (3): 293– 302. doi : 10.1016/0167-4838(91)90072-8 . ISSN 0006-3002 . PMID 1911853 .
- ↑ Kengen, Servé WM; Mosterd, Judith J.; Nelissen, Rob LH; Keltjens, Jan T.; Drift, Chris van der; Vogels, Godfried D. (1988-08-01). "Activación reductiva de la metil-tetrahidrometanopterina: coenzima M metiltransferasa de Methanobacterium thermoautotrophicum cepa ΔH". Archives of Microbiology . 150 (4): 405– 412. Bibcode : 1988ArMic.150..405K . doi : 10.1007/BF00408315 . ISSN 0302-8933 . S2CID 36366503 .
- ↑ Bobik, TA; Olson, KD; Noll, KM; Wolfe, RS (1987-12-16). "Evidencia de que el heterodisulfuro de la coenzima M y el fosfato de 7-mercaptoheptanoiltreonina es un producto de la reacción de la metilreductasa en Methanobacterium". Biochemical and Biophysical Research Communications . 149 (2): 455– 460. Bibcode : 1987BBRC..149..455B . doi : 10.1016/0006-291x(87)90389-5 . ISSN 0006-291X . PMID 3122735 .
- ↑ Ellermann, J.; Hedderich, R.; Böcher, R.; Thauer, RK (1988-03-15). "El paso final en la formación de metano. Investigaciones con metil-CoM reductasa altamente purificada (componente C) de Methanobacterium thermoautotrophicum (cepa Marburg)" . European Journal of Biochemistry . 172 (3): 669– 677. doi : 10.1111/j.1432-1033.1988.tb13941.x . ISSN 0014-2956 . PMID 3350018 .
- ↑ Appels, Lise; et al. (2008). "Principios y potencial de la digestión anaeróbica de lodos activados residuales". Progress in Energy and Combustion Science. 34 (6): 755–781. doi: 10.1016/j.pecs.2008.06.002
- ↑ Christensen, Thomas H; et al. (2010). "Digestión anaeróbica: Proceso". Solid Waste Technology & Management, Volumen 1 y 2. doi: 10.1002/9780470666883.ch372
- ↑ Shah, Fayyaz Ali, et al. (2014). "Ecología microbiana de los digestores anaeróbicos: los actores clave de la anaerobiosis". ScientificWorldJournal. 3852369 (1). doi:10.1155/2014/183752
- ↑ Lettinga, G (1995). "Sistemas de digestión anaeróbica y tratamiento de aguas residuales". Antonie van Leeuwenhoek . 67 (1): 3– 28. doi : 10.1007/bf00872193 . PMID 7741528 . S2CID 9415571 .
- 1 2 Tabatabaei, Meisa; et al. (2010). "Importancia de las poblaciones de arqueas metanogénicas en los tratamientos anaeróbicos de aguas residuales" (PDF) . Process Biochemistry . 45 (8): 1214– 1225. doi : 10.1016/j.procbio.2010.05.017 .
- ↑ Marihiro, Takashi., Sekiguchi, Yuji. (2007). "Comunidades microbianas en procesos de digestión anaeróbica para el tratamiento de residuos y aguas residuales: una actualización microbiológica". Current Opinion in Biotechnology. 18 (3): 273–278. doi: 10.1016/j.copbio.2007.04.003
- ↑ "Tratamiento anaeróbico avanzado de aguas residuales en un futuro próximo". Water Science and Technology . 35 (10). 1997. doi : 10.1016/S0273-1223(97)00222-9 .
- ↑ Woese, Carl R.; Fox, George E. (noviembre de 1977). "Estructura filogenética del dominio procariota: los reinos primarios" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 74 (11): 5088– 5090. Bibcode : 1977PNAS...74.5088W . doi : 10.1073/pnas.74.11.5088 . PMC 432104. PMID 270744 .
- ↑ Evans, Paul N.; Parks, Donovan H.; Chadwick, Grayson L.; Robbins, Steven J.; Orphan, Victoria J.; Golding, Suzanne D.; Tyson, Gene W. (23 de octubre de 2015). "Metabolismo del metano en el filo arqueal Bathyarchaeota revelado por metagenómica centrada en el genoma" . Science . 350 (6259): 434– 438. Bibcode : 2015Sci...350..434E . doi : 10.1126/science.aac7745 . ISSN 0036-8075 . PMID 26494757 .
- ^ Qi, Yan-Ling; Evans, Paul N.; Li, Yu-Xian; Rao, Yang-Zhi; Qu, Yan-Ni; Bronceado, Sha; Jiao, Jian-Yu; Chen, Ya-Ting; Hedlund, Brian P.; Shu, Wen-Sheng; Hua, Zheng-Shuang; Li, Wen-Jun (31 de agosto de 2021). "La genómica comparada revela adaptación térmica y una alta diversidad metabólica en Candidatus Bathyarchaeia" . mSistemas . 6 (4): e0025221. doi : 10.1128/msystems.00252-21 . ISSN 2379-5077 . PMC 8407382 . PMID 34282939 .
- ↑ Khomyakova, Maria A.; Merkel, Alexander Y.; Mamiy, Dana D.; Klyukina, Alexandra A.; Slobodkin, Alexander I. (22 de agosto de 2023). "Caracterización fenotípica y genómica de Bathyarchaeum tardum gen. nov., sp. nov., un representante cultivado de la clase arqueal Bathyarchaeia" . Frontiers in Microbiology . 14 1214631. doi : 10.3389/fmicb.2023.1214631 . ISSN 1664-302X . PMC 10477458. PMID 37675420 .
- ↑ Zhou, Zhichao; Pan, Jie; Wang, Fengping; Gu, Ji-Dong; Li, Meng (2018-09-01). "Bathyarchaeota: generalistas metabólicos distribuidos globalmente en ambientes anóxicos" . FEMS Microbiology Reviews . 42 (5): 639– 655. doi : 10.1093/femsre/fuy023 . ISSN 1574-6976 . PMID 29790926 .
- ↑ Yu, Tiantian; Wu, Weichao; Liang, Wenyue; Lever, Mark Alexander; Hinrichs, Kai-Uwe; Wang, Fengping (2018-06-05). "Crecimiento de Bathyarchaeota sedimentaria en lignina como fuente de energía" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 115 (23 ) : 6022– 6027. Bibcode : 2018PNAS..115.6022Y . doi : 10.1073/pnas.1718854115 . ISSN 0027-8424 . PMC 6003339. PMID 29773709 .
- ↑ Yu, Tiantian; Hu, Haining; Zeng, Xianhong; Wang, Yinzhao; Pan, Donald; Deng, Longhui; Liang, Lewen; Hou, Jialin; Wang, Fengping (septiembre de 2023). "Bathyarchaeia ampliamente distribuida codifica una nueva metiltransferasa que utiliza compuestos aromáticos derivados de la lignina" . mLife . 2 ( 3): 272– 282. doi : 10.1002/mlf2.12082 . ISSN 2097-1699 . PMC 10989822. PMID 38817817 .
- ^ Pablo, Cristina; Nonoh, James O.; Mikulski, Lena; Brune, Andreas (diciembre de 2012). ""Methanoplasmatales," Thermoplasmatales-Related Archaea in Termite Guts and Other Environments, Are the Seventh Order of Methanogens" . Applied and Environmental Microbiology . 78 (23): 8245– 8253. Bibcode : 2012ApEnM..78.8245P . doi : 10.1128/aem.02193-12 . ISSN 0099-2240 . PMC 3497382 . PMID 23001661 .
- ↑ Dridi, Bédis; Fardeau, Marie-Laure; Ollivier, Bernard; Raoult, Didier; Drancourt, Michel (2012-08-01). "Methanomassiliicoccus luminyensis gen. nov., sp. nov., una arquea metanogénica aislada de heces humanas" . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 62 (Pt_8): 1902–1907 . doi : 10.1099/ijs.0.033712-0 . ISSN 1466-5026 . PMID 22859731 .
- ↑ Iino, Takao; Tamaki, Hideyuki; Tamazawa, Satoshi; Ueno, Yoshiyuki; Ohkuma, Moriya; Suzuki, Ken-ichiro; Igarashi, Yasuo; Haruta, Shin (2013). "Candidatus Methanogranum caenicola: un nuevo metanógeno del lodo digerido anaeróbico y propuesta de Methanomassiliicoccaceae fam. nov. y Methanomassiliicoccales ord. nov., para un linaje metanogénico de la clase Thermoplasmata" . Microbes and Environments . 28 (2): 244– 250. doi : 10.1264/jsme2.ME12189 . PMC 4070666. PMID 23524372 .
- ↑ Sorokin, Dimitry Y.; Merkel, Alexander Y.; Abbas, Ben; Makarova, Kira S.; Rijpstra, W. Irene C.; Koenen, M.; Sinninghe Damsté, Jaap S.; Galinski, Erwin A.; Koonin, Eugene V.; van Loosdrecht, Mark CM (2018-07-01). "Methanonatronarchaeum thermophilum gen. nov., sp. nov. y 'Candidatus Methanohalarchaeum thermophilum', metanógenos reductores de metilo extremadamente halo(natronofílicos) de lagos hipersalinos que comprenden una nueva clase de euryarchaeales Methanonatronarchaeia classis nov." . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 68 (7): 2199– 2208. doi : 10.1099/ijsem.0.002810 . ISSN 1466-5026 . PMC 6978985 . PMID 29781801 .
- ↑ Sorokin, Dimitry Y.; Makarova, Kira S.; Abbas, Ben; Ferrer, Manuel; Golyshin, Peter N.; Galinski, Erwin A.; Ciordia, Sergio; Mena, María Carmen; Merkel, Alexander Y.; Wolf, Yuri I.; van Loosdrecht, Mark CM; Koonin, Eugene V. (2017-05-30). "El descubrimiento de euriarqueas extremadamente halófilas y reductoras de metilo proporciona información sobre el origen evolutivo de la metanogénesis" . Nature Microbiology . 2 (8): 17081. doi : 10.1038/nmicrobiol.2017.81 . PMC 5494993. PMID 28555626 .
- ↑ Sorokin, Dimitry Y.; Merkel, Alexander Y.; Abbas, Ben (noviembre de 2022). "Ecología de Methanonatronarchaeia" . Microbiología ambiental . 24 (11 ) : 5217– 5229. Bibcode : 2022EnvMi..24.5217S . doi : 10.1111/1462-2920.16108 . ISSN 1462-2912 . PMC 9796771. PMID 35726892 .
- ↑ Steiniger, Fabian; Sorokin, Dimitry Y.; Deppenmeier, Uwe (enero de 2022). "Proceso de conservación de energía en el metanógeno reductor de metilo extremadamente haloalcalifílico Methanonatronarchaeum thermophilum" . The FEBS Journal . 289 (2): 549– 563. doi : 10.1111/febs.16165 . PMID 34435454 .
- ↑ Mei, Ran; Kaneko, Masanori; Imachi, Hiroyuki; Nobu, Masaru K (2023-02-03). Ma, Li-Jun (ed.). " El origen y la evolución de la metanogénesis y las arqueas están entrelazados" . PNAS Nexus . 2 (2) pgad023. doi : 10.1093/pnasnexus/pgad023 . ISSN 2752-6542 . PMC 9982363. PMID 36874274 .
- ↑ Oren, Aharon; Arahal, David R.; Göker, Markus; Moore, Edward RB; Rossello-Mora, Ramon; Sutcliffe, Iain C. (2023-05-01). "Código Internacional de Nomenclatura de Procariotas. Código Procariota (Revisión 2022)" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 73 (5a). doi : 10.1099/ijsem.0.005585 . hdl : 10261/338243 . ISSN 1466-5026 . PMID 37219928 .
- ↑ "Filo: Methanobacteriota" . lpsn.dsmz.de. Consultado el 16 de julio de 2024 .
- ↑ Göker, Markus; Oren, Aharon (22 de enero de 2024). "Publicación válida de nombres de dos dominios y siete reinos de procariotas" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 74 (1). doi : 10.1099/ijsem.0.006242 . PMID 38252124 .
- ↑ "Instituto Leibniz DSMZ: Bienvenido al Instituto Leibniz DSMZ" . www.dsmz.de. Consultado el 16 de julio de 2024 .
- Digestión anaeróbica
- Metano
- Biología de las arqueas
- Microbiología ambiental