Marcador genético

Un marcador genético es un gen o secuencia de ADN con una ubicación conocida en un cromosoma que se puede utilizar para identificar individuos o especies . Se puede describir como una variación (que puede surgir debido a una mutación o alteración en los loci genómicos) que se puede observar. Un marcador genético puede ser una secuencia de ADN corta, como una secuencia que rodea un cambio de un solo par de bases ( polimorfismo de un solo nucleótido , SNP), o una larga, como los minisatélites .

Durante muchos años, el mapeo genético se limitó a identificar organismos mediante marcadores fenotípicos tradicionales. Esto incluía genes que codificaban características fácilmente observables, como los grupos sanguíneos o la forma de las semillas. La escasez de este tipo de características en varios organismos limitó los esfuerzos de mapeo posibles. Esto impulsó el desarrollo de marcadores genéticos, que permiten identificar características genéticas que no son fácilmente observables en los organismos (como la variación de proteínas). ^{[ 1 ]}

Algunos tipos de marcadores genéticos de uso común son:

• RFLP (o polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción )
• SSLP (o polimorfismo de longitud de secuencia simple )
• AFLP (o polimorfismo de longitud de fragmentos amplificados )
• AAD (o ADN amplificado arbitrariamente )
• RAPD (o amplificación aleatoria de ADN polimórfico )
• DAF (o huella genética por amplificación de ADN )
• AP-PCR (o PCR con cebadores arbitrarios )
• VNTR (o repetición en tándem de número variable )
• SSCP (o polimorfismo de conformación de cadena simple )
• Polimorfismo de microsatélites SSR (o repetición de secuencia simple ) ^{[ 2 ]}
• SNP (o polimorfismo de un solo nucleótido )
• STR (o repetición corta en tándem )
• SFP (o polimorfismo de característica única)
• DArT (o Tecnología de Matrices de Diversidad )
• Marcadores RAD (o marcadores de ADN asociados a sitios de restricción )
• STS (utilizando sitios marcados con secuencias ) ^{[ 2 ]}

Los marcadores genéticos moleculares se pueden dividir en dos clases: a) marcadores bioquímicos, que detectan variaciones a nivel del producto génico, como cambios en proteínas y aminoácidos, y b) marcadores moleculares, que detectan variaciones a nivel del ADN, como cambios de nucleótidos: deleción, duplicación, inversión y/o inserción. Los marcadores pueden presentar dos modos de herencia: dominante/recesivo o codominante. Si el patrón genético de los homocigotos se puede distinguir del de los heterocigotos, se dice que un marcador es codominante. Generalmente, los marcadores codominantes son más informativos que los marcadores dominantes. ^{[ 3 ]}

Los marcadores genéticos pueden utilizarse para estudiar la relación entre una enfermedad hereditaria y su causa genética (por ejemplo, una mutación específica de un gen que produce una proteína defectuosa ). Se sabe que los fragmentos de ADN cercanos entre sí en un cromosoma tienden a heredarse juntos. Esta propiedad permite el uso de un marcador, que a su vez puede utilizarse para determinar el patrón de herencia preciso del gen que aún no se ha localizado con exactitud.

Los marcadores genéticos se emplean en las pruebas de ADN genealógico para determinar la distancia genética entre individuos o poblaciones. Los marcadores uniparentales (en el ADN mitocondrial o del cromosoma Y ) se estudian para evaluar los linajes maternos o paternos . Los marcadores autosómicos se utilizan para determinar la ascendencia en general.

Los marcadores genéticos deben ser fácilmente identificables, estar asociados a un locus específico y ser altamente polimórficos , ya que los homocigotos no aportan información. La detección del marcador puede ser directa mediante secuenciación de ARN o indirecta mediante el uso de aloenzimas .

Algunos de los métodos utilizados para estudiar el genoma o la filogenia son RFLP, AFLP, RAPD y SSR. Estos métodos permiten crear mapas genéticos de cualquier organismo que se esté estudiando.

Se debatió sobre cuál era el agente transmisible del CTVT ( tumor venéreo transmisible canino ). Muchos investigadores plantearon la hipótesis de que partículas similares a virus eran responsables de la transformación celular, mientras que otros pensaban que la propia célula podía infectar a otros caninos como un aloinjerto . Con la ayuda de marcadores genéticos, los investigadores pudieron aportar pruebas concluyentes de que la célula tumoral cancerosa evolucionó hasta convertirse en un parásito transmisible. Además, se utilizaron marcadores genéticos moleculares para dilucidar la cuestión de la transmisión natural, la raza de origen ( filogenética ) y la edad del tumor canino. ^{[ 4 ]}

Los marcadores genéticos también se han utilizado para medir la respuesta genómica a la selección en el ganado. La selección natural y artificial produce un cambio en la composición genética de la célula. La presencia de diferentes alelos debido a una segregación distorsionada en los marcadores genéticos es indicativa de la diferencia entre el ganado seleccionado y el no seleccionado. ^{[ 5 ]}

• Gen marcador
• Marcador molecular
• Marcaje de ADN
• Estructura fina del cromosoma eucariota
• Secuencia repetida (ADN)

• de Vicente C, Fulton T (2004). Módulos de aprendizaje de marcadores moleculares – Vols. 1 y 2. IPGRI, Roma, Italia e Instituto para la Diversidad Genética, Ithaca, Nueva York, EE. UU.
• de Vicente C, Glaszmann JC (2006). Marcadores moleculares para la minería de alelos . AMS (Oficina Regional de Bioversity para las Américas), CIRAD, GCP, IPGRI, Fundación de Investigación MS Swaminathan. pág.  85. Archivado del original el 4 de diciembre de 2007. Recuperado el 12 de diciembre de 2007 .
• Spooner D, van Treuren R, de Vicente MC (2005). Marcadores moleculares para la gestión de bancos de genes . CGN, IPGRI, USDA. pág.  126. Archivado del original el 3 de mayo de 2008. Recuperado el 12 de diciembre de 2007 .

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