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Virología

Fago gamma , un ejemplo de partículas virales (visualizadas mediante microscopía electrónica). La virología es el estudio científico de los virus biológicos . Es una subdiscipli...

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Fago gamma , un ejemplo de partículas virales (visualizadas mediante microscopía electrónica).

La virología es el estudio científico de los virus biológicos . Es una subdisciplina de la microbiología que se centra en su detección, estructura, clasificación y evolución, sus métodos de infección y explotación de las células huésped para su reproducción, su interacción con la fisiología y la inmunidad del organismo huésped, las enfermedades que provocan, las técnicas para aislarlos y cultivarlos, y su uso en la investigación y la terapia.

La identificación del agente causal de la enfermedad del mosaico del tabaco (TMV) como un nuevo patógeno por Martinus Beijerinck (1898) se reconoce hoy como el inicio oficial de la virología como disciplina distinta de la bacteriología . Beijerinck comprendió que la causa no era una infección bacteriana ni fúngica , sino algo completamente diferente. Empleó el término «virus» para describir al misterioso agente en su « contagium vivum fluidum » («fluido vivo contagioso»). Rosalind Franklin propuso la estructura completa del virus del mosaico del tabaco en 1955.

Una de las principales motivaciones para el estudio de los virus es que causan muchas enfermedades infecciosas en plantas y animales. [ 1 ] El estudio de la manera en que los virus causan enfermedades se denomina patogénesis viral . El grado en que un virus causa una enfermedad se denomina virulencia . [ 2 ] Estos campos de estudio se denominan virología vegetal , virología animal y virología humana o médica . [ 3 ]

La virología surgió cuando no existían métodos para propagar o visualizar virus ni pruebas de laboratorio específicas para detectar infecciones virales. Los métodos para separar los ácidos nucleicos virales ( ARN y ADN ) y las proteínas , que ahora constituyen la base de la virología, no existían. Actualmente, existen numerosos métodos para observar la estructura y las funciones de los virus y sus componentes. Se conocen miles de virus diferentes y los virólogos suelen especializarse en los virus que infectan a las plantas, a las bacterias y otros microorganismos , o a los animales. Los virus que infectan a los humanos son estudiados por virólogos médicos. La virología es una disciplina amplia que abarca la biología, la salud, el bienestar animal, la agricultura y la ecología.

Historia

Un anciano con gafas, vestido con traje, está sentado en un banco junto a una gran ventana. El banco está cubierto de pequeños frascos y tubos de ensayo. En la pared detrás de él hay un gran reloj antiguo, debajo del cual se encuentran cuatro pequeños estantes cerrados repletos de frascos cuidadosamente etiquetados.
Martinus Beijerinck en su laboratorio en 1921

Louis Pasteur no pudo encontrar un agente causal de la rabia y especuló sobre un patógeno demasiado pequeño para ser detectado por microscopios. [ 4 ] En 1884, el microbiólogo francés Charles Chamberland inventó el filtro de Chamberland (o filtro Pasteur-Chamberland) con poros lo suficientemente pequeños como para eliminar todas las bacterias de una solución que pasara a través de él. [ 5 ] En 1892, el biólogo ruso Dmitri Ivanovsky utilizó este filtro para estudiar lo que ahora se conoce como el virus del mosaico del tabaco : los extractos de hojas trituradas de plantas de tabaco infectadas permanecieron infecciosos incluso después de la filtración para eliminar las bacterias. Ivanovsky sugirió que la infección podría ser causada por una toxina producida por bacterias, pero no profundizó en la idea. [ 6 ] En ese momento se pensaba que todos los agentes infecciosos podían ser retenidos por los filtros y cultivados en un medio nutritivo; esto formaba parte de la teoría microbiana de las enfermedades . [ 7 ]

En 1898, el microbiólogo holandés Martinus Beijerinck repitió los experimentos y se convenció de que la solución filtrada contenía una nueva forma de agente infeccioso. [ 8 ] Observó que el agente se multiplicaba solo en células que se estaban dividiendo, pero como sus experimentos no demostraron que estuviera compuesto de partículas, lo denominó contagium vivum fluidum (germen vivo soluble) y reintrodujo la palabra virus . Beijerinck sostenía que los virus eran líquidos por naturaleza, una teoría que más tarde fue desacreditada por Wendell Stanley , quien demostró que eran particulados. [ 6 ] Ese mismo año, Friedrich Loeffler y Paul Frosch hicieron pasar el primer virus animal, el aftovirus (el agente de la fiebre aftosa ), a través de un filtro similar. [ 9 ]

A principios del siglo XX, el bacteriólogo inglés Frederick Twort descubrió un grupo de virus que infectan bacterias, ahora llamados bacteriófagos (o comúnmente 'fagos'), en 1915. [ 10 ] [ 11 ] El microbiólogo franco-canadiense Félix d'Herelle anunció su descubrimiento independiente de bacteriófagos en 1917. D'Herelle describió virus que, al agregarse a bacterias en una placa de agar , producirían áreas de bacterias muertas. Diluyó con precisión una suspensión de estos virus y descubrió que las diluciones más altas (concentraciones virales más bajas), en lugar de matar todas las bacterias, formaban áreas discretas de organismos muertos. Contando estas áreas y multiplicándolas por el factor de dilución, pudo calcular el número de virus en la suspensión original. [ 12 ] Los fagos fueron aclamados como un tratamiento potencial para enfermedades como la fiebre tifoidea y el cólera , pero su promesa se olvidó con el desarrollo de la penicilina . El desarrollo de resistencia bacteriana a los antibióticos ha renovado el interés en el uso terapéutico de bacteriófagos. [ 13 ]

A finales del siglo XIX, los virus se definían en función de su infectividad , su capacidad para atravesar filtros y su necesidad de huéspedes vivos. Hasta entonces, los virus solo se habían cultivado en plantas y animales. En 1906, Ross Granville Harrison inventó un método para cultivar tejido en linfa , y en 1913, E.  Steinhardt, C.  Israeli y R. A. Lambert utilizaron este método para cultivar el virus vaccinia en fragmentos de tejido corneal de cobaya. [ 14 ] En 1928, H. B. Maitland y M. C. Maitland cultivaron el virus vaccinia en suspensiones de riñones de gallina picados. Su método no se adoptó ampliamente hasta la década de 1950, cuando el poliovirus se cultivó a gran escala para la producción de vacunas. [ 15 ]

Otro avance se produjo en 1931 cuando el patólogo estadounidense Ernest William Goodpasture y Alice Miles Woodruff cultivaron el virus de la influenza y otros virus en huevos de gallina fertilizados. [ 16 ] En 1949, John Franklin Enders , Thomas Weller y Frederick Robbins cultivaron el poliovirus en células cultivadas a partir de tejido embrionario humano abortado, [ 17 ] el primer virus cultivado sin utilizar tejido animal sólido ni huevos. Este trabajo permitió a Hilary Koprowski , y luego a Jonas Salk , crear una vacuna eficaz contra la polio . [ 18 ]

Las primeras imágenes de virus se obtuvieron con la invención de la microscopía electrónica en 1931 por los ingenieros alemanes Ernst Ruska y Max Knoll . [ 19 ] En 1935, el bioquímico y virólogo estadounidense Wendell Meredith Stanley examinó el virus del mosaico del tabaco y descubrió que estaba compuesto principalmente de proteínas. [ 20 ] Poco tiempo después, este virus se separó en partes de proteínas y ARN. [ 21 ] El virus del mosaico del tabaco fue el primero en ser cristalizado y, por lo tanto, su estructura pudo ser dilucidada en detalle. Las primeras imágenes de difracción de rayos X del virus cristalizado fueron obtenidas por Bernal y Fankuchen en 1941. Basándose en sus imágenes cristalográficas de rayos X, Rosalind Franklin descubrió la estructura completa del virus en 1955. [ 22 ] Ese mismo año, Heinz Fraenkel-Conrat y Robley Williams demostraron que el ARN purificado del virus del mosaico del tabaco y su cubierta proteica pueden ensamblarse por sí mismos para formar virus funcionales, lo que sugiere que este sencillo mecanismo fue probablemente el medio por el cual los virus se crearon dentro de sus células huésped. [ 23 ]

La segunda mitad del siglo XX fue la edad de oro del descubrimiento de virus, y la mayoría de las especies documentadas de virus animales, vegetales y bacterianos se descubrieron durante estos años. [ 24 ] En 1946, se describió por primera vez la diarrea viral bovina (un pestivirus ). En 1957 se descubrió el arterivirus equino . En 1963, Baruch Blumberg descubrió el virus de la hepatitis B. [ 25 ] En 1965, Howard Temin describió el primer retrovirus . La transcriptasa inversa , la enzima que los retrovirus utilizan para hacer copias de ADN de su ARN, fue descrita por primera vez en 1970 por Temin y David Baltimore de forma independiente. [ 26 ] En 1983 , el equipo de Luc Montagnier en el Instituto Pasteur de Francia, aisló por primera vez el retrovirus ahora llamado VIH. [ 27 ] En 1989, el equipo de Michael Houghton en Chiron Corporation descubrió la hepatitis C. [ 28 ] [ 29 ]

Detección de virus

Un microscopio electrónico

Existen varios métodos para detectar virus; entre ellos se incluyen la detección de partículas virales (viriones), sus antígenos o ácidos nucleicos, y los ensayos de infectividad.

Microscopía electrónica

Micrografías electrónicas de virus. A, rotavirus; B, adenovirus; C, norovirus; y D, astrovirus.

Los virus se observaron por primera vez en la década de 1930, con la invención de los microscopios electrónicos . A diferencia de los microscopios ópticos , que observan con luz visible , estos microscopios utilizan haces de electrones , cuya longitud de onda es mucho menor y permiten detectar objetos que no se pueden ver con microscopios ópticos. El mayor aumento que se puede obtener con microscopios electrónicos es de hasta 10 000 000 de veces [ 30 ] , mientras que con microscopios ópticos ronda las 1500 veces [ 31 ] .

Los virólogos suelen utilizar la tinción negativa para visualizar los virus. En este procedimiento, los virus se suspenden en una solución de sales metálicas, como el acetato de uranio. Los átomos de metal son opacos a los electrones y los virus se observan suspendidos en un fondo oscuro de átomos metálicos. [ 30 ] Esta técnica se utiliza desde la década de 1950. [ 32 ] Muchos virus se descubrieron mediante esta técnica y la microscopía electrónica de tinción negativa sigue siendo una herramienta valiosa en el arsenal de un virólogo. [ 33 ]

La microscopía electrónica tradicional tiene desventajas, ya que los virus se dañan al secarse en el alto vacío dentro del microscopio electrónico y el propio haz de electrones es destructivo. [ 30 ] En la microscopía electrónica criogénica, la estructura de los virus se preserva al incrustarlos en un entorno de agua vítrea . [ 34 ] Esto permite la determinación de estructuras biomoleculares con resolución casi atómica, [ 35 ] y ha atraído gran atención hacia este enfoque como una alternativa a la cristalografía de rayos X o la espectroscopia de RMN para la determinación de la estructura de los virus. [ 36 ]

Micrografía crioelectrónica de un rotavirus

Crecimiento en las culturas

Los virus son parásitos intracelulares obligados y, dado que solo se reproducen dentro de las células vivas de un huésped, estas células son necesarias para cultivarlos en el laboratorio. Para los virus que infectan animales (generalmente llamados "virus animales"), se utilizan células cultivadas en laboratorio . Antiguamente, se utilizaban huevos fértiles de gallina y los virus se cultivaban en las membranas que rodean al embrión. Este método todavía se utiliza en la fabricación de algunas vacunas. Para los virus que infectan bacterias, los bacteriófagos , se pueden utilizar directamente las bacterias que crecen en tubos de ensayo. Para los virus de plantas, se pueden utilizar las plantas huésped naturales o, especialmente cuando la infección no es evidente, las llamadas plantas indicadoras, que muestran signos de infección más claramente. [ 37 ] [ 38 ]

Efecto citopático del virus del herpes simple. Las células infectadas se han vuelto redondas y con aspecto de globo.

Los virus que se han desarrollado en cultivos celulares pueden detectarse indirectamente por el efecto perjudicial que tienen sobre la célula huésped. Estos efectos citopáticos suelen ser característicos del tipo de virus. Por ejemplo, los virus del herpes simple producen una característica "inflamación" de las células, típicamente fibroblastos humanos . Algunos virus, como el virus de las paperas, hacen que los glóbulos rojos de las gallinas se adhieran firmemente a las células infectadas. Esto se denomina "hemadsorción". Algunos virus producen "lesiones" localizadas en las capas celulares llamadas placas , que son útiles en ensayos de cuantificación y en la identificación de la especie de virus mediante ensayos de reducción de placas . [ 39 ] [ 40 ]

Los virus que crecen en cultivos celulares se utilizan para medir su susceptibilidad a fármacos antivirales validados y novedosos . [ 41 ]

Serología

Los virus son antígenos que inducen la producción de anticuerpos . Estos anticuerpos se pueden utilizar en laboratorios para estudiar los virus. Los virus relacionados suelen reaccionar con los anticuerpos de otros virus, y algunos virus se nombran según los anticuerpos con los que reaccionan. El uso de los anticuerpos, que antes se obtenían exclusivamente del suero (fluido sanguíneo) de los animales, se denomina serología . [ 42 ] Una vez que se ha producido una reacción de anticuerpos en una prueba, se necesitan otros métodos para confirmarla. Los métodos más antiguos incluían pruebas de fijación del complemento , [ 43 ] inhibición de la hemaglutinación y neutralización viral . [ 44 ] Los métodos más recientes utilizan inmunoensayos enzimáticos (EIA). [ 45 ]

En los años previos a la invención de la PCR , se utilizaba la inmunofluorescencia para confirmar rápidamente las infecciones virales. Se trata de un ensayo de infectividad específico para cada especie viral, ya que se emplean anticuerpos. Estos anticuerpos están marcados con un colorante luminiscente y, al utilizar un microscopio óptico con una fuente de luz modificada, las células infectadas brillan en la oscuridad. [ 46 ]

Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y otros métodos de detección de ácidos nucleicos

La PCR es un método fundamental para detectar virus en todas las especies, incluidas plantas y animales. Funciona detectando trazas de ARN o ADN específicos del virus. Es muy sensible y específica, pero puede verse fácilmente comprometida por la contaminación. La mayoría de las pruebas utilizadas en virología veterinaria y virología médica se basan en la PCR o métodos similares, como la amplificación mediada por transcripción . Cuando surge un virus nuevo, como el coronavirus de la COVID-19, se puede diseñar rápidamente una prueba específica siempre que se haya secuenciado el genoma viral y se hayan identificado regiones únicas del ADN o ARN viral. [ 47 ] La invención de las pruebas microfluídicas ha permitido automatizar la mayoría de estas pruebas. [ 48 ] A pesar de su especificidad y sensibilidad, la PCR tiene la desventaja de que no diferencia entre virus infecciosos y no infecciosos, y las "pruebas de curación" deben retrasarse hasta 21 días para permitir que el ácido nucleico viral residual se elimine del sitio de la infección. [ 49 ]

Pruebas de diagnóstico

En los laboratorios, muchas de las pruebas de diagnóstico para detectar virus son métodos de amplificación de ácidos nucleicos, como la PCR. Algunas pruebas detectan los virus o sus componentes, como la microscopía electrónica y los inmunoensayos enzimáticos . Los dispositivos de autodiagnóstico o pruebas caseras suelen ser pruebas de flujo lateral , que detectan el virus mediante un anticuerpo monoclonal marcado . [ 50 ] Estos también se utilizan en agricultura, alimentación y ciencias ambientales. [ 51 ]

Cuantificación y cargas virales

El recuento de virus (cuantificación) siempre ha desempeñado un papel importante en la virología y se ha convertido en un elemento central para el control de algunas infecciones humanas en las que se mide la carga viral . [ 52 ] Existen dos métodos básicos: los que cuentan las partículas virales totalmente infecciosas, denominados ensayos de infectividad, y los que cuentan todas las partículas, incluidas las defectuosas. [ 30 ]

Ensayos de infectividad

Las placas en las células fueron causadas por el virus del herpes simple. Las células fueron fijadas y teñidas de azul.

Los ensayos de infectividad miden la cantidad (concentración) de virus infecciosos en una muestra de volumen conocido. [ 53 ] Para las células huésped, se utilizan plantas o cultivos de células bacterianas o animales. También se han utilizado animales de laboratorio como ratones, particularmente en virología veterinaria. [ 54 ] Estos ensayos son cuantitativos, donde los resultados están en una escala continua, o cuánticos, donde un evento ocurre o no ocurre. Los ensayos cuantitativos dan valores absolutos y los ensayos cuánticos dan una probabilidad estadística, como el volumen de la muestra de prueba necesario para asegurar que el 50% de las células huésped, plantas o animales estén infectados. Esto se llama dosis infecciosa mediana o ID 50. [ 55 ] Los bacteriófagos infecciosos se pueden contar sembrándolos en "céspedes" de bacterias en placas de cultivo. Cuando están a bajas concentraciones, los virus forman agujeros en el césped que se pueden contar. El número de virus se expresa entonces como unidades formadoras de placa . Para los bacteriófagos que se reproducen en bacterias que no pueden cultivarse en cultivos, se utilizan ensayos de carga viral. [ 56 ]

Inmunofluorescencia: Células infectadas por rotavirus (arriba) y células no infectadas (abajo).

El ensayo de formación de focos (FFA, por sus siglas en inglés) es una variante del ensayo de placa, pero en lugar de basarse en la lisis celular para detectar la formación de placa, el FFA emplea técnicas de inmunotinción con anticuerpos marcados con fluorescencia específicos para un antígeno viral , con el fin de detectar células huésped infectadas y partículas virales infecciosas antes de que se forme una placa. El FFA es particularmente útil para cuantificar clases de virus que no lisan las membranas celulares, ya que estos virus no serían detectables mediante el ensayo de placa. Al igual que en el ensayo de placa, se infectan monocapas de células huésped con diversas diluciones de la muestra viral y se incuban durante un período relativamente breve (p. ej., de 24 a 72 horas) bajo un medio de cultivo semisólido que restringe la propagación del virus infeccioso, creando cúmulos localizados (focos) de células infectadas. Posteriormente, las placas se analizan con anticuerpos marcados con fluorescencia contra un antígeno viral, y se utiliza microscopía de fluorescencia para contar y cuantificar el número de focos. El método FFA generalmente produce resultados en menos tiempo que los ensayos de placa o de dosis infecciosa en cultivo tisular al 50% (TCID50 ) , pero puede ser más costoso en términos de reactivos y equipos necesarios. El tiempo de finalización del ensayo también depende del tamaño del área que el usuario está contando. Un área más grande requerirá más tiempo, pero puede proporcionar una representación más precisa de la muestra. Los resultados del FFA se expresan en unidades formadoras de focos por mililitro, o FFU/mL. [ 57 ]

Ensayos de carga viral

Cuando se realiza un ensayo para medir la partícula viral infecciosa (ensayo de placa, ensayo de foco), el título viral a menudo se refiere a la concentración de partículas virales infecciosas, que es diferente del total de partículas virales. Los ensayos de carga viral generalmente cuentan el número de genomas virales presentes en lugar del número de partículas y utilizan métodos similares a la PCR . [ 58 ] Las pruebas de carga viral son importantes en el control de las infecciones por VIH. [ 59 ] Este método versátil puede utilizarse para virus de plantas. [ 60 ] [ 61 ]

Biología molecular

La virología molecular estudia los virus a nivel de ácidos nucleicos y proteínas. Los métodos desarrollados por los biólogos moleculares han demostrado ser muy útiles en virología. Su pequeño tamaño y estructura relativamente simple hacen de los virus candidatos ideales para el estudio mediante estas técnicas.

Purificación de virus y sus componentes

Solución de cloruro de cesio (CsCl) y dos tipos morfológicos de rotavirus . Tras la centrifugación a 100 000  g, se forma un gradiente de densidad en la solución de CsCl y las partículas virales se separan según su densidad. El tubo tiene 10  cm de altura. Los virus son las dos zonas "lechosas" muy próximas entre sí. [ 62 ]

Para un estudio más profundo, los virus cultivados en laboratorio necesitan purificarse para eliminar los contaminantes de las células huésped. Los métodos empleados suelen tener la ventaja de concentrar los virus, lo que facilita su investigación.

Centrifugación

Las centrífugas se utilizan a menudo para purificar virus. Las centrífugas de baja velocidad, es decir, aquellas con una velocidad máxima de 10 000 revoluciones por minuto (rpm), no son lo suficientemente potentes para concentrar virus, pero las ultracentrífugas, con una velocidad máxima de alrededor de 100 000  rpm, sí lo son. Esta diferencia se aprovecha en un método denominado centrifugación diferencial . En este método, los contaminantes más grandes y pesados ​​se eliminan de una mezcla de virus mediante centrifugación a baja velocidad. Los virus, que son pequeños y ligeros y quedan en suspensión, se concentran posteriormente mediante centrifugación a alta velocidad. [ 63 ]

Tras la centrifugación diferencial, las suspensiones virales suelen quedar contaminadas con residuos que presentan el mismo coeficiente de sedimentación y que no se eliminan con el procedimiento. En estos casos, se utiliza una modificación de la centrifugación denominada centrifugación por densidad de flotación . En este método, los virus recuperados de la centrifugación diferencial se centrifugan de nuevo a muy alta velocidad durante varias horas en soluciones densas de azúcares o sales que forman un gradiente de densidad, de menor a mayor, en el tubo durante la centrifugación. En algunos casos, se utilizan gradientes preformados en los que se superponen cuidadosamente soluciones de densidad progresivamente decreciente. Al igual que un objeto en el Mar Muerto , a pesar de la fuerza centrífuga, las partículas virales no pueden hundirse en soluciones más densas que ellas y forman capas discretas de virus concentrados, a menudo visibles, en el tubo. El cloruro de cesio se utiliza frecuentemente para estas soluciones, ya que es relativamente inerte, pero forma fácilmente un gradiente por sí mismo al centrifugarse a alta velocidad en una ultracentrífuga. [ 62 ] La centrifugación por densidad de flotación también puede utilizarse para purificar los componentes de los virus, como sus ácidos nucleicos o proteínas. [ 64 ]

Electroforesis

Electroforesis en gel de poliacrilamida de proteínas de rotavirus teñidas con azul de Coomassie.

La separación de moléculas en función de su carga eléctrica se denomina electroforesis . Los virus y todos sus componentes pueden separarse y purificarse mediante este método. Generalmente, esto se realiza en un medio de soporte como geles de agarosa y poliacrilamida . Las moléculas separadas se visualizan mediante tinciones como el azul de Coomassie , para proteínas, o el bromuro de etidio, para ácidos nucleicos. En algunos casos, los componentes virales se vuelven radiactivos antes de la electroforesis y se visualizan mediante película fotográfica en un proceso conocido como autorradiografía . [ 65 ]

Secuenciación de genomas virales

Como la mayoría de los virus son demasiado pequeños para ser vistos por un microscopio óptico, la secuenciación es una de las principales herramientas en virología para identificar y estudiar el virus. La secuenciación Sanger tradicional y la secuenciación de próxima generación (NGS) se utilizan para secuenciar virus en investigación básica y clínica, así como para el diagnóstico de infecciones virales emergentes, epidemiología molecular de patógenos virales y pruebas de resistencia a medicamentos. Hay más de 2,3 millones de secuencias virales únicas en GenBank. [ 66 ] La NGS ha superado a la Sanger tradicional como el enfoque más popular para generar genomas virales. [ 66 ] La secuenciación del genoma viral se ha convertido en un método central en la epidemiología viral y la clasificación viral .

Análisis filogenético

Los datos de la secuenciación de genomas virales pueden utilizarse para determinar relaciones evolutivas, lo que se conoce como análisis filogenético . [ 67 ] Se utiliza software, como PHYLIP , para dibujar árboles filogenéticos . Este análisis también se utiliza para estudiar la propagación de infecciones virales en comunidades ( epidemiología ). [ 68 ]

Clonación

Cuando se necesitan virus purificados o componentes virales para pruebas de diagnóstico o vacunas, se puede utilizar la clonación en lugar del cultivo de los virus. [ 69 ] Al comienzo de la pandemia de COVID-19, la disponibilidad de la secuencia de ARN del coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo grave permitió fabricar pruebas rápidamente. [ 70 ] Existen varios métodos probados para clonar virus y sus componentes. A menudo se utilizan pequeños fragmentos de ADN llamados vectores de clonación , y los más comunes son los plásmidos modificados en laboratorio (pequeñas moléculas circulares de ADN producidas por bacterias). El ácido nucleico viral, o una parte de él, se inserta en el plásmido, que luego es copiado muchas veces por las bacterias. Este ADN recombinante se puede utilizar para producir componentes virales sin necesidad de virus nativos. [ 71 ]

Virología de fagos

Los virus que se reproducen en bacterias, arqueas y hongos se denominan informalmente "fagos" [ 72 ] , y los que infectan bacterias —los bacteriófagos— son particularmente útiles en virología y biología en general [ 73 ] . Los bacteriófagos fueron algunos de los primeros virus descubiertos a principios del siglo XX [ 74 ] , y debido a que son relativamente fáciles de cultivar rápidamente en laboratorios, gran parte de nuestro conocimiento sobre los virus se originó a partir de su estudio [ 74 ] . Los bacteriófagos, conocidos desde hace tiempo por sus efectos positivos en el medio ambiente, se utilizan en técnicas de visualización de fagos para analizar secuencias de ADN de proteínas. Son una herramienta poderosa en biología molecular [ 75 ] .

Genética

Todos los virus tienen genes que se estudian mediante genética . [ 76 ] Todas las técnicas utilizadas en biología molecular, como la clonación, la creación de mutaciones y el silenciamiento de ARN, se utilizan en genética viral. [ 77 ]

Resurtido

La recombinación genética es el intercambio de genes de diferentes progenitores y resulta particularmente útil al estudiar la genética de virus con genomas segmentados (fragmentados en dos o más moléculas de ácido nucleico), como los virus de la gripe y los rotavirus . De esta forma, se pueden identificar los genes que codifican propiedades como el serotipo . [ 78 ]

Recombinación

A menudo confundida con la reordenación, la recombinación también es la mezcla de genes, pero el mecanismo difiere en que, durante el ciclo de replicación del ARN o del ADN, se unen segmentos de moléculas de ADN o ARN, en lugar de moléculas completas. La recombinación no es tan común como la reordenación en la naturaleza, pero es una herramienta poderosa en los laboratorios para estudiar la estructura y las funciones de los genes virales. [ 79 ]

Genética inversa

La genética inversa es un método de investigación poderoso en virología. [ 80 ] En este procedimiento, se utilizan copias de ADN complementario (ADNc) de genomas virales, llamadas "clones infecciosos", para producir virus genéticamente modificados que luego se pueden analizar para detectar cambios, por ejemplo, en la virulencia o la transmisibilidad. [ 81 ]

Clasificación de virus

Una rama importante de la virología es la clasificación de virus . Es artificial porque no se basa en la filogenética evolutiva , sino en propiedades compartidas o distintivas de los virus. [ 82 ] [ 83 ] Busca describir la diversidad de los virus nombrándolos y agrupándolos en función de sus similitudes. [ 84 ] En 1962, André Lwoff , Robert Horne y Paul Tournier fueron los primeros en desarrollar un método de clasificación de virus, basado en el sistema jerárquico linneano . [ 85 ] Este sistema basaba la clasificación en filo , clase , orden , familia , género y especie . Los virus se agrupaban según sus propiedades compartidas (no las de sus huéspedes) y el tipo de ácido nucleico que forma sus genomas. [ 86 ] En 1966, se formó el Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV). El sistema propuesto por Lwoff, Horne y Tournier no fue aceptado inicialmente por el ICTV debido a que el pequeño tamaño del genoma de los virus y su alta tasa de mutación dificultaban la determinación de su ascendencia más allá del orden. Por lo tanto, el sistema de clasificación de Baltimore se ha utilizado para complementar la jerarquía más tradicional. [ 87 ] A partir de 2018, el ICTV comenzó a reconocer relaciones evolutivas más profundas entre los virus que se han descubierto con el tiempo y adoptó un sistema de clasificación de 15 rangos que abarca desde el reino hasta la especie. [ 88 ] Además, algunas especies dentro del mismo género se agrupan en un genogrupo . [ 89 ] [ 90 ]

Clasificación ICTV

El ICTV desarrolló el sistema de clasificación actual y redactó directrices que otorgan mayor importancia a ciertas propiedades de los virus para mantener la uniformidad de las familias. Se ha establecido una taxonomía unificada (un sistema universal para clasificar los virus). Solo se ha estudiado una pequeña parte de la diversidad total de virus. [ 91 ] Hasta 2021, el ICTV había definido 6 reinos, 10 reinos, 17 filos, 2 subfilos, 39 clases, 65 órdenes, 8 subórdenes, 233 familias, 168 subfamilias , 2606 géneros, 84 subgéneros y 10 434 especies de virus. [ 92 ]

A continuación se muestra la estructura taxonómica general de los rangos taxonómicos y los sufijos utilizados en los nombres taxonómicos. A partir de 2021, los rangos de subreino, subreino y subclase no se utilizan, mientras que todos los demás rangos están en uso. [ 92 ]

Reino ( -viria )
Subreino ( -vira )
Reino ( -virae )
Subreino ( -virites )
Filo ( -viricota )
Subfilo ( -viricotina )
Clase ( -viricetes )
Subclase ( -viricetidae )
Orden ( -virales )
Suborden ( -virineae )
Familia ( -viridae )
Subfamilia ( -virinae )
Género ( -virus )
Subgénero ( -virus )
Especies

Clasificación de Baltimore

Diagrama que muestra cómo la Clasificación de Baltimore se basa en el ADN o ARN de un virus y en el método de síntesis de ARNm.
La clasificación de Baltimore de los virus se basa en el método de síntesis del ARNm viral .

El biólogo ganador del Premio Nobel, David Baltimore, ideó el sistema de clasificación de Baltimore . [ 93 ]

La clasificación de Baltimore de los virus se basa en el mecanismo de producción de ARNm . Los virus deben generar ARNm a partir de sus genomas para producir proteínas y replicarse, pero cada familia de virus utiliza mecanismos diferentes para lograrlo. Los genomas virales pueden ser monocatenarios (ss) o bicatenarios (ds), de ARN o ADN, y pueden o no utilizar transcriptasa inversa (RT). Además, los virus de ARN monocatenario pueden ser de sentido (+) o antisentido (−). Esta clasificación divide a los virus en siete grupos:

Referencias

  1. ↑ Dolja VV, Koonin EV (noviembre de 2011). " Orígenes comunes y diversidad dependiente del huésped de los viromas de plantas y animales" . Current Opinion in Virology . 1 (5): 322– 31. doi : 10.1016/j.coviro.2011.09.007 . PMC 3293486. PMID 22408703 .  
  2. ↑ Novella IS, Presloid JB, Taylor RT (diciembre de 2014). "Errores de replicación del ARN y la evolución de la patogenicidad y virulencia del virus". Current Opinion in Virology . 9 : 143–7 . doi : 10.1016/j.coviro.2014.09.017 . PMID 25462446 . 
  3. ↑ Sales RK, Oraño J, Estanislao RD, Ballesteros AJ, Gomez MI (2021-04-29). "Establecimiento de prioridades de investigación para la virología humana, vegetal y animal: una experiencia en línea para el Instituto de Virología de Filipinas" . Health Research Policy and Systems . 19 (1): 70. doi : 10.1186/s12961-021-00723-z . ISSN 1478-4505 . PMC 8082216. PMID 33926472 .   
  4. ↑ Bordenave G (mayo de 2003). "Louis Pasteur (1822-1895)". Microbes and Infection . 5 (6): 553– 60. doi : 10.1016/S1286-4579(03)00075-3 . PMID 12758285 . 
  5. ↑ Shors págs. 74, 827
  6. 1 2 Collier pág. 3
  7. ↑ Dimmock pág. 4
  8. ↑ Dimmock págs. 4–5
  9. ↑ Fenner F (2009). Mahy BW, Van Regenmortal MH (eds.). Desk Encyclopedia of General Virology (1.ª ed.). Oxford: Academic Press. p. 15. ISBN   978-0-12-375146-1.
  10. ↑ Shors pág. 827
  11. ↑ Keen EC (2012). " Terapia con fagos: del concepto a la cura" . Frontiers in Microbiology . 3 : 238. doi : 10.3389/fmicb.2012.00238 . PMC 3400130. PMID 22833738 .  
  12. ↑ D'Herelle F (septiembre de 2007). "Sobre un microbio invisible antagonista de los bacilos disentéricos: breve nota del Sr. F. D'Herelle, presentada por el Sr. Roux. 1917" . Research in Microbiology . 158 (7): 553–54 . doi : 10.1016/j.resmic.2007.07.005 . PMID 17855060 . 
  13. ↑ Domingo-Calap P, Georgel P, Bahram S (marzo de 2016). " De vuelta al futuro: los bacteriófagos como herramientas terapéuticas prometedoras". HLA . 87 (3): 133– 40. doi : 10.1111/tan.12742 . PMID 26891965. S2CID 29223662 .  
  14. ↑ Steinhardt E, Israeli C, Lambert RA (1913). "Estudios sobre el cultivo del virus de la viruela" . The Journal of Infectious Diseases . 13 (2): 294– 300. doi : 10.1093/infdis/13.2.294 .
  15. ↑ Collier pág. 4
  16. ↑ Goodpasture EW, Woodruff AM, Buddingh GJ (octubre de 1931). "El cultivo de virus vacunales y otros virus en la membrana corioalantoidea de embriones de pollo". Science . 74 (1919): 371–72 . Bibcode : 1931Sci....74..371G . doi : 10.1126/science.74.1919.371 . PMID 17810781 . 
  17. ↑ Thomas Huckle Weller (2004). Cultivo de patógenos en cultivos de tejidos: cincuenta años en medicina tropical académica, pediatría y virología . Biblioteca Médica de Boston. pág. 57. ISBN  978-0-88135-380-8.
  18. ↑ Rosen FS (octubre de 2004). "Aislamiento del poliovirus: John Enders y el Premio Nobel". The New England Journal of Medicine . 351 (15): 1481– 83. doi : 10.1056/NEJMp048202 . PMID 15470207 . 
  19. ↑ Frängsmyr T, Ekspång G, eds. (1993). Nobel Lectures, Physics 1981–1990 . Singapur: World Scientific Publishing Co. Bibcode : 1993nlp..book.....F .
    • En 1887, Buist visualizó uno de los virus más grandes, el virus Vaccinia, mediante microscopía óptica tras teñirlo. En aquel entonces, no se sabía que el Vaccinia fuera un virus. (Buist JB Vaccinia and Variola: a study of their life history Churchill, Londres)
  20. ↑ Stanley WM, Loring HS (enero de 1936). "El aislamiento de la proteína cristalina del virus del mosaico del tabaco a partir de plantas de tomate enfermas". Science . 83 (2143): 85. Bibcode : 1936Sci....83...85S . doi : 10.1126/science.83.2143.85 . PMID 17756690 . 
  21. ↑ Stanley WM, Lauffer MA (abril de 1939). "Desintegración del virus del mosaico del tabaco en soluciones de urea". Science . 89 (2311): 345–47 . Bibcode : 1939Sci....89..345S . doi : 10.1126/science.89.2311.345 . PMID 17788438 . 
  22. ↑ Creager AN, Morgan GJ (junio de 2008). "Después de la doble hélice: la investigación de Rosalind Franklin sobre el virus del mosaico del tabaco". Isis . 99 (2): 239–72 . doi : 10.1086/588626 . PMID 18702397. S2CID 25741967 .  
  23. ↑ Dimmock pág. 12
  24. ↑ Norrby E (2008). "Los premios Nobel y el concepto emergente de virus". Archives of Virology . 153 (6): 1109– 23. doi : 10.1007/s00705-008-0088-8 . PMID 18446425. S2CID 10595263 .  
  25. ↑ Collier pág. 745
  26. ↑ Temin HM, Baltimore D (1972). "Síntesis de ADN dirigida por ARN y virus tumorales de ARN". Advances in Virus Research . 17 : 129–86 . doi : 10.1016/S0065-3527(08)60749-6 . ISBN 9780120398171. PMID 4348509 . 
  27. ↑ Barré-Sinoussi F, Chermann JC, Rey F, Nugeyre MT, Chamaret S, Gruest J, et al. (mayo de 1983). "Aislamiento de un retrovirus linfotrópico T de un paciente con riesgo de síndrome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA)". Science . 220 (4599): 868– 71. Bibcode : 1983Sci...220..868B . doi : 10.1126/science.6189183 . PMID 6189183 .  
  28. ↑ Choo QL, Kuo G, Weiner AJ, Overby LR, Bradley DW, Houghton M (abril de 1989). "Aislamiento de un clon de ADNc derivado de un genoma de hepatitis viral no A, no B transmitido por la sangre". Science . 244 (4902): 359– 62. Bibcode : 1989Sci...244..359C . CiteSeerX 10.1.1.469.3592 . doi : 10.1126/science.2523562 . PMID 2523562 .  
  29. ↑ Houghton M (noviembre de 2009). "El largo y sinuoso camino que condujo a la identificación del virus de la hepatitis C" . Journal of Hepatology . 51 (5): 939–48 . doi : 10.1016/j.jhep.2009.08.004 . PMID 19781804 . 
  30. 1 2 3 4 Payne S (2017). "Métodos para estudiar virus". Viruses . págs. 37–52 . doi : 10.1016/B978-0-12-803109-4.00004-0 . ISBN  978-0-12-803109-4.
  31. ↑ "Ampliación - Microscopía, tamaño y aumento (CCEA) - Revisión de Biología GCSE (Ciencia Única) - CCEA" . BBC Bitesize . Consultado el 2 de enero de 2023 .
  32. ↑ Brenner S, Horne RW (julio de 1959). "Un método de tinción negativa para la microscopía electrónica de alta resolución de virus". Biochimica et Biophysica Acta . 34 : 103–10 . doi : 10.1016/0006-3002(59)90237-9 . PMID 13804200 . 
  33. ↑ Goldsmith CS, Miller SE (octubre de 2009). "Usos modernos de la microscopía electrónica para la detección de virus" . Clinical Microbiology Reviews . 22 (4): 552– 63. doi : 10.1128/CMR.00027-09 . PMC 2772359. PMID 19822888 .  
  34. ↑ Tivol WF, Briegel A, Jensen GJ (octubre de 2008). "Un criógeno mejorado para la congelación por inmersión" . Microscopía y microanálisis . 14 ( 5): 375– 379. Bibcode : 2008MiMic..14..375T . doi : 10.1017/S1431927608080781 . ISSN 1431-9276 . PMC 3058946. PMID 18793481 .   
  35. ↑ Cheng Y, Grigorieff N, Penczek PA, Walz T (abril de 2015). "Una introducción a la criomicroscopía electrónica de partícula única" . Cell . 161 ( 3): 438– 449. Bibcode : 2015Cell..161..438C . doi : 10.1016/j.cell.2015.03.050 . PMC 4409659. PMID 25910204 .  
  36. ↑ Stoddart C (1 de marzo de 2022). "Biología estructural: cómo las proteínas obtuvieron su primer plano" . Knowable Magazine . doi : 10.1146/knowable-022822-1 . Consultado el 25 de marzo de 2022 .
  37. ↑ Liu JZ, Richerson K, Nelson RS (agosto de 2009). "Condiciones de crecimiento para estudios de virus de plantas y huéspedes". Current Protocols in Microbiology . 14 : Unit16A.1. doi : 10.1002/9780471729259.mc16a01s14 . PMID 19653216. S2CID 41236532 .  
  38. ↑ Valmonte-Cortes GR, Lilly ST, Pearson MN, Higgins CM , MacDiarmid RM (enero de 2022). "El potencial de los indicadores moleculares de la infección por virus en plantas: ¿ pueden las plantas decirnos que están infectadas?" . Plants . 11 (2): 188. Bibcode : 2022Plnts..11..188V . doi : 10.3390/plants11020188 . PMC 8777591. PMID 35050076 .  
  39. ↑ Gauger PC, Vincent AL (2014). "Ensayo de neutralización de virus en suero para la detección y cuantificación de anticuerpos neutralizantes en suero contra el virus de la influenza A en cerdos". Virus de la influenza animal . Métodos en biología molecular. Vol. 1161. págs. 313–24 . doi : 10.1007/978-1-4939-0758-8_26 . ISBN   978-1-4939-0757-1. PMID 24899440 . 
  40. ↑ Dimitrova K, Mendoza EJ, Mueller N, Wood H (2020). "Una prueba de neutralización por reducción de placa para la detección de anticuerpos específicos contra el virus Zika". Zika Virus . Methods in Molecular Biology. Vol. 2142. pp. 59–71 . doi : 10.1007/978-1-0716-0581-3_5 . ISBN   978-1-0716-0580-6. PMID 32367358 . S2CID 218504421 .  
  41. ↑ Lampejo T (julio de 2020). "Influenza y resistencia antiviral: una visión general" . European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases . 39 (7): 1201– 1208. doi : 10.1007/s10096-020-03840-9 . PMC 7223162. PMID 32056049 .  
  42. ^ Zainol Rashid Z, Othman SN, Abdul Samat MN, Ali UK, Wong KK (abril de 2020). "Rendimiento diagnóstico de ensayos serológicos COVID-19". La Revista de Patología de Malasia . 42 (1): 13– 21. PMID 32342927 . 
  43. ↑ Swack NS, Gahan TF, Hausler WJ (agosto de 1992). "Estado actual de la prueba de fijación del complemento en el serodiagnóstico viral". Agentes infecciosos y enfermedades . 1 (4): 219– 24. PMID 1365549 . 
  44. ↑ Smith TJ (agosto de 2011). "Estudios estructurales sobre el reconocimiento de anticuerpos y la neutralización de virus" . Current Opinion in Virology . 1 (2): 150– 6. doi : 10.1016/j.coviro.2011.05.020 . PMC 3163491. PMID 21887208 .  
  45. ↑ Mahony JB, Petrich A, Smieja M (2011). "Diagnóstico molecular de infecciones por virus respiratorios". Critical Reviews in Clinical Laboratory Sciences . 48 ( 5– 6): 217– 49. doi : 10.3109/10408363.2011.640976 . PMID 22185616 . S2CID 24960083 .  
  46. ^ AbuSalah MA, Gan SH, Al-Hatamleh MA, Irekeola AA, Shueb RH, Yean Yean C (marzo de 2020). "Avances recientes en los enfoques de diagnóstico del virus de Epstein-Barr" . Patógenos . 9 (3): 226. doi : 10.3390/patógenos9030226 . PMC 7157745 . PMID 32197545 .  
  47. ^ Zhu H, Zhang H, Xu Y, Laššáková S, Korabečná M, Neužil P (octubre de 2020). «PCR pasado, presente y futuro» . BioTécnicas . 69 (4): 317– 325. doi : 10.2144/btn-2020-0057 . PMC 7439763 . PMID 32815744 .  
  48. ↑ Wang X, Hong XZ, Li YW, Li Y, Wang J, Chen P, Liu BF (marzo de 2022). " Estrategias basadas en microfluídica para el diagnóstico molecular de enfermedades infecciosas" . Military Medical Research . 9 (1) 11. doi : 10.1186/s40779-022-00374-3 . PMC 8930194. PMID 35300739 .  
  49. ↑ Benzigar MR, Bhattacharjee R, Baharfar M, Liu G (abril de 2021). "Métodos actuales para el diagnóstico de coronavirus humanos: pros y contras" . Analytical and Bioanalytical Chemistry . 413 (9): 2311– 2330. doi : 10.1007/s00216-020-03046-0 . PMC 7679240. PMID 33219449 .  
  50. ↑ Burrell CJ, Howard CR, Murphy FA (1 de enero de 2017). «Capítulo 10 - Diagnóstico de laboratorio de enfermedades virales». En Burrell CJ, Howard CR, Murphy FA (eds.). Virología médica de Fenner y White (Quinta ed.). Londres: Academic Press. págs. 135–154 . doi : 10.1016/b978-0-12-375156-0.00010-2 . ISBN   978-0-12-375156-0. PMC 7149825 . 
  51. ↑ Koczula KM, Gallotta A (junio de 2016). "Ensayos de flujo lateral" . Ensayos en bioquímica . 60 (1): 111–20 . doi : 10.1042/EBC20150012 . PMC 4986465. PMID 27365041 .  
  52. ↑ Lee MJ (octubre de 2021). " Cuantificación de la carga viral del SARS-CoV-2: estado actual y perspectivas futuras" . Expert Review of Molecular Diagnostics . 21 (10): 1017– 1023. doi : 10.1080/14737159.2021.1962709 . PMC 8425446. PMID 34369836 .  
  53. ↑ Mistry BA, D'Orsogna MR , Chou T (junio de 2018). "Los efectos de la multiplicidad estadística de la infección en la cuantificación de virus y los ensayos de infectividad" . Biophysical Journal . 114 (12): 2974–2985 . arXiv : 1805.02810 . Bibcode : 2018BpJ...114.2974M . doi : 10.1016 / j.bpj.2018.05.005 . PMC 6026352. PMID 29925033 .  
  54. ↑ Kashuba C, Hsu C, Krogstad A, Franklin C (enero de 2005). "Virología de pequeños mamíferos" . The Veterinary Clinics of North America. Exotic Animal Practice . 8 (1): 107– 22. doi : 10.1016/j.cvex.2004.09.004 . PMC 7110861. PMID 15585191 .  
  55. ↑ Cutler TD, Wang C, Hoff SJ, Kittawornrat A, Zimmerman JJ (agosto de 2011). "Dosis infecciosa media (DI50 ) del aislado MN-184 del virus del síndrome reproductivo y respiratorio porcino mediante exposición por aerosol". Veterinary Microbiology . 151 ( 3–4 ): 229–37 . doi : 10.1016/j.vetmic.2011.03.003 . PMID 21474258 . 
  56. ↑ Moon K, Cho JC (marzo de 2021). "Metavirómica combinada con la identificación fago-huésped para abrir la "caja negra" viral"" . Revista de Microbiología (Seúl, Corea) . 59 (3): 311– 323. doi : 10.1007/s12275-021-1016-9 . PMID 33624268. S2CID 232023531 .  
  57. ↑ Salgado EN, Upadhyayula S, Harrison SC (septiembre de 2017). "Detección de transcripción de partículas individuales tras la entrada del rotavirus" . Journal of Virology . 91 (18) e00651-17. doi : 10.1128/JVI.00651-17 . PMC 5571246. PMID 28701394 .  
  58. ^ Yokota I, Hattori T, Shane PY, Konno S, Nagasaka A, Takeyabu K, Fujisawa S, Nishida M, Teshima T (febrero de 2021). "Cargas virales equivalentes de SARS-CoV-2 por PCR entre hisopo nasofaríngeo y saliva en pacientes sintomáticos" . Informes científicos . 11 (1) 4500. Código Bib : 2021NatSR..11.4500Y . doi : 10.1038/s41598-021-84059-2 . PMC 7904914 . PMID 33627730 .  
  59. ↑ Nichols BE, Girdwood SJ, Crompton T, Stewart-Isherwood L, Berrie L, Chimhamhiwa D, Moyo C, Kuehnle J, Stevens W, Rosen S (septiembre de 2019). "Monitorización de la carga viral en la última milla: ¿cuánto costará?" . Journal of the International AIDS Society . 22 (9) e25337. doi : 10.1002/jia2.25337 . PMC 6742838. PMID 31515967 .  
  60. ↑ Shirima RR, Maeda DG, Kanju E, Ceasar G, Tibazarwa FI, Legg JP (julio de 2017). "Cuantificación absoluta del ARNm del virus de la raya marrón de la yuca mediante qPCR en tiempo real" . Journal of Virological Methods . 245 : 5–13 . doi : 10.1016/j.jviromet.2017.03.003 . PMC 5429390. PMID 28315718 .  
  61. ↑ Rubio L, Galipienso L, Ferriol I (2020). "Detección de virus vegetales y manejo de enfermedades: relevancia de la diversidad genética y la evolución" . Frontiers in Plant Science . 11 1092. Bibcode : 2020FrPS...11.1092R . doi : 10.3389/fpls.2020.01092 . PMC 7380168. PMID 32765569 .  
  62. 1 2 Beards GM (agosto de 1982). "Un método para la purificación de rotavirus y adenovirus a partir de heces". Journal of Virological Methods . 4 (6): 343– 52. doi : 10.1016/0166-0934(82)90059-3 . PMID 6290520 . 
  63. ↑ Zhou Y, McNamara RP, Dittmer DP (agosto de 2020). "Métodos de purificación y presencia de ARN en partículas virales y vesículas extracelulares" . Viruses . 12 (9): 917. doi : 10.3390/v12090917 . PMC 7552034. PMID 32825599 .  
  64. ↑ Su Q, Sena-Esteves M, Gao G (mayo de 2019). "Purificación del adenovirus recombinante mediante centrifugación en gradiente de cloruro de cesio". Cold Spring Harbor Protocols . 2019 (5) pdb.prot095547. doi : 10.1101/pdb.prot095547 . PMID 31043560. S2CID 143423942 .  
  65. ↑ Klepárník K, Boček P (marzo de 2010). "Electroforesis hoy y mañana: ayudando a que los sueños de los biólogos se hagan realidad". BioEssays . 32 (3): 218– 226. doi : 10.1002/bies.200900152 . hdl : 11104/0183599 . PMID 20127703 . S2CID 41587013 .  
  66. 1 2 Castro C, Marine R, Ramos E, Ng TF (22 de junio de 2020). "El efecto de la interferencia de variantes en el ensamblaje de novo para la secuenciación profunda viral" . BMC Genomics . 21 (1): 421. doi : 10.1186/s12864-020-06801-w . PMC 7306937. PMID 32571214 .  
  67. ↑ Cui J, Li F, Shi ZL (marzo de 2019). "Origen y evolución de los coronavirus patógenos" . Nature Reviews. Microbiology . 17 (3): 181– 192. doi : 10.1038/s41579-018-0118-9 . PMC 7097006. PMID 30531947 .  
  68. ↑ Gorbalenya AE, Lauber C (2017). "Filogenia de los virus ☆". Reference Module in Biomedical Sciences . doi : 10.1016/B978-0-12-801238-3.95723-4 . ISBN 978-0-12-801238-3. PMC 7157450 . 
  69. ↑ Koch L (julio de 2020). "Una plataforma para la clonación de virus de ARN" . Nature Reviews. Genetics . 21 (7): 388. doi : 10.1038/s41576-020-0246-8 . PMC 7220607. PMID 32404960 .  
  70. ↑ Thi Nhu Thao T, Labroussaa F, Ebert N, V'kovski P, Stalder H, Portmann J, Kelly J, Steiner S, Holwerda M, Kratzel A, Gultom M, Schmied K, Laloli L, Hüsser L, Wider M, Pfaender S, Hirt D, Cippà V, Crespo-Pomar S, Schröder S, Muth D, Niemeyer D, Corman VM, Müller MA, Drosten C, Dijkman R, Jores J, Thiel V (junio de 2020). "Reconstrucción rápida del SARS-CoV-2 mediante una plataforma de genómica sintética" . Naturaleza . 582 (7813): 561– 565. Bibcode : 2020Natur.582..561T . doi : 10.1038/ s41586-020-2294-9 . PMID 32365353. S2CID 213516085 .  
  71. ↑ Rosano GL, Morales ES, Ceccarelli EA (agosto de 2019). "Nuevas herramientas para la producción de proteínas recombinantes en Escherichia coli: una actualización de 5 años" . Protein Science . 28 (8): 1412– 1422. doi : 10.1002/pro.3668 . PMC 6635841. PMID 31219641 .  
  72. ↑ Pennazio S (2006). "El origen de la virología de fagos". Rivista di Biología . 99 (1): 103– 29. PMID 16791793 . 
  73. ↑ Harada LK, Silva EC, Campos WF, Del Fiol FS, Vila M, Dąbrowska K, Krylov VN, Balcão VM (2018). " Aplicaciones biotecnológicas de bacteriófagos: estado del arte" . Investigación microbiológica . 212–213 : 38–58 . Bibcode : 2018MbRes.212...38H . doi : 10.1016/j.micres.2018.04.007 . hdl : 1822/54758 . PMID 29853167. S2CID 46921731 .  
  74. 1 2 Stone E, Campbell K, Grant I, McAuliffe O (junio de 2019). "Comprender y explotar las interacciones fago-huésped" . Viruses . 11 ( 6): 567. Bibcode : 2019Virus..11..567S . doi : 10.3390/v11060567 . PMC 6630733. PMID 31216787 .  
  75. ↑ Nagano K, Tsutsumi Y (enero de 2021). "Tecnología de visualización de fagos como una plataforma poderosa para el descubrimiento de fármacos de anticuerpos" . Viruses . 13 ( 2): 178. doi : 10.3390/v13020178 . PMC 7912188. PMID 33504115 .  
  76. ↑ Ibrahim B, McMahon DP, Hufsky F, Beer M, Deng L, Mercier PL, Palmarini M, Thiel V, Marz M (junio de 2018). "Una nueva era de la bioinformática de virus" . Virus Research . 251 : 86–90 . doi : 10.1016/j.virusres.2018.05.009 . PMID 29751021. S2CID 21736957 .  
  77. ↑ Bamford D, Zuckerman MA (2021). Enciclopedia de virología . Ámsterdam: Academic Press. ISBN 978-0-12-814516-6OCLC 1240584737​​ 
  78. ↑ McDonald SM, Nelson MI, Turner PE, Patton JT (julio de 2016). "Reordenamiento en virus de ARN segmentados: mecanismos y resultados" . Nature Reviews. Microbiology . 14 (7): 448–60 . doi : 10.1038/nrmicro.2016.46 . PMC 5119462. PMID 27211789 .  
  79. ↑ Li J, Arévalo MT, Zeng M (2013). "Ingeniería de vectores virales de influenza" . Bioengineered . 4 ( 1): 9– 14. doi : 10.4161/bioe.21950 . PMC 3566024. PMID 22922205 .  
  80. ↑ Lee CW (2014). "Genética inversa del virus de la influenza". Virus de la influenza animal . Métodos en biología molecular. Vol. 1161. pp. 37–50 . doi : 10.1007/978-1-4939-0758-8_4 . ISBN   978-1-4939-0757-1. PMID 24899418 . 
  81. ↑ Li Z, Zhong L, He J, Huang Y, Zhao Y (abril de 2021). "Desarrollo y aplicación de la tecnología genética inversa para el virus de la influenza" . Virus Genes . 57 (2): 151– 163. doi : 10.1007/s11262-020-01822-9 . PMC 7851324. PMID 33528730 .  
  82. ↑ Hull R, Rima B (noviembre de 2020). "Taxonomía y clasificación de virus: nomenclatura de especies virales" . Archives of Virology . 165 (11): 2733– 2736. doi : 10.1007/s00705-020-04748-7 . PMID 32740831. S2CID 220907379 .  
  83. ↑ Pellett PE, Mitra S, Holland TC (2014). "Fundamentos de virología". Neurovirología . Manual de neurología clínica. Vol. 123. págs. 45–66 . doi : 10.1016/B978-0-444-53488-0.00002-X . ISBN   9780444534880. PMC 7152233 . PMID 25015480 .  
  84. ↑ Simmonds P, Aiewsakun P (agosto de 2018). "Clasificación de virus: ¿dónde trazar la línea?" . Archives of Virology . 163 (8): 2037– 2046. doi : 10.1007/s00705-018-3938-z . PMC 6096723 . PMID 30039318 .  
  85. ^ Lwoff A, Horne RW, Tournier P (junio de 1962). "[Un sistema de virus]". Comptes Rendus Hebdomadaires des Séances de l'Académie des Sciences (en francés). 254 : 4225– 27. PMID 14467544 . 
  86. ↑ Lwoff A, Horne R, Tournier P (1962). "Un sistema de virus". Simposios de Cold Spring Harbor sobre biología cuantitativa . 27 : 51–55 . doi : 10.1101/sqb.1962.027.001.008 . PMID 13931895 . 
  87. ↑ Fauquet CM, Fargette D (agosto de 2005). " Comité Internacional de Taxonomía de Virus y las 3142 especies no asignadas" . Virology Journal . 2 64. doi : 10.1186/1743-422X-2-64 . PMC 1208960. PMID 16105179 .  
  88. ↑ Comité Ejecutivo del Comité Internacional de Taxonomía de Virus (mayo de 2020). "El nuevo alcance de la taxonomía de virus: división de la virosfera en 15 rangos jerárquicos" . Nat Microbiol . 5 (5): 668– 674. doi : 10.1038/s41564-020-0709-x . PMC 7186216. PMID 32341570 .  
  89. ↑ Khan MK, Alam MM (julio de 2021). "Brotes de gastroenteritis por norovirus, diversidad genómica y evolución: una visión general". Revista médica de Mymensingh . 30 (3): 863– 873. PMID 34226482 . 
  90. ↑ Eberle J, Gürtler L (2012). "Tipos, grupos, subtipos y formas recombinantes del VIH: errores en la replicación, presión selectiva y cuasiespecies" . Intervirology . 55 ( 2): 79–83 . doi : 10.1159/000331993 . PMID 22286874. S2CID 5642060 .  
  91. ↑ Delwart EL (2007). " Metagenómica viral" . Reviews in Medical Virology . 17 (2): 115– 31. doi : 10.1002/rmv.532 . PMC 7169062. PMID 17295196 .  
  92. 1 2 "Taxonomía de virus: versión 2021" . talk.ictvonline.org . Comité Internacional de Taxonomía de Virus . Consultado el 4 de abril de 2022 .
  93. ↑ Koonin EV, Krupovic M, Agol VI (agosto de 2021). "La clasificación de Baltimore de los virus 50 años después: ¿Cómo se mantiene a la luz de la evolución de los virus?" ( PDF ) . Microbiology and Molecular Biology Reviews . 85 (3) e0005321. doi : 10.1128/MMBR.00053-21 . PMC 8483701. PMID 34259570. S2CID 235821748 .   

Bibliografía

  • Collier L, Balows A, Sussman M (1998). Mahy B, Collier LA (eds.). Microbiología e infecciones microbianas de Topley y Wilson . Virología. Vol.  1 (Novena  ed.). ISBN 0-340-66316-2.
  • Dimmock NJ, Easton AJ, Leppard K (2007). Introducción a la virología moderna (Sexta  ed.). Blackwell Publishing. ISBN 978-1-4051-3645-7.
  • Shors T (2017). Comprensión de los virus . Jones and Bartlett Publishers. ISBN 978-1-284-02592-7.
  • Logotipo de Wikimedia CommonsContenido multimedia relacionado con la virología en Wikimedia Commons
  • Sitio web oficial del Comité Internacional de Taxonomía de Virus.
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