BPIFA3

La proteína BPIFA3 ( BPI fold containing family A, member 3 ) está codificada en humanos por el gen BPIFA3 . ^{[ 5 ]} Este gen también se conoce como SPLUNC3 y C20orf71 en humanos, y su gen ortólogo en ratones es 1700058C13Rik . ^{[ 6 ]} Existen múltiples variantes de BPIFA3 que se proyectan como proteínas secretadas. ^{[ 7 ]} Se expresa en gran medida en los testículos , con poca o ninguna expresión en otros tejidos. El proyecto Human Protein Atlas ^{[ 8 ]} y el consorcio Mouse ENCODE ^{[ 9 ]} informan una expresión de RNA-Seq a niveles de RPKM (lecturas por kilobase de transcrito por millón de lecturas mapeadas) de 29,1 para los testículos humanos y 69,4 para los ratones, pero 0 para todos los demás tejidos. ^{[ 5 ] [ 6 ]} De manera similar, el consorcio Bgee, ^{[ 10 ]} utilizando múltiples técnicas además de RNA-Seq, informa una puntuación de expresión relativa de 95,8 sobre 100 para testículos y 99,0 para espermatozoides en humanos; sin embargo, se observaron niveles bajos de BPIFA3 entre 20 y 30 para una variedad de tejidos como músculo, glándulas, próstata, sistema nervioso y piel. ^{[ 11 ]}

BPIFA3 es un miembro de una superfamilia de proteínas con pliegue BPI definida por la presencia del pliegue de proteína bactericida/que aumenta la permeabilidad (pliegue BPI), que está formado por dos dominios similares en forma de "boomerang". ^{[ 12 ]} Esta superfamilia también se conoce como la familia BPI/LBP/PLUNC o la familia BPI / LPB / CETP . ^{[ 13 ]} El pliegue BPI crea cavidades de unión apolares que pueden interactuar con moléculas hidrofóbicas y anfipáticas , como las cadenas de carbono acilo del lipopolisacárido que se encuentran en las bacterias Gram negativas , pero los miembros de esta familia pueden tener muchas otras funciones.

Los genes de la superfamilia BPI/LBP/PLUNC se encuentran en todas las especies de vertebrados, incluidos homólogos distantes en especies no vertebradas como insectos, moluscos y nematodos. ^{[ 14 ] [ 15 ]} Dentro de ese amplio grupo se encuentra la familia de genes BPIF cuyos miembros codifican el motivo estructural de pliegue BPI y se encuentran agrupados en un solo cromosoma, por ejemplo, el cromosoma 20 en humanos, el cromosoma 2 en ratones, el cromosoma 3 en ratas, el cromosoma 17 en cerdos y el cromosoma 13 en vacas. La familia de genes BPIF se divide en dos grupos, BPIFA y BPIFB. En humanos, BIPFA consta de 3 genes que codifican proteínas BPIFA1 , BPIFA2 , BPIFA3 y 1 pseudogén BPIFA4P ; El gen BPIFB consta de 5 genes que codifican proteínas (BPIFB1 , BPIFB2 , BPIFB3 , BPIFB4 , BPIFB6) y 2 pseudogenes (BPIFB5P , BPIFB9P) . Lo que en humanos se presenta como pseudogenes puede aparecer como genes completamente funcionales en otras especies.

En humanos, el gen BPIFA3 se identificó por primera vez como un gen relacionado con PLUNC humano ^{[ 16 ]} y posteriormente en ratones como 1700058C13Rik. ^{[ 17 ]} Ambos fueron reconocidos como miembros de la familia de genes BPIF y se renombraron como BPIFA3 y Bpifa3 , respectivamente.

Se sabe poco sobre la función de BPIFA3. Debido a su alto grado de similitud con otros miembros de la superfamilia BPI/LBP/PLUNC, se predice que tiene actividad de unión a lípidos como fosfolípidos y lipopolisacáridos , pero esto nunca se ha confirmado. ^{[ 18 ]}

Se ha sugerido una posible función de BPIFA3 en la defensa bacteriana del huésped. A pesar de una expresión casi exclusiva de BPIFA3 en el testículo, solo un informe lo implica en algún estado normal o patológico y ese involucra la otitis media (OM) en el oído. ^{[ 19 ]} La OM es una enfermedad común de la primera infancia caracterizada por la inflamación de la cavidad del oído medio y se hizo un esfuerzo para identificar factores de riesgo genéticos. Se realizó un estudio de asociación de todo el genoma en el "Estudio Raine", una cohorte de nacimiento longitudinal de 2868 niños en la que se analizaron 1532 muestras de sangre extraídas a los 1, 2 y 3 años de edad para la expresión génica correlacionada con una susceptibilidad a la OM. Inesperadamente, BPIFA3 y BPIFA1 fueron los principales resultados, junto con los genes CAPN14 y GALNT14 , ninguno de los cuales se había implicado previamente en la OM. Los investigadores observaron que los miembros de la familia de genes BPIF codifican proteínas implicadas en el reconocimiento temprano de patógenos bacterianos como parte de la defensa del huésped en las entradas nasofaríngea, oral y pulmonar, y que la expresión de BPIFA3 y BPIFA1 puede ser una consecuencia lógica de la presencia bacteriana crónica en el oído infectado con otitis media y lleno de pus .

• Ubicación del genoma humano BPIFA3 y página de detalles del gen BPIFA3 en el navegador genómico de UCSC .
• BPIFA3+proteína,+humana en los Encabezamientos de Materias Médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.