La proteína BPIFB6, también conocida como proteína bactericida/incrementadora de permeabilidad 3 (BPIL3), es una proteína codificada en humanos por el gen BPIFB6 , también conocido como BPIL3 y LPLUNC6 . Se expresa en niveles elevados en las amígdalas hipertróficas , [ 5 ] en niveles relativamente moderados en el epitelio oronasal , incluyendo la mucosa nasal , la lengua y las glándulas salivales , así como en la mucosa esofágica en niveles menores. [ 6 ] Existen ortólogos en muchas especies de vertebrados, incluyendo mamíferos, aves, reptiles y anfibios. [ 7 ]
Superfamilia
BPIFB6 es un miembro de una superfamilia de proteínas con pliegue BPI definida por la presencia del pliegue proteico bactericida/que aumenta la permeabilidad (pliegue BPI), que está formado por dos dominios similares en forma de "boomerang". [ 8 ] Esta superfamilia también se conoce como la familia BPI/LBP/PLUNC o la familia BPI / LPB / CETP . [ 9 ] El pliegue BPI crea cavidades de unión apolares que pueden interactuar con moléculas hidrofóbicas y anfipáticas , como las cadenas de carbono acilo del lipopolisacárido que se encuentran en las bacterias Gram negativas , pero los miembros de esta familia pueden tener muchas otras funciones.

Los genes de la superfamilia BPI/LBP/PLUNC se encuentran en todas las especies de vertebrados, incluidos homólogos distantes en especies no vertebradas como insectos, moluscos y nematodos. [ 10 ] [ 11 ] Dentro de ese amplio grupo se encuentra la familia de genes BPIF cuyos miembros codifican el motivo estructural de pliegue BPI y se encuentran agrupados en un solo cromosoma, por ejemplo, el cromosoma 20 en humanos, el cromosoma 2 en ratones, el cromosoma 3 en ratas, el cromosoma 17 en cerdos y el cromosoma 13 en vacas. La familia de genes BPIF se divide en dos grupos, BPIFA y BPIFB. En humanos, BIPFA consta de 3 genes que codifican proteínas BPIFA1 , BPIFA2 , BPIFA3 y 1 pseudogén BPIFA4P ; El gen BPIFB consta de 5 genes que codifican proteínas (BPIFB1 , BPIFB2 , BPIFB3 , BPIFB4 , BPIFB6) y 2 pseudogenes (BPIFB5P , BPIFB9P) . Lo que en humanos se presenta como pseudogenes puede aparecer como genes completamente funcionales en otras especies.
El gen BPIFB6 se identificó por primera vez en humanos como BPIL3 basándose en la homología de secuencia [ 5 ] y se reconoció inmediatamente como un miembro de la superfamilia de genes de pliegue BPI.
Función
BPIFB6 podría funcionar como regulador del tráfico de la vía secretora dentro de las células, lo que a su vez podría ayudar a regular las infecciones virales. Se ha supuesto que BPIFB6 es una proteína secretada, basándose en la similitud de su secuencia genética con otros miembros de la familia que son secretados. [ 12 ] Pero se ha demostrado en un estudio que se localiza en el retículo endoplasmático (RE). [ 13 ] El RE existe como una red de láminas y túbulos, y se encontró que BPIFB6 se localiza principalmente en las láminas del RE, donde interactúa con otros dos miembros de la familia de pliegues PBI, BPIFB2 y BPIFB3 . Además, el silenciamiento del gen BPIFB6 causó cambios drásticos en la morfología del complejo de Golgi , fragmentación del Golgi y alteración de las vesículas citoplasmáticas normales. Todo esto apunta a un papel de BPIFB6 en el tráfico de la vía secretora, lo que se ilustró aún más por sus efectos en la replicación viral. Virus como el virus Coxsackie B (CVB) y el poliovirus (PV) se apropian de la vía secretora de la célula huésped, que controla el transporte de proteínas desde el retículo endoplasmático al complejo de Golgi, para facilitar su replicación . Cuando se silenció el gen BPIFB6, se bloqueó la replicación del CVB y del PV.
La asociación de BPIFB6 con los tejidos que contienen mucosa resurgió en un estudio de biomarcadores en el cáncer rectal. En un análisis epigenómico de la metilación del ADN , BPIB6/BPIL3 fue uno de los dos genes que mostraron una hipometilación significativa. [ 14 ] Además, las amígdalas, que son tejidos linfáticos mucosos, pueden agrandarse (hipertrofiarse) tras la inflamación causada por una infección y faringitis recurrente (dolor de garganta). Se ha demostrado que las amígdalas hipertróficas presentan una expresión muy elevada de BPIFB6/BPIL3. [ 5 ]
Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000167104 – Ensembl , mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000068009 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- 1 2 3 Mulero JJ, Boyle BJ, Bradley S, Bright JM, Nelken ST, Ho TT, et al. (agosto de 2002). "Tres nuevos miembros humanos de la familia de proteínas de transferencia de lípidos/unión a lipopolisacáridos (LT/LBP)". Immunogenetics . 54 ( 5): 293– 300. doi : 10.1007/s00251-002-0467-3 . PMID 12185532. S2CID 11886572 .
- ↑ "BPIFB6 - ENSG00000167104" . bgee.org . El conjunto de herramientas Bgee: atlas de expresión curado integrado y transcriptómica comparativa en animales.
- ↑ "bpifb6 - Gen - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov .
Ver: Resultados por taxón
- ↑ Beamer LJ, Carroll SF, Eisenberg D (abril de 1998). "La familia de proteínas BPI/LBP: un análisis estructural de regiones conservadas" . Protein Science . 7 (4): 906–914 . doi : 10.1002/pro.5560070408 . PMC 2143972. PMID 9568897 .
- ↑ "Familia de dominios proteicos conservados CDD: BPI" . www.ncbi.nlm.nih.gov .
- ↑ Beamer LJ, Fischer D, Eisenberg D (julio de 1998). "Detección de parientes lejanos de las proteínas de unión a LPS y de transporte de lípidos de mamíferos" . Protein Science . 7 (7): 1643– 1646. doi : 10.1002/pro.5560070721 . PMC 2144061. PMID 9684900 .
- ↑ Bingle CD, Seal RL, Craven CJ (agosto de 2011). "Nomenclatura sistemática para las proteínas PLUNC/PSP/BSP30/SMGB como una subfamilia de la superfamilia que contiene el pliegue BPI" . Biochemical Society Transactions . 39 (4): 977– 983. doi : 10.1042/BST0390977 . PMC 3196848. PMID 21787333 .
- ↑ "Q8NFQ5 - BPIB6_HUMAN" . www.uniprot.org .
Véase: Localización subcelular.
- ↑ Morosky S, Lennemann NJ, Coyne CB (mayo de 2016). "BPIFB6 regula el tráfico de la vía secretora y la replicación de enterovirus" . Journal of Virology . 90 (10): 5098– 5107. doi : 10.1128/JVI.00170-16 . PMC 4859712. PMID 26962226 .
- ↑ Vymetalkova V, Vodicka P, Pardini B, Rosa F, Levy M, Schneiderova M, et al. (septiembre de 2016). "Análisis de metilación del ADN a nivel de todo el epigenoma revela una firma epigenómica específica del cáncer rectal". Epigenomics . 8 (9): 1193– 1207. doi : 10.2217/epi-2016-0044 . hdl : 2318/1765144 . PMID 27529132 .
Enlaces externos
- Localización del gen BPIFB6 humano en el genoma y página de detalles del gen BPIFB6 en el navegador genómico de UCSC .
- Genes en el cromosoma 20 humano
- Proteínas humanas
- Genes