Subtilasa

Las subtilasas son una familia de serina proteasas similares a la subtilisina . Aparentemente, han evolucionado de forma independiente y convergente una tríada catalítica Asp / Ser / His , como en las serina proteasas tripsina . La estructura de las proteínas de esta familia muestra que poseen un plegamiento alfa/beta que contiene una lámina beta paralela de 7 hebras .

La familia de la subtilisina es la segunda familia de serina proteasas más grande caracterizada hasta la fecha. Actualmente se conocen más de 200 subtilasas, más de 170 de las cuales tienen su secuencia completa de aminoácidos. ^{[ 2 ]} La subtilasa está ampliamente distribuida, encontrándose en eubacterias, arqueobacterias, eucariotas y virus. ^{[ 3 ]} La gran mayoría de la familia son endopeptidasas , aunque hay una exopeptidasa , la tripeptidil peptidasa . ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Se han determinado estructuras para varios miembros de la familia de la subtilisina mostrando que las subtilisinas explotan la misma tríada catalítica que las quimotripsinas aunque los residuos aparecen en un orden diferente (His/Asp/Ser en la quimotripsina y Asp/His/Ser en la subtilisina); por lo demás, las estructuras no muestran similitud con otras proteínas. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Algunas subtilisinas son proteínas mosaico , mientras que otras contienen extensiones N- y C-terminales que no muestran similitud de secuencia con ninguna otra proteína conocida. ^{[ 3 ]} Basándose en la homología de secuencia , se ha propuesto una subdivisión en seis familias. ^{[ 2 ]}

Las endopeptidasas de procesamiento de proproteínas kexina , furina y enzimas relacionadas forman una subfamilia distinta conocida como la subfamilia de kexina (S8B). Estas escinden preferentemente en el extremo C-terminal a aminoácidos básicos apareados. Los miembros de esta subfamilia se pueden identificar por motivos sutilmente diferentes alrededor del sitio activo. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Los miembros de la familia de kexina, junto con las endopeptidasas R, T y K de la levadura Tritirachium y la peptidasa degradadora de cutícula de Metarhizium, requieren activación de tiol. Esto puede atribuirse a la presencia de Cys-173 cerca de la histidina activa. ^{[ 4 ]} Solo se conoce un miembro viral de la familia de la subtilisina, una proteasa de 56 kDa del virus del herpes 1, que infecta al bagre de canal. ^{[ 3 ]}

Las sedolisinas (serina-carboxil peptidasas) son enzimas proteolíticas cuyo plegamiento se asemeja al de la subtilisina; sin embargo, son considerablemente más grandes, con dominios catalíticos maduros que contienen aproximadamente 375 aminoácidos. Las características distintivas de estas enzimas son una tríada catalítica única, Ser/Glu/Asp, así como la presencia de un residuo de ácido aspártico en el sitio del oxianión. Se han resuelto estructuras cristalinas de alta resolución para la sedolisina de Pseudomonas sp. 101, así como para la kumamolisina de la bacteria termófila Bacillus novo sp. MN-32. Las mutaciones en el gen humano provocan una enfermedad neurodegenerativa fatal. ^{[ 5 ]}

Proteínas humanas que contienen este dominio

FURIN ; MBTPS1 ; PCSK1 ; PCSK2 ; PCSK4 ; PCSK5 ; PCSK6 ; PCSK7 ; PCSK9 ; TPP2 ;

Referencias

↑ Bode W, Papamokos E, Musil D (agosto de 1987). "La estructura cristalina de rayos X de alta resolución del complejo formado entre la subtilisina Carlsberg y la eglina c, un inhibidor de la elastasa de la sanguijuela Hirudo medicinalis. Análisis estructural, estructura de la subtilisina y geometría de la interfaz" . Eur. J. Biochem . 166 (3): 673–92 . doi : 10.1111/j.1432-1033.1987.tb13566.x . PMID 3301348 .
1 2 Siezen RJ, Leunissen JA (1997). "Subtilasas: la superfamilia de serina proteasas similares a la subtilisina" . Protein Sci . 6 (3): 501– 523. doi : 10.1002/pro.5560060301 . PMC 2143677. PMID 9070434 .
1 2 3 4 5 6 Rawlings ND, Barrett AJ (1994). "Familias de peptidasas de serina". Enzimas proteolíticas: peptidasas de serina y cisteína . Métodos en enzimología. Vol. 244. págs. 19–61 . doi : 10.1016/0076-6879(94)44004-2 . ISBN 9780121821456. PMC 7133253 . PMID 7845208 .
1 2 3 4 Rawlings ND, Barrett AJ (1993). "Familias evolutivas de peptidasas" . Biochem. J. 290 ( Pt 1): 205–218 . doi : 10.1042/ bj2900205 . PMC 1132403. PMID 8439290 .
↑ Wlodawer A, Oda K, Li M, Gustchina A, Dunn BM, Oyama H (2003). "Propiedades estructurales y enzimáticas de la familia de sedolisinas de peptidasas de serina-carboxilo" . Acta Biochim. Pol . 50 (1): 81– 102. doi : 10.18388/abp.2003_3716 . PMID 12673349 .