Hispanopedia Wiki
Articulo de referencia

proteína de la espícula del coronavirus

La glicoproteína Spike (S) (a veces también llamada proteína Spike , [ 2 ] anteriormente conocida como E2 [ 3 ] ) es la más grande de las cuatro principales proteínas estructura...

Hispanopedia WikiContenido en espanolLectura gratuita

La glicoproteína Spike (S) (a veces también llamada proteína Spike , [ 2 ] anteriormente conocida como E2 [ 3 ] ) es la más grande de las cuatro principales proteínas estructurales que se encuentran en los coronavirus . [ 4 ] La proteína Spike se ensambla en trímeros que forman grandes estructuras, llamadas espículas o peplómeros , [ 3 ] que se proyectan desde la superficie del virión . [ 4 ] [ 5 ] La apariencia distintiva de estas espículas cuando se visualizan mediante microscopía electrónica de transmisión con tinción negativa , "que recuerda a la corona solar ", [ 6 ] da a la familia de virus su nombre principal. [ 2 ]

La función de la glicoproteína de la espícula es mediar la entrada del virus en la célula huésped mediante la interacción con moléculas de la superficie celular externa y la posterior fusión de las membranas viral y celular . La glicoproteína de la espícula es una proteína de fusión de clase I que contiene dos regiones, conocidas como S1 y S2, responsables de estas dos funciones. La región S1 contiene el dominio de unión al receptor que se une a los receptores de la superficie celular. Los coronavirus utilizan una amplia gama de receptores; HCoV-NL63 , SARS-CoV (que causa el SARS ) y SARS-CoV-2 (que causa la COVID-19 ) interactúan con la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2). La región S2 contiene el péptido de fusión y otra infraestructura de fusión necesaria para la fusión de la membrana con la célula huésped, un paso esencial para la infección y la replicación viral . La glicoproteína de la espícula determina el rango de huéspedes del virus (qué organismos puede infectar) y el tropismo celular (qué células o tejidos puede infectar dentro de un organismo). [ 4 ] [ 5 ] [ 7 ] [ 8 ]

La glicoproteína de la espícula es altamente inmunogénica . Se han encontrado anticuerpos contra la glicoproteína de la espícula en pacientes recuperados de SARS y COVID-19. Los anticuerpos neutralizantes se dirigen a epítopos en el dominio de unión al receptor. [ 9 ] La mayoría de los esfuerzos de desarrollo de vacunas contra la COVID-19 en respuesta a la pandemia de COVID-19 tienen como objetivo activar el sistema inmunitario contra la proteína de la espícula. [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ]

Estructura

Glicoproteína Spike del SARS-CoV-2. PDB : 6VSB . Solo se resalta un monómero. La proteína completa es un homotrímero. El resto del trímero se muestra como una superficie gris. No se muestran partes de la estructura real. A continuación se enumeran los elementos desde el extremo N-terminal (letra N) hasta el extremo C-terminal (C): dominio N-terminal (azul), dominio de unión al receptor ACE2 (magenta), estructura general (cian), hélice central (naranja, orientada hacia el interior del homotrímero) y dominio conector (púrpura, que ancla la proteína Spike a la envoltura lipídica del virus). Amarillo: enlaces disulfuro. Rojo: carbohidratos. Bloque gris: membrana lipídica del virus.

La proteína de la espícula es muy grande, a menudo de 1200 a 1400 residuos de aminoácidos ; [ 8 ] tiene 1273 residuos en el SARS-CoV-2 . [ 5 ] Es una proteína transmembrana de un solo paso con una cola C-terminal corta en el interior del virus, una hélice transmembrana y un gran ectodominio N-terminal expuesto en el exterior del virus. [ 5 ] [ 7 ]

La glicoproteína Spike forma homotrímeros en los que tres copias de la proteína interactúan a través de sus ectodominios. [ 5 ] [ 7 ] Las estructuras del trímero se han descrito como de forma de pera o de pétalo. [ 3 ] Cada proteína Spike contiene dos regiones conocidas como S1 y S2, y en el trímero ensamblado, las regiones S1 en el extremo N-terminal forman la porción de la proteína más alejada de la superficie viral, mientras que las regiones S2 forman un "tallo" flexible que contiene la mayoría de las interacciones proteína-proteína que mantienen el trímero en su lugar. [ 7 ] Tanto las regiones S1 como S2 están involucradas en la unión al receptor ACE2 y la fusión entre la envoltura viral y la membrana de la célula huésped. [ 13 ] [ 14 ]

S1

La región S1 de la glicoproteína de la espícula es responsable de interactuar con moléculas receptoras en la superficie de la célula huésped en el primer paso de la entrada viral . [ 4 ] [ 7 ] S1 contiene dos dominios , llamados dominio N-terminal (NTD) y dominio C-terminal (CTD), [ 2 ] [ 7 ] a veces también conocidos como dominios A y B. [ 15 ] Dependiendo del coronavirus, uno o ambos dominios pueden usarse como dominios de unión al receptor (RBD). Los receptores objetivo pueden ser muy diversos, incluyendo proteínas receptoras de la superficie celular y azúcares como los ácidos siálicos como receptores o correceptores. [ 2 ] [ 7 ] En general, el NTD se une a moléculas de azúcar mientras que el CTD se une a proteínas, con la excepción del virus de la hepatitis del ratón que usa su NTD para interactuar con un receptor de proteína llamado CEACAM1 . [ 7 ] El NTD tiene un plegamiento de proteína similar a la galectina , pero se une a las moléculas de azúcar de manera algo diferente a las galectinas. [ 7 ] La unión observada del ácido N-acetilneuramínico por el NTD [ 16 ] y la pérdida de dicha unión mediante mutación del bolsillo de unión de azúcar correspondiente en variantes emergentes de interés ha sugerido un papel potencial para la unión transitoria de azúcar en la zoonosis del SARS-CoV-2, en consonancia con propuestas evolutivas previas. [ 17 ]

El CTD es responsable de las interacciones del MERS-CoV con su receptor dipeptidil peptidasa-4 , [ 7 ] y de las del SARS-CoV [ 7 ] y el SARS-CoV-2 [ 5 ] con su receptor enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2). El CTD de estos virus se puede dividir en dos subdominios, conocidos como núcleo y bucle extendido o motivo de unión al receptor (RBM), donde se localiza la mayoría de los residuos que contactan directamente con el receptor diana. [ 5 ] [ 7 ] Existen diferencias sutiles, principalmente en el RBM, entre las interacciones de las proteínas espiga del SARS-CoV y del SARS-CoV-2 con la ACE2. [ 5 ] Las comparaciones de las proteínas espiga de múltiples coronavirus sugieren que la divergencia en la región RBM puede explicar las diferencias en los receptores diana, incluso cuando el núcleo del CTD S1 es estructuralmente muy similar. [ 7 ]

Dentro de los linajes de coronavirus, así como en los cuatro subgrupos principales de coronavirus, la región S1 está menos conservada que la S2, como corresponde a su función de interacción con los receptores de células huésped específicos del virus. [ 4 ] [ 5 ] [ 7 ] Dentro de la región S1, el NTD está más conservado que el CTD. [ 7 ]

S2

La región S2 de la glicoproteína de la espícula es responsable de la fusión de la membrana entre la envoltura viral y la célula huésped , lo que permite la entrada del genoma del virus en la célula. [ 5 ] [ 7 ] [ 8 ] La región S2 contiene el péptido de fusión , un segmento de aminoácidos mayoritariamente hidrofóbicos cuya función es entrar y desestabilizar la membrana de la célula huésped. [ 5 ] [ 8 ] S2 también contiene dos subdominios de repetición de heptapéptidos conocidos como HR1 y HR2, a veces llamados la región del "núcleo de fusión". [ 5 ] Estos subdominios experimentan cambios conformacionales drásticos durante el proceso de fusión para formar un haz de seis hélices , una característica de las proteínas de fusión de clase I. [ 5 ] [ 8 ] También se considera que la región S2 incluye la hélice transmembrana y la cola C-terminal ubicadas en el interior del virión. [ 5 ]

En relación con S1, la región S2 está muy bien conservada entre los coronavirus. [ 5 ] [ 7 ]

Modificaciones postraduccionales

Proteína Spike ilustrada con y sin glicosilación . [ 18 ] [ 19 ]

La glicoproteína Spike está fuertemente glicosilada mediante glicosilación N-ligada . [ 4 ] Estudios de la proteína Spike del SARS-CoV-2 también han reportado glicosilación O-ligada en la región S1. [ 20 ] La cola C-terminal, ubicada en el interior del virión, está enriquecida en residuos de cisteína y está palmitoilada . [ 5 ] [ 21 ]

Las proteínas Spike se activan mediante escisión proteolítica . Son escindidas por proteasas de la célula huésped en el límite S1-S2 y posteriormente en lo que se conoce como el sitio S2' en el extremo N-terminal del péptido de fusión. [ 4 ] [ 5 ] [ 7 ] [ 8 ] Esta escisión puede ocurrir tras la unión al receptor, o la proteína Spike puede ser pre-escindida, por ejemplo, por Furina en un sitio de escisión de furina si está presente.

Cambio conformacional

Al igual que otras proteínas de fusión de clase I , la proteína de la espícula experimenta un cambio conformacional muy grande durante el proceso de fusión. [ 4 ] [ 5 ] [ 7 ] [ 8 ] Tanto los estados de prefusión como de postfusión de varios coronavirus, especialmente el SARS-CoV-2 , se han estudiado mediante criomicroscopía electrónica . [ 5 ] [ 22 ] [ 23 ] [ 24 ] También se han observado dinámicas proteicas funcionalmente importantes dentro del estado de prefusión, en el que las orientaciones relativas de algunas de las regiones S1 con respecto a S2 en un trímero pueden variar. En el estado cerrado, las tres regiones S1 están empaquetadas de forma compacta y la región que hace contacto con los receptores de la célula huésped es estéricamente inaccesible, mientras que los estados abiertos tienen uno o dos RBD S1 más accesibles para la unión al receptor, en una conformación abierta o "hacia arriba". [ 5 ]

Micrografía electrónica de transmisión de un virión del SARS-CoV-2 , que muestra la apariencia característica de "corona" con las proteínas de la espícula (verdes) formando proyecciones prominentes desde la superficie del virión (amarillo).

Expresión y localización

El gen que codifica la proteína de la espícula se encuentra hacia el extremo 3' del genoma de ARN de sentido positivo del virus, junto con los genes de las otras tres proteínas estructurales y varias proteínas accesorias específicas del virus . [ 4 ] [ 5 ] El tráfico de proteínas de la espícula parece depender del subgrupo de coronavirus: cuando se expresan de forma aislada sin otras proteínas virales, las proteínas de la espícula de los betacoronavirus pueden llegar a la superficie celular , mientras que las de los alfacoronavirus y gammacoronavirus se retienen intracelularmente. En presencia de la proteína M , el tráfico de la proteína de la espícula se altera y, en cambio, se retiene en el ERGIC , el sitio donde ocurre el ensamblaje viral. [ 21 ] En el SARS-CoV-2 , tanto la proteína M como la proteína E modulan el tráfico de la proteína de la espícula a través de diferentes mecanismos. [ 25 ]

Ilustración de un virión de coronavirus en la mucosa respiratoria , que muestra las posiciones de las cuatro proteínas estructurales y los componentes del entorno extracelular. [ 26 ]

La proteína de la espícula no es necesaria para el ensamblaje viral ni para la formación de partículas similares a virus ; [ 21 ] sin embargo, la presencia de la espícula puede influir en el tamaño de la envoltura. [ 27 ] La incorporación de la proteína de la espícula en los viriones durante el ensamblaje y la gemación depende de las interacciones proteína-proteína con la proteína M a través de la cola C-terminal. [ 21 ] [ 25 ] El examen de los viriones mediante criomicroscopía electrónica sugiere que hay aproximadamente de 25 [ 28 ] a 100 trímeros de espícula por virión. [ 23 ] [ 27 ]

Función

La proteína de la espícula es responsable de la entrada del virus en la célula huésped , un paso inicial necesario en la replicación viral . Es esencial para la replicación. [ 2 ] Realiza esta función en dos pasos: primero, se une a un receptor en la superficie de la célula huésped mediante interacciones con la región S1, y luego fusiona las membranas viral y celular mediante la acción de la región S2. [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] La ubicación de la fusión varía según el coronavirus específico; algunos pueden entrar por la membrana plasmática y otros lo hacen desde los endosomas después de la endocitosis . [ 8 ]

Adjunto

La interacción del dominio de unión al receptor en la región S1 con su receptor diana en la superficie celular inicia el proceso de entrada viral. Diferentes coronavirus se dirigen a diferentes receptores de la superficie celular, a veces utilizando moléculas de azúcar como los ácidos siálicos , o formando interacciones proteína-proteína con proteínas expuestas en la superficie celular. [ 7 ] [ 9 ] Diferentes coronavirus varían ampliamente en su receptor diana, aunque algunos como el SARS-CoV-1 y el HCoV-NL63 utilizan el mismo receptor a pesar de tener proteínas de espícula muy divergentes (21% de identidad de aminoácidos, y solo 14% en el RBD ). [ 29 ] La presencia de un receptor diana al que S1 puede unirse es un determinante del rango de huéspedes y el tropismo celular . [ 7 ] [ 9 ] [ 30 ] La albúmina sérica humana se une a la región S1, compitiendo con ACE2 y, por lo tanto, restringiendo la entrada viral en las células. [ 31 ]

Escisión proteolítica

La escisión proteolítica de la proteína de la espícula, a veces conocida como "cebado", es necesaria para la fusión de membranas. En relación con otras proteínas de fusión de clase I, este proceso es complejo y requiere dos escisiones en sitios diferentes, una en el límite S1/S2 y otra en el sitio S2' para liberar el péptido de fusión . [ 5 ] [ 7 ] [ 9 ] Los coronavirus varían en qué parte del ciclo de vida viral ocurren estas escisiones, particularmente la escisión S1/S2. Muchos coronavirus son escindidos en S1/S2 antes de la salida viral de la célula productora del virus, por furina y otras proproteína convertasas ; [ 7 ] en el SARS-CoV-2 hay un sitio de escisión de furina polibásico presente en esta posición. [ 5 ] [ 9 ] Otros pueden ser escindidos por proteasas extracelulares como la elastasa , por proteasas ubicadas en la superficie celular después de la unión al receptor, o por proteasas encontradas en los lisosomas después de la endocitosis . [ 7 ] Las proteasas específicas responsables de esta escisión dependen del virus, el tipo de célula y el entorno local. [ 8 ] En el SARS-CoV , la serina proteasa TMPRSS2 es importante para este proceso, con contribuciones adicionales de las cisteína proteasas catepsina B y catepsina L en los endosomas. [ 8 ] [ 9 ] [ 38 ] También se ha informado que la tripsina y las proteasas similares a la tripsina contribuyen. [ 8 ] En el SARS-CoV-2 , TMPRSS2 es la proteasa principal para la escisión S2', y se informa que su presencia es esencial para la infección viral, [ 5 ] [ 9 ] siendo la proteasa catepsina L funcional, pero no esencial. [ 38 ]

Fusión de membranas

Comparación de las conformaciones de prefusión (naranja, azul claro) y postfusión (rojo, azul oscuro) del trímero de la proteína espiga del SARS-CoV. En la conformación de prefusión, la hélice central (naranja) y la repetición heptamérica 1 (HR1, azul claro) se pliegan una sobre la otra en una orientación antiparalela. En la conformación de postfusión, la hélice central (rojo) y la secuencia HR1 (azul oscuro) se reorganizan para formar una hélice enrollada trimérica extendida. La membrana viral se encuentra en la parte inferior y la membrana de la célula huésped en la parte superior. Solo se muestran porciones clave de la subunidad S2. De PDB : 6NB6 ( prefusión) [ 39 ] y PDB : 6M3W ( postfusión). [ 40 ]

Al igual que otras proteínas de fusión de clase I , la proteína de la espícula en su conformación de prefusión se encuentra en un estado metaestable . [ 7 ] Se desencadena un cambio conformacional drástico para inducir que las repeticiones de heptapéptidos en la región S2 se replieguen en un haz extendido de seis hélices , lo que provoca que el péptido de fusión interactúe con la membrana celular y acerque las membranas viral y celular. [ 5 ] [ 7 ] Se requiere la unión al receptor y la escisión proteolítica (a veces conocida como "cebado"), pero los desencadenantes adicionales para este cambio conformacional varían según el coronavirus y el entorno local. [ 41 ] Los estudios in vitro del SARS-CoV sugieren una dependencia de la concentración de calcio . [ 8 ] Inusualmente para los coronavirus, el virus de la bronquitis infecciosa , que infecta a las aves, puede ser desencadenado solo por un pH bajo ; para otros coronavirus, el pH bajo no es en sí mismo un desencadenante, pero puede ser necesario para la actividad de las proteasas, que a su vez son necesarias para la fusión. [ 8 ] [ 41 ] La ubicación de la fusión de membranas —en la membrana plasmática o en los endosomas— puede variar según la disponibilidad de estos desencadenantes del cambio conformacional. [ 41 ] La fusión de las membranas virales y celulares permite la entrada del genoma de ARN de sentido positivo del virus en el citosol de la célula huésped , después de lo cual comienza la expresión de las proteínas virales. [ 2 ] [ 4 ] [ 9 ]

Además de la fusión de las membranas virales y de las células huésped, algunas proteínas de la espícula del coronavirus pueden iniciar la fusión de membranas entre células infectadas y células vecinas, formando sincitios . [ 42 ] Este comportamiento puede observarse en células infectadas en cultivos celulares . [ 43 ] Se han observado sincitios en muestras de tejido de pacientes con infecciones por SARS-CoV , MERS-CoV y SARS-CoV-2 , [ 43 ] aunque algunos informes destacan una diferencia en la formación de sincitios entre las espículas del SARS-CoV y del SARS-CoV-2 atribuida a diferencias de secuencia cerca del sitio de escisión S1/S2. [ 44 ] [ 45 ] [ 46 ]

Inmunogenicidad

Debido a que está expuesta en la superficie del virus, la proteína de la espícula es un antígeno principal contra el cual se desarrollan anticuerpos neutralizantes . [ 2 ] [ 9 ] [ 47 ] [ 48 ] Su extensa glicosilación puede servir como un escudo de glicanos que oculta epítopos del sistema inmunitario . [ 9 ] [ 19 ] Debido al brote de SARS y la pandemia de COVID-19 , los anticuerpos contra las proteínas de la espícula del SARS-CoV y del SARS-CoV-2 han sido estudiados extensamente. [ 47 ] Se han identificado anticuerpos contra las proteínas de la espícula del SARS-CoV y del SARS-CoV-2 que se dirigen a epítopos en el dominio de unión al receptor [ 9 ] [ 47 ] [ 49 ] o interfieren con el proceso de cambio conformacional. [ 9 ] La mayoría de los anticuerpos de individuos infectados se dirigen al dominio de unión al receptor. [ 47 ] [ 50 ] [ 51 ] También se ha informado que los anticuerpos dirigidos a la subunidad S2 de la proteína de la espícula son eficaces contra múltiples variantes del SARS-CoV2. [ 52 ]

respuesta ante el COVID-19

Vacunas

En respuesta a la pandemia de COVID-19 , se han desarrollado varias vacunas contra la COVID-19 utilizando diversas tecnologías, incluidas vacunas de ARNm y vacunas de vectores virales . La mayoría del desarrollo de vacunas se ha centrado en la proteína de la espícula. [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] Basándose en técnicas utilizadas previamente en la investigación de vacunas dirigidas al virus sincitial respiratorio y al SARS-CoV , muchos esfuerzos de desarrollo de vacunas contra el SARS-CoV-2 han utilizado construcciones que incluyen mutaciones para estabilizar la conformación de prefusión de la proteína de la espícula, facilitando el desarrollo de anticuerpos contra epítopos expuestos en esta conformación. [ 53 ] [ 54 ]

Anticuerpos monoclonales

Casirivimab (azul) e imdevimab (naranja) interactuando con el dominio de unión al receptor de la proteína de la espícula (rosa). [ 55 ] [ 56 ]

Se han desarrollado anticuerpos monoclonales que se dirigen al dominio de unión al receptor de la proteína de la espícula como tratamientos para la COVID-19 . Al 8 de julio de 2021, tres productos de anticuerpos monoclonales habían recibido la Autorización de Uso de Emergencia en los Estados Unidos: [ 57 ] bamlanivimab/etesevimab , [ 58 ] [ 59 ] casirivimab/imdevimab , [ 60 ] y sotrovimab . [ 61 ] Bamlanivimab/etesevimab no fue recomendado en los Estados Unidos debido al aumento de variantes del SARS-CoV-2 que son menos susceptibles a estos anticuerpos. [ 57 ]

Variantes del SARS-CoV-2

Durante la pandemia de COVID-19 , el genoma de los virus SARS-CoV-2 se secuenció muchas veces, lo que permitió identificar miles de variantes distintas . [ 62 ] Muchas de estas poseen mutaciones que cambian la secuencia de aminoácidos de la proteína de la espícula. En un análisis de la Organización Mundial de la Salud de julio de 2020, el gen de la espícula ( S ) fue el segundo más frecuentemente mutado en el genoma, después de ORF1ab (que codifica la mayoría de las proteínas no estructurales del virus ). [ 62 ] La tasa de evolución en el gen de la espícula es mayor que la observada en el genoma en general. [ 63 ] Los análisis de los genomas del SARS-CoV-2 sugieren que algunos sitios en la secuencia de la proteína de la espícula, particularmente en el dominio de unión al receptor, son de importancia evolutiva [ 64 ] y están experimentando selección positiva . [ 50 ] [ 65 ]

Las mutaciones de la proteína Spike generan preocupación porque pueden afectar la infectividad o la transmisibilidad , o facilitar el escape inmunitario . [ 50 ] La mutación D 614 G ha surgido de forma independiente en múltiples linajes virales y se ha vuelto dominante entre los genomas secuenciados; [ 66 ] [ 67 ] puede tener ventajas en la infectividad y la transmisibilidad [ 50 ] posiblemente debido a que aumenta la densidad de espículas en la superficie viral, [ 68 ] aumenta la proporción de conformaciones competentes para la unión o mejora la estabilidad, [ 69 ] pero no afecta a las vacunas. [ 70 ] La mutación N501Y es común a las variantes Alfa, Beta, Gamma y Ómicron del SARS-CoV-2 y ha contribuido a una mayor infección y transmisión, [ 71 ] una menor eficacia de la vacuna, [ 72 ] y la capacidad del SARS-CoV-2 para infectar nuevas especies de roedores. [ 73 ] N501Y aumenta la afinidad de la proteína espiga por la ACE2 humana en aproximadamente 10 veces, [ 74 ] lo que podría subyacer a algunas de las ventajas de aptitud conferidas por esta mutación, aunque la relación entre afinidad e infectividad es compleja. [ 75 ] La mutación P681R altera el sitio de escisión de la furina y ha sido responsable del aumento de la infectividad, la transmisión y el impacto global de la variante delta del SARS-CoV-2 . [ 76 ] [ 77 ] Las mutaciones en la posición E 484, en particular E 484 K , se han asociado con el escape inmunitario y la reducción de la unión de anticuerpos . [ 50 ] [ 63 ]

La variante ómicron del SARS-CoV-2 se caracteriza por tener un número inusualmente alto de mutaciones en la proteína de la espícula. [ 78 ] La mutación 69–70del (Δ69-70) del gen de la espícula (gen S) del SARS-CoV-2 provoca que una sonda de prueba de PCR TaqPath no se una a su diana del gen S, lo que da lugar a un fallo de la diana del gen S (SGTF) en muestras positivas para SARS-CoV-2. Este efecto se utilizó como marcador para monitorizar la propagación de la variante alfa [ 79 ] [ 80 ] y la variante ómicron . [ 81 ]

Desinformación

Durante la pandemia de COVID-19 , circuló en redes sociales desinformación antivacunas sobre la COVID-19 relacionada con el papel de la proteína de la espícula en las vacunas contra la COVID-19 . Se afirmaba que las proteínas de la espícula eran peligrosamente " citotóxicas " y que, por lo tanto, las vacunas de ARNm que las contenían eran peligrosas en sí mismas. Las proteínas de la espícula no son citotóxicas ni peligrosas. [ 82 ] [ 83 ] También se decía que las personas vacunadas "liberaban" proteínas de la espícula, en una alusión errónea al fenómeno de la liberación viral inducida por la vacuna , que es un efecto poco frecuente de las vacunas de virus vivos, a diferencia de las utilizadas para la COVID-19. La "liberación" de proteínas de la espícula no es posible. [ 84 ] [ 85 ]

Evolución, conservación y recombinación

Se cree que las proteínas de fusión de clase I , un grupo cuyos ejemplos bien caracterizados incluyen la proteína de la espícula del coronavirus, la hemaglutinina del virus de la influenza y la Gp41 del VIH , están relacionadas evolutivamente. [ 7 ] [ 86 ] La región S2 de la proteína de la espícula responsable de la fusión de membranas está más conservada que la región S1 responsable de las interacciones con el receptor. [ 4 ] [ 5 ] [ 7 ] La región S1 parece haber experimentado una selección diversificadora significativa . [ 87 ]

Dentro de la región S1, el dominio N-terminal (NTD) está más conservado que el dominio C-terminal (CTD). [ 7 ] El plegamiento proteico tipo galectina del NTD sugiere una relación con proteínas celulares estructuralmente similares de las cuales puede haber evolucionado a través de la captura de genes del huésped. [ 7 ] Se ha sugerido que el CTD puede haber evolucionado a partir del NTD por duplicación génica . [ 7 ] La posición expuesta en la superficie del CTD, vulnerable al sistema inmunitario del huésped , puede colocar esta región bajo una alta presión selectiva . [ 7 ] Las comparaciones de las estructuras de diferentes CTD de coronavirus sugieren que pueden estar bajo selección diversificadora [ 88 ] y, en algunos casos, los coronavirus distantemente relacionados que utilizan el mismo receptor de superficie celular pueden hacerlo a través de evolución convergente . [ 15 ]

Referencias

  1. ↑ Solodovnikov, Alexey; Arkhipova, Valeria (29 de julio de 2021). "Достоверно красиво: как мы сделали 3D-modelь SARS-CoV-2" [ Verdaderamente hermoso: cómo hicimos el modelo 3D del SARS-CoV-2 ] (en ruso). N+1 . Archivado desde el original el 30 de julio de 2021 . Consultado el 30 de julio de 2021 .
  2. 1 2 3 4 5 6 7 Deng, X.; Baker, SC (2021). "Coronavirus: Biología molecular (Coronaviridae)". Enciclopedia de virología . págs. 198–207 . doi : 10.1016/B978-0-12-814515-9.02550-9 . ISBN  978-0-12-814516-6. PMC 7917440 . 
  3. 1 2 3 Masters, Paul S. (2006). "La biología molecular de los coronavirus" . Advances in Virus Research . 66 : 193–292 . doi : 10.1016/S0065-3527(06)66005-3 . ISBN 978-0-12-039869-0. PMC 7112330 . PMID 16877062 .  
  4. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 Wang , Yuhang ; Grunewald , Matthew ; Perlman, Stanley (2020). "Coronavirus: Una visión general actualizada de su replicación y patogénesis". Coronaviruses . Methods in Molecular Biology. Vol. 2203. pp. 1–29 . doi : 10.1007/978-1-0716-0900-2_1 . ISBN   978-1-07-160899-9. PMC 7682345 . PMID 32833200 .  
  5. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 Zhu, Chaogeng; Él, Guiyun; Yin, Qinqin; Zeng, Lin; Sí, Xiangli; Shi, Yongzhong; Xu, Wei (14 de junio de 2021). "Biología molecular de la proteína de pico SARs-CoV-2: una revisión del conocimiento actual" . Revista de Virología Médica . 93 (10): 5729– 5741. doi : 10.1002/jmv.27132 . PMC 8427004 . PMID 34125455 .  
  6. ↑ "Virología: Coronavirus" . Nature . 220 (5168): 650. Noviembre de 1968. Bibcode : 1968Natur.220..650. . doi : 10.1038/220650b0 . PMC 7086490 . 
  7. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 Li, Fang (29 de septiembre de 2016). "Estructura, función y evolución de las proteínas de la espícula del coronavirus" . Annual Review of Virology . 3 (1): 237– 261. doi : 10.1146/annurev-virology-110615-042301 . PMC 5457962. PMID 27578435 .  
  8. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 Millet, Jean Kaoru; Whittaker, Gary R. (abril de 2018). "Desencadenantes fisiológicos y moleculares para la fusión de la membrana del SARS-CoV y la entrada en las células huésped" . Virology . 517 : 3–8 . doi : 10.1016/j.virol.2017.12.015 . PMC 7112017. PMID 29275820 .  
  9. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 V'kovski, Philip; Kratzel, Annika; Steiner, Silvio; Stalder, Hanspeter; Thiel, Volker (marzo de 2021). " Biología y replicación del coronavirus: implicaciones para el SARS-CoV-2" . Nature Reviews Microbiology . 19 (3): 155– 170. doi : 10.1038/s41579-020-00468-6 . PMC 7592455. PMID 33116300 .  
  10. 1 2 Flanagan, Katie L.; Best, Emma; Crawford, Nigel W.; Giles, Michelle; Koirala, Archana; Macartney, Kristine; Russell, Fiona; Teh, Benjamin W.; Wen, Sophie CH (2 de octubre de 2020). "Progreso y dificultades en la búsqueda de vacunas eficaces contra el SARS-CoV-2 (COVID-19)" . Frontiers in Immunology . 11 579250. doi : 10.3389/fimmu.2020.579250 . hdl : 11343/251733 . PMC 7566192. PMID 33123165 .  
  11. 1 2 Le, Tung Thanh; Cramer, Jakob P.; Chen, Robert; Mayhew, Stephen (octubre de 2020). "Evolución del panorama del desarrollo de la vacuna contra la COVID-19" . Nature Reviews Drug Discovery . 19 (10): 667– 668. doi : 10.1038/d41573-020-00151-8 . PMID 32887942. S2CID 221503034 .  
  12. 12Kyriakidis, Nikolaos C.; López-Cortés, Andrés; González, Eduardo Vásconez; Grimaldos, Alejandra Barreto; Prado, Esteban Ortiz (December 2021). "SARS-CoV-2 vaccines strategies: a comprehensive review of phase 3 candidates". npj Vaccines. 6 (1): 28. doi:10.1038/s41541-021-00292-w. PMC 7900244. PMID 33619260.
  13. ↑Lavie, Muriel; Dubuisson, Jean; Belouzard, Sandrine (13 July 2022). "SARS-CoV-2 Spike Furin Cleavage Site and S2' Basic Residues Modulate the Entry Process in a Host Cell-Dependent Manner". Journal of Virology. 96 (13): e0047422. doi:10.1128/jvi.00474-22. ISSN 1098-5514. PMC 9278140. PMID 35678602.
  14. ↑Lan, Jun; Ge, Jiwan; Yu, Jinfang; Shan, Sisi; Zhou, Huan; Fan, Shilong; Zhang, Qi; Shi, Xuanling; Wang, Qisheng; Zhang, Linqi; Wang, Xinquan (May 2020). "Structure of the SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain bound to the ACE2 receptor". Nature. 581 (7807): 215–220. Bibcode:2020Natur.581..215L. doi:10.1038/s41586-020-2180-5. ISSN 1476-4687. PMID 32225176.
  15. 12Hulswit, R.J.G.; de Haan, C.A.M.; Bosch, B.-J. (2016). "Coronavirus Spike Protein and Tropism Changes". Advances in Virus Research. 96: 29–57. doi:10.1016/bs.aivir.2016.08.004. ISBN 978-0-12-804736-1. PMC 7112277. PMID 27712627.
  16. 12Buchanan, Charles J.; Gaunt, Ben; Harrison, Peter J.; Yang, Yun; Liu, Jiwei; Khan, Aziz; Giltrap, Andrew M.; Le Bas, Audrey; Ward, Philip N.; Gupta, Kapil; Dumoux, Maud; Tan, Tiong Kit; Schimaski, Lisa; Daga, Sergio; Picchiotti, Nicola (2022). "Pathogen-sugar interactions revealed by universal saturation transfer analysis". Science. 377 (6604) eabm3125. doi:10.1126/science.abm3125. hdl:1983/355cbd8f-c424-4cc0-adb2-881c04ab3bf0. ISSN 0036-8075. PMID 35737812.
  17. ↑ Rossmann, MG (1989). "La hipótesis del cañón" . Journal of Biological Chemistry . 264 (25): 14587– 14590. doi : 10.1016/s0021-9258(18)63732-9 . ISSN 0021-9258 . 
  18. ↑ Zimmer, Carl (9 de octubre de 2020). "El coronavirus al descubierto" . The New York Times . Consultado el 12 de agosto de 2021 .
  19. 1 2 Casalino, Lorenzo; Gaieb, Zied; Goldsmith, Jory A.; Hjorth, Christy K.; Dommer, Abigail C.; Harbison, Aoife M.; Fogarty, Carl A.; Barros, Emilia P.; Taylor, Bryn C.; McLellan, Jason S.; Fadda, Elisa; Amaro, Rommie E. (28 de octubre de 2020). "Más allá del blindaje: los roles de los glicanos en la proteína Spike del SARS-CoV-2" . ACS Central Science . 6 (10): 1722– 1734. Bibcode : 2020ACSCS...6.1722C . doi : 10.1021/acscentsci.0c01056 . PMC 7523240. PMID 33140034 .  
  20. ↑ Shajahan, Asif; Supekar, Nitin T; Gleinich, Anne S; Azadi, Parastoo (9 de diciembre de 2020). "Deducción del perfil de N- y O-glicosilación de la proteína de la espícula del nuevo coronavirus SARS-CoV-2" . Glycobiology . 30 (12): 981– 988. doi : 10.1093/glycob/cwaa042 . PMC 7239183. PMID 32363391 .  
  21. 1 2 3 4 Ujike, Makoto; Taguchi, Fumihiro (3 de abril de 2015). "Incorporación de glicoproteínas de espícula y membrana en viriones de coronavirus" . Viruses . 7 ( 4): 1700– 1725. doi : 10.3390/v7041700 . PMC 4411675. PMID 25855243 .  
  22. ↑ Walls, Alexandra C.; Park, Young-Jun; Tortorici, M. Alejandra; Wall, Abigail; McGuire, Andrew T.; Veesler, David (abril de 2020). " Estructura, función y antigenicidad de la glicoproteína Spike del SARS-CoV-2" . Cell . 181 (2): 281–292.e6. doi : 10.1016/j.cell.2020.02.058 . PMC 7102599. PMID 32155444 .  
  23. 1 2 Klein, Steffen; Cortese, Mirko; Winter, Sophie L.; Wachsmuth-Melm, Moritz; Neufeldt, Christopher J.; Cerikan, Berati; Stanifer, Megan L.; Boulant, Steeve; Bartenschlager, Ralf; Chlanda, Petr (diciembre de 2020). "Estructura y replicación del SARS-CoV-2 caracterizadas mediante tomografía crioelectrónica in situ" . Nature Communications . 11 (1): 5885. Bibcode : 2020NatCo..11.5885K . doi : 10.1038/ s41467-020-19619-7 . PMC 7676268. PMID 33208793 .  
  24. ↑ Cai, Yongfei; Zhang, Jun; Xiao, Tianshu; Peng, Hanqin; Sterling, Sarah M.; Walsh, Richard M.; Rawson, Shaun; Rits-Volloch, Sophia; Chen, Bing (25 de septiembre de 2020). "Estados conformacionales distintos de la proteína de la espícula del SARS-CoV-2" . Science . 369 (6511): 1586–1592 . Bibcode : 2020Sci ... 369.1586C . doi : 10.1126/science.abd4251 . PMC 7464562. PMID 32694201 .  
  25. 1 2 Boson, Bertrand; Legros, Vincent; Zhou, Bingjie; Siret, Eglantine; Mathieu, Cyrille; Cosset, François-Loïc; Lavillette, Dimitri; Denolly, Solène (enero de 2021). "Las proteínas de la envoltura y la membrana del SARS-CoV-2 modulan la maduración y retención de la proteína de la espícula, lo que permite el ensamblaje de partículas similares a virus" . Journal of Biological Chemistry . 296 100111. doi : 10.1074/jbc.RA120.016175 . PMC 7833635. PMID 33229438 .  
  26. ↑ Goodsell, David S.; Voigt, Maria; Zardecki, Christine; Burley, Stephen K. (6 de agosto de 2020). " Ilustración integradora para la divulgación sobre el coronavirus" . PLOS Biology . 18 (8) e3000815. doi : 10.1371/journal.pbio.3000815 . PMC 7433897. PMID 32760062 .  
  27. 1 2 Neuman, Benjamin W.; Kiss, Gabriella; Kunding, Andreas H.; Bhella, David; Baksh, M. Fazil; Connelly, Stephen; Droese, Ben; Klaus, Joseph P.; Makino, Shinji; Sawicki, Stanley G.; Siddell, Stuart G.; Stamou, Dimitrios G.; Wilson, Ian A.; Kuhn, Peter; Buchmeier, Michael J. (abril de 2011). " Análisis estructural de la proteína M en el ensamblaje y la morfología del coronavirus" . Journal of Structural Biology . 174 (1): 11– 22. doi : 10.1016/j.jsb.2010.11.021 . PMC 4486061. PMID 21130884 .  
  28. ^ Ke, Zunlong; Otón, Joaquín; Qu, Kun; Cortese, Mirko; Zila, Vojtech; McKeane, Lesley; Nakane, Takanori; Zivanov, Jasenko; Neufeldt, Christopher J.; Cerikan, Berati; Lu, Juan M.; Peukes, Julia; Xiong, Xiaoli; Kräusslich, Hans-Georg; Scheres, Sjors HW; Bartenschlager, Ralf; Briggs, John AG (17 de diciembre de 2020). "Estructuras y distribuciones de proteínas de pico del SARS-CoV-2 en viriones intactos" . Naturaleza . 588 (7838): 498– 502. Bibcode : 2020Natur.588..498K . doi : 10.1038/s41586-020-2665-2 . PMC 7116492 . PMID 32805734 .  
  29. ↑ Lin, Han-Xin; Feng, Yan; Tu, Xinming; Zhao, Xuesen; Hsieh, Chih-Heng; Griffin, Lauren; Junop, Murray; Zhang, Chengsheng (septiembre de 2011). "Caracterización de la proteína de la espícula del coronavirus humano NL63 en la unión al receptor y la entrada del virus pseudotipo" . Virus Research . 160 ( 1–2 ): 283–293 . doi : 10.1016/j.virusres.2011.06.029 . ISSN 1872-7492 . PMC 7114368. PMID 21798295 .   
  30. 1 2 Lim, Yvonne; Ng, Yan; Tam, James; Liu, Ding (25 de julio de 2016). "Coronavirus humanos: una revisión de las interacciones virus-huésped" . Diseases . 4 (3): 26. doi : 10.3390/diseases4030026 . PMC 5456285. PMID 28933406 .  
  31. ↑ Varricchio, Romualdo; De Simone, Giovanna; Vita, Gian Marco; Nocera Cariola, Walter; Viscardi, Mauricio; Brandi, Sergio; Picazio, Gerardo; Zerbato, Verena; Koncan, Raffaella; Segat, Ludovica; Di Bella, Stefano; Fusco, Giovanna; Ascenzi, Paolo; di Masi, Alessandra (2024). "La albúmina sérica humana se une a la proteína de pico y protege las células de la infección por SARS-CoV-2 modulando la vía RAS" . Aspectos de la Medicina Molecular . 3 100033. doi : 10.1016/j.amolm.2023.100033 . hdl : 11368/3066818 .
  32. ↑ Yeager, Curtis L.; Ashmun, Richard A.; Williams, Richard K.; Cardellichio, Christine B.; Shapiro, Linda H.; Look, A. Thomas; Holmes, Kathryn V. (junio de 1992). "La aminopeptidasa N humana es un receptor para el coronavirus humano 229E" . Nature . 357 ( 6377): 420– 422. Bibcode : 1992Natur.357..420Y . doi : 10.1038/357420a0 . PMC 7095410. PMID 1350662 .  
  33. ↑ Hofmann, H.; Pyrc, K.; van der Hoek, L.; Geier, M.; Berkhout, B.; Pohlmann, S. (31 de mayo de 2005). "El coronavirus humano NL63 emplea el receptor del coronavirus del síndrome respiratorio agudo grave para la entrada celular" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 102 (22): 7988– 7993. Bibcode : 2005PNAS..102.7988H . doi : 10.1073/pnas.0409465102 . PMC 1142358. PMID 15897467 .  
  34. ↑ Huang, Xingchuan; Dong, Wenjuan; Milewska, Aleksandra; Golda, Anna; Qi, Yonghe; Zhu, Quan K.; Marasco, Wayne A.; Baric, Ralph S.; Sims, Amy C.; Pyrc, Krzysztof; Li, Wenhui; Sui, Jianhua (15 de julio de 2015). "La proteína Spike del coronavirus humano HKU1 utiliza ácido siálico O-acetilado como determinante del receptor de unión y emplea la proteína hemaglutinina-esterasa como enzima destructora del receptor" . Journal of Virology . 89 (14): 7202– 7213. doi : 10.1128/JVI.00854-15 . PMC 4473545. PMID 25926653 .  
  35. ↑ Künkel, Frank; Herrler, Georg (julio de 1993). " Análisis estructural y funcional de la proteína de superficie del coronavirus humano OC43" . Virology . 195 (1): 195–202 . doi : 10.1006/viro.1993.1360 . PMC 7130786. PMID 8317096 .  
  36. ^ Raj, V. Stalin; Mou, Huihui; Smits, Saskia L.; Dekkers, Dick HW; Müller, Marcel A.; Dijkman, Ronald; Muth, Doreen; Demmers, Jeroen AA; Zaki, Ali; Fouchier, Ron AM; Thiel, Volker; Drosten, cristiano; Rottier, Peter JM; Osterhaus, Albert DME; Bosch, Berend Jan; Haagmans, Bart L. (marzo de 2013). "La dipeptidil peptidasa 4 es un receptor funcional para el emergente coronavirus humano-EMC" . Naturaleza . 495 (7440): 251– 254. Bibcode : 2013Natur.495..251R . doi : 10.1038/naturaleza12005 . PMC 7095326 . PMID 23486063 .  
  37. ^ Li, Wenhui; Moore, Michael J.; Vasilieva, Natalia; Sui, Jianhua; Wong, Swee Kee; Berna, Michael A.; Somasundaran, Mohan; Sullivan, John L.; Luzuriaga, Katherine; Greenough, Thomas C.; Choe, Hyeryun; Farzan, Michael (noviembre de 2003). "La enzima convertidora de angiotensina 2 es un receptor funcional del coronavirus del SARS" . Naturaleza . 426 (6965): 450– 454. Bibcode : 2003Natur.426..450L . doi : 10.1038/naturaleza02145 . PMC 7095016 . PMID 14647384 .  
  38. 1 2 Jackson CB, Farzan M, Chen B, Choe H (2022). "Mecanismos de entrada del SARS-CoV-2 en las células" . Nature Reviews Molecular Cell Biology . 23 (1): 3– 20. doi : 10.1038/s41580-021-00418-x . PMC 8491763. PMID 34611326 .  
  39. ^ Paredes, Alexandra C.; Xiong, Xiaoli; Park, Young-Jun; Tortorici, M. Alejandra; Snijder, Joost; Quispe, Joel; Cameroni, Elisabetta; Gopal, Robin; Dai, Mian; Lanzavecchia, Antonio; Zambon, María; Rey, Félix A.; Corti, Davide; Veesler, David (febrero de 2019). "El mimetismo funcional inesperado del receptor aclara la activación de la fusión del coronavirus" . Celúla . 176 (5): 1026–1039.e15. doi : 10.1016/j.cell.2018.12.028 . PMC 6751136 . PMID 30712865 .  
  40. ↑ Fan, Xiaoyi; Cao, Duanfang; Kong, Lingfei; Zhang, Xinzheng (diciembre de 2020). "Análisis por crio-EM de la estructura post-fusión de la glicoproteína de la espícula del SARS-CoV" . Nature Communications . 11 (1): 3618. Bibcode : 2020NatCo..11.3618F . doi : 10.1038/ s41467-020-17371-6 . PMC 7367865. PMID 32681106 .  
  41. 1 2 3 White, Judith M.; Whittaker, Gary R. (junio de 2016). "Fusión de virus envueltos en endosomas" . Traffic . 17 (6): 593– 614. doi : 10.1111/tra.12389 . PMC 4866878. PMID 26935856 .  
  42. ↑ Belouzard, Sandrine; Millet, Jean K.; Licitra, Beth N.; Whittaker, Gary R. (20 de junio de 2012). " Mecanismos de entrada celular del coronavirus mediados por la proteína de la espícula viral" . Viruses . 4 (6): 1011– 1033. Bibcode : 2012Virus...4.1011B . doi : 10.3390/v4061011 . PMC 3397359. PMID 22816037 .  
  43. 1 2 Buchrieser, Julián; Dufloo, Jérémy; Hubert, Mathieu; Monel, Blandine; Planas, Delfina; Rajá, Maaran Michael; Planchais, Cirilo; Porrot, Françoise; Guivel-Benhassine, Florencia; Van der Werf, Sylvie; Casartelli, Nicoletta; Mouquet, Hugo; Bruel, Timothée; Schwartz, Olivier (diciembre de 2020). "Formación de sincitios por células infectadas por SARS-CoV-2" . La Revista EMBO . 39 (23) e106267. doi : 10.15252/embj.2020106267 . PMC 7646020 . PMID 33051876 .  
  44. ^ Zhang, Zhengrong; Zheng, tú; Niu, Zubiao; Zhang, Bo; Wang, Chenxi; Yao, Xiaohong; Peng, Haoran; Franca, Del Nono; Wang, Yunyun; Zhu, Yichao; Su, Yan; Tang, Meng; Jiang, Xiaoyi; Ren, él; Él, Meifang; Wang, Yuqi; Gao, Lihua; Zhao, Ping; Shi, Hanping; Chen, Zhaolie; Wang, Xiao Ning; Piacentini, Mauro; Bian, Xiuwu; Melino, Gerry; Liu, Liang; Huang, Hongyan; Sun, Qiang (20 de abril de 2021). "La proteína de pico del SARS-CoV-2 dicta la eliminación de linfocitos mediada por sincitios" . Muerte y diferenciación celular . 28 (9): 2765–2777.doi : 10.1038 / s41418-021-00782-3 . PMC 8056997 . PMID 33879858 .  
  45. ↑ Braga, Luca; Ali, Hashim; Secco, Ilaria; Chiavacci, Elena; Neves, Guilherme; Colina de oro, Daniel; Penn, Rebeca; Jiménez-Guardeño, José M.; Ortega-Prieto, Ana M.; Bussani, Rossana; Cannatà, Antonio; Rizzari, Giorgia; Collesi, Chiara; Schneider, Eduardo; Arosio, Daniele; Shah, Ajay M.; Barclay, Wendy S.; Malim, Michael H.; Burrón, Juan; Giacca, Mauro (3 de junio de 2021). "Los medicamentos que inhiben las proteínas TMEM16 bloquean los sincitios inducidos por picos de SARS-CoV-2" . Naturaleza . 594 (7861): 88– 93. Bibcode : 2021Natur.594...88B . doi : 10.1038/ s41586-021-03491-6 . PMC 7611055. PMID 33827113 .  
  46. ↑ Lin, Liangyu; Li, Qing; Wang, Ying; Shi, Yufang (junio de 2021). "Formación de sincitios durante la infección pulmonar por SARS-CoV-2: una unidad desastrosa para eliminar linfocitos" . Cell Death & Differentiation . 28 (6): 2019– 2021. doi : 10.1038/s41418-021-00795- y . PMC 8114657. PMID 33981020 .  
  47. 1 2 3 4 Ho, Mitchell (abril de 2020). "Perspectivas sobre el desarrollo de anticuerpos neutralizantes contra el SARS-CoV-2" . Antibody Therapeutics . 3 (2): 109– 114. doi : 10.1093/abt / tbaa009 . ISSN 2516-4236 . PMC 7291920. PMID 32566896 .   
  48. ↑ Yang, Lifei; Liu, Weihan; Yu, Xin; Wu, Meng; Reichert, Janice M.; Ho, Mitchell (julio de 2020). "Rastreador de terapias con anticuerpos para la COVID-19: una base de datos global en línea de terapias con anticuerpos para la prevención y el tratamiento de la COVID-19" . Antibody Therapeutics . 3 (3): 205– 212. doi : 10.1093/abt/tbaa020 . ISSN 2516-4236 . PMC 7454247. PMID 33215063 .   
  49. ↑ Premkumar, Lakshmanane; Segovia-Chumbez, Bruno; Jadi, Ramesh; Martinez, David R.; Raut, Rajendra; Markmann, Alena; Cornaby, Caleb; Bartelt, Luther; Weiss, Susan; Park, Yara; Edwards, Caitlin E.; Weimer, Eric; Scherer, Erin M.; Rouphael, Nadine; Edupuganti, Srilatha; Weiskopf, Daniela; Tse, Longping V.; Hou, Yixuan J.; Margolis, David; Sette, Alessandro; Collins, Matthew H.; Schmitz, John; Baric, Ralph S.; de Silva, Aravinda M. (11 de junio de 2020). "El dominio de unión al receptor de la proteína de la espícula viral es un objetivo inmunodominante y altamente específico de los anticuerpos en pacientes con SARS-CoV-2" . Science Immunology . 5 (48) eabc8413. doi : 10.1126/ sciimmunol.abc8413 . PMC 7292505. PMID 32527802 .  
  50. 1 2 3 4 5 Harvey, William T.; Carabelli, Alessandro M.; Jackson, Ben; Gupta, Ravindra K.; Thomson, Emma C.; Harrison, Ewan M.; Ludden, Catherine; Reeve, Richard; Rambaut, Andrew; Peacock, Sharon J.; Robertson, David L. (julio de 2021). "Variantes del SARS-CoV-2, mutaciones de la proteína espiga y escape inmunitario" . Nature Reviews Microbiology . 19 (7): 409– 424. doi : 10.1038/s41579-021-00573-0 . PMC 8167834. PMID 34075212 .  
  51. ^ Hong, Jessica; Kwon, Hyung Joon; Cachau, Raúl; Chen, Catalina Z.; Butay, Kevin John; Duan, Zhijian; Li, Dan; Ren, Hua; Liang, Tianyuzhou; Zhu, Jianghai; Dandey, Venkata P.; Martín, Negin P.; Espósito, Domingo; Ortega-Rodríguez, Uriel; Xu, Miao (3 de mayo de 2022). "Los nanocuerpos de camello dromedario neutralizan ampliamente las variantes del SARS-CoV-2" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 119 (18) e2201433119. Código Bib : 2022PNAS..11901433H . doi : 10.1073/pnas.2201433119 . ISSN 1091-6490 . PMC 9170159 . PMID 35476528 .   
  52. ↑ Buffington, Jesse; Duan, Zhijian; Kwon, Hyung Joon; Hong, Jessica; Li, Dan; Feng, Mingqian; Xie, Hang; Ho, Mitchell (junio de 2023). "Identificación de anticuerpos de dominio único VNAR de tiburón nodriza dirigidos a la subunidad S2 de la espícula del SARS-CoV-2" . FASEB Journal . 37 ( 6): e22973. doi : 10.1096/fj.202202099RR . ISSN 1530-6860 . PMC 10715488. PMID 37191949. S2CID 258717083 .    
  53. ↑ Fauci, Anthony S. (9 de abril de 2021). "La historia detrás de las vacunas contra la COVID-19". Science . 372 ( 6538): 109. Bibcode : 2021Sci...372..109F . doi : 10.1126/science.abi8397 . PMID 33833099. S2CID 233186026 .  
  54. ↑ Koenig, Paul-Albert; Schmidt, Florian I. (17 de junio de 2021). "Spike D614G: un antígeno candidato para vacuna contra la COVID-19" . New England Journal of Medicine . 384 (24): 2349– 2351. doi : 10.1056/NEJMcibr2106054 . PMID 34133867 . 
  55. ↑ Wrapp, Daniel; Wang, Nianshuang; Corbett, Kizzmekia S.; Goldsmith, Jory A.; Hsieh, Ching-Lin; Abiona, Olubukola; Graham, Barney S.; McLellan, Jason S. (13 de marzo de 2020). "Estructura por crio-EM de la espícula del 2019-nCoV en la conformación de prefusión" . Science . 367 ( 6483): 1260–1263 . Bibcode : 2020Sci...367.1260W . doi : 10.1126/science.abb2507 . PMC 7164637. PMID 32075877 .  
  56. ^ Hansen, Johanna; Baum, Alina; Pascal, Kristen E.; Russo, Vincenzo; Giordano, Stephanie; Wloga, Elzbieta; Fulton, Benjamín O.; Yan, Ying; Koon, Katrina; Patel, Krunal; Chung, Kyung Min; Hermann, Aynur; Ullman, Erica; Cruz, Jonatán; Rafique, Ashique; Huang, Tammy; Fairhurst, Jeanette; Libertad, Christen; Malbec, Marino; Lee, Wen-yi; galés, Richard; Farr, Glen; Pennington, Seth; Deshpande, Dipali; Cheng, Jemmie; Watty, Anke; Bouffard, Pascal; Babb, Robert; Levenkova, Natasha; Chen, Calvino; Zhang, Bojie; Romero Hernández, Annabel; Saotome, Kei; Zhou, Yi; Franklin, Mateo; Sivapalasingam, Sumathi; Lejía, David Chien; Weston, Stuart; Logue, James; Haupt, Robert; Frieman, Matthew; Chen, Gang; Olson, William; Murphy, Andrew J.; Stahl, Neil; Yancopoulos, George D.; Kyratsous, Christos A. (21 de agosto de 2020). "Estudios en ratones humanizados y humanos convalecientes producen un cóctel de anticuerpos contra el SARS-CoV-2" . Science . 369 ( 6506): 1010– 1014. Bibcode : 2020Sci...369.1010H . doi : 10.1126/science.abd0827 . PMC 7299284. PMID 32540901 .  
  57. 1 2 "Manejo terapéutico de adultos no hospitalizados con COVID-19" . Guías de tratamiento de COVID-19 . Institutos Nacionales de Salud. Archivado del original el 4 de diciembre de 2021. Recuperado el 11 de agosto de 2021 .
  58. ↑ "etesevimab" . Guía de farmacología de la IUPHAR/BPS . Consultado el 10 de febrero de 2021 .
  59. ↑ "Lilly anuncia un acuerdo con el gobierno de EE. UU. para suministrar 300 000 viales del anticuerpo neutralizante experimental bamlanivimab (LY-CoV555) en un esfuerzo por combatir la COVID-19" . Eli Lilly and Company (Comunicado de prensa). 28 de octubre de 2020.
  60. ↑ "Inyección de casirivimab, solución, concentrado. Inyección de imdevimab, solución, concentrado. Kit REGEN-COV-casirivimab e imdevimab" . DailyMed . Consultado el 18 de marzo de 2021 .
  61. ↑ "Sotrovimab inyectable, solución, concentrado" . DailyMed . Consultado el 15 de junio de 2021 .
  62. 1 2 Koyama, Takahiko; Platt, Daniel; Parida, Laxmi (1 de julio de 2020). "Análisis de variantes de genomas de SARS-CoV-2" . Boletín de la Organización Mundial de la Salud . 98 (7): 495– 504. doi : 10.2471/BLT.20.253591 . PMC 7375210. PMID 32742035 .  
  63. 1 2 Winger, Anna; Caspari, Thomas (27 de mayo de 2021). "El pico de preocupación: las nuevas variantes del SARS-CoV-2" . Viruses . 13 ( 6): 1002. doi : 10.3390/v13061002 . PMC 8229995. PMID 34071984 .  
  64. ↑ Saputri, Dianita S.; Li, Songling; van Eerden, Floris J.; Rozewicki, John; Xu, Zichang; Ismanto, Hendra S.; Davila, Ana; Teraguchi, Shunsuke; Katoh, Kazutaka; Standley, Daron M. (17 de septiembre de 2020). " Flexible, funcional y familiar: características de la evolución de la proteína Spike del SARS-CoV-2" . Frontiers in Microbiology . 11 2112. doi : 10.3389/fmicb.2020.02112 . PMC 7527407. PMID 33042039 .  
  65. ↑ Cagliani, Rachele; Forni, Diego; Clerici, Mario; Sironi, Manuela (junio de 2020). "Inferencia computacional de la selección subyacente a la evolución del nuevo coronavirus, coronavirus del síndrome respiratorio agudo grave 2" . Journal of Virology . 94 (12) e00411-20. doi : 10.1128/JVI.00411-20 . PMC 7307108. PMID 32238584 .  
  66. ↑ Isabel, Sandra; Graña-Miraglia, Lucía; Gutiérrez, Jahir M.; Bundalovic-Torma, Cedoljub; Arboledas, Helen E.; Isabel, Marc R.; Eshaghi, AliReza; Patel, Samir N.; Gubbay, Jonathan B.; Poutanen, Tomi; Guttman, David S.; Poutanen, Susan M. (diciembre de 2020). "Los análisis evolutivos y estructurales de la mutación de la proteína de pico D614G del SARS-CoV-2 ahora están documentados en todo el mundo" . Informes científicos . 10 (1): 14031. Bibcode : 2020NatSR..1014031I . doi : 10.1038/s41598-020-70827-z . PMC 7441380 . PMID 32820179 .  
  67. ↑ Korber, Bette; Fischer, Will M.; Gnanakaran, Sandrasegaram; Yoon, Hyejin; Theiler, James; Abfalterer, Werner; Hengartner, Nick; Giorgi, Elena E.; Bhattacharya, Tanmoy; Foley, Brian; Hastie, Kathryn M.; Parker, Matthew D.; Partridge, David G.; Evans, Cariad M.; Freeman, Timothy M.; de Silva, Thushan I.; McDanal, Charlene; Perez, Lautaro G.; Tang, Haili; Moon-Walker, Alex; Whelan, Sean P.; LaBranche, Celia C.; Saphire, Erica O.; Montefiori, David C.; Angyal, Adrienne; Brown, Rebecca L.; Carrilero, Laura; Green, Luke R.; Groves, Danielle C.; Johnson, Katie J.; Keeley, Alexander J.; Lindsey, Benjamin B.; Parsons, Paul J.; Raza, Mohammad; Rowland-Jones, Sarah; Smith, Nikki; Tucker, Rachel M.; Wang, Dennis; Wyles, Matthew D. (agosto de 2020). "Seguimiento de los cambios en la proteína Spike del SARS-CoV-2: evidencia de que D614G aumenta la infectividad del virus COVID-19" . Cell . 182 ( 4): 812–827.e19. doi : 10.1016/j.cell.2020.06.043 . PMC 7332439. PMID 32697968 .  
  68. ↑ Zhang, Lizhou; Jackson, Cody B.; Mou, Huihui; Ojha, Amrita; Peng, Haiyong; Quinlan, Brian D.; Rangarajan, Erumbi S.; Pan, Andi; Vanderheiden, Abigail; Suthar, Mehul S.; Li, Wenhui; Izard, Tina; Rader, Christoph; Farzan, Michael; Choe, Hyeryun (diciembre de 2020). "La mutación D614G de la proteína de la espícula del SARS-CoV-2 aumenta la densidad de la espícula del virión y la infectividad" . Nature Communications . 11 (1): 6013. Bibcode : 2020NatCo..11.6013Z . doi : 10.1038/s41467-020-19808-4 . PMC 7693302 . PMID 33243994 .  
  69. ↑ Jackson, Cody B.; Zhang, Lizhou; Farzan, Michael; Choe, Hyeryun (enero de 2021). "Importancia funcional de la mutación D614G en la proteína de la espícula del SARS-CoV-2" . Biochemical and Biophysical Research Communications . 538 : 108–115 . Bibcode : 2021BBRC..538..108J . doi : 10.1016/j.bbrc.2020.11.026 . PMC 7664360. PMID 33220921 .  
  70. ↑ McAuley, Alexander J. (octubre de 2020). "La evidencia experimental e in silico sugiere que es poco probable que las vacunas se vean afectadas por la mutación D614G en la proteína de la espícula del SARS-CoV-2" . npj Vaccines . 5 96. doi : 10.1038/s41541-020-00246-8 . PMC 7546614. PMID 33083031 .  
  71. ↑ Liu, Yang (noviembre de 2021). " La sustitución N501Y de la proteína Spike mejora la infección y transmisión del SARS-CoV-2" . Nature . 602 (7896): 294–299 . doi : 10.1038/ s41586-021-04245-0 . PMC 8900207. PMID 34818667. S2CID 244647259 .   
  72. ↑ Abdool Karim, SS (2021). "Nuevas variantes del SARS-CoV-2: implicaciones clínicas, de salud pública y de vacunas" . New England Journal of Medicine . 384 (19): 1866– 1868. doi : 10.1056/NEJMc2100362 . PMC 8008749. PMID 33761203 .  
  73. ↑ Kuiper, Michael (2021). "Pero ratón, no estás solo: Sobre algunas variantes del coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo grave que infectan a los ratones" . ILAR Journal . 62 ( 1–2 ): 48–59 . doi : 10.1093/ilar/ilab031 . PMC 9236659. PMID 35022734 .  
  74. ↑ Barton, Michael I; MacGowan, Stuart A; Kutuzov, Mikhail A; Dushek, Omer; Barton, Geoffrey John; van der Merwe, P Anton (26 de agosto de 2021). Fouchier, Ron AM; Van der Meer, Jos W; Fouchier, Ron AM (eds.). "Efectos de mutaciones comunes en el RBD de la proteína Spike del SARS-CoV-2 y su ligando, el receptor ACE2 humano, sobre la afinidad de unión y la cinética" . eLife . 10 e70658 . doi : 10.7554/eLife.70658 . ISSN 2050-084X . PMC 8480977. PMID 34435953 .   
  75. ↑ MacGowan, Stuart A.; Barton, Michael I.; Kutuzov, Mikhail; Dushek, Omer; Merwe, P. Anton van der; Barton, Geoffrey J. (2 de marzo de 2022). "Las variantes de sentido erróneo en ACE2 humano afectan fuertemente la unión a la Spike del SARS-CoV-2, proporcionando un mecanismo para el riesgo genético mediado por ACE2 en Covid-19: un estudio de caso en predicciones de afinidad de variantes de interfaz" . PLOS Computational Biology . 18 (3) e1009922. Bibcode : 2022PLSCB..18E9922M . doi : 10.1371/journal.pcbi.1009922 . ISSN 1553-7358 . PMC 8920257. PMID 35235558 .   
  76. ↑ Callaway, Ewen (2021). "La mutación que ayuda a Delta a propagarse como la pólvora". Nature . 596 ( 7873): 472– 473. Bibcode : 2021Natur.596..472C . doi : 10.1038/d41586-021-02275-2 . PMID 34417582. S2CID 237254466 .  
  77. ↑ Peacock, TP (2021). "Las variantes del SARS-CoV-2 asociadas con infecciones en India, B.1.617, muestran una mayor escisión de la proteína Spike por la furina". bioRxiv 10.1101/2021.05.28.446163 . 
  78. ↑ "Clasificación de Omicron (B.1.1.529): Variante preocupante del SARS-CoV-2" . Organización Mundial de la Salud . 26 de noviembre de 2021. Archivado del original el 26 de noviembre de 2021. Consultado el 26 de noviembre de 2021 .
  79. ↑ Brown KA, Gubbay J, Hopkins J, Patel S, Buchan SA, Daneman N, Goneau LW (25 de mayo de 2021). "Fallo del objetivo del gen S como marcador de la variante B.1.1.7 entre los aislados de SARS-CoV-2 en el área metropolitana de Toronto, de diciembre de 2020 a marzo de 2021" . JAMA . 325 ( 20): 2115–2116 . doi : 10.1001/jama.2021.5607 . ISSN 0098-7484 . PMC 8033504. PMID 33830171 .   
  80. ↑ Métodos para la detección e identificación de variantes del SARS-CoV-2 (Informe técnico). Estocolmo y Copenhague: Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades/Oficina Regional para Europa de la Organización Mundial de la Salud. 3 de marzo de 2021. Ensayos de cribado diagnóstico de COV conocidos.
  81. ↑ Variantes preocupantes y variantes en investigación del SARS-CoV-2 en Inglaterra Variante preocupante: Omicron, VOC21NOV-01 (B.1.1.529), informe técnico 30 (PDF) (Informe). Salud Pública de Inglaterra. 3 de diciembre de 2021. GOV-10547. Archivado (PDF) del original el 11 de diciembre de 2021. Recuperado el 15 de diciembre de 2021 .
  82. ↑ "Las vacunas contra la COVID-19 no son 'citotóxicas'"( Verificación de datos). Reuters. 18 de junio de 2021.
  83. ↑ Gorski DH (24 de mayo de 2021). "La proteína de la espícula del coronavirus 'mortal' (según los antivacunas)" . Medicina basada en la ciencia .
  84. ↑ McCarthy B (5 de mayo de 2021). "Desmintiendo el engaño antivacunas sobre la 'eliminación de virus tras la vacunación'"" . PolitiFact . Consultado el 11 de mayo de 2021 .
  85. ↑ Fiore K (29 de abril de 2021). "El último mito antivacunas: 'la diseminación de virus tras la vacunación'"" . MedPage Today . Consultado el 11 de mayo de 2021 .
  86. ↑ Vance, Tyler DR; Lee, Jeffrey E. (julio de 2020). "Superfamilias de fusógenos de virus y eucariotas" . Current Biology . 30 (13): R750– R754. Bibcode : 2020CBio...30.R750V . doi : 10.1016/ j.cub.2020.05.029 . PMC 7336913. PMID 32634411 .  
  87. ↑ Li, F. (1 de marzo de 2012). "Evidencia de un origen evolutivo común de las subunidades de unión al receptor de la proteína Spike del coronavirus" . Journal of Virology . 86 (5): 2856– 2858. doi : 10.1128/jvi.06882-11 . PMC 3302248. PMID 22205743 .  
  88. ^ Shang, Jian; Zheng, Yuan; Yang, Yang; Liu, Chang; Geng, Qibin; Luo, Chuming; Zhang, Wei; Li, Fang (23 de abril de 2018). "La estructura crio-EM de la proteína de pico del coronavirus de la bronquitis infecciosa revela la evolución estructural y funcional de las proteínas de pico del coronavirus" . Más patógenos . 14 (4) e1007009. doi : 10.1371/journal.ppat.1007009 . PMC 5933801 . PMID 29684066 .  
  • Scudellari, Megan (28 de julio de 2021). "Cómo infecta el coronavirus a las células y por qué Delta es tan peligroso" . Nature . Consultado el 15 de agosto de 2021 .
  • Iwasa, Janet; Meyer, Miriah; Lex, Alexander; Rogers, Jen; Liu, Ann (Hui); Riggi, Margot. "Construcción de un modelo de consenso visual del ciclo de vida del SARS-CoV-2" . Laboratorio de Animación . Universidad de Utah . Consultado el 15 de agosto de 2021 .