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Familia de genes SOX

Los genes SOX ( genes HMG-box relacionados con SRY ) codifican una familia de factores de transcripción que se unen al surco menor del ADN y pertenecen a una superfamilia de gen...

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Los genes SOX ( genes HMG-box relacionados con SRY ) codifican una familia de factores de transcripción que se unen al surco menor del ADN y pertenecen a una superfamilia de genes caracterizada por una secuencia homóloga denominada HMG-box ( grupo de alta movilidad ). Esta HMG-box es un dominio de unión al ADN altamente conservado en todas las especies eucariotas . Se han identificado homólogos en insectos, nematodos, anfibios, reptiles, aves y diversos mamíferos. Sin embargo, las HMG-box pueden ser muy diversas en la naturaleza, con solo unos pocos aminoácidos conservados entre especies.

Los genes Sox se definen por contener la caja HMG de un gen implicado en la determinación del sexo llamado SRY , que reside en el cromosoma Y. Existen 20 genes SOX en humanos y ratones, y 8 en Drosophila. Casi todos los genes Sox muestran al menos un 50 % de similitud de aminoácidos con la caja HMG de Sry. La familia se divide en subgrupos según la homología dentro del dominio HMG y otros motivos estructurales, así como según ensayos funcionales. [ 1 ]

La familia Sox, de gran importancia para el desarrollo, no tiene una función única, y muchos de sus miembros poseen la capacidad de regular diversos aspectos del desarrollo. Si bien muchos genes Sox participan en la determinación del sexo, algunos también son importantes en procesos como el desarrollo neuronal . Por ejemplo, Sox2 y Sox3 participan en la transición de las células granulares epiteliales del cerebelo a su estado migratorio. Sox2 también es un factor de transcripción en el mantenimiento de la pluripotencia tanto en embriones tempranos como en células ES. [ 2 ] Posteriormente, las células granulares se diferencian en neuronas granulares, proceso en el que participa Sox11. [ 3 ] Se cree que algunos genes Sox podrían ser útiles en el diagnóstico precoz de tumores cerebrales infantiles debido a esta expresión secuencial en el cerebelo, lo que los convierte en un objetivo de investigación importante.

Las proteínas Sox se unen a la secuencia WWCAAW y secuencias similares ( W=A o T ). Tienen una especificidad de unión débil y una afinidad inusualmente baja por el ADN. Los genes Sox están relacionados con el grupo de genes Tcf/Lef1 , que también contiene un grupo de alta movilidad específico de secuencia y tiene una especificidad de secuencia similar (aproximadamente TWWCAAAG). [ 4 ]

Grupos

Los genes Sox se clasifican en grupos. Los genes Sox de diferentes grupos comparten poca similitud fuera del dominio de unión al ADN. En ratones y humanos, los miembros de los grupos son: [ 5 ]

Véase también

Referencias

  1. ↑ Bowles, J; Schepers G; Koopman P. (noviembre de 2000). "Filogenia de la familia SOX de factores de transcripción del desarrollo basada en indicadores de secuencia y estructura" . Dev. Biol . 227 (2): 239– 55. doi : 10.1006/dbio.2000.9883 . PMID 11071752 . 
  2. ↑ Takahashi, Kazutoshi; Yamanaka, Shinya (25 de agosto de 2006). "Inducción de células madre pluripotentes a partir de cultivos de fibroblastos embrionarios y adultos de ratón mediante factores definidos" . Cell . 126 (4): 663– 676. doi : 10.1016/j.cell.2006.07.024 . hdl : 2433/159777 . ISSN 0092-8674 . PMID 16904174 .  
  3. ↑ Rex, M; Church, R; Tointon, K; Ichihashi, RM; Mokhtar, S; Uwanogho, D; Sharpe, PT; Scotting, PJ (marzo de 1998). "El desarrollo de las células granulares en el cerebelo está marcado por cambios en la expresión del gen Sox". Molecular Brain Research . 55 (1): 28– 34. doi : 10.1016/S0169-328X(97)00354-9 . PMID 9645957 . 
  4. ↑ Lefebvre V, Dumitriu B, Penzo-Méndez A, Han Y, Pallavi B (2007). "Control del destino celular y la diferenciación por factores de transcripción Sox (grupo de alta movilidad relacionado con Sry)" . Int . J. Biochem. Cell Biol . 39 (12): 2195–214 . doi : 10.1016/j.biocel.2007.05.019 . PMC 2080623. PMID 17625949 .  
  5. ↑ Guth SI, Wegner M (octubre de 2008). "Tenerlo todo: la función de la proteína Sox entre la conservación y la innovación" . Cell . Mol. Life Sci . 65 (19): 3000– 18. doi : 10.1007/s00018-008-8138-7 . PMC 11131603. PMID 18516494. S2CID 8943181 .   
  • Wegner, M (marzo de 1999). "De la cabeza a los pies: las múltiples facetas de las proteínas Sox" . Nucleic Acids Res. 27 (6): 1409– 1420. doi : 10.1093/nar/27.6.1409 . PMC 148332. PMID 10037800 .  
  • Wright, EM; Snopek B; Koopman P. (febrero de 1993). "Siete nuevos miembros de la familia de genes Sox expresados ​​durante el desarrollo del ratón" . Nucleic Acids Res . 21 (3): 744. doi : 10.1093/nar/21.3.744 . PMC 309180. PMID 8441686 .  
  • NCBI CDD: cd01388 (SOX-TCF_HMG-box); proteínas humanas