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dominio del dedo anular

En biología molecular , un dominio de dedo RING (acrónimo de Really Interesting New Gene ) es un dominio estructural de proteína de tipo dedo de zinc que contiene un motivo de a...

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En biología molecular , un dominio de dedo RING (acrónimo de Really Interesting New Gene ) es un dominio estructural de proteína de tipo dedo de zinc que contiene un motivo de aminoácidos C3HC4 que se une a dos cationes de zinc (siete cisteínas y una histidina dispuestas de forma no consecutiva). [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] Este dominio proteico contiene de 40 a 60 aminoácidos. Muchas proteínas que contienen un dedo RING desempeñan un papel clave en la vía de ubiquitinación . Por el contrario, las proteínas con dominios de dedo RING son el tipo más grande de ubiquitina ligasas en el genoma humano. [ 6 ]

dedos de zinc

Los dominios de dedos de zinc (Znf) son motivos proteicos relativamente pequeños que se unen a uno o más átomos de zinc y que generalmente contienen múltiples protuberancias en forma de dedos que establecen contactos en tándem con su molécula diana. Se unen a sustratos de ADN , ARN , proteínas y/o lípidos . [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] Sus propiedades de unión dependen de la secuencia de aminoácidos de los dominios de dedos y del conector entre los dedos, así como de las estructuras de orden superior y el número de dedos. Los dominios Znf se encuentran a menudo en grupos, donde los dedos pueden tener diferentes especificidades de unión. Existen muchas superfamilias de motivos Znf, que varían tanto en secuencia como en estructura. Muestran una considerable versatilidad en los modos de unión, incluso entre miembros de la misma clase (por ejemplo, algunos se unen al ADN, otros a las proteínas), lo que sugiere que los motivos Znf son andamios estables que han evolucionado para tener funciones especializadas. Por ejemplo, las proteínas que contienen Znf funcionan en la transcripción genética , la traducción, el tráfico de ARNm, la organización del citoesqueleto , el desarrollo epitelial, la adhesión celular , el plegamiento de proteínas , la remodelación de la cromatina y la detección de zinc. [ 12 ] Los motivos de unión al zinc son estructuras estables y rara vez experimentan cambios conformacionales al unirse a su objetivo.

Algunos dominios de dedos de zinc han divergido de tal manera que aún conservan su estructura central, pero han perdido su capacidad de unirse al zinc, utilizando otros medios como puentes salinos o la unión a otros metales para estabilizar los pliegues en forma de dedo.

Función

Muchos dominios de dedo RING se unen simultáneamente a las enzimas de ubiquitinación y sus sustratos, funcionando así como ligasas . La ubiquitinación, a su vez, dirige la proteína sustrato hacia la degradación. [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ]

Recombinación meiótica

Durante la meiosis , el entrecruzamiento entre cromosomas homólogos promueve la segregación cromosómica precisa . [ 16 ] En mamíferos, las proteínas de dominio anular RNF212, HEI10 y RNF212B facilitan el entrecruzamiento entre cada par de homólogos durante la meiosis. [ 16 ] Estudios en ratones demostraron que estas proteínas de dominio anular pro-entrecruzamiento tienen funciones distintas, pero interdependientes, al facilitar la recombinación homóloga y los procesos de reparación del ADN que producen entrecruzamientos. [ 16 ]

Estructura

El dominio del dedo RING tiene la secuencia consenso C -X 2 - C -X [9-39] - C -X [1-3] - H -X [2-3] - C -X 2 - C -X [4-48] - C -X 2 - C . [ 2 ] donde:

A continuación se muestra una representación esquemática de la estructura del dominio del dedo RING: [ 2 ]

 xxxxxx xxxx xxxx xxxx CCCC x \ / xx \ / x x Zn xx Zn x C / \ HC / \ C xxxx xxxxxxxxxxxxx

Ejemplos

Algunos ejemplos de genes humanos que codifican proteínas que contienen un dominio de dedo RING son:

AMFR , BARD1 , BBAP , BFAR , BIRC2 , BIRC3 , BIRC7 , BIRC8 , BMI1 , BRAP , BRCA1 , CBL , CBLB , CBLC , CBLL1 , CHFR , CNOT4 , COMMD3 , DTX1 , DTX2 , DTX3 , DTX3L , DTX4 , DZIP3 , HCGV , HLTF , HOIL-1 , IRF2BP2 , LNX1 , LNX2 , LONRF1 , LONRF2 , LONRF3 , MARZO1 , MARZO2 , MARZO3 , MARZO4 , MARZO5 , MARZO6 , MARZO7 , MARZO8 , MARZO9 , MARZO10 , MDM2 , MEX3A , MEX3B , MEX3C , MEX3D , MGRN1 , MIB1 , MID1 , MID2 , MKRN1 , MKRN2 , MKRN3 , MKRN4 , MNAT1 , MYLIP , NFX1 , NFX2 , PCGF1 , PCGF2 , PCGF3 , PCGF4 , PCGF5 , PCGF6 , PDZRN3 , PDZRN4 , PEX10 , PHRF1 , PJA1 , PJA2 , PML , PML-RAR , PXMP3 , RAD18 , RAG1 , RAPSN , RBCK1 , RBX1 , RC3H1 , RC3H2 , RCHY1 , RFP2 , RFPL1 , RFPL2 , RFPL3 , RFPL4B , RFWD2 , RFWD3 , RING1 ,RNF2 , RNF4 , RNF5 , RNF6 , RNF7 , RNF8 , RNF10 , RNF11 , RNF12 , RNF13 , RNF14 , RNF19A , RNF20 , RNF24 , RNF25 , RNF26 , RNF32 , RNF38 , RNF39 , RNF40 , RNF41 , RNF43 , RNF44 , RNF55 , RNF71 , RNF103 , RNF111 , RNF113A , RNF113B , RNF121 , RNF122 , RNF123 , RNF125 , RNF126 , RNF128 , RNF130 , RNF133 , RNF135 , RNF138 , RNF139 , RNF141 , RNF144A , RNF145 , RNF146 , RNF148 , RNF149 , RNF150 , RNF151 , RNF152 , RNF157 , RNF165 , RNF166 , RNF167 , RNF168 , RNF169 , RNF170 , RNF175 , RNF180 , RNF181 , RNF182 , RNF185 , RNF207 , RNF213 , RNF215 , RNFT1 , SH3MD4 , SH3RF1 , SH3RF2 , SYVN1 , TIF1 , TMEM118 , TOPORS , TRAF2 , TRAF3 , TRAF4 , TRAF5 , TRAF6 , TRAF7 , TRAIP , TRIM2 , TRIM3 , TRIM4 , TRIM5 , TRIM6 , TRIM7 , TRIM8 , TRIM9 , TRIM10 , TRIM11 , TRIM13, TRIM15 , TRIM17 , TRIM21 , TRIM22 , TRIM23 , TRIM24 , TRIM25 , TRIM26 , TRIM27 , TRIM28 , TRIM31 , TRIM32 , TRIM33 , TRIM34 , TRIM35 , TRIM36 , TRIM38 , TRIM39 , TRIM40 , TRIM41 , TRIM42 , TRIM43 , TRIM45 , TRIM46 , TRIM47 , TRIM48 , TRIM49 , TRIM50 , TRIM52 , TRIM54 , TRIM55 , TRIM56 , TRIM58 , TRIM59 , TRIM60 , TRIM61 , TRIM62 , TRIM63 , TRIM65 , TRIM67 , TRIM68 , TRIM69 , TRIM71 , TRIM72 , TRIM73 , TRIM74 , TRIML1 , TTC3 , UHRF1 , UHRF2 , VPS11 , VPS8 , ZNF179 , ZNF294 , ZNF313 , ZNF364 , ZNF451 , ZNF650 , ZNFB7 , ZNRF1 , ZNRF2 , ZNRF3 , ZNRF4 , y ZSWIM2 .

Referencias

  1. ↑ Barlow PN, Luisi B, Milner A, Elliott M, Everett R (marzo de 1994). "Estructura del dominio C3HC4 mediante espectroscopia de resonancia magnética nuclear de 1H. Una nueva clase estructural de dedos de zinc". J. Mol. Biol . 237 (2): 201–11 . doi : 10.1006/jmbi.1994.1222 . PMID 8126734 . 
  2. 1 2 3 Borden KL, Freemont PS (1996). "El dominio del dedo RING: un ejemplo reciente de una familia de secuencia-estructura". Curr. Opin. Struct. Biol . 6 (3): 395– 401. doi : 10.1016/S0959-440X(96)80060-1 . PMID 8804826 . 
  3. ↑ Hanson IM, Poustka A, Trowsdale J (1991). "Nuevos genes en la región de clase II del complejo mayor de histocompatibilidad humano". Genomics . 10 (2): 417– 24. doi : 10.1016/0888-7543(91)90327-B . PMID 1906426 . 
  4. ↑ Freemont PS, Hanson IM, Trowsdale J (1991). "Un nuevo motivo de secuencia rico en cisteína" . Cell . 64 (3): 483–4 . doi : 10.1016/0092-8674(91)90229-R . PMID 1991318 . 
  5. ↑ Lovering R, Hanson IM, Borden KL, Martin S, O'Reilly NJ, Evan GI, Rahman D, Pappin DJ, Trowsdale J, Freemont PS (1993). "Identificación y caracterización preliminar de un motivo proteico relacionado con el dedo de zinc" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 90 (6): 2112– 6. Bibcode : 1993PNAS...90.2112L . doi : 10.1073 / pnas.90.6.2112 . PMC 46035. PMID 7681583 .  
  6. ↑ Scalia, Pierluigi; Williams, Stephen J.; Suma, Antonio; Carnevale, Vincenzo (2023-06-21). "La familia de proteínas DTX: un conjunto emergente de ligasas de ubiquitina E3 en el cáncer" . Cells . 12 ( 13): 1680. doi : 10.3390/cells12131680 . ISSN 2073-4409 . PMC 10340142. PMID 37443713 .   
  7. ↑ Klug A (1999). "Péptidos de dedos de zinc para la regulación de la expresión génica". J. Mol. Biol . 293 (2): 215– 8. doi : 10.1006/jmbi.1999.3007 . PMID 10529348 . 
  8. ↑ Hall TM (2005). "Múltiples modos de reconocimiento de ARN por proteínas de dedos de zinc" . Curr. Opin. Struct. Biol . 15 (3): 367– 73. doi : 10.1016/j.sbi.2005.04.004 . PMID 15963892 . 
  9. ↑ Brown RS (2005). "Proteínas de dedos de zinc: cómo controlar el ARN". Curr. Opin. Struct. Biol . 15 (1): 94– 8. doi : 10.1016/j.sbi.2005.01.006 . PMID 15718139 . 
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  11. ↑ Matthews JM, Sunde M (2002). " Dedos de zinc: pliegues para muchas ocasiones" . IUBMB Life . 54 (6): 351– 5. doi : 10.1080/15216540216035 . PMID 12665246. S2CID 22109146 .  
  12. ↑ Laity JH, Lee BM, Wright PE (2001). "Proteínas de dedos de zinc: nuevas perspectivas sobre la diversidad estructural y funcional". Curr. Opin. Struct. Biol . 11 (1): 39– 46. doi : 10.1016/S0959-440X(00)00167-6 . PMID 11179890 . 
  13. ↑ Lorick KL, Jensen JP, Fang S, Ong AM, Hatakeyama S, Weissman AM (1999). "Los dedos RING median la ubiquitinación dependiente de la enzima conjugadora de ubiquitina (E2)" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 96 (20): 11364–9 . Bibcode : 1999PNAS...9611364L . doi : 10.1073/pnas.96.20.11364 . PMC 18039. PMID 10500182 .  
  14. ↑ Joazeiro CA, Weissman AM (2000). "Proteínas con dominio RING: mediadores de la actividad de la ubiquitina ligasa" . Cell . 102 (5): 549– 52. doi : 10.1016/S0092-8674(00)00077-5 . PMID 11007473 . 
  15. ↑ Freemont PS (2000). "¿RING para la destrucción?" . Curr. Biol . 10 (2): R84–7. doi : 10.1016/S0960-9822(00)00287-6 . PMID 10662664 . 
  16. ^ Ito M, Yun Y , Kulkarni DS, Lee S, Sandhu S, Nuñez B, Hu L, Lee K, Lim N, Hirota RM, Prendergast R, Huang C, Huang I, Hunter N (enero de 2025) . "Las funciones distintas e interdependientes de tres proteínas RING regulan la recombinación durante la meiosis de los mamíferos" . Proc Natl Acad Sci Estados Unidos . 122 (2) e2412961121. doi : 10.1073/pnas.2412961121 . PMC 11745341 . PMID 39761402 .  
Este artículo incorpora texto de dominio público Pfam e InterPro : IPR001841
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