Repetición de WD40

La repetición WD40 (también conocida como repetición WD o beta-transducina ) es un motivo estructural corto de aproximadamente 40 aminoácidos , que a menudo termina en un dipéptido triptófano - ácido aspártico (WD). ^{[ 2 ]} Las copias en tándem de estas repeticiones normalmente se pliegan juntas para formar un tipo de dominio proteico solenoide circular llamado dominio WD40 .

Las proteínas que contienen el dominio WD40 tienen de 4 a 16 unidades repetitivas, que se cree que forman una estructura de hélice beta circular (véase la figura de la derecha). ^{[ 3 ] [ 4 ]} El dominio WD40 está compuesto por aproximadamente 40 a 60 ^{[ 4 ]} aminoácidos con un dipéptido de glicina e histidina cerca del extremo N y un dipéptido de triptófano y ácido aspártico, generalmente en el extremo C. Hay dos regiones variables presentes. Las repeticiones suelen formar una lámina beta antiparalela de cuatro hebras o una pala. Estas palas se unen para formar una hélice, siendo la más común una hélice beta de siete palas. Las palas se entrelazan de manera que la última hebra beta de una repetición se forma con las tres primeras de la siguiente repetición para formar la estructura de pala 3D. ^{[ 3 ] [ 4 ]}

Las proteínas con repeticiones WD40 son una gran familia presente en todos los eucariotas y están implicadas en diversas funciones, desde la transducción de señales y la regulación de la transcripción hasta el control del ciclo celular , la autofagia y la apoptosis . ^{[ 5 ]} La función común subyacente de todas las proteínas con repeticiones WD40 es la coordinación de ensamblajes de complejos multiproteicos, donde las unidades repetitivas sirven como un andamiaje rígido para las interacciones proteicas. La especificidad de las proteínas está determinada por las secuencias fuera de las propias repeticiones. Ejemplos de estos complejos son las proteínas G (la subunidad beta es una hélice beta), el factor de transcripción TAFII y la ubiquitina ligasa E3 . ^{[ 3 ] [ 4 ]}

Según el análisis inicial del genoma humano, las repeticiones WD40 constituyen la octava familia de proteínas más grande. En total, se identificaron 277 proteínas que las contienen. ^{[ 6 ]} Los genes humanos que codifican proteínas que contienen este dominio incluyen:

• AAAS , AAMP , AHI1 , AMBRA1 , APAF1 , ARPC1A , ARPC1B , ATG16L1 ,
• BOP1 , BRWD1 , BRWD3 , BTRC , BUB3 ,
• C6orf11 , CDC20 , CDC40 , CDRT1 , CHAF1B , CIAO1 , CIRH1A , COPA , COPB2 , CORO1A , CORO1B , CORO1C , CORO2A , CORO2B , CORO6 , CORO7 , CSTF1 ,
• DDB2 , DENND3 , DMWD , DMXL1 , DMXL2 , DNAI1 , DNAI2 , DNCI1 , DTL , DYNC1I1 , DYNC1I2 , EDC4 ,
• EED , EIF3S2 , ELP2 , EML1 , EML2 , EML3 , EML4 , EML4-ALK , EML5 , ERCC8 ,
• FBXW10 , FBXW11 , FBXW2 , FBXW4 , FBXW5 , FBXW7 , FBXW8 , FBXW9 , FZR1 ,
• GBL, GEMIN5 , GNB1 , GNB1L , GNB2 , GNB2L1 , GNB3 , GNB4 , GNB5 , GRWD1 , GTF3C2 ,
• HERC1 , HIRA , HZGJ ,
• IFT121 , IFT122 , IFT140 , IFT172 , IFT80 , IQWD1 ,
• KATNB1 , KIAA1336 , KIF21A , KIF21B , KM-PA-2 ,
• KEAP1 ,
• LLGL1 , LLGL2 , LRBA , LRRK1 , LRRK2 , LRWD1 , LYST ,
• MAPKBP1 , MED16 , MORG1 ,
• NBEA , NBEAL1 , NEDD1 , NLE1 , NSMAF , NUP37 , NUP43 , NWD1 ,
• PAAF1 , PAFAH1B1 , PAK1IP1 , PEX7 , PHIP , PIK3R4 , PLAA , PLRG1 , PPP2R2A , PPP2R2B , PPP2R2C , PPP2R2D , PPWD1 , PREB , PRPF19 , PRPF4 , PWP1 , PWP2 ,
• RAE1 , RPTOR , RBBP4 , RBBP5 , RBBP7 , RFWD2 , RFWD3 , RRP9 ,
• SCAP , SEC13 , SEC31A , SEC31B , SEH1L , SHKBP1 , SMU1 , SPAG16 , SPG, CORREA , STRN , STRN3 , STRN4 , STXBP5 , STXBP5L ,
• TAF5 , TAF5L , TBL1X , TBL1XR1 , TBL1Y , TBL2 , TBL3 , TEP1 , THOC3 , THOC6 , TLE1 , TLE2 , TLE3 , TLE4 , TLE6 , TRAF7 , TSSC1 , TULP4 , TUWD12 ,
• UTP15 , UTP18 ,
• WAIT1, WDF3, WDFY1, WDFY2, WDFY3, WDFY4, WDHD1, WDR1, WDR10, WDR11, WDR12, WDR13, WDR16, WDR17, WDR18, WDR19, WDR20, WDR21A, WDR21C, WDR22, WDR23, WDR24, WDR25, WDR26, WDR27, WDR3, WDR31, WDR32, WDR33, WDR34, WDR35, WDR36, WDR37, WDR38, WDR4, WDR40A, WDR40B, WDR40C, WDR41, WDR42A, WDR42B, WDR43, WDR44, WDR46, WDR47, WDR48, WDR49, WDR5, WDR51A, WDR51B, WDR52, WDR53, WDR54, WDR55, WDR57, WDR59, WDR5B, WDR6, WDR60, WDR61, WDR62, WDR63, WDR64, WDR65, WDR66, WDR67, WDR68, WDR69, WDR7, WDR70, WDR72, WDR73, WDR74, WDR75, WDR76, WDR77, WDR78, WDR79, WDR8, WDR81, WDR82, WDR85, WDR86, WDR88, WDR89, WDR90, WDR91, WDR92, WDSOF1, WDSUB1, WDTC1, WSB1, WSB2,
• ZFP106

• Hélice Beta
• Tomosina , una proteína con dos dominios WD40.
• Repeticiones en tándem de proteínas

• Motivo lineal eucariota, clase de motivo LIG_APCC_Dbox_1
• Motivo lineal eucariota, recurso de la clase de motivo LIG_APCC_KENbox_2
• Motivo lineal eucariota, clase de motivo LIG_COP1
• Motivo lineal eucariota, clase de motivo LIG_CRL4_Cdt2_1
• Motivo lineal eucariota, clase de motivo LIG_CRL4_Cdt2_2
• Motivo lineal eucariota, clase de motivo LIG_EH1_1
• Motivo lineal eucariota, clase de motivo LIG_GLEBS_BUB3_1
• Motivo lineal eucariota, clase de motivo LIG_RAPTOR_TOS_1
• Motivo lineal eucariota, clase de motivo LIG_SCF_FBW7_1
• Motivo lineal eucariota, clase de motivo LIG_SCF_FBW7_2
• Motivo lineal eucariota, clase de motivo LIG_SCF-TrCP1_1
• Motivo lineal eucariota, clase de motivo LIG_WRPW_1
• Motivo lineal eucariota, clase de motivo LIG_WRPW_2
• Motivo lineal eucariota, clase de motivo TRG_ER_diArg_1
• Motivo lineal eucariota, clase de motivo TRG_ER_diLys_1
• Motivo lineal eucariota, clase de motivo TRG_Golgi_diPhe_1
• Motivo lineal eucariota, recurso de la clase de motivo TRG_PTS2