Articulo de referencia

Receptores similares a la rodopsina

Los receptores tipo rodopsina son una familia de proteínas que comprenden el grupo más grande de receptores acoplados a proteínas G. [ 2 ] Alcance Los receptores acoplados a pro...

Los receptores tipo rodopsina son una familia de proteínas que comprenden el grupo más grande de receptores acoplados a proteínas G. [ 2 ]

Alcance

Los receptores acoplados a proteínas G (GPCR) constituyen una vasta familia de proteínas que abarca una amplia gama de funciones (incluidos diversos procesos autocrinos, paracrinos y endocrinos). Presentan una considerable diversidad a nivel de secuencia, lo que permite separarlos en distintos grupos. Los GPCR se suelen describir como una "superfamilia" porque engloban un grupo de familias con indicios de relación evolutiva, pero sin una similitud estadísticamente significativa en la secuencia entre ellas. [ 2 ] Los miembros de la superfamilia actualmente conocidos incluyen los GPCR tipo rodopsina (esta familia), los GPCR tipo secretina , los receptores de AMPc , los receptores de feromonas de apareamiento fúngico y la familia de receptores metabotrópicos de glutamato . Existe una base de datos especializada para los GPCR . [ 3 ]

Función

Los GPCR tipo rodopsina representan una extensa familia de proteínas que incluye receptores de hormonas, neuropéptidos, neurotransmisores y luz, los cuales transducen señales extracelulares mediante la interacción con proteínas de unión a nucleótidos de guanina (G). Si bien sus ligandos activadores varían ampliamente en estructura y características, las secuencias de aminoácidos de los receptores son muy similares y se cree que adoptan una estructura común compuesta por 7 hélices transmembrana (TM). [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]

Clases

Los GPCR similares a la rodopsina se han clasificado en los siguientes 19 subgrupos (A1-A19) basándose en un análisis filogenético. [ 7 ]

Subfamilia A1

Subfamilia A2

Subfamilia A3

Subfamilia A4

Subfamilia A5

Subfamilia A6

Subfamilia A7

Subfamilia A8

Subfamilia A9

Subfamilia A10

Subfamilia A11

Subfamilia A12

Subfamilia A13

Subfamilia A14

Subfamilia A15

Subfamilia A16

Subfamilia A17

Subfamilia A18

Subfamilia A19

Sin clasificar

Referencias

  1. Palczewski K, Kumasaka T, Hori T, et  al. (agosto de 2000). "Estructura cristalina de la rodopsina: receptor acoplado a proteína AG". Science . 289 (5480): 739–45 . Bibcode : 2000Sci...289..739P . doi : 10.1126/science.289.5480.739 . PMID 10926528 . 
  2. 1 2 Attwood TK, Findlay JB (1994). "Identificación de receptores acoplados a proteínas G". Protein Eng . 7 (2): 195– 203. doi : 10.1093/protein/7.2.195 . PMID 8170923 . 
  3. "Sistema de información para receptores acoplados a proteínas G" . GPCRDB . www.gpcr.org. Archivado del original el 22 de abril de 2009. Consultado el 5 de diciembre de 2008 .
  4. Birnbaumer L (1990). "Proteínas G en la transducción de señales". Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol . 30 : 675–705 . doi : 10.1146/annurev.pa.30.040190.003331 . PMID 2111655 . 
  5. Gilman AG, Casey PJ (1988). "Participación de la proteína G en el acoplamiento receptor-efector" . J. Biol. Chem . 263 (6): 2577– 2580. doi : 10.1016/S0021-9258(18)69103-3 . PMID 2830256 . 
  6. Attwood TK, Findlay JB (1993). "Diseño de una huella dactilar discriminatoria para receptores acoplados a proteínas G". Protein Eng . 6 (2): 167– 176. doi : 10.1093/protein/6.2.167 . PMID 8386361 . 
  7. Joost P, Methner A (2002). "Análisis filogenético de 277 receptores acoplados a proteínas G humanas como herramienta para la predicción de ligandos de receptores huérfanos" . Genome Biol . 3 (11): research0063.1–0063.16. doi : 10.1186/gb-2002-3-11-research0063 . PMC 133447. PMID 12429062 .  
  8. Terakita A (2005). " Las opsinas" . Genome Biol . 6 (3): 213. doi : 10.1186/gb-2005-6-3-213 . PMC 1088937. PMID 15774036 .  
  9. 1 2 Nordström KJ, Sällman Almén M, Edstam MM, Fredriksson R, Schiöth HB (septiembre de 2011). "Análisis independientes de HHsearch, Needleman-Wunsch-based y de motivos revelan la jerarquía general de la mayoría de las familias de receptores acoplados a proteínas G" . Biología molecular y evolución . 28 (9): 2471–80 . doi : 10.1093/molbev/msr061 . PMID 21402729 . 
  • Vriend G, Horn F, Oliveira L, Bywater RP, Cohen FE. "GPCRDB (G Protein-Coupled Receptor Data Base): datos derivados de secuencias" . Archivado del original el 14 de noviembre de 2007. Recuperado el 10 de diciembre de 2007 .
  • Horn F, Bettler E, Oliveira L, Campagne F, Cohen FE, Vriend G (2003). "Sistema de información GPCRDB para receptores acoplados a proteínas G" . Nucleic Acids Res . 31 (1): 294– 7. doi : 10.1093/nar/gkg103 . PMC 165550. PMID 12520006 .   Esta base de datos incluye alineamientos de secuencias múltiples de todas las familias y subfamilias de GPCR.