Los receptores tipo rodopsina son una familia de proteínas que comprenden el grupo más grande de receptores acoplados a proteínas G. [ 2 ]
Alcance
Los receptores acoplados a proteínas G (GPCR) constituyen una vasta familia de proteínas que abarca una amplia gama de funciones (incluidos diversos procesos autocrinos, paracrinos y endocrinos). Presentan una considerable diversidad a nivel de secuencia, lo que permite separarlos en distintos grupos. Los GPCR se suelen describir como una "superfamilia" porque engloban un grupo de familias con indicios de relación evolutiva, pero sin una similitud estadísticamente significativa en la secuencia entre ellas. [ 2 ] Los miembros de la superfamilia actualmente conocidos incluyen los GPCR tipo rodopsina (esta familia), los GPCR tipo secretina , los receptores de AMPc , los receptores de feromonas de apareamiento fúngico y la familia de receptores metabotrópicos de glutamato . Existe una base de datos especializada para los GPCR . [ 3 ]
Función
Los GPCR tipo rodopsina representan una extensa familia de proteínas que incluye receptores de hormonas, neuropéptidos, neurotransmisores y luz, los cuales transducen señales extracelulares mediante la interacción con proteínas de unión a nucleótidos de guanina (G). Si bien sus ligandos activadores varían ampliamente en estructura y características, las secuencias de aminoácidos de los receptores son muy similares y se cree que adoptan una estructura común compuesta por 7 hélices transmembrana (TM). [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]
Clases
Los GPCR similares a la rodopsina se han clasificado en los siguientes 19 subgrupos (A1-A19) basándose en un análisis filogenético. [ 7 ]
Subfamilia A1
- Receptor de quimiocinas InterPro : IPR000355
- Receptor de quimiocina (motivo CC) 1 ( CCR1 , CKR1)
- Receptor de quimiocina (motivo CC) 2 ( CCR2 , CKR2)
- Receptor de quimiocina (motivo CC) 3 ( CCR3 , CKR3)
- Receptor de quimiocina (motivo CC) 4 ( CCR4 , CKR4)
- Receptor de quimiocina (motivo CC) 5 ( CCR5 , CKR5)
- Receptor de quimiocina (motivo CC) 8 ( CCR8 , CKR8)
- Receptor tipo 2 de quimiocina (motivo CC) ( CCRL2 , CKRX)
- Receptor de quimiocina (motivo C) 1 ( XCR1 , CXC1) InterPro : IPR005393
- Receptor de quimiocina (motivo C-X3-C) 1 ( CX3CR1 , C3X1) InterPro : IPR005387
- GPR137B ( GPR137B , TM7SF1)
Subfamilia A2
- Receptor de quimiocinas InterPro : IPR000355
- Receptor tipo 1 de quimiocina (motivo CC) ( CCRL1 , CCR11)
- Receptor de quimiocina (motivo CC) 6 ( CCR6 , CKR6)
- Receptor de quimiocina (motivo CC) 7 ( CCR7 , CKR7)
- Receptor de quimiocina (motivo CC) 9 ( CCR9 , CKR9)
- Receptor de quimiocina (motivo CC) 10 ( CCR10 , CKRA)
- Receptores de quimiocinas CXC InterPro : IPR001053
- Receptor de quimiocina (motivo CXC) 3 ( CXCR3 )
- Receptor de quimiocina (motivo CXC) 4 ( CXCR4 , Fusina)
- Receptor de quimiocina (motivo CXC) 5 ( CXCR5 )
- Receptor de quimiocina (motivo CXC) 6 ( CXCR6 , BONZO)
- Receptor de quimiocina (motivo CXC) 7 ( CXCR7 , RDC1) InterPro : IPR001416
- Interleucina-8 InterPro : IPR000174 (IL8R)
- Receptor de adrenomedulina ( GPR182 )
- Grupo sanguíneo Duffy, receptor de quimiocinas ( DARC , DUFF)
- Receptor acoplado a proteína G 30 ( GPER , CML2, receptor de estrógeno GPCR)
Subfamilia A3
- Receptor de angiotensina II InterPro : IPR000248
- Receptor de angiotensina II, tipo 1 ( AGTR1 , AG2S)
- Receptor de angiotensina II, tipo 2 ( AGTR2 , AG22)
- Receptor de apelina ( AGTRL1 , APJ) InterPro : IPR003904
- Receptor de bradicinina InterPro : IPR000496
- Receptor de bradicinina B1 ( BDKRB1 , BRB1)
- Receptor de bradicinina B2 ( BDKRB2 , BRB2)
- GPR15 ( GPR15 , GPRF)
- GPR25 ( GPR25 )
Subfamilia A4
- Receptor opioide InterPro : IPR001418
- Receptor opioide delta ( OPRD1 , OPRD)
- Receptor opioide kappa ( OPRK1 , OPRK)
- Receptor opioide mu ( OPRM1 , OPRM)
- Receptor de nociceptina ( OPRL1 , OPRX)
- Receptor de somatostatina InterPro : IPR000586
- Receptor de somatostatina 1 ( SSTR1 , SSR1)
- Receptor de somatostatina 2 ( SSTR2 , SSR2)
- Receptor de somatostatina 3 ( SSTR3 , SSR3)
- Receptor de somatostatina 4 ( SSTR4 , SSR4)
- Receptor de somatostatina 5 ( SSTR5 , SSR5)
- Receptor de neuropéptido GPCR InterPro : IPR009150
- Receptor 1 de neuropéptidos B/W ( NPBWR1 , GPR7)
- Receptor 2 de neuropéptidos B/W ( NPBWR2 , GPR8)
- Receptor tipo quemerina 2 ( CMKLR2 ) InterPro : IPR002275
Subfamilia A5
- Receptor de galanina InterPro : IPR000405
- Receptor 1 de galanina ( GALR1 , GALR)
- Receptor de galanina 2 ( GALR2 , GALS)
- Receptor 3 de galanina ( GALR3 , GALT)
- Receptor de leucotrieno cisteinílico InterPro : IPR004071
- Receptor de leucotrieno cisteinílico 1 ( CYSLTR1 )
- Receptor de leucotrieno cisteinílico 2 ( CYSLTR2 )
- Receptor de leucotrieno B4 InterPro : IPR003981
- Receptor de leucotrieno B4 ( LTB4R , P2Y7)
- Receptor 2 de leucotrienos B4 ( LTB4R2 )
- Receptor de relaxina InterPro : IPR008112
- Receptor 1 de péptidos de la familia relaxina/insulina ( RXFP1 , LGR7)
- Receptor 2 de péptidos de la familia relaxina/similar a la insulina ( RXFP2 , GPR106)
- Receptor 3 de péptidos de la familia relaxina/insulina ( RXFP3 , SALPR)
- Receptor 4 de péptidos de la familia relaxina/similar a la insulina ( RXFP4 , GPR100/GPR142)
- Receptor peptídico derivado de KiSS1 (GPR54) ( KISS1R ) InterPro : IPR008103
- Receptor 1 de la hormona concentradora de melanina ( MCHR1 , GPRO) InterPro : IPR008361
- Receptor de urotensina II ( UTS2R , UR2R) InterPro : IPR000670
Subfamilia A6
- Receptor de colecistoquinina InterPro : IPR009126
- Receptor de colecistoquinina A ( CCKAR , CCKR)
- Receptor de colecistoquinina B ( CCKBR , GASR)
- Receptor de neuropéptido FF InterPro : IPR005395
- Receptor 1 del neuropéptido FF ( NPFFR1 , FF1R)
- Receptor 2 del neuropéptido FF ( NPFFR2 , FF2R)
- Receptor de orexina InterPro : IPR000204
- Receptor 1 de hipocretina (orexina) ( HCRTR1 , OX1R)
- Receptor 2 de hipocretina (orexina) ( HCRTR2 , OX2R)
- Receptor de vasopresina InterPro : IPR001817
- Receptor de arginina vasopresina 1A ( AVPR1A , V1AR)
- Receptor de arginina vasopresina 1B ( AVPR1B , V1BR)
- Receptor de arginina vasopresina 2 ( AVPR2 , V2R)
- Receptor de oxitocina ( OXTR )
- Receptor de la hormona liberadora de gonadotropina ( GNRHR , GRHR) InterPro : IPR001658
- Receptor del péptido RFamida piroglutamilado ( QRFPR , GPR103)
- GPR22 ( GPR22 , GPRM)
- GPR176 ( GPR176 , GPR)
Subfamilia A7
- Receptor de bombesina InterPro : IPR001556
- Receptor tipo bombesina 3 ( BRS3 )
- Receptor de neuromedina B ( NMBR )
- Receptor del péptido liberador de gastrina ( GRPR )
- Receptor de endotelina InterPro : IPR000499
- Receptor de endotelina tipo A ( EDNRA , ET1R)
- Receptor de endotelina tipo B ( EDNRB , ETBR)
- GPR37 ( GPR37 , ETBR-LP2) InterPro : IPR003909
- Receptor de neuromedina U InterPro : IPR005390
- Receptor 1 de neuromedina U ( NMUR1 )
- Receptor 2 de neuromedina U ( NMUR2 )
- Receptor de neurotensina InterPro : IPR003984
- Receptor de neurotensina 1 ( NTSR1 , NTR1)
- Receptor de neurotensina 2 ( NTSR2 , NTR2)
- Receptor de la hormona liberadora de tirotropina ( TRHR , TRFR) InterPro : IPR009144
- Receptor secretagogo de la hormona del crecimiento ( GHSR ) InterPro : IPR003905
- GPR39 ( GPR39 )
- Receptor de motilina ( MLNR , GPR38)
Subfamilia A8
- Receptores de anafilatoxina InterPro : IPR002234
- Receptor C3a ( C3AR1 , C3AR)
- Receptor C5a ( C5AR1 , C5AR)
- Receptor tipo quimiocina 1 ( CMKLR1 , CML1) InterPro : IPR002258
- Receptor de péptido formilo InterPro : IPR000826
- Receptor de péptidos formilados 1 ( FPR1 , FMLR)
- Receptor de péptidos formilados tipo 1 ( FPRL1 , FML2)
- Receptor de péptidos formilados tipo 2 ( FPRL2 , FML1)
- Oncogén MAS1 InterPro : IPR000820
- CMKLR2 ( GPR1 )
- GPR32 ( GPR32 , GPRW)
- GPR44 ( GPR44 )
- GPR77 ( GPR77 , C5L2)
Subfamilia A9
- Receptor de melatonina InterPro : IPR000025
- Receptor de melatonina 1A ( MTNR1A , ML1A)
- Receptor de melatonina 1B ( MTNR1B , ML1B)
- Receptor de neuroquinina InterPro : IPR001681
- Receptor de taquiquinina 1 ( TACR1 , NK1R)
- Receptor de taquiquinina 2 ( TACR2 , NK2R)
- Receptor de taquiquinina 3 ( TACR3 , NK3R)
- Receptor de neuropéptido Y InterPro : IPR000611
- Receptor Y1 del neuropéptido Y ( NPY1R , NY1R)
- Receptor Y2 del neuropéptido Y ( NPY2R , NY2R)
- Receptor 1 del polipéptido pancreático ( PPYR1 , NY4R)
- Receptor Y5 del neuropéptido Y ( NPY5R , NY5R)
- Receptor del péptido liberador de prolactina ( PRLHR , GPRA) InterPro : IPR001402
- Receptor de procineticina 1 ( PROKR1 , GPR73)
- Receptor de procineticina 2 ( PROKR2 , PKR2)
- GPR19 ( GPR19 , GPRJ)
- GPR50 ( GPR50 , ML1X)
- GPR75 ( GPR75 )
- GPR83 ( GPR83 , GPR72)
Subfamilia A10
- Receptor de hormona glicoproteica InterPro : IPR002131
- Receptor de FSH ( FSHR )
- Receptor de la hormona luteinizante/gonadotropina coriónica ( LHCGR , LSHR)
- Receptor de tirotropina ( TSHR )
- Receptor 4 acoplado a proteína G con repeticiones ricas en leucina ( LGR4 , GPR48)
- Receptor 5 acoplado a proteína G que contiene repeticiones ricas en leucina ( LGR5 , GPR49)
- Receptor 6 acoplado a proteína G con repeticiones ricas en leucina ( LGR6 )
Subfamilia A11
- Receptor relacionado con GPR40 InterPro : IPR013312
- Receptor de ácidos grasos libres 1 ( FFAR1 , GPR40)
- Receptor de ácidos grasos libres 2 ( FFAR2 , GPR43)
- Receptor de ácidos grasos libres 3 ( FFAR3 , GPR41)
- GPR42 ( GPR42 , FFAR1L)
- Purinoceptor P2 InterPro : IPR002286
- Receptor purinérgico P2Y 1 ( P2RY1 )
- Receptor purinérgico P2Y 2 ( P2RY2 )
- Receptor purinérgico P2Y 4 ( P2RY4 )
- Receptor purinérgico P2Y 6 ( P2RY6 )
- Receptor purinérgico P2Y 8 ( P2RY8 )
- Receptor purinérgico P2Y 11 ( P2RY11 )
- Receptor de ácido hidroxicarboxílico 1 ( HCAR1 , GPR81)
- Receptor de ácido hidroxicarboxílico 2, receptor de niacina 1 ( HCAR2 , GPR109A)
- Receptor de ácido hidroxicarboxílico 3, receptor de niacina 2 ( HCAR3 , GPR109B, HM74)
- GPR31 ( GPR31 , GPRV)
- GPR82 ( GPR82 )
- Receptor 1 de oxoglutarato (alfa-cetoglutarato) ( OXGR1 , GPR80)
- Receptor de succinato 1 ( SUCNR1 , GPR91)
Subfamilia A12
- Purinoceptor P2 InterPro : IPR002286
- Receptor purinérgico P2Y 12 ( P2RY12 )
- Receptor purinérgico P2Y 13 ( P2RY13 , GPR86) InterPro : IPR008109
- Receptor purinérgico P2Y 14 ( P2RY14 , receptor de UDP-glucosa, KI01) InterPro : IPR005466
- GPR34 ( GPR34 )
- GPR87 ( GPR87 )
- GPR171 ( GPR171 , H963)
- Receptor del factor activador de plaquetas ( PTAFR , PAFR) InterPro : IPR002282
Subfamilia A13
- Receptor cannabinoide InterPro : IPR002230
- Receptor cannabinoide 1 (cerebro) ( CNR1 , CB1R)
- Receptor cannabinoide 2 (macrófago) ( CNR2 , CB2R)
- Receptor de ácido lisofosfatídico InterPro : IPR004065
- Receptor 1 del ácido lisofosfatídico ( LPAR1 )
- Receptor 2 del ácido lisofosfatídico ( LPAR2 )
- Receptor 3 del ácido lisofosfatídico ( LPAR3 )
- Receptor de esfingosina 1-fosfato InterPro : IPR004061
- Receptor de esfingosina 1-fosfato 1 ( S1PR1 )
- Receptor de esfingosina 1-fosfato 2 ( S1PR2 )
- Receptor de esfingosina 1-fosfato 3 ( S1PR3 )
- Receptor de esfingosina 1-fosfato 4 ( S1PR4 )
- Receptor de esfingosina 1-fosfato 5 ( S1PR5 )
- Receptor de melanocortina/ACTH InterPro : IPR001671
- Receptor de melanocortina 1 ( MC1R , MSHR)
- Receptor de melanocortina 3 ( MC3R )
- Receptor de melanocortina 4 ( MC4R )
- Receptor de melanocortina 5 ( MC5R )
- receptor de ACTH ( MC2R , ACTR)
- GPR3 ( GPR3 )
- GPR6 ( GPR6 )
- GPR12 ( GPR12 , GPRC)
Subfamilia A14
- Receptor de eicosanoides InterPro : IPR008365
- Receptor de prostaglandina D2 ( PTGDR , PD2R)
- Receptor de prostaglandina E 1 ( PTGER1 , PE21)
- Receptor de prostaglandina E2 ( PTGER2 , PE22)
- Receptor de prostaglandina E 3 ( PTGER3 , PE23)
- Receptor de prostaglandina E 4 ( PTGER4 , PE24)
- Receptor de prostaglandina F ( PTGFR , PF2R)
- Receptor de prostaglandina I 2 (prostaciclina) ( PTGIR , PI2R)
- Receptor de tromboxano A2 ( TBXA2R , TA2R)
Subfamilia A15
- Receptor de ácido lisofosfatídico InterPro : IPR004065
- Receptor 4 del ácido lisofosfatídico ( LPAR4 )
- Receptor 5 del ácido lisofosfatídico ( LPAR5 )
- Receptor 6 del ácido lisofosfatídico ( LPAR6 ) InterPro : IPR002188
- Purinoceptor P2 InterPro : IPR002286
- Receptor purinérgico P2Y 10 ( P2RY10 , P2Y10)
- Receptor activado por proteasa InterPro : IPR003912
- Receptor tipo 1 del factor de coagulación II (trombina) ( F2RL1 , PAR2)
- Receptor tipo 2 del factor de coagulación II (trombina) ( F2RL2 , PAR3)
- Receptor tipo 3 del factor de coagulación II (trombina) ( F2RL3 , PAR4)
- Gen 2 inducido por el virus de Epstein-Barr (receptor acoplado a proteína G específico de linfocitos) ( GPR183 )
- Receptores acoplados a proteínas G sensibles a los protones
- GPR17 ( GPR17 , GPRH)
- GPR18 ( GPR18 , GPRI)
- GPR20 ( GPR20 , GPRK)
- GPR35 ( GPR35 )
- GPR55 ( GPR55 )
- Receptor del factor de coagulación II ( F2R , THRR)
Subfamilia A16
- Opsins InterPro : IPR001760 [ 8 ]
- Rodopsina ( RHO , OPSD)
- Opsina 1 (pigmentos de conos), sensible a la luz de onda corta (daltonismo, tritan) ( OPN1SW , OPSB) (opsina sensible al azul)
- Opsina 1 (pigmentos de conos), sensible a la luz de onda media (daltonismo, deutan) ( OPN1MW , OPSG) (opsina sensible al verde)
- Opsina 1 (pigmentos de conos), sensible a la luz de onda larga (daltonismo, protan) ( OPN1LW , OPSR) (opsina sensible al rojo)
- Opsina 3, Panopsina ( OPN3 )
- Opsina 4, Melanopsina ( OPN4 )
- Opsina 5 ( OPN5 , GPR136)
- Receptor acoplado a proteína G de la retina ( RGR )
- Homólogo de rodopsina derivado del epitelio pigmentario de la retina ( RRH , OPSX) (opsina receptora similar al pigmento visual) InterPro : IPR001793
Subfamilia A17
- Receptor de 5-hidroxitriptamina (5-HT) InterPro : IPR002231
- Receptor adrenérgico InterPro : IPR002233
- Receptor de dopamina InterPro : IPR000929
- Receptor de aminas traza InterPro : IPR009132
- Receptor de histamina H2 ( HRH2 , HH2R) InterPro : IPR000503
Subfamilia A18
- Receptor de histamina H1 ( HRH1 , HH1R) InterPro : IPR000921
- Receptor de histamina H3 ( HRH3 ) InterPro : IPR003980
- Receptor de histamina H4 ( HRH4 ) InterPro : IPR008102
- Receptor de adenosina InterPro : IPR001634
- Receptor muscarínico de acetilcolina InterPro : IPR000995
- GPR21 ( GPR21 , GPRL)
- GPR27 ( GPR27 )
- GPR45 ( GPR45 , PSP24)
- GPR52 ( GPR52 )
- GPR61 ( GPR61 )
- GPR62 ( GPR62 )
- GPR63 ( GPR63 )
- GPR78 ( GPR78 )
- GPR84 ( GPR84 )
- GPR85 ( GPR85 )
- GPR88 ( GPR88 )
- GPR101 ( GPR101 )
- GPR161 ( GPR161 , RE2)
- GPR173 ( GPR173 , SREB3)
Subfamilia A19
Sin clasificar
- Receptor olfativo InterPro : IPR000725
- Quimiorreceptor de nematodos [ 9 ] (múltiple, incluyendo InterPro : IPR000344 InterPro : IPR019424 )
- Receptor del gusto tipo 2 [ 9 ] InterPro : IPR007960
- Receptor vomeronasal tipo 1 InterPro : IPR004072
Referencias
- ↑ Palczewski K, Kumasaka T, Hori T, et al. (agosto de 2000). "Estructura cristalina de la rodopsina: receptor acoplado a proteína AG". Science . 289 (5480): 739–45 . Bibcode : 2000Sci...289..739P . doi : 10.1126/science.289.5480.739 . PMID 10926528 .
- 1 2 Attwood TK, Findlay JB (1994). "Identificación de receptores acoplados a proteínas G". Protein Eng . 7 (2): 195– 203. doi : 10.1093/protein/7.2.195 . PMID 8170923 .
- ↑ "Sistema de información para receptores acoplados a proteínas G" . GPCRDB . www.gpcr.org. Archivado del original el 22 de abril de 2009. Consultado el 5 de diciembre de 2008 .
- ↑ Birnbaumer L (1990). "Proteínas G en la transducción de señales". Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol . 30 : 675–705 . doi : 10.1146/annurev.pa.30.040190.003331 . PMID 2111655 .
- ↑ Gilman AG, Casey PJ (1988). "Participación de la proteína G en el acoplamiento receptor-efector" . J. Biol. Chem . 263 (6): 2577– 2580. doi : 10.1016/S0021-9258(18)69103-3 . PMID 2830256 .
- ↑ Attwood TK, Findlay JB (1993). "Diseño de una huella dactilar discriminatoria para receptores acoplados a proteínas G". Protein Eng . 6 (2): 167– 176. doi : 10.1093/protein/6.2.167 . PMID 8386361 .
- ↑ Joost P, Methner A (2002). "Análisis filogenético de 277 receptores acoplados a proteínas G humanas como herramienta para la predicción de ligandos de receptores huérfanos" . Genome Biol . 3 (11): research0063.1–0063.16. doi : 10.1186/gb-2002-3-11-research0063 . PMC 133447. PMID 12429062 .
- ↑ Terakita A (2005). " Las opsinas" . Genome Biol . 6 (3): 213. doi : 10.1186/gb-2005-6-3-213 . PMC 1088937. PMID 15774036 .
- 1 2 Nordström KJ, Sällman Almén M, Edstam MM, Fredriksson R, Schiöth HB (septiembre de 2011). "Análisis independientes de HHsearch, Needleman-Wunsch-based y de motivos revelan la jerarquía general de la mayoría de las familias de receptores acoplados a proteínas G" . Biología molecular y evolución . 28 (9): 2471–80 . doi : 10.1093/molbev/msr061 . PMID 21402729 .
Enlaces externos
- Vriend G, Horn F, Oliveira L, Bywater RP, Cohen FE. "GPCRDB (G Protein-Coupled Receptor Data Base): datos derivados de secuencias" . Archivado del original el 14 de noviembre de 2007. Recuperado el 10 de diciembre de 2007 .
- Horn F, Bettler E, Oliveira L, Campagne F, Cohen FE, Vriend G (2003). "Sistema de información GPCRDB para receptores acoplados a proteínas G" . Nucleic Acids Res . 31 (1): 294– 7. doi : 10.1093/nar/gkg103 . PMC 165550. PMID 12520006 . Esta base de datos incluye alineamientos de secuencias múltiples de todas las familias y subfamilias de GPCR.
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