Familia de transportadores de solutos

El grupo de transportadores de solutos (SLC) incluye más de 400 miembros organizados en 66 familias. ^{[ 1 ] [ 2 ]} La mayoría de los miembros del grupo SLC se encuentran en la membrana celular . El sistema de nomenclatura de genes SLC fue propuesto originalmente por el Comité de Nomenclatura de Genes HUGO ( HGNC ) y es la base de los nombres oficiales del HGNC para los genes que codifican estos transportadores. Una clasificación más general de transportadores transmembrana se puede encontrar en la base de datos TCDB .

Los solutos transportados por los distintos miembros del grupo SLC son extremadamente diversos e incluyen moléculas orgánicas cargadas y neutras, así como iones inorgánicos y el gas amoníaco .

Como es típico de las proteínas de membrana integrales , las SLC contienen varias hélices alfa transmembrana hidrofóbicas conectadas entre sí por bucles intra y extracelulares hidrofílicos. Dependiendo de la SLC, estos transportadores funcionan como monómeros o como homo- u hetero-oligómeros obligados. Muchas familias de SLC pertenecen a la superfamilia de transportadores principales .

Por convención del sistema de nomenclatura , los miembros de una misma familia SLC comparten entre sí una identidad de secuencia superior al 20-25%. En cambio, la homología entre las familias SLC es muy baja o inexistente. ^{[ 3 ]} Por lo tanto, el criterio para la inclusión de una familia en el grupo SLC no es la relación evolutiva con otras familias SLC, sino la funcionalidad (es decir, una proteína de membrana integral que transporta un soluto).

El grupo SLC incluye ejemplos de proteínas de transporte que son:

• transportadores facilitadores (permiten que los solutos fluyan cuesta abajo con sus gradientes electroquímicos )
• Transportadores activos secundarios (permiten que los solutos fluyan cuesta arriba en contra de su gradiente electroquímico acoplándose al transporte de un segundo soluto que fluye cuesta abajo a favor de su gradiente, de manera que el cambio de energía libre total siga siendo favorable).

La serie SLC no incluye miembros de familias de proteínas de transporte que hayan sido clasificadas previamente por otros sistemas de nomenclatura ampliamente aceptados, entre ellos:

• Los transportadores activos primarios (que permiten el flujo contra gradientes electroquímicos), como los transportadores ABC ( ATP Binding Cassette), acoplan el transporte a un evento de liberación de energía, como la hidrólisis de ATP.
• canales iónicos
• acuaporinas (canales de agua)

La mayoría de los miembros del grupo SLC se encuentran en la membrana celular , pero algunos se localizan en las mitocondrias (el más notable es la familia SLC 25) u otros orgánulos intracelulares .

Los nombres de los miembros individuales de SLC tienen el siguiente formato: ^{[ 4 ]}

${\displaystyle {\ce {SLCnXm}}}$

dónde:

• SLC es el nombre raíz ( S o Lute Carrier )
• n = un número entero que representa una familia (por ejemplo, del 1 al 52)
• X = una sola letra (A, B, C, ...) que denota una subfamilia
• m = un número entero que representa a un miembro individual de la familia ( isoforma ).

Por ejemplo, SLC1A1 es la primera isoforma de la subfamilia A de la familia SLC 1.

Se produce una excepción con la familia SLC 21 ^{[ 5 ]} (los transportadores de polipéptidos transportadores de aniones orgánicos), que por razones históricas tienen nombres en el formato SLCOnXm donde n = número de familia, X = letra de subfamilia y m = número de miembro.

Si bien el HGNC solo asigna nomenclatura a genes humanos, por convención, los ortólogos de vertebrados de estos genes adoptan la misma nomenclatura (por ejemplo, los ortólogos de SLC10A1 asignados por el VGNC ). En el caso de los roedores, el uso de mayúsculas y minúsculas en los símbolos difiere del de otros vertebrados, ya que se utiliza la primera letra en mayúscula; es decir, Slc1a1 denota el ortólogo de roedor del gen humano SLC1A1.

Las siguientes familias se nombran bajo SLC: ^{[ 6 ]}

1. transportador de glutamato y aminoácidos neutros de alta afinidad ^{[ 7 ]}
   • ( SLC1A1 , SLC1A2 , SLC1A3 , SLC1A4 , SLC1A5 , SLC1A6 , SLC1A7 )
2. transportador GLUT facilitador ^{[ 8 ]}
   • ( SLC2A1 , SLC2A2 , SLC2A3 , SLC2A4 , SLC2A5 , SLC2A6 , SLC2A7 , SLC2A8 , SLC2A9 , SLC2A10 , SLC2A11 , SLC2A12 , SLC2A13 , SLC2A14 )
3. subunidades pesadas de transportadores de aminoácidos heterodiméricos ^{[ 9 ]}
   • ( SLC3A1 , SLC3A2 )
4. transportador de bicarbonato ^{[ 10 ]}
   • ( SLC4A1 , SLC4A2 , SLC4A3 , SLC4A4 , SLC4A5 , SLC4A6 , SLC4A7 , SLC4A8 , SLC4A9 , SLC4A10 , SLC4A11 )
5. cotransportador de sodio-glucosa ^{[ 11 ]}
   • ( SLC5A1 , SLC5A2 , SLC5A3 , SLC5A4 , SLC5A5 , SLC5A6 , SLC5A7 , SLC5A8 , SLC5A9 , SLC5A10 , SLC5A11 , SLC5A12 )
6. simportadores de sodio:neurotransmisores dependientes de sodio y cloruro ^{[ 12 ]}
   • ( SLC6A1 , SLC6A2 , SLC6A3 , SLC6A4 , SLC6A5 , SLC6A6 , SLC6A7 , SLC6A8 , SLC6A9 , SLC6A10 , SLC6A11 , SLC6A12 , SLC6A13 , SLC6A14 , SLC6A15 , SLC6A16 , SLC6A17 , SLC6A18 , SLC6A19 , SLC6A20 )
7. transportador de aminoácidos catiónicos/asociado a glicoproteínas ^{[ 13 ]}
   • transportadores de aminoácidos catiónicos ( SLC7A1 , SLC7A2 , SLC7A3 , SLC7A4 )
   • subunidades asociadas a glicoproteínas/ligeras o catalíticas de transportadores de aminoácidos heterodiméricos ( SLC7A5 , SLC7A6 , SLC7A7 , SLC7A8 , SLC7A9 , SLC7A10 , SLC7A11 , SLC7A13 , SLC7A14 )
8. Intercambiador Na+/Ca2+ ^{[ 14 ]}
   • ( SLC8A1 , SLC8A2 , SLC8A3 )
9. Intercambiador Na+/H+ ^{[ 15 ]}
   • ( SLC9A1 , SLC9A2 , SLC9A3 , SLC9A4 , SLC9A5 , SLC9A6 , SLC9A7 , SLC9A8 , SLC9A9 , SLC9A10 , SLC9A11 , SLC9B1 , SLC9B2 )
10. cotransporte de sales biliares de sodio ^{[ 16 ]}
    • ( SLC10A1 , SLC10A2 , SLC10A3 , SLC10A4 , SLC10A5 , SLC10A6 , SLC10A7 )
11. transportador de iones metálicos acoplado a protones ^{[ 17 ]}
    • ( SLC11A1 , SLC11A2 )
12. cotransportador de cationes-Cl electroneutro ^{[ 18 ]}
    • ( SLC12A1 , SLC12A2 , SLC12A3 , SLC12A4 , SLC12A5 , SLC12A6 , SLC12A7 , SLC12A8 , SLC12A9 )
13. Cotransportador de sulfato/carboxilato de Na+ ^{[ 19 ]}
    • ( SLC13A1 , SLC13A2 , SLC13A3 , SLC13A4 , SLC13A5 )
14. transportador de urea ^{[ 20 ]}
    • ( SLC14A1 , SLC14A2 )
15. cotransportador de oligopéptidos de protones ^{[ 21 ]}
    • ( SLC15A1 , SLC15A2 , SLC15A3 , SLC15A4 )
16. transportador de monocarboxilato ^{[ 22 ]}
    • ( SLC16A1 , SLC16A2 , SLC16A3 , SLC16A4 , SLC16A5 , SLC16A6 , SLC16A7 , SLC16A8 , SLC16A9 , SLC16A10 , SLC16A11 , SLC16A12 , SLC16A13 , SLC16A14 )
17. transportador vesicular de glutamato ^{[ 23 ]}
    • ( SLC17A1 , SLC17A2 , SLC17A3 , SLC17A4 , SLC17A5 , SLC17A6 , SLC17A7 , SLC17A8 , SLC17A9 )
18. transportador vesicular de aminas ^{[ 24 ]}
    • ( SLC18A1 , SLC18A2 , SLC18A3 )
19. transportador de folato / tiamina ^{[ 25 ]}
    • ( SLC19A1 , SLC19A2 , SLC19A3 )
20. cotransportador de Na+-fosfato tipo III ^{[ 26 ]}
    • ( SLC20A1 , SLC20A2 )
21. transporte de aniones orgánicos ^{[ 27 ]}
    • subfamilia 1 ( SLCO1A2 , SLCO1B1 , SLCO1B3 , SLCO1C1 )
    • subfamilia 2 ( SLCO2A1 , SLCO2B1 )
    • subfamilia 3 ( SLCO3A1 )
    • subfamilia 4 ( SLCO4A1 , SLCO4C1 )
    • subfamilia 5 ( SLCO5A1 )
    • subfamilia 6 ( SLCO6A1 )
22. transportador de cationes/aniones/zwitteriones orgánicos ^{[ 28 ]}
    • ( SLC22A1 , SLC22A2 , SLC22A3 , SLC22A4 , SLC22A5 , SLC22A6 , SLC22A7 , SLC22A8 , SLC22A9 , SLC22A10 , SLC22A11 , SLC22A12 , SLC22A13 , SLC22A14 , SLC22A15 , SLC22A16 , SLC22A17 , SLC22A18 , SLC22A18AS , SLC22A19 , SLC22A20 , SLC22A23 , SLC22A24 , SLC22A25 , SLC22A31 )
23. Transportador de ácido ascórbico dependiente de Na+ ^{[ 29 ]}
    • ( SLC23A1 , SLC23A2 , SLC23A3 , SLC23A4 )
24. Intercambiador Na+/(Ca2+-K+) ^{[ 30 ]}
    • ( SLC24A1 , SLC24A2 , SLC24A3 , SLC24A4 , SLC24A5 , SLC24A6 )
25. transportador mitocondrial ^{[ 31 ]}
    • ( SLC25A1 , SLC25A2 , SLC25A3 , SLC25A4 , SLC25A5 , SLC25A6 , UCP1(SLC25A7) , UCP2(SLC25A8) , UCP3(SLC25A9) , SLC25A10 , SLC25A11 , SLC25A12 , SLC25A13 , SLC25A14 , SLC25A15 , SLC25A16 , SLC25A17 , SLC25A18 , SLC25A19 , SLC25A20 , SLC25A21 , SLC25A22 , SLC25A23 , SLC25A24 , SLC25A25 , SLC25A26 , SLC25A27 , SLC25A28 , SLC25A29 , SLC25A30 , SLC25A31 , SLC25A32 , SLC25A33 , SLC25A34 , SLC25A35 , SLC25A36 , SLC25A37 , SLC25A38 , SLC25A39 , SLC25A40 , SLC25A41 , SLC25A42 , SLC25A43 , SLC25A44 , SLC25A45 , SLC25A46 ), SLC25A47 , SLC25A48 , MTCH1(SLC25A49) , MTCH2(SLC25A50) , SLC25A51 , SLC25A52 , SLC25A53
26. intercambiador de aniones multifuncional ^{[ 32 ]}
    • ( SLC26A1 , SLC26A2 , SLC26A3 , SLC26A4 , SLC26A5 , SLC26A6 , SLC26A7 , SLC26A8 , SLC26A9 , SLC26A10 , SLC26A11 )
27. proteínas transportadoras de ácidos grasos ^{[ 33 ]}
    • ( SLC27A1 , SLC27A2 , SLC27A3 , SLC27A4 , SLC27A5 , SLC27A6 )
28. Transporte de nucleósidos acoplado a Na+ ^{[ 34 ]}
    • ( SLC28A1 , SLC28A2 , SLC28A3 )
29. transportador de nucleósidos facilitador ^{[ 35 ]}
    • ( SLC29A1 , SLC29A2 , SLC29A3 , SLC29A4 )
30. transportador de zinc ^{[ 36 ]}
    • ( SLC30A1 , SLC30A2 , SLC30A3 , SLC30A4 , SLC30A5 , SLC30A6 , SLC30A7 , SLC30A8 , SLC30A9 , SLC30A10 )
31. transportador de cobre ^{[ 37 ]}
    • ( SLC31A1 , SLC31A2 )
32. transportador vesicular inhibidor de aminoácidos ^{[ 38 ]}
    • ( SLC32A1 )
33. Transportador de acetil-CoA ^{[ 39 ]}
    • ( SLC33A1 )
34. cotransportador de Na+-fosfato tipo II ^{[ 40 ]}
    • ( SLC34A1 , SLC34A2 , SLC34A3 )
35. transportador de nucleótido-azúcar ^{[ 41 ]}
    • subfamilia A ( SLC35A1 , SLC35A2 , SLC35A3 , SLC35A4 , SLC35A5 )
    • subfamilia B ( SLC35B1 , SLC35B2 , SLC35B3 , SLC35B4 )
    • subfamilia C ( SLC35C1 , SLC35C2 )
    • subfamilia D ( SLC35D1 , SLC35D2 , SLC35D3 )
    • subfamilia E (SLC35E1, SLC35E2A, SLC35E2B, SLC35E3, SLC35E4)
    • subfamilia F ( SLC35F1 , SLC35F2 , SLC35F3 , SLC35F4 , SLC35F5 )
    • subfamilia G ( SLC35G1 , SLC35G3 , SLC35G4 , SLC35G5 , SLC35G6 )
36. transportador de aminoácidos acoplado a protones ^{[ 42 ]}
    • ( SLC36A1 , SLC36A2 , SLC36A3 , SLC36A4 )
37. intercambiador azúcar-fosfato/fosfato ^{[ 43 ]}
    • ( SLC37A1 , SLC37A2 , SLC37A3 , SLC37A4 )
38. Sistema A y N, transportador de aminoácidos neutros acoplado a sodio ^{[ 44 ]}
    • ( SLC38A1 , SLC38A2 , SLC38A3 , SLC38A4 , SLC38A5 , SLC38A6 , SLC38A7 , SLC38A8 , SLC38A9 , SLC38A10 , SLC38A11 )
39. transportador de iones metálicos ^{[ 45 ]}
    • ( SLC39A1 , SLC39A2 , SLC39A3 , SLC39A4 , SLC39A5 , SLC39A6 , SLC39A7 , SLC39A8 , SLC39A9 , SLC39A10 , SLC39A11 , SLC39A12 , SLC39A13 , SLC39A14 )
40. transportador basolateral de hierro ^{[ 46 ]}
    • ( SLC40A1 )
41. Transportador de magnesio similar a MgtE
    • ( SLC41A1 , SLC41A2 , SLC41A3 )
42. Transportador de amoníaco ^{[ 47 ] [ 48 ]}
    • ( RHAG(SLC42A1) , RHBG(SLC42A2) , RHCG(SLC42A3) )
43. Transportador de aminoácidos independiente de Na+, similar al sistema L.
    • ( SLC43A1 , SLC43A2 , SLC43A3 )
44. Transportador similar a la colina
    • ( SLC44A1 , SLC44A2 , SLC44A3 , SLC44A4 , SLC44A5 )
45. Transportador de azúcar putativo
    • ( SLC45A1 , SLC45A2 , SLC45A3 , SLC45A4 )
46. transportador de folato
    • ( SLC46A1 , SLC46A2 , SLC46A3 )
47. Extrusión de múltiples fármacos y toxinas
    • ( SLC47A1 , SLC47A2 )
48. Familia de transportadores de hemo
    • (SLC48A1)
49. transportador de hemo
    • ( FLVCR1(SLC49A1) , FLVCR2(SLC49A2) , SLC49A3, SLC49A4)
50. Transportadores de eflujo de azúcar de la familia SWEET
    • ( SLC50A1 )
51. Transportadores de moléculas derivadas de esteroides
    • ( SLC51A , SLC51B )
52. Familia de transportadores de riboflavina RFVT/SLC52
    • ( SLC52A1 , SLC52A2 , SLC52A3 )
53. Transportadores de fosfato
    • ( XPR1(SLC53A1) )
54. Transportadores mitocondriales de piruvato
    • ( MPC1 (SLC54A1), MPC2 (SLC54A2), MPC1L (SLC54A3))
55. Intercambiadores mitocondriales de cationes/protones
    • ( LETM1 (SLC55A1), LETM2 (SLC55A2), LETMD1 (SLC55A3))
56. Sideroflexinas
    • ( SFXN1(SLC56A1) , SFXN2 (SLC56A2), SFXN3 (SLC56A3), SFXN4 (SLC56A4), SFXN5 (SLC56A5))
57. Familia de transportadores de magnesio tipo NiPA
    • ( NIPA1(SLC57A1) , NIPA2(SLC57A2) , NIPAL1 (SLC57A3), NIPAL2 (SLC57A4), NIPAL3 (SLC57A5), NIPAL4 (SLC57A6))
58. Familia de transportadores de magnesio tipo MagT
    • ( MAGT1(SLC58A1) , TUSC3(SLC58A2 ))
59. Familia de simportadores de lisofosfatidilcolina dependientes de sodio
    • ( MFSD2A (SLC59A1), MFSD2B (SLC59A2))
60. Transportadores de glucosa
    • ( MFSD4A (SLC60A1), MFSD4B (SLC60A2))
61. Familia de transportadores de molibdato
    • ( MFSD5 (SLC61A1))
62. Transportadores de pirofosfato
    • ( ANKH (SLC62A1))
63. Transportadores de esfingosina-fosfato
    • ( SPNS1 (SLC63A1), SPNS2 (SLC63A2), SPNS3 (SLC63A3))
64. Intercambiadores de Ca2+/H+ del aparato de Golgi
    • ( TMEM165 (SLC64A1))
65. Transportadores de colesterol de tipo NPC
    • ( NPC1(SLC65A1) , NPC1L1(SLC65A2))
66. Exportadores de aminoácidos catiónicos
    • ( SLC66A1 , SLC66A2 , SLC66A3 , CTNS(SLC66A4) , MPDU1 (SLC66A5))

Los SLC putativos , también llamados SLC atípicos, son proteínas transportadoras secundarias activas o facilitadoras novedosas y plausibles que comparten un origen ancestral con los SLC conocidos. ^{[ 2 ] [ 49 ]} Sin embargo, los SLC atípicos de tipo MFS se pueden subdividir en 15 familias de transportadores MFS putativos ( AMTF ). ^{[ 49 ]}

Todos los supuestos SLC son transportadores SLC plausibles. Algunos son simplemente "atípicos" en lo que respecta a su nomenclatura; los genes tienen una asignación SLC, pero como alias, y han conservado su símbolo genético "no SLC" ya asignado como símbolo aprobado.

Aquí se enumeran algunos SLC putativos: OCA2 , CLN3 , TMEM104 , SPNS1, SPNS2 , SPNS3 , SV2A , SV2B , SV2C , SVOP, SVOPL, MFSD1 , ^{[ 50 ]} MFSD2A , MFSD2B , MFSD3 , ^{[ 50 ]} MFSD4A , ^{[ 51 ]} MFSD4B , MFSD5 , ^{[ 52 ]} MFSD6 , MFSD6L , MFSD8 , MFSD9 , ^{[ 51 ]} MFSD10 , MFSD11 , ^{[ 52 ]} MFSD12 , MFSD13A , MFSD14A , ^{[ 53 ]} MFSD14B , ^{[ 53 ]} UNC93A ^{[ 54 ] [ 55 ]} y UNC93B1 .

Tablas SLC. Tablas SLC

• Esquema de las familias
• Conjuntos de datos y reactivos de la familia de transportadores de solutos
• Lista de proteínas en el sitio web de HGNC